More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BCE_0005 on replicon NC_003909
Organism: Bacillus cereus ATCC 10987



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011898  Ccel_0006  DNA gyrase, B subunit  63.88 
 
 
642 aa  819  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.965796  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0005  DNA gyrase subunit B  99.84 
 
 
640 aa  1315  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00230725  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0087  DNA gyrase subunit B  57.81 
 
 
650 aa  744  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5127  DNA gyrase subunit B  59.17 
 
 
805 aa  654  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.50645  normal  0.271851 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0004  DNA gyrase, B subunit  57.98 
 
 
801 aa  642  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0231697  decreased coverage  0.000608059 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4227  DNA gyrase subunit B  59.49 
 
 
804 aa  656  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4063  DNA gyrase subunit B  59.49 
 
 
804 aa  655  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.795543  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0004  DNA gyrase, B subunit  59.5 
 
 
796 aa  681  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00006  DNA gyrase subunit B  58.53 
 
 
806 aa  638  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.00261354  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1622  DNA gyrase, B subunit  58.45 
 
 
786 aa  647  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4047  DNA gyrase subunit B  59.49 
 
 
804 aa  656  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4169  DNA gyrase subunit B  59.49 
 
 
804 aa  656  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.994459  normal  0.269221 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4120  DNA gyrase subunit B  59.49 
 
 
804 aa  656  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0016  DNA gyrase, B subunit  57.99 
 
 
649 aa  752  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00028541  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0015  DNA gyrase, B subunit  58.7 
 
 
644 aa  775  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  unclonable  1.55334e-06 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0015  DNA gyrase, B subunit  58.63 
 
 
644 aa  772  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.000401037  normal  0.862842 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3624  DNA topoisomerase IV subunit B  55.99 
 
 
654 aa  708  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  4.39989e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1547  DNA gyrase, B subunit  59.69 
 
 
635 aa  741  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.00189026  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0006  DNA gyrase subunit B  52.11 
 
 
695 aa  660  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  6.1906e-14 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2993  DNA gyrase subunit B  58.03 
 
 
645 aa  704  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1048  DNA gyrase, B subunit  52.48 
 
 
665 aa  700  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.903378  normal  0.436385 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3685  DNA gyrase, B subunit  58.23 
 
 
636 aa  758  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.50658  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2676  DNA topoisomerase (ATP-hydrolyzing)  53.08 
 
 
638 aa  686  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  4.29732e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0005  DNA gyrase, B subunit  66.72 
 
 
644 aa  864  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00336478  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3608  DNA topoisomerase IV subunit B  55.99 
 
 
654 aa  708  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    decreased coverage  8.88333e-33 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0005  DNA gyrase subunit B  99.84 
 
 
640 aa  1315  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5315  DNA gyrase subunit B  97.97 
 
 
640 aa  1228  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.021698  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1609  DNA topoisomerase IV subunit B  55.68 
 
 
654 aa  702  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  9.67673e-06  decreased coverage  6.94445e-13 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0003  DNA gyrase, B subunit  58.21 
 
 
800 aa  641  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0442  DNA gyrase, B subunit  57.89 
 
 
634 aa  712  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1282  DNA gyrase subunit B  58.44 
 
 
641 aa  705  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3706  DNA topoisomerase IV subunit B  55.68 
 
 
654 aa  704  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000176643  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0005  DNA gyrase subunit B  99.38 
 
 
640 aa  1307  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.204678  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1109  hypothetical protein  54.67 
 
 
651 aa  726  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.432981 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1432  DNA gyrase subunit B  52.92 
 
 
696 aa  647  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17611  DNA gyrase subunit B  56.74 
 
 
658 aa  724  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.616229  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0007  DNA gyrase, B subunit  55.66 
 
 
648 aa  686  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  6.47413e-07 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0006  DNA gyrase subunit B  53.37 
 
 
652 aa  639  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0035  DNA gyrase subunit B  59.67 
 
 
804 aa  655  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.373833  normal  0.195519 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4209  DNA gyrase subunit B  59.31 
 
 
804 aa  651  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00242077  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3912  DNA gyrase subunit B  59.31 
 
 
804 aa  651  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.139583  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4195  DNA gyrase, B subunit  56.07 
 
 
653 aa  731  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00698411 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0966  DNA gyrase, B subunit  54.16 
 
 
650 aa  664  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4150  DNA gyrase subunit B  59.31 
 
 
804 aa  653  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0128391  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2247  DNA topoisomerase IV subunit B  55.97 
 
 
654 aa  705  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  2.27299e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0005  DNA gyrase subunit B  96.88 
 
 
640 aa  1221  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0006  DNA gyrase, B subunit  53.66 
 
 
686 aa  637  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00629788 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0004  DNA gyrase, B subunit  57.49 
 
 
807 aa  637  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0620606  hitchhiker  2.88479e-10 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1443  DNA topoisomerase IV subunit B  53.92 
 
 
663 aa  682  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0710964  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0005  DNA gyrase, B subunit  70.19 
 
 
640 aa  873  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0005  DNA gyrase, B subunit  62.28 
 
 
642 aa  765  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0296  DNA topoisomerase (ATP-hydrolyzing)  51.63 
 
 
642 aa  649  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0004  DNA gyrase, B subunit  60.54 
 
 
802 aa  683  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0015  DNA gyrase, B subunit  58.71 
 
 
643 aa  759  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00473367  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0007  DNA gyrase subunit B  63.91 
 
 
640 aa  853  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.630363  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4226  DNA gyrase subunit B  59.31 
 
 
804 aa  652  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.765134  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0005  DNA gyrase, B subunit  55.59 
 
 
825 aa  635  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  hitchhiker  1.46448e-06 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4064  DNA gyrase subunit B  59.49 
 
 
804 aa  653  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0861092  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0094  DNA gyrase, B subunit  55.73 
 
 
636 aa  715  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.000129942  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0004  DNA gyrase subunit B  59.31 
 
 
804 aa  651  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.873229  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0004  DNA gyrase subunit B  59.31 
 
 
804 aa  653  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0005  DNA gyrase, B subunit  59.21 
 
 
635 aa  758  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0009  DNA gyrase subunit B  67.03 
 
 
633 aa  835  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  6.95632e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3285  DNA topoisomerase IV subunit B  55.68 
 
 
654 aa  700  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.014971  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0005  DNA gyrase subunit B  96.72 
 
 
640 aa  1213  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4174  DNA gyrase subunit B  59.31 
 
 
804 aa  653  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.274174  normal  0.0336166 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0177  DNA topoisomerase (ATP-hydrolyzing)  52.95 
 
 
641 aa  670  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.724108  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0671  DNA gyrase, B subunit  58.64 
 
 
627 aa  720  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.958816  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2816  DNA gyrase subunit B  58.1 
 
 
645 aa  700  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0322238  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0007  DNA topoisomerase (ATP-hydrolyzing)  55.33 
 
 
647 aa  686  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_4  DNA gyrase, B subunit  55.15 
 
 
642 aa  702  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0006  DNA gyrase, B subunit  51.77 
 
 
681 aa  648  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0051  DNA gyrase, B subunit  61.56 
 
 
640 aa  805  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0130  DNA gyrase, B subunit  59.08 
 
 
636 aa  780  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.95821  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00060  DNA gyrase subunit B  53.61 
 
 
683 aa  672  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0007  DNA gyrase, B subunit  58.57 
 
 
642 aa  756  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000235506  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1260  DNA gyrase, B subunit  52.92 
 
 
660 aa  671  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0006  DNA gyrase, B subunit  56.7 
 
 
649 aa  708  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2717  DNA gyrase, B subunit  58.06 
 
 
649 aa  777  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002006  DNA gyrase subunit B  58.35 
 
 
805 aa  636  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.132236  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0005  DNA gyrase, B subunit  51.79 
 
 
685 aa  685  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0004  DNA gyrase, B subunit  56.91 
 
 
817 aa  636  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.127407  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0004  DNA gyrase subunit B  57.69 
 
 
805 aa  642  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2558  DNA topoisomerase IV subunit B  55.92 
 
 
645 aa  696  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0041  DNA gyrase, B subunit  52.88 
 
 
691 aa  645  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2996  DNA gyrase, B subunit  53.78 
 
 
666 aa  691  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.39538  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06825  DNA gyrase subunit B  54.06 
 
 
645 aa  717  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0335  DNA gyrase, B subunit  54.22 
 
 
645 aa  650  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.457317 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0006  DNA gyrase, B subunit  55.81 
 
 
645 aa  688  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.0161215 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0006  DNA gyrase subunit B  56.41 
 
 
647 aa  694  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.195447  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0009  DNA gyrase, B subunit  50.3 
 
 
688 aa  662  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0006  DNA gyrase, B subunit  53.54 
 
 
698 aa  639  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2748  DNA gyrase, B subunit  58.58 
 
 
637 aa  768  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000339515  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0006  DNA gyrase B subunit  54.32 
 
 
656 aa  708  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.381905 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2927  DNA topoisomerase (ATP-hydrolyzing)  53.76 
 
 
643 aa  642  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.192259 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0820  DNA gyrase, B subunit  56.7 
 
 
644 aa  719  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.929877  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0306  DNA gyrase, B subunit  57.79 
 
 
643 aa  744  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.337431  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0004  DNA gyrase, B subunit  57.95 
 
 
810 aa  652  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.311816 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0010  DNA gyrase, B subunit  50.74 
 
 
680 aa  650  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2271  DNA gyrase, B subunit  57.23 
 
 
644 aa  738  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>