67 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BCE_1612 on replicon NC_003909
Organism: Bacillus cereus ATCC 10987



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003909  BCE_1612  lysM domain-containing protein  100 
 
 		 159 aa  320  4e-87  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.0000000378837  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1648  lysM domain protein  100 
 
 		 159 aa  320  4e-87  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000383151  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1369  peptidoglycan-binding protein  98.11 
 
 		 162 aa  315  1e-85  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  5.6403400000000004e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1581  lysM domain protein  98.11 
 
 		 159 aa  315  2e-85  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.05729e-36 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1368  peptidoglycan-binding protein  96.23 
 
 		 159 aa  283  9e-76  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000000189168  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3803  lysM domain protein  89.31 
 
 		 159 aa  263  5.999999999999999e-70  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000302093  hitchhiker  1.81276e-16 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1542  lysM domain protein  89.31 
 
 		 159 aa  262  1e-69  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.001251  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1396  lysM domain-containing protein  88.68 
 
 		 159 aa  259  2e-68  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000873032  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1507  lysm domain-containing protein  88.68 
 
 		 159 aa  259  2e-68  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.00000000000123436  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1409  peptidoglycan-binding LysM  86.79 
 
 		 159 aa  256  1e-67  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.0000000791474  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1210  peptidoglycan-binding LysM  61.11 
 
 		 160 aa  172  1.9999999999999998e-42  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000146268  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2191  Peptidoglycan-binding LysM  32.72 
 
 		 191 aa  76.6  0.0000000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2898  Lytic transglycosylase catalytic  48.33 
 
 		 849 aa  48.5  0.00004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.52326 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0438  Peptidoglycan-binding lysin domain protein  42.31 
 
 		 180 aa  48.1  0.00005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0821  Peptidoglycan-binding LysM  38.98 
 
 		 164 aa  47.4  0.00008  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.0727806 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0569  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  37.04 
 
 		 471 aa  46.6  0.0001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1338  protein serine/threonine phosphatase  35.48 
 
 		 474 aa  45.1  0.0004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000169814  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4945  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase, family 3  35.85 
 
 		 471 aa  44.7  0.0005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01980  putative membrane-bound lytic murein transglycosylase  42.86 
 
 		 554 aa  44.7  0.0005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.531039  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0157  Peptidoglycan-binding lysin domain protein  32.86 
 
 		 353 aa  44.3  0.0007  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1687  Peptidoglycan-binding LysM  37.5 
 
 		 516 aa  44.3  0.0007  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0930816  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1716  peptidoglycan-binding LysM  39.22 
 
 		 597 aa  43.5  0.001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.925679  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00097  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  44.44 
 
 		 576 aa  43.1  0.001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0122  NLP/P60 protein  41.18 
 
 		 301 aa  43.5  0.001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.806641  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3724  cell wall hydrolase/autolysin  40.91 
 
 		 557 aa  43.5  0.001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0816524  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0072  Peptidoglycan-binding lysin domain protein  35.85 
 
 		 334 aa  43.5  0.001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.859252  normal  0.733338 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0489  cell wall hydrolase/autolysin  41.07 
 
 		 560 aa  42.7  0.002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.000671829  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0750  peptidoglycan-binding LysM  41.18 
 
 		 377 aa  42.7  0.002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.000075939  normal  0.966774 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3314  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  37.1 
 
 		 447 aa  42.7  0.002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.0000664916  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1995  lytic transglycosylase, catalytic  43.48 
 
 		 539 aa  43.1  0.002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0964783  normal  0.42715 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_3022  NLP/P60 protein  42.55 
 
 		 289 aa  42.7  0.002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.618403  normal  0.062405 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0702  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  39.34 
 
 		 631 aa  42.7  0.002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00039621  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1857  lytic transglycosylase, catalytic  39.34 
 
 		 485 aa  42.4  0.002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2497  Curculin domain protein (mannose-binding) lectin  43.75 
 
 		 190 aa  42.7  0.002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0532  cell wall hydrolase/autolysin  44.44 
 
 		 563 aa  42  0.003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.00749255  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2228  Peptidoglycan-binding LysM  38.57 
 
 		 319 aa  42.4  0.003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  hitchhiker  0.00208524  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2780  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  37.14 
 
 		 579 aa  42  0.003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.395604  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0139  membrane-bound lytic murein transglycosylase D, putative  45.83 
 
 		 451 aa  42.4  0.003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.518176 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4688  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  41.3 
 
 		 477 aa  42  0.003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.802168  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0549  lytic transglycosylase, catalytic  52.08 
 
 		 638 aa  42  0.003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.357331  normal  0.13799 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3802  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  37.7 
 
 		 637 aa  42.4  0.003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0514476  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3543  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  38.6 
 
 		 440 aa  42.4  0.003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3656  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  39.34 
 
 		 593 aa  42.4  0.003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000106561  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1840  cell wall hydrolase SleB  40 
 
 		 264 aa  42.4  0.003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000645557  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1087  lytic transglycosylase, catalytic  36.84 
 
 		 650 aa  42  0.003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.106498  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3241  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  42.31 
 
 		 840 aa  42  0.003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2542  peptidoglycan-binding LysM  28.93 
 
 		 116 aa  41.6  0.004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0261672  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3862  putative cell wall hydrolase  38.57 
 
 		 265 aa  41.6  0.004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000210035  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2034  rare lipoprotein A  41.3 
 
 		 168 aa  41.6  0.005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.13997  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2842  LysM repeat-containing protein  43.14 
 
 		 389 aa  41.2  0.005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0595  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  34.43 
 
 		 462 aa  41.2  0.005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.000000955274  hitchhiker  0.0000000140637 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3435  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  34.43 
 
 		 462 aa  41.2  0.005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00000801055  normal  0.0458053 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65370  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  41.3 
 
 		 475 aa  41.2  0.005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0527105  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0894  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  34.69 
 
 		 472 aa  41.2  0.005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3922  cell wall hydrolase/autolysin  37.93 
 
 		 542 aa  41.2  0.006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.00766484  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0246  peptidoglycan-binding LysM  34.29 
 
 		 473 aa  40.8  0.007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0486  lytic transglycosylase, catalytic  45.65 
 
 		 419 aa  40.8  0.007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.232763  normal  0.0521482 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2132  cell wall hydrolase SleB  35.53 
 
 		 216 aa  40.8  0.007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4773  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  39.13 
 
 		 476 aa  40.8  0.007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4949  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  39.13 
 
 		 476 aa  40.8  0.007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0480001  normal  0.137764 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4897  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  39.13 
 
 		 476 aa  40.8  0.007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.019111  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3028  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  40.91 
 
 		 435 aa  40.8  0.008  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0809739  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1436  putative cell wall hydrolase  38.57 
 
 		 265 aa  40.8  0.008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000951619  hitchhiker  0.000921187 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0411  Lytic transglycosylase catalytic  35.59 
 
 		 447 aa  40.8  0.008  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000674118  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0484  cell wall hydrolase SleB  31.58 
 
 		 241 aa  40.8  0.008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  0.000000000000226048  normal  0.576315 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2004  LysM domain/BON superfamily protein  35.14 
 
 		 161 aa  40.4  0.009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3795  cell wall hydrolase, putative  37.88 
 
 		 265 aa  40.4  0.009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.00000000105599  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>