More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BCB4264_A4347 on replicon NC_011725
Organism: Bacillus cereus B4264



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011725  BCB4264_A4347  shikimate kinase  100 
 
 
156 aa  322  1e-87  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0893  shikimate kinase  95.51 
 
 
165 aa  310  4.999999999999999e-84  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4089  shikimate kinase  94.19 
 
 
165 aa  304  3e-82  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3987  shikimate kinase  94.84 
 
 
165 aa  303  5.0000000000000004e-82  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.585593  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3977  shikimate kinase  94.84 
 
 
165 aa  303  7e-82  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.537604  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4313  shikimate kinase  94.19 
 
 
170 aa  303  9.000000000000001e-82  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4255  shikimate kinase  94.19 
 
 
165 aa  301  2.0000000000000002e-81  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4137  shikimate kinase  94.19 
 
 
165 aa  301  3.0000000000000004e-81  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.151576  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4457  shikimate kinase  94.19 
 
 
165 aa  301  3.0000000000000004e-81  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.745283  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4366  shikimate kinase  93.55 
 
 
165 aa  300  5.000000000000001e-81  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2922  shikimate kinase  72.9 
 
 
165 aa  243  6.999999999999999e-64  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2970  shikimate kinase  38.99 
 
 
190 aa  121  4e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2901  shikimate kinase  38.36 
 
 
179 aa  116  9.999999999999999e-26  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.12691 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3248  shikimate kinase  37.74 
 
 
179 aa  115  3e-25  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3206  shikimate kinase  42.38 
 
 
209 aa  114  6e-25  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.289523  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1757  shikimate kinase  42.38 
 
 
177 aa  114  6.9999999999999995e-25  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2747  shikimate kinase  42.38 
 
 
177 aa  114  6.9999999999999995e-25  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3729  shikimate kinase  42.38 
 
 
184 aa  114  6.9999999999999995e-25  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.427035  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3758  shikimate kinase  42.38 
 
 
177 aa  114  6.9999999999999995e-25  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.485321  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2797  shikimate kinase  42.38 
 
 
177 aa  114  6.9999999999999995e-25  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.135069  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3700  shikimate kinase  42.38 
 
 
177 aa  114  6.9999999999999995e-25  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.049823  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3024  shikimate kinase  42.38 
 
 
199 aa  113  7.999999999999999e-25  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0359  shikimate kinase  39.74 
 
 
183 aa  109  1.0000000000000001e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0471264 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1819  shikimate kinase  38.16 
 
 
169 aa  110  1.0000000000000001e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0528  Shikimate kinase  38.71 
 
 
166 aa  108  3e-23  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.276227  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0320  shikimate kinase  40.4 
 
 
169 aa  107  9.000000000000001e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.715658 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0311  shikimate kinase  40.4 
 
 
184 aa  106  9.000000000000001e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3598  shikimate kinase  39.74 
 
 
183 aa  107  9.000000000000001e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000887516  hitchhiker  0.0000000252706 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3489  shikimate kinase  39.74 
 
 
184 aa  106  1e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1855  shikimate kinase  38.22 
 
 
181 aa  105  2e-22  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0371  shikimate kinase  39.74 
 
 
169 aa  105  2e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2715  shikimate kinase  39.74 
 
 
169 aa  105  2e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0246166  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0392  shikimate kinase  39.74 
 
 
184 aa  105  2e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2168  shikimate kinase  37.97 
 
 
186 aa  105  3e-22  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.157663  normal  0.699838 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0678  shikimate kinase  35.44 
 
 
182 aa  104  4e-22  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.211914 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0441  shikimate kinase  39.1 
 
 
176 aa  104  5e-22  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.567872  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2661  Shikimate kinase  35.85 
 
 
170 aa  103  6e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000463113 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3130  shikimate kinase  39.07 
 
 
192 aa  104  6e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1556  shikimate kinase  36.13 
 
 
173 aa  104  6e-22  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.367363 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1700  Shikimate kinase  36.43 
 
 
172 aa  103  8e-22  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0464  shikimate kinase  38.46 
 
 
176 aa  102  1e-21  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0994  shikimate kinase I  37.91 
 
 
175 aa  102  2e-21  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0963  shikimate kinase I  37.91 
 
 
175 aa  102  2e-21  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0215  shikimate kinase  37.34 
 
 
172 aa  102  2e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.365544  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1591  Shikimate kinase  37.25 
 
 
175 aa  102  3e-21  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1103  shikimate kinase  38.06 
 
 
165 aa  101  3e-21  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.396409  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1529  shikimate kinase  34.62 
 
 
180 aa  102  3e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.140024  normal  0.642585 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2745  shikimate kinase  37.04 
 
 
173 aa  101  3e-21  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.164945  normal  0.272805 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0652  shikimate kinase  35.85 
 
 
195 aa  101  3e-21  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1555  shikimate kinase  33.33 
 
 
170 aa  102  3e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.436884  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2549  Shikimate kinase  36.13 
 
 
189 aa  101  5e-21  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0946  shikimate kinase  36.81 
 
 
199 aa  100  5e-21  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.133424  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2794  shikimate kinase  37.75 
 
 
183 aa  100  6e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_407  shikimate kinase  37.18 
 
 
176 aa  100  7e-21  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1878  shikimate kinase  36.08 
 
 
186 aa  100  8e-21  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.190429  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2925  shikimate kinase  37.33 
 
 
179 aa  100  8e-21  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3401  shikimate kinase  39.33 
 
 
182 aa  100  9e-21  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3267  shikimate kinase  37.09 
 
 
229 aa  100  1e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0553  shikimate kinase  36.94 
 
 
181 aa  99.4  2e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.387005  normal  0.100064 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2817  shikimate kinase  33.97 
 
 
181 aa  99.4  2e-20  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.248239  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01231  shikimate kinase  37.93 
 
 
197 aa  99.4  2e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.428162 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1479  shikimate kinase  33.97 
 
 
193 aa  99  2e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.298287  normal  0.404477 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1506  shikimate kinase  40.29 
 
 
184 aa  99.4  2e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.494789 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2532  shikimate kinase  35.06 
 
 
173 aa  99  2e-20  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.884272  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1002  shikimate kinase  39.26 
 
 
183 aa  98.2  3e-20  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0089  shikimate kinase  38.56 
 
 
161 aa  98.2  4e-20  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.506122  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3108  shikimate kinase  34.67 
 
 
184 aa  98.2  4e-20  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0973333 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2026  shikimate kinase  36.84 
 
 
175 aa  97.8  5e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0658  shikimate kinase  36.88 
 
 
178 aa  97.8  5e-20  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1942  Shikimate kinase  38.12 
 
 
167 aa  97.4  7e-20  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.195968  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0091  shikimate kinase  38.26 
 
 
173 aa  97.1  7e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.10625 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2258  shikimate kinase  34.18 
 
 
177 aa  97.1  9e-20  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1145  shikimate kinase  35.33 
 
 
182 aa  96.7  1e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2456  shikimate kinase  35.67 
 
 
170 aa  96.3  1e-19  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.209695  normal  0.679915 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0613  shikimate kinase  35.95 
 
 
180 aa  96.7  1e-19  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0086  Shikimate kinase  38.56 
 
 
161 aa  96.3  1e-19  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.744352  hitchhiker  0.00173966 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3524  Shikimate kinase  35.14 
 
 
169 aa  95.9  2e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.236256  normal  0.835023 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2137  shikimate kinase  38.12 
 
 
174 aa  96.3  2e-19  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.628527  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0989  shikimate kinase  34.81 
 
 
189 aa  95.5  2e-19  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.764928  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0295  shikimate kinase  38.89 
 
 
162 aa  95.9  2e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0252  shikimate kinase  34.39 
 
 
190 aa  95.5  3e-19  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0786  shikimate kinase  36 
 
 
174 aa  95.1  3e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.549744  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1018  shikimate kinase II  34.81 
 
 
174 aa  95.1  3e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.891294 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66610  shikimate kinase  37.34 
 
 
172 aa  95.1  3e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2361  shikimate kinase II  35.85 
 
 
175 aa  95.5  3e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.314592  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1282  shikimate kinase  35.44 
 
 
178 aa  95.1  3e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.410778  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0207  shikimate kinase  34.59 
 
 
183 aa  94.7  4e-19  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.807253  normal  0.16478 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0960  shikimate kinase  33.13 
 
 
199 aa  94.7  4e-19  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3282  shikimate kinase II  36.31 
 
 
174 aa  94.4  5e-19  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.970543  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3143  shikimate kinase II  36.31 
 
 
174 aa  94.4  5e-19  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.770724  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0346  shikimate kinase  36.18 
 
 
191 aa  94.4  6e-19  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2686  shikimate kinase  38.99 
 
 
169 aa  94.4  6e-19  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.536815  normal  0.0662498 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1516  shikimate kinase  35.58 
 
 
197 aa  94.4  6e-19  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.681098 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5776  shikimate kinase  37.34 
 
 
172 aa  94  8e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0859  shikimate kinase II  35.29 
 
 
174 aa  93.6  8e-19  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.386804 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3293  shikimate kinase II  35.67 
 
 
174 aa  94  8e-19  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.431512  normal  0.133035 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1220  shikimate kinase  34.97 
 
 
190 aa  93.6  9e-19  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.455019  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0977  shikimate kinase  34.21 
 
 
168 aa  93.6  9e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.937224  normal  0.13223 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0305  shikimate kinase II  37.34 
 
 
174 aa  92.8  1e-18  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4117  shikimate kinase  36.48 
 
 
182 aa  92.8  1e-18  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.944295  hitchhiker  0.000000685723 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>