More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BCB4264_A4256 on replicon NC_011725
Organism: Bacillus cereus B4264



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011772  BCG9842_B0979  DNA polymerase IV  97.09 
 
 
412 aa  830    Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4214  DNA polymerase IV  96.6 
 
 
412 aa  830    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.000424274  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4051  DNA polymerase IV  95.87 
 
 
412 aa  826    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3889  DNA polymerase IV  95.87 
 
 
412 aa  826    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3983  DNA polymerase IV  95.39 
 
 
412 aa  823    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3897  DNA polymerase IV  95.87 
 
 
412 aa  826    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4166  DNA polymerase IV  95.87 
 
 
412 aa  826    Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4366  DNA polymerase IV  95.87 
 
 
412 aa  826    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2840  DNA polymerase IV  89.32 
 
 
412 aa  792    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.527026  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4277  DNA polymerase IV  95.87 
 
 
412 aa  825    Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.727972  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4256  DNA polymerase IV  100 
 
 
412 aa  855    Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0566938  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1767  DNA polymerase IV  53.06 
 
 
414 aa  416  9.999999999999999e-116  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2528  DNA polymerase IV  51.28 
 
 
414 aa  402  1e-111  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1314  UMUC domain protein DNA-repair protein  37.75 
 
 
399 aa  264  2e-69  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.0000131963  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2364  DNA-directed DNA polymerase  37.56 
 
 
409 aa  263  4.999999999999999e-69  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.259486  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0758  DNA polymerase IV  34.28 
 
 
395 aa  245  9.999999999999999e-64  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1070  DNA-directed DNA polymerase  37.37 
 
 
409 aa  244  1.9999999999999999e-63  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7175  DNA-directed DNA polymerase  36.84 
 
 
371 aa  243  3e-63  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1574  DNA-directed DNA polymerase  37 
 
 
410 aa  243  3e-63  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1132  DNA-directed DNA polymerase  38.6 
 
 
408 aa  243  3.9999999999999997e-63  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1362  DNA-directed DNA polymerase  35.99 
 
 
393 aa  243  3.9999999999999997e-63  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1547  DNA-directed DNA polymerase  36.03 
 
 
425 aa  241  2e-62  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.153092  normal  0.161564 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0370  DNA-directed DNA polymerase  34.89 
 
 
423 aa  240  2.9999999999999997e-62  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0318  DNA-directed DNA polymerase  37.06 
 
 
372 aa  239  8e-62  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.154893 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0043  ImpB/MucB/SamB family protein  36.36 
 
 
413 aa  238  1e-61  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1756  UMUC domain protein DNA-repair protein  36.08 
 
 
409 aa  238  2e-61  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000481583  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1229  DNA polymerase IV  36.18 
 
 
400 aa  236  5.0000000000000005e-61  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000257934  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2492  DNA-directed DNA polymerase  36.08 
 
 
409 aa  236  6e-61  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1441  UMUC-like DNA-repair protein  36.96 
 
 
407 aa  235  9e-61  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0190  DNA-directed DNA polymerase  34.43 
 
 
410 aa  233  4.0000000000000004e-60  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1107  DNA-directed DNA polymerase  33.77 
 
 
385 aa  233  4.0000000000000004e-60  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.27085  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08990  DNA-directed DNA polymerase  35.49 
 
 
385 aa  233  6e-60  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2316  DNA-directed DNA polymerase  35.79 
 
 
411 aa  230  4e-59  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2727  DNA-directed DNA polymerase  35.68 
 
 
400 aa  230  4e-59  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0115509  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1904  DNA-directed DNA polymerase  34.09 
 
 
411 aa  229  7e-59  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1773  DNA-directed DNA polymerase  33.59 
 
 
397 aa  229  8e-59  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.49151  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2663  DNA-directed DNA polymerase  36.87 
 
 
358 aa  228  2e-58  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0579235  normal  0.454418 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3236  DNA-directed DNA polymerase  35.11 
 
 
419 aa  228  2e-58  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.516429  decreased coverage  0.00986036 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3462  DNA-directed DNA polymerase  34.83 
 
 
419 aa  228  2e-58  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00370364 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1616  ImpB/MucB/SamB family protein  35.9 
 
 
409 aa  227  3e-58  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1185  DNA-directed DNA polymerase  37.15 
 
 
381 aa  227  3e-58  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.129375  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2772  DNA polymerase IV  33.68 
 
 
395 aa  227  3e-58  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.317028  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2317  DNA-directed DNA polymerase  31.14 
 
 
426 aa  224  2e-57  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2331  DNA-directed DNA polymerase  34.41 
 
 
408 aa  224  2e-57  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.632571  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3129  damage-inducible protein DinP  35.2 
 
 
399 aa  223  4e-57  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2280  DNA-directed DNA polymerase  36.46 
 
 
378 aa  223  6e-57  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.924608  hitchhiker  0.0000031101 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2654  DNA polymerase IV  36.46 
 
 
378 aa  223  6e-57  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1433  DNA polymerase IV  35.29 
 
 
356 aa  222  7e-57  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0224  DNA-directed DNA polymerase  34.74 
 
 
413 aa  222  8e-57  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0380  DNA-directed DNA polymerase  34.93 
 
 
360 aa  221  9.999999999999999e-57  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.158929  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0260  DNA polymerase IV  35.9 
 
 
351 aa  221  1.9999999999999999e-56  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0195  DNA polymerase IV  36.18 
 
 
389 aa  221  1.9999999999999999e-56  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1621  DNA polymerase IV  35.29 
 
 
367 aa  221  1.9999999999999999e-56  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1949  DNA polymerase IV  34.17 
 
 
356 aa  220  3e-56  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.259115  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1983  DNA polymerase IV  34.17 
 
 
356 aa  220  3e-56  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.858676  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0265  DNA polymerase IV  35.61 
 
 
351 aa  220  3.9999999999999997e-56  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2083  DNA-directed DNA polymerase  34.19 
 
 
399 aa  220  3.9999999999999997e-56  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.968018  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0285  DNA polymerase IV  35.9 
 
 
351 aa  220  5e-56  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.32449 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00226  DNA polymerase IV  35.61 
 
 
351 aa  219  6e-56  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3376  DNA-directed DNA polymerase  35.61 
 
 
351 aa  219  6e-56  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00229  hypothetical protein  35.61 
 
 
351 aa  219  6e-56  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3349  DNA polymerase IV  35.61 
 
 
351 aa  219  6e-56  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5112  DNA-directed DNA polymerase  35.34 
 
 
420 aa  219  8.999999999999998e-56  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.360047  normal  0.490555 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0228  DNA polymerase IV  35.53 
 
 
354 aa  218  1e-55  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.190428  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2314  DNA polymerase IV  36.73 
 
 
364 aa  218  1e-55  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.023311  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0229  DNA-directed DNA polymerase  34.97 
 
 
384 aa  218  2e-55  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1272  DNA-directed DNA polymerase  35.55 
 
 
359 aa  218  2e-55  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0144  DNA-directed DNA polymerase  34.08 
 
 
354 aa  218  2e-55  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0276  DNA polymerase IV  35.61 
 
 
351 aa  218  2e-55  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.820662 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1432  DNA-directed DNA polymerase  37.05 
 
 
374 aa  217  2.9999999999999998e-55  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.517371  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0738  DNA-directed DNA polymerase  33.33 
 
 
425 aa  217  2.9999999999999998e-55  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.59258  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2007  UMUC domain protein DNA-repair protein  33.59 
 
 
413 aa  216  5e-55  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.470929  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_16030  DNA repair nucleotidyltransferase/DNA polymerase  31.78 
 
 
407 aa  216  5e-55  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.218569  normal  0.0704551 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2313  DNA-directed DNA polymerase  35.03 
 
 
481 aa  216  5.9999999999999996e-55  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0732  DNA-directed DNA polymerase  35.39 
 
 
363 aa  216  7e-55  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.833353  normal  0.0993965 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0985  DNA polymerase IV  36.34 
 
 
359 aa  216  8e-55  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0354  DNA polymerase IV  35.13 
 
 
351 aa  215  9.999999999999999e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000360383 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0362  DNA polymerase IV  34.84 
 
 
351 aa  214  1.9999999999999998e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.933253  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1114  DNA polymerase IV  37.61 
 
 
357 aa  214  1.9999999999999998e-54  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0947  DNA polymerase IV  36.07 
 
 
359 aa  214  1.9999999999999998e-54  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0347  DNA polymerase IV  34.84 
 
 
351 aa  214  1.9999999999999998e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1726  DNA polymerase IV  36.77 
 
 
352 aa  213  2.9999999999999995e-54  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  decreased coverage  0.000164893  normal  0.305741 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1726  DNA polymerase IV  33.05 
 
 
364 aa  214  2.9999999999999995e-54  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.503643  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3597  DNA-directed DNA polymerase  34.78 
 
 
380 aa  213  3.9999999999999995e-54  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.456033 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0352  DNA polymerase IV  34.84 
 
 
351 aa  213  4.9999999999999996e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.990512 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22910  DNA repair nucleotidyltransferase/DNA polymerase  34.82 
 
 
414 aa  213  4.9999999999999996e-54  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.0450607 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0343  DNA polymerase IV  34.84 
 
 
351 aa  213  7e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.663031 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1195  DNA polymerase IV  36.49 
 
 
353 aa  213  7e-54  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0662024 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0619  DNA-directed DNA polymerase  34.41 
 
 
345 aa  212  9e-54  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.146752  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1393  DNA-directed DNA polymerase  34.55 
 
 
410 aa  212  1e-53  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0677634  normal  0.0363654 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1818  DNA polymerase IV  33.15 
 
 
359 aa  212  1e-53  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.432608  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0011  DNA polymerase IV, putative  36.18 
 
 
390 aa  211  2e-53  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1560  DNA-directed DNA polymerase  33.25 
 
 
408 aa  211  2e-53  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_10  DNA polymerase IV (Y-family)  35.92 
 
 
391 aa  211  3e-53  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0010  DNA-directed DNA polymerase  35.66 
 
 
390 aa  210  3e-53  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1670  DNA-directed DNA polymerase  32.27 
 
 
419 aa  209  6e-53  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000999976  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0949  DNA polymerase IV  35.52 
 
 
359 aa  209  9e-53  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2656  DNA polymerase IV  34.1 
 
 
378 aa  208  1e-52  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0159  DNA-directed DNA polymerase  35.81 
 
 
418 aa  209  1e-52  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5890  DNA-directed DNA polymerase  34.1 
 
 
409 aa  208  1e-52  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.315723  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>