More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BCB4264_A4333 on replicon NC_011725
Organism: Bacillus cereus B4264



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011725  BCB4264_A4333  transcriptional regulator, GntR family  100 
 
 
124 aa  241  3e-63  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000068149  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4353  transcriptional regulator, GntR family  98.39 
 
 
124 aa  236  8e-62  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000250168  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4299  GntR family transcriptional regulator  97.58 
 
 
124 aa  235  2e-61  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000000606617  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4077  GntR family transcriptional regulator  97.58 
 
 
124 aa  235  2e-61  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.0000000584944  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4242  transcriptional regulator, GntR family  97.58 
 
 
124 aa  235  2e-61  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4126  GntR family transcriptional regulator  96.77 
 
 
124 aa  233  4e-61  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000000992152  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3966  GntR family transcriptional regulator  96.77 
 
 
124 aa  233  4e-61  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000936551  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4445  GntR family transcriptional regulator  96.77 
 
 
124 aa  233  4e-61  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000000230512  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3976  GntR family transcriptional regulator  96.77 
 
 
124 aa  233  5.0000000000000005e-61  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000000310644  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2910  regulatory protein GntR HTH  87.9 
 
 
124 aa  211  1.9999999999999998e-54  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000302631  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1382  GntR family transcriptional regulator  57.38 
 
 
125 aa  144  5e-34  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00127899  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1991  regulatory protein GntR, HTH  50 
 
 
126 aa  135  2e-31  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2024  regulatory protein GntR HTH  50 
 
 
126 aa  135  2e-31  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3903  GntR family transcriptional regulator  55.65 
 
 
124 aa  133  9e-31  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000301963  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1549  GntR family transcriptional regulator  51.61 
 
 
124 aa  132  1.9999999999999998e-30  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.478849  decreased coverage  0.0000058181 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2835  GntR family transcriptional regulator  50 
 
 
129 aa  132  1.9999999999999998e-30  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.062788  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2807  gluconate operon transcriptional repressor  50 
 
 
129 aa  132  1.9999999999999998e-30  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00313262  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2769  GntR family transcriptional regulator  50 
 
 
129 aa  132  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3049  GntR family transcriptional regulator  50 
 
 
129 aa  132  1.9999999999999998e-30  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3079  transcriptional regulator, GntR family  50 
 
 
129 aa  132  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3062  transcriptional regulator, GntR family  50 
 
 
129 aa  132  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2969  GntR family transcriptional regulator  53.23 
 
 
124 aa  130  6e-30  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.233568  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2275  transcriptional regulator, GntR family  52.46 
 
 
126 aa  130  6e-30  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00673812  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1478  GntR family transcriptional regulator  44.63 
 
 
125 aa  120  5e-27  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0392506  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0445  GntR family transcriptional regulator  51.67 
 
 
123 aa  119  9.999999999999999e-27  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0436  GntR family transcriptional regulator  51.67 
 
 
123 aa  119  9.999999999999999e-27  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0118  transcriptional regulator, GntR family  48.39 
 
 
129 aa  113  6.9999999999999995e-25  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.000000000889333  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1981  GntR family transcriptional regulator  45.16 
 
 
128 aa  110  7.000000000000001e-24  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.291359  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2129  GntR family transcriptional regulator  45.16 
 
 
128 aa  110  7.000000000000001e-24  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.625758  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2162  transcriptional regulator, GntR family  45.16 
 
 
128 aa  110  7.000000000000001e-24  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2507  transcriptional regulator, GntR family  53.33 
 
 
125 aa  108  2.0000000000000002e-23  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0191  transcriptional regulator, GntR family  45 
 
 
125 aa  104  5e-22  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0222  transcriptional regulator, GntR family  45.16 
 
 
127 aa  103  6e-22  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.672326  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0791  putative transcriptional regulator  45.53 
 
 
124 aa  99  2e-20  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2650  transcriptional regulator, putative  38.02 
 
 
121 aa  88.6  2e-17  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07820  predicted transcriptional regulator  36.13 
 
 
126 aa  84  7e-16  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3817  GntR family transcriptional regulator  35.25 
 
 
139 aa  81.3  0.000000000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3833  GntR family transcriptional regulator  35.25 
 
 
139 aa  81.3  0.000000000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1052  transcriptional regulator, GntR family  35.25 
 
 
139 aa  81.3  0.000000000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00681455 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4186  transcriptional regulator, GntR family  35.25 
 
 
139 aa  81.3  0.000000000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0817984  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4146  GntR family transcriptional regulator  35.25 
 
 
139 aa  80.9  0.000000000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4209  transcriptional regulator, GntR family  35.25 
 
 
139 aa  80.9  0.000000000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000240895  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4098  transcriptional regulator, GntR family  35.25 
 
 
139 aa  80.9  0.000000000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.57441e-29 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3987  GntR family transcriptional regulator  35.25 
 
 
139 aa  80.5  0.000000000000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.142638  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4298  GntR family transcriptional regulator  35.25 
 
 
139 aa  80.5  0.000000000000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.4553  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2775  regulatory protein GntR HTH  35.25 
 
 
139 aa  80.5  0.000000000000007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.233655  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1900  hypothetical protein  45.78 
 
 
84 aa  80.1  0.00000000000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3907  GntR family transcriptional regulator  34.43 
 
 
139 aa  80.1  0.00000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2387  transcriptional regulator, GntR family  47.83 
 
 
133 aa  79.3  0.00000000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.136165 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1665  GntR family transcriptional regulator  44.04 
 
 
132 aa  78.6  0.00000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.244402  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1165  GntR family transcriptional regulator  50.54 
 
 
129 aa  78.2  0.00000000000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000015678  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2248  transcriptional regulator, GntR family  39.82 
 
 
128 aa  77.4  0.00000000000006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0793  transcriptional regulator, GntR family  35.04 
 
 
120 aa  75.5  0.0000000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2407  transcriptional regulator, GntR family  32.74 
 
 
159 aa  75.9  0.0000000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00608999  normal  0.35427 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0548  transcriptional regulator, GntR family  32.52 
 
 
123 aa  75.5  0.0000000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0065  GntR family transcriptional regulator  48.75 
 
 
128 aa  75.1  0.0000000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2175  GntR family transcriptional regulator  50 
 
 
477 aa  74.7  0.0000000000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0162  regulatory protein GntR, HTH  36.29 
 
 
121 aa  74.3  0.0000000000005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000379114  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0160  GntR family transcriptional regulator  36.29 
 
 
121 aa  74.3  0.0000000000005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00000659048  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0429  regulatory protein GntR HTH  39.32 
 
 
122 aa  74.3  0.0000000000005  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2409  transcriptional regulator  42.35 
 
 
479 aa  73.9  0.0000000000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00453228  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2000  GntR family transcriptional regulator  35.09 
 
 
118 aa  73.6  0.0000000000009  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2285  GntR family transcriptional regulator  35.45 
 
 
118 aa  73.6  0.000000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2506  GntR family transcriptional regulator  44.3 
 
 
477 aa  72  0.000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00205118  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2461  transcriptional regulator, GntR family  34.48 
 
 
125 aa  72.8  0.000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2620  transcriptional regulator, GntR family  36.36 
 
 
119 aa  71.6  0.000000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0363096  normal  0.140863 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2472  GntR family transcriptional regulator  43.04 
 
 
477 aa  71.6  0.000000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.656755  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2244  GntR family transcriptional regulator  32.74 
 
 
130 aa  71.2  0.000000000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0898  GntR family transcriptional regulator  34.19 
 
 
321 aa  70.9  0.000000000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.329812  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1451  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  42.11 
 
 
490 aa  71.2  0.000000000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2550  GntR family transcriptional regulator  43.04 
 
 
477 aa  70.9  0.000000000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0241547  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2745  transcriptional regulator, GntR family/aminotransferase, class I protein  43.04 
 
 
477 aa  70.9  0.000000000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.59979e-16 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2737  GntR family transcriptional regulator  43.04 
 
 
477 aa  70.9  0.000000000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0058  regulatory protein GntR, HTH  33.63 
 
 
123 aa  70.5  0.000000000007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2543  transcriptional regulator, GntR family  33.02 
 
 
477 aa  70.5  0.000000000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000100804 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0631  transcriptional regulator, GntR family  33.64 
 
 
121 aa  70.5  0.000000000007  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_07005  hypothetical protein  30.89 
 
 
166 aa  70.5  0.000000000008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3243  regulatory protein GntR, HTH  37.72 
 
 
126 aa  70.5  0.000000000008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0072  GntR family transcriptional regulator  34.51 
 
 
123 aa  69.7  0.00000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000965  transcriptional regulator GntR family  32.46 
 
 
123 aa  70.1  0.00000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3779  GntR family transcriptional regulator  31.36 
 
 
126 aa  68.9  0.00000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2749  transcriptional regulator, GntR family  33.02 
 
 
477 aa  69.3  0.00000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_03060  predicted transcriptional regulator  41.33 
 
 
126 aa  69.3  0.00000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0996  transcriptional regulator, GntR family  33.33 
 
 
129 aa  69.3  0.00000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.467589 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0075  GntR family transcriptional regulator  34.51 
 
 
121 aa  69.3  0.00000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0073  GntR family transcriptional regulator  34.51 
 
 
121 aa  69.3  0.00000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02090  predicted transcriptional regulator  30.97 
 
 
156 aa  69.3  0.00000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0077  GntR family transcriptional regulator  34.51 
 
 
121 aa  69.3  0.00000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000256514 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2319  GntR family transcriptional regulator  38.55 
 
 
120 aa  68.6  0.00000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000162157  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2637  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  38.55 
 
 
493 aa  68.6  0.00000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.750053 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2455  transcriptional regulator, GntR family  35.14 
 
 
128 aa  68.2  0.00000000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2769  GntR family transcriptional regulator  33.96 
 
 
477 aa  67.8  0.00000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.0000296805  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2645  transcriptional regulator, GntR family  34.78 
 
 
125 aa  67.8  0.00000000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1271  GntR family transcriptional regulator  39.78 
 
 
126 aa  67  0.00000000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1243  GntR family transcriptional regulator  39.78 
 
 
126 aa  67  0.00000000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.151316  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1245  GntR family transcriptional regulator  39.78 
 
 
126 aa  67  0.00000000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2171  GntR family transcriptional regulator  43.84 
 
 
507 aa  67  0.00000000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.164401  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1373  GntR family transcriptional regulator  39.78 
 
 
126 aa  67  0.00000000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1407  transcriptional regulator, GntR family  39.78 
 
 
126 aa  67  0.00000000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.378384  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1514  transcriptional regulator, GntR family  39.78 
 
 
126 aa  67  0.00000000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>