More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BCE_0399 on replicon NC_003909
Organism: Bacillus cereus ATCC 10987



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_003909  BCE_0399  ClpP protease family protein  100 
 
 
229 aa  466  1.0000000000000001e-131  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2835  peptidase S14 ClpP  99.56 
 
 
229 aa  465  9.999999999999999e-131  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1629  peptidase S14, ClpP  71.67 
 
 
242 aa  318  5e-86  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1086  ATP-dependent Clp protease, proteolytic subunit ClpP, putative  64.17 
 
 
242 aa  305  3e-82  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1253  peptidase S14, ClpP  68.26 
 
 
226 aa  296  2e-79  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1484  protease subunit of ATP-dependent Clp protease  53.28 
 
 
223 aa  218  8.999999999999998e-56  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1720  peptidase S14, ClpP  47 
 
 
247 aa  186  3e-46  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0626  peptidase S14 ClpP  53.67 
 
 
244 aa  177  1e-43  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1115  peptidase S14, ClpP  43.41 
 
 
243 aa  147  2.0000000000000003e-34  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1633  peptidase S14 ClpP  41.3 
 
 
287 aa  139  3.9999999999999997e-32  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2501  peptidase S14 ClpP  45.1 
 
 
280 aa  132  6e-30  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0232282  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0643  peptidase S14, ClpP  42.39 
 
 
282 aa  130  2.0000000000000002e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1874  peptidase S14, ClpP  36.32 
 
 
361 aa  129  4.0000000000000003e-29  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008265  CPR_C0013  putative endopeptidase  49.23 
 
 
243 aa  126  2.0000000000000002e-28  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0361  peptidase S14, ClpP  43.79 
 
 
280 aa  125  6e-28  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0990  peptidase S14, ClpP  43.79 
 
 
280 aa  125  6e-28  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4353  peptidase S14 ClpP  38.15 
 
 
620 aa  122  6e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.26326  hitchhiker  0.00986992 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2700  phage protein  45.1 
 
 
260 aa  122  7e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.946322 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1646  protease subunit of ATP-dependent Clp protease  40.66 
 
 
229 aa  121  8e-27  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2593  peptidase S14 ClpP  40.96 
 
 
284 aa  120  1.9999999999999998e-26  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.315454 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3598  peptidase S14 ClpP  42.04 
 
 
640 aa  119  4.9999999999999996e-26  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0756  peptidase S14 ClpP  42.04 
 
 
671 aa  119  4.9999999999999996e-26  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0787  peptidase S14 ClpP  42.04 
 
 
668 aa  119  4.9999999999999996e-26  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.0494258 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0783  peptidase S14 ClpP  42.04 
 
 
669 aa  119  6e-26  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.364039 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2964  ClpP protease family protein  41.46 
 
 
284 aa  117  9.999999999999999e-26  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2473  peptidase S14 ClpP  40.54 
 
 
227 aa  116  3e-25  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.631102  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1061  peptidase S14, ClpP  36.52 
 
 
257 aa  116  3e-25  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1081  peptidase S14 ClpP  36.52 
 
 
257 aa  116  3e-25  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.631599  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7330  peptidase S14 ClpP  34.25 
 
 
237 aa  115  6e-25  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.307077  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1046  ClpP protease  41.61 
 
 
280 aa  115  6e-25  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.304732  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3866  peptidase S14 ClpP  42.95 
 
 
280 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00220297 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1543  peptidase S14, ClpP  37.02 
 
 
281 aa  112  3e-24  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3134  putative phage portal protein, lambda family  42.41 
 
 
1156 aa  112  4.0000000000000004e-24  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000244044 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3202  Clp protease domain protein  42.41 
 
 
651 aa  112  4.0000000000000004e-24  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.790281  hitchhiker  0.00227439 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1864  Clp protease domain protein  42.41 
 
 
651 aa  112  4.0000000000000004e-24  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00657309 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0900  Clp protease domain protein  41.77 
 
 
652 aa  111  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2190  peptidase S14, ClpP  44.7 
 
 
688 aa  109  3e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000592191 
 
 
-
 
NC_009829  Spro_4920  peptidase S14 ClpP  46.39 
 
 
365 aa  108  5e-23  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.558143 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2057  peptidase S14 ClpP  37.76 
 
 
245 aa  108  7.000000000000001e-23  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2021  peptidase S14, ClpP  37.76 
 
 
245 aa  108  7.000000000000001e-23  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1205  peptidase S14, ClpP  44.44 
 
 
300 aa  107  1e-22  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0522889  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3971  peptidase S14, ClpP  32.83 
 
 
216 aa  107  2e-22  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.269828 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4464  ClpP protease  44.44 
 
 
282 aa  107  2e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000555404 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2605  peptidase S14, ClpP  35 
 
 
258 aa  106  3e-22  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0586  Clp protease  36.36 
 
 
247 aa  105  7e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0695  ATP-dependent protease  40.13 
 
 
689 aa  104  1e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.265261  hitchhiker  0.00014029 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3045  ClpP protease, putative  38.99 
 
 
387 aa  102  5e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0206351  normal  0.193198 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1143  ATP-dependent protease  37.09 
 
 
683 aa  102  5e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1071  ATP-dependent protease  37.09 
 
 
684 aa  102  7e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.146018  hitchhiker  0.00123703 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1408  ATP-dependent protease  37.09 
 
 
684 aa  102  7e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.104115  hitchhiker  0.000644227 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3409  ATP-dependent Clp protease, proteolytic subunit ClpP  36.46 
 
 
381 aa  101  1e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.702089  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2239  prophage LambdaBa02, Clp protease family protein  32.5 
 
 
251 aa  100  2e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00816781  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3804  prophage LambdaBa02, Clp protease family protein  35.12 
 
 
251 aa  99  5e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4092  prophage LambdaBa02, Clp protease family protein  35.12 
 
 
251 aa  99  5e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4003  Clp protease  31.51 
 
 
230 aa  98.6  6e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2623  Clp protease  37.13 
 
 
197 aa  98.2  9e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1198  peptidase S14 ClpP  37.2 
 
 
383 aa  96.7  3e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.0124862 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03500  peptidase S14 ClpP  32.16 
 
 
234 aa  96.3  3e-19  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2068  putative ClpP-like protease  38.1 
 
 
279 aa  96.3  4e-19  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.254217  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6185  ClpP-type protease  38.69 
 
 
284 aa  95.5  7e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.141561  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3317  peptidase S14, ClpP  37.57 
 
 
279 aa  95.1  8e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.13528 
 
 
-
 
NC_014149  Plim_4252  peptidase S14 ClpP  37.01 
 
 
179 aa  94.4  1e-18  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3590  peptidase S14 ClpP  30.22 
 
 
247 aa  92.4  6e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.226439  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1378  Clp protease  32.45 
 
 
247 aa  92  7e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00455608 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3437  peptidase S14 ClpP  33.99 
 
 
345 aa  90.1  2e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6597  putative peptidase S14, ClpP  38.75 
 
 
684 aa  89.4  4e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0660  Clp protease  34.3 
 
 
248 aa  89.4  4e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2389  peptidase S14, ClpP  35.8 
 
 
351 aa  89  6e-17  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.142476  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2853  peptidase S14 ClpP  38.19 
 
 
564 aa  87.4  2e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.12086  normal  0.0147966 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2253  peptidase S14, ClpP  38.04 
 
 
674 aa  85.9  4e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0288659 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0961  peptidase S14, ClpP  41.54 
 
 
641 aa  84.3  0.000000000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.019957  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1678  peptidase S14, ClpP  32.12 
 
 
656 aa  84  0.000000000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3249  peptidase S14, ClpP  31.53 
 
 
667 aa  82.8  0.000000000000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0715  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  32.16 
 
 
196 aa  80.9  0.00000000000002  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1304  peptidase S14 ClpP  32 
 
 
260 aa  77.4  0.0000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2808  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit ClpP  28.14 
 
 
208 aa  76.6  0.0000000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0596044  normal  0.977221 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3499  endopeptidase Clp  29.17 
 
 
213 aa  75.1  0.0000000000008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0591598  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3878  endopeptidase Clp  30.21 
 
 
213 aa  73.6  0.000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.182477  hitchhiker  0.00149389 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2194  ClpP1 peptidase. Serine peptidase. MEROPS family S14  33.33 
 
 
203 aa  72.8  0.000000000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011683  PHATRDRAFT_14387  predicted protein  27.54 
 
 
214 aa  72.4  0.000000000006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.209543  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0418  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  33.55 
 
 
222 aa  71.2  0.00000000001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.169971 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2913  Endopeptidase Clp  28 
 
 
215 aa  70.9  0.00000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1180  hypothetical protein  35.07 
 
 
224 aa  70.5  0.00000000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.222987 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1696  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  27.93 
 
 
210 aa  70.1  0.00000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.82204  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1338  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit ClpP  26.16 
 
 
211 aa  70.1  0.00000000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.114529  normal  0.132142 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1051  Endopeptidase Clp  26.74 
 
 
218 aa  69.7  0.00000000003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0321666  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0917  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  27.98 
 
 
211 aa  69.7  0.00000000004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3324  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  26.79 
 
 
212 aa  68.9  0.00000000005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.09384 
 
 
-
 
NC_002978  WD0319  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  33.83 
 
 
208 aa  69.3  0.00000000005  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5374  ATP-dependent Clp protease, proteolytic subunit ClpP  28.57 
 
 
193 aa  68.9  0.00000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2184  endopeptidase Clp  28.92 
 
 
217 aa  68.6  0.00000000007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.604475  normal  0.932772 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2388  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  28.34 
 
 
200 aa  67.8  0.0000000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0202  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  31.55 
 
 
200 aa  68.2  0.0000000001  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.211478  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0934  ATP-dependent Clp protease, proteolytic subunit ClpP  29.76 
 
 
209 aa  67  0.0000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.593149  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0901  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  30.95 
 
 
199 aa  67.4  0.0000000002  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1851  Endopeptidase Clp  31.82 
 
 
229 aa  67.4  0.0000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0126573  normal  0.0136032 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1265  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  26.7 
 
 
209 aa  67.4  0.0000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0203  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  33.33 
 
 
193 aa  66.6  0.0000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2206  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  27.54 
 
 
230 aa  66.6  0.0000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5270  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  33.33 
 
 
193 aa  66.6  0.0000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.491278  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>