More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BCE_0932 on replicon NC_003909
Organism: Bacillus cereus ATCC 10987



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011658  BCAH187_A1024  putative ABC transporter, substrate-binding protein  96.19 
 
 
579 aa  1155    Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0932  ABC transporter, substrate-binding protein, putative  100 
 
 
579 aa  1200    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0799  ABC transporter substrate-binding protein  94.45 
 
 
579 aa  1132    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0748  oligopeptide ABC transporter, solute-binding protein  95.49 
 
 
579 aa  1146    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0230399  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0743  oligopeptide ABC transporter, solute-binding protein  94.82 
 
 
579 aa  1144    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.601164  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0839  ABC transporter substrate-binding protein  94.45 
 
 
579 aa  1132    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.689681  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0935  putative ABC transporter, substrate-binding protein  95.67 
 
 
579 aa  1151    Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.13566e-23 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0895  putative ABC transporter, substrate-binding protein  94.82 
 
 
586 aa  1145    Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2689  extracellular solute-binding protein  29.33 
 
 
571 aa  259  7e-68  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.377797  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2612  oligopeptide ABC transporter, substrate-binding protein  29.31 
 
 
578 aa  249  1e-64  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.808743  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2884  extracellular solute-binding protein  28.95 
 
 
578 aa  247  4.9999999999999997e-64  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0154142 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2636  oligopeptide ABC transporter, substrate-binding protein  28.81 
 
 
578 aa  246  8e-64  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2687  solute-binding family 5 protein  28.81 
 
 
578 aa  244  3.9999999999999997e-63  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.240712  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2881  solute-binding family 5 protein  28.81 
 
 
578 aa  244  3.9999999999999997e-63  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.629347  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2347  extracellular solute-binding protein  28.48 
 
 
578 aa  243  7e-63  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0243341  normal  0.0193694 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2898  extracellular solute-binding protein  28.4 
 
 
578 aa  240  4e-62  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0908192  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2932  extracellular solute-binding protein  27.39 
 
 
578 aa  232  2e-59  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.0000417004  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2920  solute-binding family 5 protein  27.27 
 
 
578 aa  228  3e-58  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00308535  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1843  ABC-type oligopeptide transport system, periplasmic component  25.95 
 
 
569 aa  201  3.9999999999999996e-50  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1552  extracellular solute-binding protein  24.58 
 
 
563 aa  174  5e-42  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.851364 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0521  hypothetical protein  24.69 
 
 
565 aa  148  3e-34  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3616  transcriptional regulator SgrR  29.43 
 
 
552 aa  142  1.9999999999999998e-32  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.455862  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2953  ABC transporter substrate-binding protein  26.34 
 
 
554 aa  141  3e-32  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0313683  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2942  transcriptional regulator SgrR  28.77 
 
 
553 aa  140  6e-32  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.940242 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3540  transcriptional regulator SgrR  28.77 
 
 
553 aa  140  7e-32  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3411  transcriptional regulator SgrR  28.77 
 
 
553 aa  140  7e-32  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0118  transcriptional regulator SgrR  27.2 
 
 
552 aa  139  1e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.217334  normal  0.271533 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0115  transcriptional regulator SgrR  27.42 
 
 
552 aa  139  1e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0122  transcriptional regulator SgrR  27.2 
 
 
552 aa  139  1e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.40957  decreased coverage  0.00940564 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0122  transcriptional regulator SgrR  27.2 
 
 
552 aa  139  1e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0117  transcriptional regulator SgrR  27.2 
 
 
552 aa  139  1e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.947764  normal  0.240994 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0585  transcriptional regulator SgrR  28.05 
 
 
555 aa  138  2e-31  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0738  transcriptional regulator SgrR  28.61 
 
 
553 aa  138  4e-31  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3805  transcriptional regulator SgrR  28.48 
 
 
552 aa  137  4e-31  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.397454  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0074  transcriptional regulator SgrR  26.5 
 
 
551 aa  137  5e-31  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0074  transcriptional regulator SgrR  26.5 
 
 
552 aa  136  8e-31  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.492998 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0076  transcriptional regulator SgrR  26.5 
 
 
552 aa  136  9e-31  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00071  DNA-binding transcriptional regulator  26.5 
 
 
551 aa  136  9.999999999999999e-31  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0496  extracellular solute-binding protein, family 5  29.25 
 
 
566 aa  136  9.999999999999999e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3588  transcriptional regulator SgrR  26.5 
 
 
551 aa  136  9.999999999999999e-31  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000489241 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00070  hypothetical protein  26.5 
 
 
551 aa  136  9.999999999999999e-31  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0531  extracellular solute-binding protein  23.68 
 
 
566 aa  135  1.9999999999999998e-30  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.585387  normal  0.74128 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0559  extracellular solute-binding protein  29.25 
 
 
566 aa  135  1.9999999999999998e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.111824  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0072  transcriptional regulator SgrR  26.21 
 
 
551 aa  135  1.9999999999999998e-30  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0522  solute-binding family 5 protein  22.67 
 
 
566 aa  135  1.9999999999999998e-30  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0612149  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0062  transcriptional regulator SgrR  26.21 
 
 
551 aa  135  1.9999999999999998e-30  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0481  solute-binding family 5 protein  23.51 
 
 
566 aa  134  3e-30  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0505  extracellular solute-binding protein family 5  29.25 
 
 
566 aa  135  3e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.679744  normal  0.144898 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0624  transcriptional regulator SgrR  27.27 
 
 
553 aa  134  3e-30  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.172958  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0488  solute-binding family 5 protein  23.51 
 
 
566 aa  134  3.9999999999999996e-30  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.189151  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0368  extracellular solute-binding protein  23.51 
 
 
566 aa  134  5e-30  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0515  extracellular solute-binding protein, family 5  28.96 
 
 
566 aa  134  6e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000690  ABC-type uncharacterized transport system component  28.32 
 
 
555 aa  133  6.999999999999999e-30  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00397  predicted transporter subunit: periplasmic-binding component of ABC superfamily  23.51 
 
 
566 aa  132  1.0000000000000001e-29  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00401  hypothetical protein  23.51 
 
 
566 aa  132  1.0000000000000001e-29  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05812  hypothetical protein  29.25 
 
 
568 aa  133  1.0000000000000001e-29  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3187  extracellular solute-binding protein  23.51 
 
 
566 aa  132  1.0000000000000001e-29  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0538168 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0616  transcriptional regulator SgrR  25.36 
 
 
551 aa  130  7.000000000000001e-29  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0296144 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0912  extracellular solute-binding protein  28.94 
 
 
566 aa  129  1.0000000000000001e-28  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0653  putative extracellular solute-binding protein  23.83 
 
 
569 aa  128  3e-28  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3164  extracellular solute-binding protein family 5  27.94 
 
 
566 aa  126  1e-27  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000178  SgrR sugar-phosphate stress transcriptional activator of SgrS small RNA  29.25 
 
 
569 aa  126  1e-27  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.976786  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4249  HTH-type transcriptional regulator SgrR  28.8 
 
 
596 aa  120  7e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4191  HTH-type transcriptional regulator SgrR  28.8 
 
 
596 aa  119  9.999999999999999e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.415119  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4069  HTH-type transcriptional regulator SgrR  28.8 
 
 
596 aa  119  9.999999999999999e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4085  HTH-type transcriptional regulator SgrR  28.8 
 
 
596 aa  119  9.999999999999999e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4141  HTH-type transcriptional regulator SgrR  28.48 
 
 
596 aa  116  1.0000000000000001e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.898899  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3226  extracellular solute-binding protein  27.27 
 
 
567 aa  115  2.0000000000000002e-24  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001411  putative transport protein  25.41 
 
 
585 aa  115  2.0000000000000002e-24  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3045  hypothetical protein  27.27 
 
 
567 aa  115  2.0000000000000002e-24  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1253  hypothetical protein  22.38 
 
 
637 aa  111  3e-23  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00065566  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3084  putative ABC transporter, periplasmic binding protein  26.87 
 
 
567 aa  111  3e-23  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0617058  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0009  extracellular solute-binding protein family 5  23.61 
 
 
544 aa  110  9.000000000000001e-23  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.327799  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02700  hypothetical protein  28.33 
 
 
345 aa  109  2e-22  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0008  extracellular solute-binding protein family 5  22.65 
 
 
544 aa  107  4e-22  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00260142  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2933  putative dipeptide/oligopeptide/nickel ABC-type transport system periplasmic component  23.1 
 
 
559 aa  107  6e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000000113765 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2760  extracellular solute-binding protein  23.73 
 
 
544 aa  105  2e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2498  extracellular solute-binding protein  23.22 
 
 
547 aa  105  2e-21  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.228611  normal  0.10844 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0431  extracellular solute-binding protein  27.93 
 
 
522 aa  104  4e-21  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0263  extracellular solute-binding protein family 5  25.29 
 
 
516 aa  104  5e-21  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0801202  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1103  extracellular solute-binding protein  24.91 
 
 
575 aa  103  8e-21  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000365076 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2650  acetate kinase  22.76 
 
 
541 aa  102  2e-20  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.76691 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3863  extracellular solute-binding protein family 5  23.98 
 
 
523 aa  101  3e-20  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00142419 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0310  extracellular solute-binding protein family 5  25.29 
 
 
512 aa  102  3e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.630415  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1805  peptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein  22.55 
 
 
525 aa  100  8e-20  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0479  4-phytase  25.53 
 
 
535 aa  99.8  1e-19  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0187568  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1135  4-phytase  25.89 
 
 
520 aa  99.8  1e-19  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00134056  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2484  extracellular solute-binding protein  22.56 
 
 
541 aa  99.4  2e-19  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.0213722 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0858  4-phytase  25.65 
 
 
524 aa  98.6  3e-19  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.557115  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2547  extracellular solute-binding protein  24.56 
 
 
534 aa  98.6  3e-19  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.220611  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2552  extracellular solute-binding protein  22.24 
 
 
541 aa  98.6  3e-19  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.0329561 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5671  extracellular solute-binding protein  25.61 
 
 
531 aa  98.6  3e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.880059  normal  0.0905991 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2482  extracellular solute-binding protein  24.17 
 
 
582 aa  98.2  4e-19  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0259131  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0484  extracellular solute-binding protein  22.66 
 
 
523 aa  98.2  4e-19  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.036637  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1982  extracellular solute-binding protein  23.32 
 
 
508 aa  97.4  5e-19  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.204968  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2226  extracellular solute-binding protein family 5  25.85 
 
 
507 aa  97.8  5e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0969064 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1615  extracellular solute-binding protein  22.7 
 
 
541 aa  97.8  5e-19  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.577375  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2686  extracellular solute-binding protein  23.4 
 
 
528 aa  97.4  6e-19  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  decreased coverage  0.0000382125  normal  0.980281 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0161  extracellular solute-binding protein family 5  22.76 
 
 
505 aa  97.4  7e-19  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2957  4-phytase  23.38 
 
 
520 aa  97.1  8e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>