43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BCE_0079 on replicon NC_003909
Organism: Bacillus cereus ATCC 10987



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_003909  BCE_0079  hypothetical protein  100 
 
 
182 aa  376  1e-104  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.148772  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0075  nucleotide excision repair protein  98.35 
 
 
182 aa  372  1e-102  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.452997  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0089  hypothetical protein  98.35 
 
 
182 aa  372  1e-102  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.84577e-49 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0078  hypothetical protein  97.8 
 
 
182 aa  370  1e-102  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0792443  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0079  hypothetical protein  97.8 
 
 
182 aa  370  1e-102  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0076  UvrB/UvrC protein  97.8 
 
 
182 aa  369  1e-101  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.247563  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0109  hypothetical protein  97.25 
 
 
182 aa  365  1e-100  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  4.54963e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5226  hypothetical protein  94.51 
 
 
182 aa  356  1e-97  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  1.28201e-06  hitchhiker  4.7433e-20 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0100  hypothetical protein  91.76 
 
 
182 aa  349  1e-95  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00596962  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0074  UvrB/UvrC protein  90.66 
 
 
182 aa  341  3e-93  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.525038  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0074  UvrB/UvrC protein  73.63 
 
 
182 aa  293  6e-79  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0417571  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0081  UvrB/UvrC protein  54.95 
 
 
182 aa  204  6e-52  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00231542  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0077  UvrB/UvrC protein  50.55 
 
 
182 aa  179  1e-44  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0144  UvrB/UvrC protein  47.46 
 
 
175 aa  168  4e-41  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0833  UvrB/UvrC protein  46.37 
 
 
171 aa  162  2e-39  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  4.20974e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1827  UvrB/UvrC protein  45.76 
 
 
170 aa  155  4e-37  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  2.80692e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0160  UvrB/UvrC protein  41.14 
 
 
169 aa  146  1e-34  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2742  UvrB/UvrC protein  42.94 
 
 
173 aa  140  1e-32  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00850  UvrB/UvrC protein  41.48 
 
 
170 aa  134  7e-31  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.038021  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0325  UvrB/UvrC protein  37.21 
 
 
162 aa  132  3e-30  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00358864  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1791  UvrB/UvrC protein  40.12 
 
 
168 aa  131  4e-30  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.261454  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1950  UvrB/UvrC protein  38.51 
 
 
177 aa  129  2e-29  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0127215  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0178  UvrB/UvrC protein  39.33 
 
 
170 aa  125  3e-28  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0179  UvrB/UvrC protein  38.42 
 
 
167 aa  125  3e-28  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0253  UvrB/UvrC protein  40.11 
 
 
174 aa  124  7e-28  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.552848 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0387  UvrB/UvrC protein  35.8 
 
 
165 aa  119  2e-26  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  8.14074e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2369  hypothetical protein  39.53 
 
 
169 aa  115  3e-25  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  5.15373e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3463  UvrB/UvrC protein  36.36 
 
 
173 aa  102  2e-21  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  1.25325e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2676  UvrB/UvrC protein  32.58 
 
 
170 aa  102  3e-21  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.712915  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0559  hypothetical protein  32.97 
 
 
188 aa  101  5e-21  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0545  hypothetical protein  32.97 
 
 
188 aa  101  5e-21  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0163  UvrB/UvrC domain-containing protein  28.96 
 
 
192 aa  89.4  3e-17  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0762  UvrB/UvrC protein  31.79 
 
 
173 aa  85.1  4e-16  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0331206  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0057  UvrB/UvrC protein  29.59 
 
 
178 aa  82.8  3e-15  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  decreased coverage  0.00323429  normal  0.240627 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1404  UvrB/UvrC protein  31.03 
 
 
159 aa  71.6  6e-12  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1482  UvrB/UvrC protein  25.42 
 
 
145 aa  61.2  7e-09  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.051637  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1084  Uncharacterized protein with conserved CXXC pairs-like protein  25.14 
 
 
182 aa  56.2  3e-07  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.944063  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2439  hypothetical protein  26.55 
 
 
175 aa  54.3  9e-07  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2753  hypothetical protein  26.55 
 
 
178 aa  54.3  1e-06  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.105534  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0047  hypothetical protein  26.92 
 
 
177 aa  52.8  3e-06  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.0283317  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2038  UVR domain-containing protein  24.16 
 
 
165 aa  52.8  3e-06  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0648  ATP-dependent Clp protease  34.38 
 
 
752 aa  43.5  0.002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0578  ATP-binding subunit of Clp protease and DnaK/DnaJ chaperones  31.88 
 
 
748 aa  42.4  0.003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>