More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BCE_0133 on replicon NC_003909
Organism: Bacillus cereus ATCC 10987



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_003909  BCE_0133  translation initiation factor IF-1  100 
 
 
72 aa  147  4e-35  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000000119555  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0133  translation initiation factor IF-1  100 
 
 
72 aa  147  4e-35  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.000000000000219097  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0129  translation initiation factor IF-1  100 
 
 
72 aa  147  4e-35  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  3.6060100000000006e-24  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0127  translation initiation factor IF-1  100 
 
 
72 aa  147  4e-35  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.0000000000000150239  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0128  translation initiation factor IF-1  100 
 
 
72 aa  147  4e-35  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000000687625  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0154  translation initiation factor IF-1  100 
 
 
72 aa  147  4e-35  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.00000709815  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0133  translation initiation factor IF-1  100 
 
 
72 aa  147  4e-35  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.0000000000000769266  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0164  translation initiation factor IF-1  100 
 
 
72 aa  147  4e-35  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000048346  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0146  translation initiation factor IF-1  100 
 
 
72 aa  147  4e-35  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  1.72927e-62 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5172  translation initiation factor IF-1  100 
 
 
72 aa  147  4e-35  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.0000000000623661  unclonable  4.6789e-26 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0127  translation initiation factor IF-1  100 
 
 
72 aa  147  4e-35  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000431634  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0134  translation initiation factor IF-1  91.67 
 
 
72 aa  139  1.9999999999999998e-32  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000106677  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0130  translation initiation factor IF-1  90.28 
 
 
72 aa  138  3e-32  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2296  translation initiation factor IF-1  87.5 
 
 
72 aa  135  2e-31  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1809  translation initiation factor IF-1  87.5 
 
 
72 aa  135  2e-31  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.23928  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2255  translation initiation factor IF-1  87.5 
 
 
72 aa  135  2e-31  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0195898  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0782  translation initiation factor IF-1  86.11 
 
 
72 aa  133  9e-31  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00000000198783  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2688  translation initiation factor IF-1  86.11 
 
 
72 aa  132  1.9999999999999998e-30  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00223234  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2436  translation initiation factor 1  86.11 
 
 
72 aa  130  5e-30  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0238  translation initiation factor IF-1  86.11 
 
 
72 aa  130  5e-30  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.197943  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1578  translation initiation factor IF-1  84.72 
 
 
73 aa  130  5e-30  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  decreased coverage  0.0000164388  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0445  translation initiation factor IF-1  86.11 
 
 
72 aa  128  2.0000000000000002e-29  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.25567  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2927  translation initiation factor IF-1  83.33 
 
 
72 aa  128  2.0000000000000002e-29  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000377018  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2309  translation initiation factor IF-1  83.33 
 
 
72 aa  129  2.0000000000000002e-29  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00000804366  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0218  translation initiation factor 1 (bIF-1)  81.94 
 
 
85 aa  128  2.0000000000000002e-29  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2809  translation initiation factor IF-1  81.94 
 
 
72 aa  128  3e-29  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.0000000371749  hitchhiker  0.00000000419913 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0890  translation initiation factor IF-1  81.94 
 
 
72 aa  127  5.0000000000000004e-29  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000000152368  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19760  translation initiation factor 1  81.94 
 
 
72 aa  127  5.0000000000000004e-29  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00431201  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2690  translation initiation factor IF-1  79.17 
 
 
72 aa  127  6e-29  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2375  translation initiation factor IF-1  79.17 
 
 
72 aa  127  6e-29  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0312  translation initiation factor IF-1  81.69 
 
 
83 aa  125  1.0000000000000001e-28  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000120042  unclonable  9.19989e-29 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1501  translation initiation factor IF-1  83.33 
 
 
72 aa  126  1.0000000000000001e-28  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2379  translation initiation factor IF-1  81.94 
 
 
72 aa  125  2.0000000000000002e-28  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.0001894  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01400  translation initiation factor 1  80.56 
 
 
72 aa  125  3e-28  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0644583  normal  0.998737 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01400  translation initiation factor IF-1  80.56 
 
 
75 aa  125  3e-28  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000118167  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0729  translation initiation factor IF-1  81.94 
 
 
72 aa  125  3e-28  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000728141  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1837  translation initiation factor IF-1  80.56 
 
 
72 aa  124  4.0000000000000003e-28  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000118565  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1750  translation initiation factor IF-1  80.56 
 
 
72 aa  124  5e-28  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  decreased coverage  0.000829048  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2132  translation initiation factor 1  77.78 
 
 
73 aa  124  5e-28  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0444568  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0309  translation initiation factor IF-1  80.56 
 
 
72 aa  122  2e-27  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.776821  normal  0.33267 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0080  translation initiation factor IF-1  79.17 
 
 
72 aa  122  2e-27  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.0000359666  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0738  translation initiation factor IF-1  80 
 
 
73 aa  122  2e-27  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0248  translation initiation factor IF-1  82.86 
 
 
73 aa  122  2e-27  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000341025  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1722  translation initiation factor IF-1  76.39 
 
 
72 aa  122  2e-27  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000000935268  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1885  translation initiation factor IF-1  79.17 
 
 
72 aa  122  2e-27  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.00000000423872  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3769  translation initiation factor IF-1  79.17 
 
 
72 aa  121  3e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00277571  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1461  translation initiation factor IF-1  79.17 
 
 
72 aa  121  3e-27  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.00000000000000527108  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0217  translation initiation factor IF-1  81.16 
 
 
71 aa  121  3e-27  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.425198  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1160  translation initiation factor IF-1  75 
 
 
72 aa  120  5e-27  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000283848  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0336  translation initiation factor IF-1  75 
 
 
72 aa  120  5e-27  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2146  translation initiation factor IF-1  77.78 
 
 
72 aa  120  6e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000135511  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3644  translation initiation factor IF-1  75 
 
 
72 aa  120  9e-27  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000000405996  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2056  translation initiation factor IF-1  77.78 
 
 
72 aa  119  9.999999999999999e-27  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2160  translation initiation factor IF-1  77.78 
 
 
72 aa  119  9.999999999999999e-27  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1857  translation initiation factor IF-1  75 
 
 
72 aa  119  9.999999999999999e-27  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0737608  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1912  translation initiation factor IF-1  76.39 
 
 
72 aa  119  9.999999999999999e-27  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.000000211647  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2042  translation initiation factor IF-1  76.39 
 
 
72 aa  119  9.999999999999999e-27  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000000556493  normal  0.276902 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3972  translation initiation factor IF-1  73.61 
 
 
72 aa  119  9.999999999999999e-27  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1138  translation initiation factor IF-1  76.39 
 
 
72 aa  119  9.999999999999999e-27  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.00000117845  normal  0.0449626 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1762  translation initiation factor IF-1  76.39 
 
 
72 aa  119  9.999999999999999e-27  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00307993  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3296  translation initiation factor IF-1  73.61 
 
 
72 aa  119  1.9999999999999998e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5148  translation initiation factor IF-1  75.71 
 
 
73 aa  118  1.9999999999999998e-26  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.594538 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1729  translation initiation factor IF-1  75 
 
 
72 aa  118  3e-26  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.616662  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0329  translation initiation factor 1  75.71 
 
 
73 aa  118  3e-26  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.208578  decreased coverage  0.000347298 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0232  translation initiation factor IF-1  72.22 
 
 
75 aa  117  3.9999999999999996e-26  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0229  translation initiation factor IF-1  72.22 
 
 
75 aa  117  3.9999999999999996e-26  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00409892  normal  0.0798851 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02359  translation initiation factor IF-1  73.61 
 
 
72 aa  117  3.9999999999999996e-26  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.000000147738  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2132  translation initiation factor IF-1  76.39 
 
 
72 aa  117  3.9999999999999996e-26  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0718  translation initiation factor 1  72.22 
 
 
87 aa  117  3.9999999999999996e-26  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1762  translation initiation factor IF-1  70.83 
 
 
72 aa  117  4.9999999999999996e-26  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1578  translation initiation factor IF-1  70.83 
 
 
72 aa  117  4.9999999999999996e-26  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3276  translation initiation factor IF-1  73.61 
 
 
72 aa  117  4.9999999999999996e-26  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000759571 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0588  translation initiation factor IF-1  72.86 
 
 
73 aa  117  4.9999999999999996e-26  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.50343  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2373  translation initiation factor IF-1  72.22 
 
 
72 aa  117  4.9999999999999996e-26  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.00000287842  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1944  translation initiation factor IF-1  70.83 
 
 
72 aa  117  4.9999999999999996e-26  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.25939  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2274  translation initiation factor IF-1  75 
 
 
72 aa  117  6e-26  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00199811  hitchhiker  0.00298742 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1249  translation initiation factor IF-1  76.39 
 
 
72 aa  117  6e-26  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  decreased coverage  0.000018307  normal  0.0943393 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3002  translation initiation factor IF-1  75.71 
 
 
73 aa  117  6e-26  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.275871  hitchhiker  0.00604316 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0071  translation initiation factor IF-1  72.22 
 
 
72 aa  117  7e-26  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.358943  hitchhiker  0.000000000845588 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1163  translation initiation factor IF-1  75.71 
 
 
73 aa  117  7e-26  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000296746  normal  0.0905518 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01568  translation initiation factor IF-1  72.22 
 
 
72 aa  117  7e-26  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1338  translation initiation factor IF-1  72.22 
 
 
72 aa  117  7e-26  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0544501  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4004  translation initiation factor IF-1  75.71 
 
 
73 aa  117  7e-26  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.0000265509  hitchhiker  0.000014317 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003955  translation initiation factor 1  72.22 
 
 
72 aa  117  7e-26  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.0000363825  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2622  translation initiation factor IF-1  74.29 
 
 
73 aa  116  7.999999999999999e-26  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.378683  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0705  translation initiation factor IF-1  70.83 
 
 
72 aa  116  7.999999999999999e-26  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2949  translation initiation factor IF-1  75 
 
 
72 aa  116  7.999999999999999e-26  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0348  translation initiation factor IF-1  72.22 
 
 
72 aa  116  9e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.101425 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3783  translation initiation factor IF-1  72.22 
 
 
72 aa  116  9e-26  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.752054  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3725  translation initiation factor IF-1  72.22 
 
 
72 aa  116  9e-26  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0238444  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3755  translation initiation factor IF-1  72.22 
 
 
72 aa  116  9e-26  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0935334  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3468  translation initiation factor IF-1  72.22 
 
 
72 aa  116  9e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.623681  normal  0.410728 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0297  translation initiation factor IF-1  72.22 
 
 
72 aa  116  9e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00110331  normal  0.109612 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3047  translation initiation factor IF-1  72.22 
 
 
72 aa  116  9e-26  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.119475  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0335  translation initiation factor IF-1  72.22 
 
 
72 aa  116  9e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.170612  normal  0.0103305 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0288  translation initiation factor IF-1  72.22 
 
 
72 aa  116  9e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.460296  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2818  translation initiation factor IF-1  72.22 
 
 
72 aa  116  9e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.196542  normal  0.235424 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0369  translation initiation factor IF-1  72.22 
 
 
72 aa  116  9e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0502306  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2055  translation initiation factor IF-1  70.83 
 
 
72 aa  116  9e-26  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00014827  normal  0.33014 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0270  translation initiation factor IF-1  72.22 
 
 
72 aa  116  9e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.712061  normal  0.0408075 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>