235 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BCB4264_A2655 on replicon NC_011725
Organism: Bacillus cereus B4264



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011725  BCB4264_A2655  hypothetical protein  100 
 
 
165 aa  338  2.9999999999999998e-92  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2669  hypothetical protein  96.97 
 
 
165 aa  327  4e-89  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.010535 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2658  hypothetical protein  91.52 
 
 
165 aa  315  1e-85  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.287076  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2509  PadR-like family transcriptional regulator  92.12 
 
 
165 aa  315  1e-85  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0736667  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2451  hypothetical protein  89.7 
 
 
165 aa  310  4.999999999999999e-84  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.073124  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2413  hypothetical protein  89.7 
 
 
165 aa  310  4.999999999999999e-84  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000015361  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2631  hypothetical protein  89.7 
 
 
165 aa  310  4.999999999999999e-84  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2649  hypothetical protein  89.7 
 
 
165 aa  310  4.999999999999999e-84  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000115894 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2376  hypothetical protein  89.09 
 
 
165 aa  308  2e-83  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.247862  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2700  hypothetical protein  86.9 
 
 
112 aa  156  1e-37  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.724274  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7317  PadR-like family transcriptional regulator  28.99 
 
 
229 aa  70.1  0.00000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.939389  normal  0.16375 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2527  transcriptional regulator, PadR-like family  27.49 
 
 
202 aa  65.9  0.0000000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3510  transcriptional regulator, PadR-like family  31.87 
 
 
198 aa  65.9  0.0000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4677  PadR family transcriptional regulator  27.98 
 
 
203 aa  65.5  0.0000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3567  PadR-like family transcriptional regulator  26.79 
 
 
213 aa  64.7  0.0000000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.979058  normal  0.850546 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4200  transcriptional regulator, PadR-like family  27.33 
 
 
209 aa  64.3  0.0000000007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1535  transcriptional regulator, PadR-like family  24.2 
 
 
183 aa  60.8  0.000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.918183  normal  0.0405313 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3098  PadR family transcriptional regulator  25.61 
 
 
187 aa  60.5  0.000000009  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4528  PadR family transcriptional regulator  27.22 
 
 
272 aa  59.3  0.00000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7032  transcriptional regulator, PadR-like family  29.91 
 
 
181 aa  58.9  0.00000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8234  transcriptional regulator, PadR-like family  36.49 
 
 
123 aa  58.9  0.00000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5073  transcriptional regulator, PadR-like family  24.16 
 
 
205 aa  58.5  0.00000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.189916  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3512  transcriptional repressor PadR  34.38 
 
 
179 aa  58.5  0.00000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2204  PadR family transcriptional regulator  24.85 
 
 
179 aa  58.5  0.00000004  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0586729  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5080  PadR-like family transcriptional regulator  30.4 
 
 
212 aa  58.5  0.00000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.6626  hitchhiker  0.0000475922 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2019  transcriptional regulator, PadR-like family  36.9 
 
 
160 aa  57.8  0.00000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.41981 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3358  transcriptional regulator, PadR-like family  25 
 
 
213 aa  57.8  0.00000007  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37830  transcriptional regulator, PadR family  26.32 
 
 
227 aa  57.8  0.00000007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2137  PadR family transcriptional regulator  26.62 
 
 
199 aa  56.6  0.0000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4562  transcriptional regulator PadR family protein  29.84 
 
 
211 aa  57  0.0000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.605184  normal  0.596762 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1910  PadR family transcriptional regulator  36.9 
 
 
174 aa  55.8  0.0000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1669  PadR family transcriptional regulator  36.9 
 
 
179 aa  56.2  0.0000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.107785  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1645  transcriptional regulator  36.9 
 
 
179 aa  56.2  0.0000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3110  transcriptional regulator, PadR-like family  28.09 
 
 
325 aa  56.2  0.0000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000271029  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1946  transcriptional regulator, PadR family  36.9 
 
 
179 aa  56.2  0.0000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.145779  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_2045  PadR family transcriptional regulator  30.23 
 
 
116 aa  56.2  0.0000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6039  PadR-like family transcriptional regulator  28.81 
 
 
181 aa  55.8  0.0000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.258534  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0868  PadR-like family transcriptional regulator  29.66 
 
 
181 aa  56.2  0.0000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.525718  normal  0.842124 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10046  hypothetical protein  30.77 
 
 
180 aa  56.2  0.0000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1163  transcriptional regulator, PadR-like family  23.75 
 
 
191 aa  55.8  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.984047 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4755  transcriptional regulator, PadR-like family  24.71 
 
 
196 aa  55.5  0.0000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.208471  hitchhiker  0.00173659 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0755  PadR family transcriptional regulator  32.53 
 
 
125 aa  55.1  0.0000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.916558  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3146  PadR-like family transcriptional regulator  37.14 
 
 
185 aa  54.7  0.0000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.280559 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1345  transcriptional regulator, PadR-like family  28.8 
 
 
190 aa  54.3  0.0000006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1035  PadR family transcriptional regulator  31.4 
 
 
108 aa  53.9  0.0000009  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00460025  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0346  transcriptional regulator, PadR-like family  24.71 
 
 
201 aa  53.9  0.0000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.824785  normal  0.03301 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0172  PadR-like family transcriptional regulator  33.64 
 
 
242 aa  53.5  0.000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.786766 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8023  transcriptional regulator protein-like protein  23.75 
 
 
178 aa  53.5  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4304  hypothetical protein  30.95 
 
 
119 aa  53.1  0.000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2234  PadR-like family transcriptional regulator  32.58 
 
 
174 aa  53.9  0.000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.156481  decreased coverage  0.00573263 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4588  transcriptional regulator, PadR-like family  35 
 
 
125 aa  53.1  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00658109  normal  0.0547899 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4957  transcriptional regulator, PadR-like family  24.29 
 
 
212 aa  53.1  0.000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3181  transcriptional regulator, PadR-like family  21.71 
 
 
177 aa  53.1  0.000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.000117068  hitchhiker  0.000000000506359 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02430  transcriptional regulator, PadR family  27.54 
 
 
174 aa  52.4  0.000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.467679  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0838  transcriptional regulator, PadR-like family  28.41 
 
 
305 aa  52.4  0.000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1313  transcriptional regulator, PadR-like family  34.57 
 
 
113 aa  52  0.000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.107904  normal  0.0202461 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4626  PadR family transcriptional regulator  31.17 
 
 
114 aa  52  0.000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.658032 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0813  PadR family transcriptional regulator  29.63 
 
 
195 aa  52.4  0.000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.403384 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3031  transcriptional regulator, PadR-like family  37.31 
 
 
150 aa  52  0.000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2179  PadR-like family transcriptional regulator  25.43 
 
 
186 aa  51.6  0.000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00487663 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0735  PadR-like family transcriptional regulator  36.49 
 
 
111 aa  51.2  0.000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0073319 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3281  PadR family transcriptional regulator  31.91 
 
 
109 aa  51.2  0.000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1117  transcriptional regulator, PadR-like family  33.33 
 
 
122 aa  51.2  0.000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.742645 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3702  transcriptional regulator, PadR-like family  28.48 
 
 
212 aa  51.2  0.000006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1371  transcriptional regulator, PadR-like family  26.19 
 
 
182 aa  51.2  0.000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0218081  normal  0.0807721 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4576  PadR family transcriptional regulator  25 
 
 
181 aa  50.8  0.000009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9364  transcriptional regulator protein-like protein  23.73 
 
 
224 aa  50.8  0.000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.401607  normal  0.508496 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3551  transcriptional regulator, PadR-like family  31.78 
 
 
210 aa  50.8  0.000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2974  PadR family transcriptional regulator  24.85 
 
 
213 aa  50.4  0.00001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.412017  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0152  putative PadR transcriptional regulator  24.85 
 
 
218 aa  50.1  0.00001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.762671  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2928  transcriptional regulator, PadR-like family  35.14 
 
 
106 aa  50.4  0.00001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.425588  hitchhiker  0.00045831 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4407  transcriptional regulator protein-like protein  22.52 
 
 
176 aa  50.4  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0291759 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3335  PadR family transcriptional regulator  24.85 
 
 
213 aa  50.4  0.00001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1565  PadR family transcriptional regulator  24.85 
 
 
213 aa  50.4  0.00001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3948  PadR family transcriptional regulator  24.85 
 
 
213 aa  50.4  0.00001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_4021  PadR family transcriptional regulator  24.85 
 
 
213 aa  50.4  0.00001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_13740  predicted transcriptional regulator  31.4 
 
 
196 aa  50.4  0.00001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3036  PadR family transcriptional regulator  24.85 
 
 
213 aa  50.4  0.00001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2223  hypothetical protein  28.12 
 
 
179 aa  50.1  0.00001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000756416  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1318  transcriptional regulator, PadR-like family  22.94 
 
 
185 aa  50.1  0.00001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4194  transcriptional regulator, PadR-like family  24.26 
 
 
199 aa  50.4  0.00001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0778  transcriptional regulator, PadR-like family  36.49 
 
 
115 aa  49.7  0.00002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0301  transcriptional regulator, PadR-like family  33.82 
 
 
176 aa  49.3  0.00002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_06690  predicted transcriptional regulator  31.4 
 
 
191 aa  49.7  0.00002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.00000111873  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4747  transcriptional regulator PadR family protein  29.31 
 
 
252 aa  49.7  0.00002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0617  PadR family transcriptional regulator  31.25 
 
 
108 aa  49.3  0.00002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5383  transcriptional regulator, PadR-like family  24.42 
 
 
249 aa  49.3  0.00002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3845  transcriptional regulator, PadR-like family  25.47 
 
 
174 aa  49.7  0.00002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5375  PadR family transcriptional regulator  30.19 
 
 
181 aa  49.7  0.00002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.658005  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4580  transcriptional regulator, PadR-like family  28.47 
 
 
203 aa  50.1  0.00002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.282947 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5464  PadR family transcriptional regulator  30.19 
 
 
181 aa  49.7  0.00002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0280313 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1493  PadR family transcriptional regulator  33.75 
 
 
204 aa  50.1  0.00002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.170448  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5751  PadR family transcriptional regulator  30.19 
 
 
181 aa  49.7  0.00002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.833226  normal  0.410016 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6781  transcriptional regulator, PadR-like family  26.22 
 
 
174 aa  48.9  0.00003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1408  transcriptional regulator, PadR-like family  34.21 
 
 
118 aa  48.9  0.00003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.364205  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1891  PadR family transcriptional regulator  30.77 
 
 
134 aa  49.3  0.00003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.240691  normal  0.0316492 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1993  transcriptional regulator, PadR-like family  29.27 
 
 
107 aa  48.9  0.00003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.765293  normal  0.399206 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2396  transcriptional regulator, PadR-like family  30.85 
 
 
111 aa  49.3  0.00003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.109028  normal  0.171865 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4876  transcriptional regulator, PadR-like family  24.44 
 
 
226 aa  48.5  0.00004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8052  transcriptional regulator protein-like protein  30 
 
 
175 aa  48.5  0.00004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.440354  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>