86 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BCB4264_A2452 on replicon NC_011725
Organism: Bacillus cereus B4264



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011725  BCB4264_A2452  transcriptional regulator, XRE family  100 
 
 
292 aa  578  1e-164  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2884  transcriptional regulator, XRE family  98.97 
 
 
292 aa  573  1.0000000000000001e-162  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.308835 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1315  transcriptional regulator, XRE family  69.86 
 
 
300 aa  397  1e-109  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000145495  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4288  transcriptional regulator, XRE family  69.86 
 
 
297 aa  396  1e-109  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.492783  normal  0.641627 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1013  transcriptional regulator, XRE family  68.84 
 
 
297 aa  394  1e-109  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0833138  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1058  transcriptional regulator  68.4 
 
 
294 aa  391  1e-108  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.758834  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1271  DNA-binding protein  68.75 
 
 
294 aa  392  1e-108  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00018946  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1239  DNA-binding protein  68.75 
 
 
294 aa  391  1e-108  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1061  transcriptional regulator  68.75 
 
 
294 aa  393  1e-108  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000113559  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1163  DNA-binding protein  68.06 
 
 
294 aa  387  1e-107  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0231046  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1080  DNA-binding protein  68.06 
 
 
294 aa  387  1e-107  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0425  transcriptional regulator  68.15 
 
 
297 aa  383  1e-105  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.732449  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1212  transcriptional regulator, XRE family  69.52 
 
 
298 aa  373  1e-102  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.295347  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4129  transcriptional regulator, XRE family  68.49 
 
 
298 aa  365  1e-100  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000159672  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3869  helix-turn-helix domain-containing protein  31.54 
 
 
288 aa  116  3.9999999999999997e-25  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00219461  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5529  putative transcriptional regulator PlcR  29.68 
 
 
285 aa  108  8.000000000000001e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5473  putative transcriptional regulator PlcR  29.41 
 
 
285 aa  108  8.000000000000001e-23  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00043011  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5479  putative transcriptional regulator PlcR  30 
 
 
285 aa  104  2e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.000111873  hitchhiker  1.75075e-16 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5033  transcription activator  31.39 
 
 
285 aa  103  3e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.191322  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5049  transcriptional activator  31.39 
 
 
285 aa  103  3e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5443  putative transcriptional regulator PlcR  30.77 
 
 
285 aa  103  4e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5481  transcriptional regulator PlcR, putative  30.47 
 
 
285 aa  102  9e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5148  XRE family transcriptional regulator  27.5 
 
 
287 aa  102  1e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1693  XRE family transcriptional regulator  28.52 
 
 
289 aa  81.3  0.00000000000002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0267924  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5199  transcriptional regulator, PlcR  31.8 
 
 
213 aa  80.5  0.00000000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1356  helix-turn-helix domain-containing protein  26.35 
 
 
321 aa  68.9  0.0000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00217094  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2859  helix-turn-helix domain-containing protein  24.2 
 
 
316 aa  61.2  0.00000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000554172  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0295  helix-turn-helix/TPR domain protein  25.52 
 
 
421 aa  55.5  0.000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0167  helix-turn-helix/TPR domain-containing protein  25.52 
 
 
421 aa  55.5  0.000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1747  transcriptional regulator, XRE family  45.45 
 
 
436 aa  54.7  0.000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3595  DNA-binding protein  32.98 
 
 
404 aa  52.8  0.000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2265  XRE family transcriptional regulator  40.28 
 
 
433 aa  52.4  0.000008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.796244  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1554  XRE family transcriptional regulator  38.82 
 
 
310 aa  52.4  0.000009  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2675  XRE family transcriptional regulator  41.38 
 
 
422 aa  51.6  0.00001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0980951  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0026  transcriptional regulator, XRE family  24.3 
 
 
435 aa  51.6  0.00002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0122456  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2474  XRE family transcriptional regulator  33.33 
 
 
267 aa  48.9  0.00009  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3720  XRE family transcriptional regulator  32 
 
 
200 aa  49.3  0.00009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.310668  normal  0.0265405 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0335  helix-turn-helix domain protein  23.35 
 
 
301 aa  48.5  0.0001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2600  transcriptional regulator  37.93 
 
 
423 aa  48.5  0.0001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00128459  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0478  helix-turn-helix domain-containing protein  38.6 
 
 
281 aa  48.1  0.0002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.000000000308908  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3656  putative transcriptional regulator/TPR domain protein  36.07 
 
 
421 aa  47.8  0.0002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4068  XRE family transcriptional regulator  39.34 
 
 
432 aa  48.1  0.0002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.231317 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0172  helix-turn-helix domain-containing protein  44.44 
 
 
313 aa  48.1  0.0002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1784  XRE family transcriptional regulator  35.21 
 
 
184 aa  47.4  0.0003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2177  transcriptional regulator, putative  34.67 
 
 
184 aa  47  0.0003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0423  transcriptional regulator/TPR domain protein, putative  45.61 
 
 
427 aa  47  0.0004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3560  XRE family transcriptional regulator  35.21 
 
 
184 aa  47  0.0004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.444346  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4902  XRE family transcriptional regulator  28 
 
 
185 aa  46.6  0.0004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.634753 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3464  XRE family transcriptional regulator  28 
 
 
185 aa  46.6  0.0004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5384  XRE family transcriptional regulator  28 
 
 
185 aa  46.6  0.0005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.840154  normal  0.424249 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2181  Cro/CI family transcriptional regulator  30.67 
 
 
184 aa  46.6  0.0005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1606  XRE family transcriptional regulator  31.88 
 
 
404 aa  46.6  0.0005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0568777  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3556  XRE family transcriptional regulator  30.67 
 
 
184 aa  46.6  0.0005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.427188  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1730  DNA-binding protein  29.2 
 
 
403 aa  46.6  0.0006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1606  DNA-binding protein  29.2 
 
 
403 aa  46.6  0.0006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1781  DNA-binding protein  29.2 
 
 
403 aa  46.2  0.0006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1788  XRE family transcriptional regulator  30.67 
 
 
184 aa  46.6  0.0006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1567  transcriptional regulator  29.2 
 
 
403 aa  45.4  0.001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1558  transcriptional regulator  29.2 
 
 
403 aa  45.4  0.001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4807  XRE family transcriptional regulator  28 
 
 
185 aa  45.8  0.001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.730727  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2379  hypothetical protein  26.98 
 
 
156 aa  45.4  0.001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4279  XRE family transcriptional regulator  28 
 
 
185 aa  45.8  0.001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.195081 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0793  XRE family transcriptional regulator  23.31 
 
 
282 aa  45.4  0.001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.313892  n/a   
 
 
-
 
NC_013502  Rmar_2812  helix-turn-helix domain protein  33.33 
 
 
347 aa  44.7  0.002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1668  transcriptional regulator, XRE family  43.86 
 
 
256 aa  45.1  0.002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000231765  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0665  transcriptional regulator  40 
 
 
425 aa  44.7  0.002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0803  XRE family transcriptional regulator  28 
 
 
185 aa  45.1  0.002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.215741  normal  0.130979 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_2039  XRE family transcriptional regulator  39.62 
 
 
280 aa  44.7  0.002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1861  DNA-binding protein  30.38 
 
 
403 aa  44.7  0.002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0512  XRE family transcriptional regulator  41.67 
 
 
419 aa  43.5  0.004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3505  transcriptional regulator, XRE family  33.7 
 
 
97 aa  43.5  0.004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0638  putative transcriptional regulator  30.88 
 
 
184 aa  43.1  0.005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1807  DNA-binding protein  29.11 
 
 
403 aa  43.5  0.005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0636  transcriptional activator  51.11 
 
 
423 aa  43.1  0.006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0856  XRE family transcriptional regulator  44 
 
 
275 aa  43.1  0.006  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.609139  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4702  transcriptional activator  51.11 
 
 
419 aa  43.1  0.006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00084826 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0897  helix-turn-helix domain-containing protein  46.67 
 
 
296 aa  43.1  0.006  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.0000000354473  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0725  transcriptional activator  51.11 
 
 
419 aa  43.1  0.006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0514  helix-turn-helix domain-containing protein  51.11 
 
 
426 aa  42.7  0.007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2729  transcriptional regulator, XRE family  35.48 
 
 
117 aa  42.7  0.007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0566  transcriptional regulator  51.11 
 
 
422 aa  42.7  0.008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0508  transcriptional activator (transcriptional regulator)  51.11 
 
 
423 aa  42.4  0.008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0597  transcriptional regulator  51.11 
 
 
422 aa  42.7  0.008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2958  transcriptional regulator HTH family  29.59 
 
 
134 aa  42.4  0.009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0654  DNA-binding protein  51.11 
 
 
424 aa  42.4  0.009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000206988 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0510  transcriptional activator (transcriptional regulator)  51.11 
 
 
423 aa  42.4  0.009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.924451  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>