194 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BCE_0055 on replicon NC_003909
Organism: Bacillus cereus ATCC 10987



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011772  BCG9842_B5254  S4 domain protein  100 
 
 
91 aa  178  2e-44  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00238131  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0056  s4 domain-containing protein  100 
 
 
91 aa  178  2e-44  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00178771  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0055  S4 domain-containing protein  100 
 
 
91 aa  178  2e-44  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.28078  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0056  S4 domain-containing protein  100 
 
 
91 aa  178  2e-44  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0066  S4 domain protein  100 
 
 
91 aa  178  2e-44  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0453623  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0052  heat shock protein 15  100 
 
 
91 aa  178  2e-44  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000120975  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0052  heat shock protein 15  100 
 
 
91 aa  178  2e-44  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.69267  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0063  S4 domain protein  100 
 
 
91 aa  178  2e-44  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0062  S4 domain protein  100 
 
 
91 aa  178  2e-44  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.244767  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0052  RNA-binding S4 domain-containing protein  96.7 
 
 
91 aa  174  4e-43  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0052  RNA-binding S4 domain-containing protein  93.41 
 
 
91 aa  169  2e-41  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.052055  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0052  RNA-binding S4 domain protein  79.52 
 
 
93 aa  135  1e-31  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0054  RNA-binding S4 domain protein  77.91 
 
 
90 aa  135  2e-31  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0449701  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0144  S4 domain-containing protein  62.07 
 
 
87 aa  117  4e-26  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0400  ribosome-associated heat shock protein implicated in the recycling of the 50S subunit S4-like protein  67.9 
 
 
93 aa  116  1e-25  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0012  ribosome-associated heat shock protein implicated in the recycling of the 50S subunit S4-like protein  66.67 
 
 
89 aa  116  1e-25  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0541  RNA-binding S4 domain-containing protein  75 
 
 
87 aa  115  2e-25  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000262722  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0528  RNA-binding S4 domain-containing protein  75 
 
 
87 aa  115  2e-25  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  2.33006e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0008  S4 domain-containing protein  56.82 
 
 
91 aa  113  7e-25  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.340534  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0010  S4 domain-containing protein  56.82 
 
 
90 aa  111  3e-24  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0263  RNA-binding S4 domain-containing protein  67.9 
 
 
90 aa  110  6e-24  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0184  ribosome-associated heat shock protein implicated in the recycling of the 50S subunit S4-like protein  60.98 
 
 
86 aa  107  6e-23  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0187  RNA-binding S4 domain protein  55.42 
 
 
100 aa  100  6e-21  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0272  ribosome-associated heat shock protein implicated in the recycling of the 50S subunit S4-like protein  56.96 
 
 
91 aa  94.7  4e-19  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0084  hypothetical protein  53.16 
 
 
80 aa  90.5  7e-18  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0688  RNA-binding S4 domain-containing protein  56.79 
 
 
81 aa  89.7  1e-17  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0948167  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3084  RNA-binding S4 domain protein  53.85 
 
 
79 aa  88.2  3e-17  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000350444  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0134  RNA-binding S4 domain-containing protein  56.58 
 
 
79 aa  87.8  5e-17  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  1.11292e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0116  RNA-binding S4 domain-containing protein  53.16 
 
 
80 aa  87.4  6e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0649  RNA-binding S4 domain protein  46.84 
 
 
80 aa  85.9  2e-16  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  9.16676e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2658  RNA-binding S4  52.63 
 
 
79 aa  84.7  4e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  1.95193e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2801  S4 domain-containing protein  48.24 
 
 
86 aa  84.3  5e-16  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  unclonable  5.68506e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2487  S4 domain-containing protein  47.06 
 
 
86 aa  82  2e-15  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  unclonable  3.25164e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0220  RNA-binding S4 domain protein  50.62 
 
 
86 aa  81.6  4e-15  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.126994  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0076  RNA-binding S4 domain-containing protein  44.83 
 
 
88 aa  79.7  1e-14  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0086  RNA-binding S4  47.73 
 
 
89 aa  78.6  3e-14  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0510355  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0136  RNA-binding S4 domain protein  38.64 
 
 
90 aa  73.2  1e-12  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.170322  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0093  RNA-binding S4 domain protein  50.67 
 
 
82 aa  73.2  1e-12  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  4.15805e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1262  RNA-binding S4 domain protein  48.61 
 
 
83 aa  69.7  1e-11  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1221  RNA-binding S4 domain protein  39.77 
 
 
89 aa  67.4  6e-11  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  1.80321e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0620  RNA-binding S4 domain protein  41.98 
 
 
81 aa  65.1  3e-10  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.215008  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0164  S4 domain protein  51.67 
 
 
87 aa  64.3  6e-10  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0343  RNA-binding S4 domain protein  51.67 
 
 
87 aa  64.3  6e-10  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.343465  normal  0.703045 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1380  RNA-binding S4 domain-containing protein  45.78 
 
 
77 aa  63.5  8e-10  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.278565  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0965  RNA-binding S4 domain-containing protein  50 
 
 
79 aa  62.8  2e-09  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0753  S4 RNA-binding domain protein  43.94 
 
 
82 aa  62.8  2e-09  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2068  RNA-binding S4 domain protein  39.51 
 
 
81 aa  57.8  5e-08  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1066  S4 domain-containing protein  34.85 
 
 
81 aa  56.2  2e-07  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1468  RNA-binding S4  50 
 
 
146 aa  55.1  3e-07  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.369867  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1237  uroporphyrinogen decarboxylase  49.02 
 
 
81 aa  55.5  3e-07  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2075  RNA-binding S4 domain protein  42.86 
 
 
134 aa  54.7  4e-07  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.142935  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2419  RNA-binding S4 domain-containing protein  42.86 
 
 
139 aa  54.7  4e-07  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.676645  normal 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0768  S4 domain-containing protein  37.66 
 
 
81 aa  54.7  4e-07  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.515789  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1332  S4 domain-containing protein  37.66 
 
 
81 aa  54.7  4e-07  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05160  heat shock protein implicated in 50S component recycling (S4 paralogue)  35.96 
 
 
130 aa  54.3  5e-07  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0946751  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1639  RNA-binding S4 domain-containing protein  41.27 
 
 
141 aa  54.3  6e-07  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.290258 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0850  S4 domain-containing protein  47.06 
 
 
81 aa  53.9  8e-07  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.00127812  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1980  S4 domain-containing protein  47.06 
 
 
81 aa  53.9  8e-07  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0693  S4 domain-containing protein  36.36 
 
 
81 aa  53.5  9e-07  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0791  RNA-binding S4 domain protein  37.08 
 
 
133 aa  53.5  1e-06  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2515  RNA-binding S4 domain-containing protein  42.86 
 
 
149 aa  52.8  2e-06  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.165462  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3625  putative heat shock protein  37.66 
 
 
128 aa  51.6  3e-06  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.679676 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3813  ribosome-associated heat shock protein Hsp15  38.96 
 
 
133 aa  51.2  5e-06  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2048  RNA-binding S4 domain protein  30.77 
 
 
141 aa  50.8  6e-06  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2308  hypothetical protein  33.33 
 
 
127 aa  50.8  6e-06  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1002  RNA-binding S4  40.74 
 
 
131 aa  50.8  6e-06  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.320344 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0330  RNA-binding S4 domain protein  35.37 
 
 
135 aa  50.8  7e-06  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0496107 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0879  RNA-binding S4 domain protein  37.1 
 
 
128 aa  50.4  7e-06  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0019  RNA-binding S4 domain-containing protein  39.68 
 
 
138 aa  50.4  8e-06  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.329407  normal  0.209211 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2006  RNA-binding S4  46.15 
 
 
142 aa  50.4  8e-06  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.654471  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0119  RNA-binding S4  38.24 
 
 
132 aa  50.4  9e-06  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0359647  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4615  RNA-binding S4 domain-containing protein  37.78 
 
 
135 aa  50.1  9e-06  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3539  RNA-binding S4 domain-containing protein  38.46 
 
 
93 aa  50.1  1e-05  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.595425  normal  0.44689 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4208  RNA-binding S4 domain-containing protein  37.68 
 
 
132 aa  50.1  1e-05  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.513978  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0150  RNA-binding S4 domain protein  37.68 
 
 
132 aa  49.7  1e-05  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0950  heat shock RNA-binding protein  44.23 
 
 
146 aa  49.7  1e-05  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0147  RNA-binding S4 domain-containing protein  37.68 
 
 
132 aa  49.7  1e-05  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.834314  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0574  RNA-binding S4  37.88 
 
 
124 aa  49.7  1e-05  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  4.75662e-07  unclonable  2.09736e-08 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1038  RNA-binding S4  37.04 
 
 
131 aa  49.7  1e-05  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0151  RNA-binding S4 domain-containing protein  37.68 
 
 
132 aa  49.7  1e-05  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.245693 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2496  putative heat shock protein  50 
 
 
137 aa  50.1  1e-05  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.416109 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0717  RNA-binding S4 domain-containing protein  42.86 
 
 
135 aa  49.7  2e-05  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0328  RNA-binding S4 domain protein  41.38 
 
 
137 aa  49.3  2e-05  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0870  RNA-binding S4  35.37 
 
 
132 aa  49.3  2e-05  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.774132  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0095  RNA-binding S4 domain-containing protein  41.54 
 
 
134 aa  48.9  2e-05  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.273746  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_68630  putative heat shock protein  39.34 
 
 
131 aa  49.3  2e-05  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0263  RNA-binding S4  42.86 
 
 
135 aa  49.3  2e-05  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.935864  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0747  RNA-binding S4 domain-containing protein  42.86 
 
 
135 aa  49.3  2e-05  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.503491  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0249  RNA-binding S4 domain protein  41.38 
 
 
137 aa  48.1  4e-05  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0665  RNA-binding S4 domain-containing protein  40.82 
 
 
135 aa  48.1  4e-05  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3977  RNA-binding S4  40 
 
 
123 aa  48.1  4e-05  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3696  ribosome-associated heat shock protein Hsp15  36.36 
 
 
133 aa  48.1  4e-05  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3976  heat shock protein 15  33.33 
 
 
135 aa  48.1  4e-05  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0176  RNA-binding S4 domain-containing protein  33.33 
 
 
135 aa  48.1  4e-05  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.905823  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0641  RNA-binding S4 domain-containing protein  40.82 
 
 
157 aa  48.1  4e-05  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1231  RNA-binding S4 domain-containing protein  46.15 
 
 
138 aa  48.1  4e-05  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.984155  normal  0.301013 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3698  RNA-binding S4 domain-containing protein  36.99 
 
 
130 aa  48.1  4e-05  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3737  heat shock protein 15  33.77 
 
 
135 aa  47.8  5e-05  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2637  RNA-binding S4 domain-containing protein  40.82 
 
 
135 aa  47.8  5e-05  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3596  ribosome-associated heat shock protein Hsp15  36.36 
 
 
133 aa  47.4  6e-05  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>