More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BCE_0073 on replicon NC_003909
Organism: Bacillus cereus ATCC 10987



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_003909  BCE_0073  DNA-binding protein  100 
 
 
67 aa  134  3e-31  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0070  transcriptional regulator  100 
 
 
67 aa  134  3e-31  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0070  transcriptional regulator  100 
 
 
67 aa  134  3e-31  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0086  DNA-binding protein  100 
 
 
67 aa  134  3e-31  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.786766  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0074  DNA-binding protein  100 
 
 
67 aa  134  3e-31  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0083  DNA-binding protein  100 
 
 
67 aa  134  3e-31  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.40854e-08 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0074  DNA-binding protein  100 
 
 
67 aa  134  3e-31  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5234  DNA-binding protein  98.51 
 
 
67 aa  133  9e-31  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  3.02998e-06 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0070  XRE family transcriptional regulator  97.01 
 
 
67 aa  132  2e-30  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0082  DNA-binding protein  97.01 
 
 
67 aa  131  4e-30  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.815457  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0072  transcriptional regulator, XRE family  69.7 
 
 
73 aa  101  4e-21  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0075  transcriptional regulator, XRE family  71.21 
 
 
73 aa  101  4e-21  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0070  XRE family transcriptional regulator  90.38 
 
 
52 aa  98.6  3e-20  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0207  transcriptional regulator, XRE family  48.39 
 
 
106 aa  66.6  1e-10  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  4.25004e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2142  XRE family transcriptional regulator  48.33 
 
 
175 aa  58.5  3e-08  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4210  XRE family transcriptional regulator  39.68 
 
 
106 aa  53.5  9e-07  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.0378977 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_67  hypothetical protein  42.62 
 
 
72 aa  53.5  1e-06  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1555  DNA-binding protein  40.98 
 
 
72 aa  52  3e-06  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  2.36293e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1349  XRE family transcriptional regulator  39.68 
 
 
97 aa  50.8  5e-06  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0058  transcriptional regulator, XRE family  36.67 
 
 
112 aa  51.2  5e-06  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0711688  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1827  XRE family transcriptional regulator  41.67 
 
 
252 aa  50.4  7e-06  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0400601  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3248  transcriptional regulator, XRE family  41.38 
 
 
110 aa  50.4  8e-06  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2281  XRE family transcriptional regulator  37.5 
 
 
74 aa  49.7  1e-05  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.048354  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1153  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  40 
 
 
1143 aa  48.9  2e-05  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.648529  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2981  helix-turn-helix domain-containing protein  38.98 
 
 
387 aa  48.9  2e-05  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1971  XRE family transcriptional regulator  35.94 
 
 
112 aa  49.3  2e-05  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.910423 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4237  transcriptional regulator, XRE family  41.27 
 
 
140 aa  49.3  2e-05  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.55821  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2401  XRE family transcriptional regulator  36.51 
 
 
97 aa  49.3  2e-05  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  2.42769e-07  hitchhiker  2.23583e-05 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0712  transcriptional regulator, XRE family  40.68 
 
 
504 aa  48.9  2e-05  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2077  transcriptional regulator, XRE family  39.66 
 
 
81 aa  48.1  3e-05  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0889  XRE family transcriptional regulator  39.68 
 
 
81 aa  48.5  3e-05  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20950  putative prophage repressor  38.71 
 
 
200 aa  48.5  3e-05  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  5.78065e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1992  transcriptional regulator, XRE family  39.66 
 
 
81 aa  48.1  3e-05  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0299  XRE family transcriptional regulator  41.94 
 
 
71 aa  48.5  3e-05  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  2.89962e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3050  transcriptional regulator, XRE family  37.29 
 
 
195 aa  48.1  3e-05  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0215158  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0101  XRE family transcriptional regulator  41.94 
 
 
71 aa  48.5  3e-05  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  3.91644e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0623  transcriptional regulator, putative  37.1 
 
 
302 aa  48.1  3e-05  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.0864444  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1868  XRE family transcriptional regulator  39.66 
 
 
81 aa  48.5  3e-05  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2028  transcriptional regulator, XRE family  37.29 
 
 
194 aa  48.1  4e-05  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.165285  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1135  XRE family transcriptional regulator  34.92 
 
 
99 aa  48.1  4e-05  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0684  XRE family transcriptional regulator  38.1 
 
 
101 aa  47.8  5e-05  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0300399  normal  0.200777 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3407  transcriptional regulator, XRE family  38.98 
 
 
192 aa  47.8  5e-05  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3871  transcriptional regulator, XRE family  37.29 
 
 
72 aa  47.4  6e-05  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3920  transcriptional regulator, XRE family  37.29 
 
 
72 aa  47.4  6e-05  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  8.06628e-06  normal  0.211868 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4162  XRE family transcriptional regulator  34.92 
 
 
98 aa  47.4  6e-05  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010679  Bphyt_7274  transcriptional regulator, XRE family  35 
 
 
79 aa  47.4  7e-05  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.21577  normal  0.150525 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2793  transcriptional regulator, XRE family  33.85 
 
 
108 aa  47.4  7e-05  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  2.36555e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2248  transcriptional regulator, XRE family  35.59 
 
 
505 aa  47.4  7e-05  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.99928  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0903  helix-turn-helix domain-containing protein  40.68 
 
 
255 aa  47.4  8e-05  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  1.93278e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0255  transcriptional regulator, putative  38.71 
 
 
308 aa  47  8e-05  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1481  XRE family transcriptional regulator  34.92 
 
 
97 aa  47  9e-05  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.817787 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2116  hypothetical protein  37.1 
 
 
86 aa  47  9e-05  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0461  XRE family transcriptional regulator  34.92 
 
 
97 aa  47  9e-05  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.171408  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31160  hypothetical protein  36.51 
 
 
107 aa  46.6  0.0001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  1.26154e-15  unclonable  8.75499e-23 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3463  XRE family transcriptional regulator  35 
 
 
97 aa  46.6  0.0001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5338  transcriptional regulator, XRE family  38.98 
 
 
503 aa  46.2  0.0001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.81894 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4036  transcriptional regulator, XRE family  43.86 
 
 
84 aa  46.6  0.0001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.610056  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3530  transcriptional regulator, XRE family  36.51 
 
 
97 aa  47  0.0001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.606022  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1725  transcriptional regulator, XRE family  36.07 
 
 
145 aa  46.2  0.0001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0622  transcriptional regulator, putative  38.1 
 
 
303 aa  46.6  0.0001  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.436499  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3536  helix-turn-helix domain protein  36.92 
 
 
513 aa  46.2  0.0001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.948286 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3324  Cro/CI family transcriptional regulator  35.59 
 
 
212 aa  46.6  0.0001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2433  transcriptional regulator, XRE family  33.85 
 
 
132 aa  45.8  0.0002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000213647 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0594  transcriptional regulator, XRE family  35.59 
 
 
117 aa  45.8  0.0002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4304  transcriptional regulator, XRE family  41.27 
 
 
131 aa  46.2  0.0002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.663644 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3652  XRE family transcriptional regulator  37.1 
 
 
196 aa  45.8  0.0002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00533728 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4208  XRE family transcriptional regulator  37.93 
 
 
129 aa  45.8  0.0002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.629555  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3404  cupin 2 domain-containing protein  35.59 
 
 
215 aa  45.8  0.0002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3227  transcriptional regulator  37.29 
 
 
201 aa  45.4  0.0002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.792428  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1668  transcriptional regulator, XRE family  42.59 
 
 
256 aa  46.2  0.0002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  2.31765e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1566  transcriptional regulator, XRE family  38.98 
 
 
202 aa  46.2  0.0002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.0862847 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3134  DNA-binding protein  41.67 
 
 
80 aa  45.8  0.0002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0931  transcriptional regulator, XRE family  35 
 
 
99 aa  45.1  0.0003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6629  putative Phage-related transcriptional regulator  40.74 
 
 
143 aa  45.1  0.0003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.275503 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0068  XRE family transcriptional regulator  30.3 
 
 
87 aa  45.1  0.0003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5158  transcriptional regulator, XRE family  41.38 
 
 
198 aa  45.4  0.0003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.503819  normal  0.690311 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1436  transcriptional regulator, XRE family  38.33 
 
 
83 aa  45.1  0.0003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.118358  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0893  XRE family transcriptional regulator  37.5 
 
 
110 aa  45.4  0.0003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  decreased coverage  0.00171565  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0584  transcriptional regulator  37.29 
 
 
495 aa  45.1  0.0003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1522  transcriptional regulator, XRE family  36.51 
 
 
68 aa  45.1  0.0003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.379498  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2436  XRE family transcriptional regulator  36.51 
 
 
68 aa  45.1  0.0003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.109963  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2380  DNA-binding protein  32.79 
 
 
186 aa  45.4  0.0003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.801132  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2434  transcriptional regulator, XRE family  38.98 
 
 
77 aa  45.1  0.0003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4781  transcriptional regulator, XRE family  36.92 
 
 
113 aa  45.1  0.0003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00061071  normal  0.699893 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1427  transcriptional regulator, XRE family  36.51 
 
 
68 aa  45.1  0.0003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0986  transcriptional regulator, XRE family  32.14 
 
 
130 aa  45.1  0.0003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1052  hypothetical protein  37.7 
 
 
84 aa  45.1  0.0003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2326  hypothetical protein  37.7 
 
 
87 aa  45.1  0.0003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2432  transcriptional regulator, XRE family  41.67 
 
 
73 aa  45.4  0.0003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00020915 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4788  transcriptional regulator, XRE family  36.92 
 
 
114 aa  44.7  0.0004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  2.00631e-08  normal  0.763075 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2174  XRE family transcriptional regulator  35 
 
 
99 aa  44.7  0.0004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.112097  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2406  hypothetical protein  35 
 
 
99 aa  44.7  0.0004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3368  DNA-binding protein  36.84 
 
 
67 aa  44.7  0.0004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00271776  n/a   
 
 
-
 
NC_013224  Dret_2524  transcriptional regulator, XRE family  37.7 
 
 
76 aa  44.7  0.0004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000972778  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2259  transcriptional regulator, XRE family  37.29 
 
 
255 aa  45.1  0.0004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00208232 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0941  transcriptional regulator, XRE family  37.93 
 
 
141 aa  44.7  0.0004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.551097  normal  0.0671843 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1444  helix-turn-helix domain-containing protein  36.51 
 
 
68 aa  45.1  0.0004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.557197  normal 
 
 
-
 
NC_004632  PSPTO_B0045  PbsX family transcriptional regulator  33.33 
 
 
117 aa  44.7  0.0004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.108741  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1889  transcriptional regulator, XRE family  39.66 
 
 
198 aa  44.3  0.0005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.717984  normal  0.734051 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0278  XRE family transcriptional regulator  40.68 
 
 
128 aa  44.7  0.0005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  6.72654e-05  normal  0.646275 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>