More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BCB4264_A1962 on replicon NC_011725
Organism: Bacillus cereus B4264



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011725  BCB4264_A1962  DNA-binding response regulator  100 
 
 
225 aa  458  9.999999999999999e-129  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.597164  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3366  DNA-binding response regulator  99.11 
 
 
225 aa  454  1e-127  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.166078  hitchhiker  0.00000000000000126215 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2041  DNA-binding response regulator  94.22 
 
 
225 aa  441  1e-123  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0972255  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2062  DNA-binding response regulator  95.11 
 
 
225 aa  442  1e-123  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000169038  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1772  response regulator  93.78 
 
 
254 aa  437  9.999999999999999e-123  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1790  response regulator  93.33 
 
 
254 aa  436  1e-121  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0306127  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1991  DNA-binding response regulator  93.33 
 
 
254 aa  436  1e-121  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.9362699999999994e-45 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1816  DNA-binding response regulator  92.89 
 
 
254 aa  432  1e-120  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1955  DNA-binding response regulator  92.89 
 
 
228 aa  432  1e-120  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1824  two component transcriptional regulator  90.67 
 
 
225 aa  429  1e-119  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.529032  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1696  two component transcriptional regulator, winged helix family  65.62 
 
 
224 aa  311  4.999999999999999e-84  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1740  two component transcriptional regulator, winged helix family  58.3 
 
 
225 aa  270  1e-71  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000204942  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3138  two component transcriptional regulator  58.3 
 
 
224 aa  268  5e-71  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0044  two component transcriptional regulator, winged helix family  54.55 
 
 
224 aa  251  6e-66  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2001  DNA-binding response regulator  52.73 
 
 
225 aa  243  9.999999999999999e-64  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2977  two component transcriptional regulator  52.73 
 
 
223 aa  243  1.9999999999999999e-63  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0131031  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3028  DNA-binding response regulator  52.27 
 
 
225 aa  241  7.999999999999999e-63  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3261  DNA-binding response regulator  52.27 
 
 
225 aa  241  7.999999999999999e-63  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3258  DNA-binding response regulator  52.27 
 
 
225 aa  241  7.999999999999999e-63  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3013  response regulator  52.27 
 
 
225 aa  240  1e-62  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.120143  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3249  DNA-binding response regulator  52.27 
 
 
225 aa  240  1e-62  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3272  DNA-binding response regulator  52.51 
 
 
225 aa  240  2e-62  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0802882  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2949  response regulator  51.82 
 
 
225 aa  239  2e-62  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.028063  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3279  DNA-binding response regulator  52.51 
 
 
225 aa  240  2e-62  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1288  two component transcriptional regulator  47.75 
 
 
228 aa  219  3e-56  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00000000128008  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1456  two component transcriptional regulator, winged helix family  47.3 
 
 
223 aa  219  3e-56  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.000183373  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1953  DNA-binding response regulator  47.47 
 
 
224 aa  218  5e-56  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2431  response regulator receiver  45.21 
 
 
224 aa  216  2.9999999999999998e-55  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.721266  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2385  two component transcriptional regulator  45.21 
 
 
224 aa  216  2.9999999999999998e-55  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1892  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.95 
 
 
228 aa  215  4e-55  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000392  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1028  two component transcriptional regulator, winged helix family  47.75 
 
 
237 aa  211  5.999999999999999e-54  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0644  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.34 
 
 
236 aa  210  1e-53  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1215  two component transcriptional regulator  45.25 
 
 
223 aa  206  2e-52  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.533573  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1351  DNA-binding response regulator  44.8 
 
 
223 aa  206  2e-52  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3993  DNA-binding response regulator  44.8 
 
 
223 aa  205  4e-52  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.910988 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1193  response regulator  44.34 
 
 
223 aa  205  5e-52  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1389  DNA-binding response regulator  44.34 
 
 
223 aa  205  5e-52  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1191  response regulator  43.89 
 
 
223 aa  204  7e-52  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1213  DNA-binding response regulator  43.89 
 
 
223 aa  204  1e-51  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.203275  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1312  DNA-binding response regulator  43.89 
 
 
223 aa  204  1e-51  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1413  DNA-binding response regulator  43.89 
 
 
223 aa  202  3e-51  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1453  DNA-binding response regulator  43.89 
 
 
223 aa  202  3e-51  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1021  two component transcriptional regulator  44.34 
 
 
223 aa  199  1.9999999999999998e-50  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0070  two component transcriptional regulator  47.53 
 
 
229 aa  199  3e-50  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.834843 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0154  two component transcriptional regulator  42.92 
 
 
238 aa  198  6e-50  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.644268  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0588  two component transcriptional regulator  44.84 
 
 
227 aa  197  1.0000000000000001e-49  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000451147  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1728  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.42 
 
 
233 aa  197  1.0000000000000001e-49  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1903  two component transcriptional regulator  43.53 
 
 
230 aa  197  1.0000000000000001e-49  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2981  two component transcriptional regulator  42.15 
 
 
229 aa  197  1.0000000000000001e-49  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.0000000201285  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0170  two component transcriptional regulator, winged helix family  40.99 
 
 
232 aa  195  5.000000000000001e-49  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1055  DNA-binding response regulator SrrA  42.06 
 
 
241 aa  193  1e-48  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1924  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.24 
 
 
225 aa  194  1e-48  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3739  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.53 
 
 
230 aa  193  2e-48  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000466515  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0302  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.89 
 
 
221 aa  191  6e-48  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0623  DNA-binding response regulator  47.98 
 
 
231 aa  191  7e-48  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000212568  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1580  response regulator receiver  42.92 
 
 
241 aa  190  2e-47  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1549  two component transcriptional regulator  42.92 
 
 
241 aa  190  2e-47  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1897  two component transcriptional regulator  42.15 
 
 
227 aa  189  2.9999999999999997e-47  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.151466  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1011  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.67 
 
 
231 aa  188  4e-47  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3302  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.64 
 
 
231 aa  187  9e-47  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000343135 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0827  two component transcriptional regulator  42.86 
 
 
256 aa  187  1e-46  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00211389  normal  0.244563 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3394  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.89 
 
 
230 aa  187  1e-46  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.103692  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0142  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.15 
 
 
221 aa  186  2e-46  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.709604 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0080  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.55 
 
 
230 aa  186  2e-46  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1756  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.67 
 
 
230 aa  187  2e-46  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.769657  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2796  DNA-binding response regulator  41.99 
 
 
231 aa  185  4e-46  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.512352  hitchhiker  0.00000533196 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2526  DNA-binding response regulator  41.99 
 
 
231 aa  185  5e-46  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0785  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.1 
 
 
235 aa  185  5e-46  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2286  two component transcriptional regulator, winged helix family  40.36 
 
 
231 aa  185  5e-46  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000188753  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3409  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.36 
 
 
236 aa  184  8e-46  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5259  two component transcriptional regulator  42.54 
 
 
235 aa  184  1.0000000000000001e-45  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000559572  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5346  DNA-binding response regulator YycF  42.98 
 
 
235 aa  184  1.0000000000000001e-45  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000234523  hitchhiker  0.00000000000323141 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1784  alkaline phosphatase synthesis transcriptional regulatory protein  41.81 
 
 
234 aa  184  1.0000000000000001e-45  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.561076  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1679  two component transcriptional regulator  42.86 
 
 
224 aa  184  1.0000000000000001e-45  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4006  two component transcriptional regulator  42.54 
 
 
235 aa  183  1.0000000000000001e-45  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.010356  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1750  two component transcriptional regulator  41.81 
 
 
234 aa  184  1.0000000000000001e-45  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5589  DNA-binding response regulator YycF  42.54 
 
 
235 aa  183  2.0000000000000003e-45  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0469644  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2219  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.04 
 
 
240 aa  183  2.0000000000000003e-45  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1865  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.3 
 
 
226 aa  183  2.0000000000000003e-45  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1419  two component transcriptional regulator  42.67 
 
 
231 aa  183  2.0000000000000003e-45  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0720218  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0951  response regulator receiver protein  42.11 
 
 
239 aa  182  3e-45  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000000111905  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5615  DNA-binding response regulator YycF  42.54 
 
 
235 aa  182  5.0000000000000004e-45  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5319  DNA-binding response regulator YycF  42.54 
 
 
235 aa  182  5.0000000000000004e-45  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.169223  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5147  response regulator  42.54 
 
 
235 aa  182  5.0000000000000004e-45  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00168683  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2302  DNA-binding response regulator  41.13 
 
 
231 aa  182  5.0000000000000004e-45  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5163  response regulator  42.54 
 
 
235 aa  182  5.0000000000000004e-45  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00196509  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2915  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.79 
 
 
225 aa  182  5.0000000000000004e-45  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.892207  normal  0.300351 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5572  DNA-binding response regulator YycF  42.54 
 
 
235 aa  182  5.0000000000000004e-45  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.81316e-29 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5715  DNA-binding response regulator YycF  42.54 
 
 
235 aa  182  5.0000000000000004e-45  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.656882  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0609  DNA-binding response regulator  46.64 
 
 
231 aa  182  5.0000000000000004e-45  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0000282114  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5650  DNA-binding response regulator YycF  42.54 
 
 
235 aa  182  5.0000000000000004e-45  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00563499  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2313  two component transcriptional regulator  39.91 
 
 
228 aa  181  1e-44  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0313786  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1200  two component transcriptional regulator  41.99 
 
 
238 aa  181  1e-44  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2564  DNA-binding response regulator  40.26 
 
 
231 aa  180  1e-44  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0589521  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4720  DNA-binding response regulator PhoP  43.64 
 
 
239 aa  181  1e-44  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0488  two component transcriptional regulator, winged helix family  40.09 
 
 
235 aa  180  1e-44  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00220414 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0654  two component transcriptional regulator, winged helix family  40.89 
 
 
229 aa  181  1e-44  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.200991  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1077  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.88 
 
 
235 aa  181  1e-44  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1487  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.05 
 
 
232 aa  181  1e-44  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.487145  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2855  two component transcriptional regulator  39.82 
 
 
224 aa  181  1e-44  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000000952101  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>