67 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BCB4264_A1013 on replicon NC_011725
Organism: Bacillus cereus B4264



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011725  BCB4264_A1013  transcriptional regulator, XRE family  100 
 
 
297 aa  598  1e-170  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0833138  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4288  transcriptional regulator, XRE family  93.94 
 
 
297 aa  563  1.0000000000000001e-159  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.492783  normal  0.641627 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0425  transcriptional regulator  86.53 
 
 
297 aa  518  1e-146  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.732449  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1271  DNA-binding protein  76.79 
 
 
294 aa  449  1e-125  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00018946  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1058  transcriptional regulator  76.45 
 
 
294 aa  448  1e-125  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.758834  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1239  DNA-binding protein  76.45 
 
 
294 aa  447  1e-125  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1061  transcriptional regulator  76.79 
 
 
294 aa  450  1e-125  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000113559  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1080  DNA-binding protein  75.77 
 
 
294 aa  443  1e-123  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1163  DNA-binding protein  75.77 
 
 
294 aa  443  1e-123  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0231046  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4129  transcriptional regulator, XRE family  81.21 
 
 
298 aa  436  1e-121  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000159672  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1212  transcriptional regulator, XRE family  80.68 
 
 
298 aa  430  1e-119  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.295347  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1315  transcriptional regulator, XRE family  75.93 
 
 
300 aa  421  1e-117  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000145495  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2452  transcriptional regulator, XRE family  68.84 
 
 
292 aa  394  1e-109  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2884  transcriptional regulator, XRE family  68.86 
 
 
292 aa  392  1e-108  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.308835 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3869  helix-turn-helix domain-containing protein  30.34 
 
 
288 aa  123  3e-27  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00219461  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5473  putative transcriptional regulator PlcR  31.58 
 
 
285 aa  120  3.9999999999999996e-26  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00043011  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5529  putative transcriptional regulator PlcR  29.9 
 
 
285 aa  118  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5479  putative transcriptional regulator PlcR  28.81 
 
 
285 aa  113  5e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.000111873  hitchhiker  1.75075e-16 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5033  transcription activator  30.45 
 
 
285 aa  110  2.0000000000000002e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.191322  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5049  transcriptional activator  30.45 
 
 
285 aa  110  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5443  putative transcriptional regulator PlcR  30.45 
 
 
285 aa  108  8.000000000000001e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5481  transcriptional regulator PlcR, putative  29.68 
 
 
285 aa  107  4e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5148  XRE family transcriptional regulator  26.9 
 
 
287 aa  104  2e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5199  transcriptional regulator, PlcR  30 
 
 
213 aa  78.6  0.0000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0335  helix-turn-helix domain protein  26.84 
 
 
301 aa  73.9  0.000000000003  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1356  helix-turn-helix domain-containing protein  24.48 
 
 
321 aa  66.6  0.0000000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00217094  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1693  XRE family transcriptional regulator  26.61 
 
 
289 aa  63.2  0.000000005  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0267924  n/a   
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0167  helix-turn-helix/TPR domain-containing protein  25 
 
 
421 aa  62.8  0.000000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0295  helix-turn-helix/TPR domain protein  25 
 
 
421 aa  62.8  0.000000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0026  transcriptional regulator, XRE family  23.79 
 
 
435 aa  57  0.0000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0122456  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2859  helix-turn-helix domain-containing protein  22.26 
 
 
316 aa  55.5  0.000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000554172  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2675  XRE family transcriptional regulator  43.64 
 
 
422 aa  54.3  0.000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0980951  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4068  XRE family transcriptional regulator  42.62 
 
 
432 aa  53.1  0.000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.231317 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1747  transcriptional regulator, XRE family  42.59 
 
 
436 aa  51.2  0.00002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1554  XRE family transcriptional regulator  48.21 
 
 
310 aa  51.6  0.00002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2474  XRE family transcriptional regulator  34.04 
 
 
267 aa  50.8  0.00003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2265  XRE family transcriptional regulator  40.28 
 
 
433 aa  50.8  0.00003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.796244  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3656  putative transcriptional regulator/TPR domain protein  38.6 
 
 
421 aa  50.1  0.00005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2600  transcriptional regulator  36.84 
 
 
423 aa  49.7  0.00007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00128459  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0423  transcriptional regulator/TPR domain protein, putative  44.83 
 
 
427 aa  48.5  0.0001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0793  XRE family transcriptional regulator  26.09 
 
 
282 aa  48.1  0.0002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.313892  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2379  hypothetical protein  26.72 
 
 
156 aa  47  0.0004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013502  Rmar_2812  helix-turn-helix domain protein  30.53 
 
 
347 aa  46.2  0.0006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0172  helix-turn-helix domain-containing protein  41.07 
 
 
313 aa  46.2  0.0006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0512  XRE family transcriptional regulator  32.95 
 
 
419 aa  46.2  0.0007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0478  helix-turn-helix domain-containing protein  24.83 
 
 
281 aa  46.2  0.0007  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.000000000308908  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_2039  XRE family transcriptional regulator  37.93 
 
 
280 aa  45.8  0.0008  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0510  transcriptional activator (transcriptional regulator)  27.56 
 
 
423 aa  45.8  0.0008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.924451  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0508  transcriptional activator (transcriptional regulator)  26.77 
 
 
423 aa  45.4  0.001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0636  transcriptional activator  44 
 
 
423 aa  44.7  0.002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0665  transcriptional regulator  44 
 
 
425 aa  44.3  0.002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0566  transcriptional regulator  32.29 
 
 
422 aa  44.3  0.002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2319  transcriptional regulator, XRE family  37.5 
 
 
124 aa  44.7  0.002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4702  transcriptional activator  44 
 
 
419 aa  44.7  0.002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00084826 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0597  transcriptional regulator  32.29 
 
 
422 aa  44.3  0.002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0514  helix-turn-helix domain-containing protein  44 
 
 
426 aa  44.7  0.002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0725  transcriptional activator  44 
 
 
419 aa  44.7  0.002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1558  transcriptional regulator  26.72 
 
 
403 aa  44.3  0.003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0654  DNA-binding protein  44 
 
 
424 aa  43.9  0.003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000206988 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1567  transcriptional regulator  26.72 
 
 
403 aa  44.3  0.003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1781  DNA-binding protein  26.72 
 
 
403 aa  43.5  0.004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1730  DNA-binding protein  26.72 
 
 
403 aa  43.9  0.004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3595  DNA-binding protein  29.03 
 
 
404 aa  43.5  0.004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1606  DNA-binding protein  26.72 
 
 
403 aa  43.9  0.004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1668  transcriptional regulator, XRE family  42.11 
 
 
256 aa  43.5  0.004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000231765  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003400  GGDEF family protein  26.55 
 
 
657 aa  43.5  0.005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00535181  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2247  transcriptional regulator, XRE family  32.39 
 
 
190 aa  42.7  0.007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>