More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BCB4264_A0082 on replicon NC_011725
Organism: Bacillus cereus B4264



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011725  BCB4264_A0082  DNA-binding protein  100 
 
 		 67 aa  134  3.0000000000000003e-31  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.815457  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5234  DNA-binding protein  98.51 
 
 		 67 aa  134  6.0000000000000005e-31  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000302998 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0070  XRE family transcriptional regulator  97.01 
 
 		 67 aa  132  1.9999999999999998e-30  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0073  DNA-binding protein  97.01 
 
 		 67 aa  131  3.9999999999999996e-30  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0074  DNA-binding protein  97.01 
 
 		 67 aa  131  3.9999999999999996e-30  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0070  transcriptional regulator  97.01 
 
 		 67 aa  131  3.9999999999999996e-30  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0070  transcriptional regulator  97.01 
 
 		 67 aa  131  3.9999999999999996e-30  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0074  DNA-binding protein  97.01 
 
 		 67 aa  131  3.9999999999999996e-30  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0083  DNA-binding protein  97.01 
 
 		 67 aa  131  3.9999999999999996e-30  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000440854 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0086  DNA-binding protein  97.01 
 
 		 67 aa  131  3.9999999999999996e-30  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.786766  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0075  transcriptional regulator, XRE family  74.24 
 
 		 73 aa  104  3e-22  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0072  transcriptional regulator, XRE family  72.73 
 
 		 73 aa  104  4e-22  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0070  XRE family transcriptional regulator  90.38 
 
 		 52 aa  99  2e-20  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0207  transcriptional regulator, XRE family  50.82 
 
 		 106 aa  69.3  0.00000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.0000425004  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2142  XRE family transcriptional regulator  46.67 
 
 		 175 aa  57.4  0.00000007  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1827  XRE family transcriptional regulator  45 
 
 		 252 aa  54.7  0.0000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0400601  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4210  XRE family transcriptional regulator  39.68 
 
 		 106 aa  54.3  0.0000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0378977 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0058  transcriptional regulator, XRE family  36.67 
 
 		 112 aa  52.4  0.000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0711688  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1153  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  41.82 
 
 		 1143 aa  51.2  0.000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.648529  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_67  hypothetical protein  40.98 
 
 		 72 aa  51.2  0.000005  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3248  transcriptional regulator, XRE family  41.38 
 
 		 110 aa  50.8  0.000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2401  XRE family transcriptional regulator  36.51 
 
 		 97 aa  50.1  0.000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000000242769  hitchhiker  0.0000223583 
 
 
-
 
NC_002936  DET1555  DNA-binding protein  39.34 
 
 		 72 aa  50.1  0.00001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.00000236293  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1971  XRE family transcriptional regulator  35.94 
 
 		 112 aa  49.7  0.00001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.910423 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0903  helix-turn-helix domain-containing protein  42.37 
 
 		 255 aa  50.1  0.00001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.0000000193278  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2281  XRE family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 74 aa  50.1  0.00001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.048354  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0623  transcriptional regulator, putative  37.1 
 
 		 302 aa  48.9  0.00002  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.0864444  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2248  transcriptional regulator, XRE family  37.29 
 
 		 505 aa  48.9  0.00002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.99928  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20950  putative prophage repressor  38.71 
 
 		 200 aa  49.3  0.00002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000578065  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1992  transcriptional regulator, XRE family  39.66 
 
 		 81 aa  48.9  0.00002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1868  XRE family transcriptional regulator  39.66 
 
 		 81 aa  48.9  0.00002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1668  transcriptional regulator, XRE family  44.44 
 
 		 256 aa  48.9  0.00002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000231765  n/a   
 
 
-
 
NC_010679  Bphyt_7274  transcriptional regulator, XRE family  36.67 
 
 		 79 aa  48.9  0.00002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.21577  normal  0.150525 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0712  transcriptional regulator, XRE family  40.68 
 
 		 504 aa  49.3  0.00002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1349  XRE family transcriptional regulator  38.1 
 
 		 97 aa  49.3  0.00002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2077  transcriptional regulator, XRE family  39.66 
 
 		 81 aa  48.9  0.00002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2028  transcriptional regulator, XRE family  37.29 
 
 		 194 aa  48.9  0.00003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.165285  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2116  hypothetical protein  38.71 
 
 		 86 aa  48.5  0.00003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0684  XRE family transcriptional regulator  38.1 
 
 		 101 aa  48.5  0.00003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0300399  normal  0.200777 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2752  XRE family transcriptional regulator  40.32 
 
 		 113 aa  47.8  0.00004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.272342  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1725  transcriptional regulator, XRE family  36.07 
 
 		 145 aa  48.1  0.00004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4162  XRE family transcriptional regulator  34.92 
 
 		 98 aa  48.1  0.00004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD0622  transcriptional regulator, putative  38.1 
 
 		 303 aa  47.8  0.00005  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.436499  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3871  transcriptional regulator, XRE family  37.29 
 
 		 72 aa  47.8  0.00005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0299  XRE family transcriptional regulator  41.94 
 
 		 71 aa  47.8  0.00005  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00000289962  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0101  XRE family transcriptional regulator  41.94 
 
 		 71 aa  47.8  0.00005  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000000391644  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2981  helix-turn-helix domain-containing protein  37.29 
 
 		 387 aa  47.8  0.00005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3920  transcriptional regulator, XRE family  37.29 
 
 		 72 aa  47.8  0.00005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.00000806628  normal  0.211868 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4613  XRE family transcriptional regulator  42.11 
 
 		 180 aa  47.4  0.00006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.101875  hitchhiker  0.00323798 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0076  XRE family transcriptional regulator  42.11 
 
 		 180 aa  47.4  0.00006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.196991  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2380  DNA-binding protein  34.43 
 
 		 186 aa  47.8  0.00006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.801132  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1135  XRE family transcriptional regulator  34.92 
 
 		 99 aa  47.4  0.00006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5244  XRE family transcriptional regulator  42.11 
 
 		 180 aa  47.4  0.00006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.664792  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5615  XRE family transcriptional regulator  42.11 
 
 		 180 aa  47.4  0.00006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.322287  normal  0.0794813 
 
 
-
 
NC_002978  WD0255  transcriptional regulator, putative  38.71 
 
 		 308 aa  47.4  0.00007  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0594  transcriptional regulator, XRE family  35.59 
 
 		 117 aa  47.4  0.00007  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5444  XRE family transcriptional regulator  40.35 
 
 		 180 aa  47  0.00008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  decreased coverage  0.00345676  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2259  transcriptional regulator, XRE family  38.98 
 
 		 255 aa  47  0.00008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00208232 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4894  XRE family transcriptional regulator  40.35 
 
 		 180 aa  47  0.00008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0489002 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3324  Cro/CI family transcriptional regulator  35.59 
 
 		 212 aa  47  0.00009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1743  transcriptional regulator, XRE family  40 
 
 		 402 aa  47  0.00009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2434  transcriptional regulator, XRE family  40.68 
 
 		 77 aa  47  0.00009  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0508  transcriptional regulator, putative  37.1 
 
 		 312 aa  46.6  0.0001  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2951  DNA-binding protein  34.43 
 
 		 186 aa  46.6  0.0001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000726653  hitchhiker  0.00000000446905 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3536  helix-turn-helix domain protein  36.92 
 
 		 513 aa  46.2  0.0001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.948286 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1436  transcriptional regulator, XRE family  40 
 
 		 83 aa  47  0.0001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.118358  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4208  XRE family transcriptional regulator  39.66 
 
 		 129 aa  46.6  0.0001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.629555  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4036  transcriptional regulator, XRE family  43.86 
 
 		 84 aa  46.6  0.0001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.610056  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3134  DNA-binding protein  41.67 
 
 		 80 aa  46.6  0.0001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0889  XRE family transcriptional regulator  38.1 
 
 		 81 aa  46.6  0.0001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4237  transcriptional regulator, XRE family  39.68 
 
 		 140 aa  46.6  0.0001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.55821  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1481  XRE family transcriptional regulator  34.92 
 
 		 97 aa  46.6  0.0001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.817787 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0461  XRE family transcriptional regulator  34.92 
 
 		 97 aa  46.6  0.0001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.171408  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3530  transcriptional regulator, XRE family  36.51 
 
 		 97 aa  46.2  0.0001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.606022  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31160  hypothetical protein  36.51 
 
 		 107 aa  46.2  0.0001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000126154  unclonable  8.75499e-23 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5158  transcriptional regulator, XRE family  41.38 
 
 		 198 aa  46.2  0.0001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.503819  normal  0.690311 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0941  transcriptional regulator, XRE family  39.66 
 
 		 141 aa  46.6  0.0001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.551097  normal  0.0671843 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2433  transcriptional regulator, XRE family  32.31 
 
 		 132 aa  45.8  0.0002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000213647 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1819  XRE family transcriptional regulator  35.09 
 
 		 69 aa  45.8  0.0002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.344657  n/a   
 
 
-
 
NC_004632  PSPTO_B0045  PbsX family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 117 aa  45.4  0.0002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.108741  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1430  transcriptional regulator, XRE family  35.48 
 
 		 490 aa  45.8  0.0002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.236575  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2195  XRE family transcriptional regulator  34.92 
 
 		 83 aa  46.2  0.0002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3463  XRE family transcriptional regulator  35 
 
 		 97 aa  45.8  0.0002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1522  transcriptional regulator, XRE family  36.51 
 
 		 68 aa  45.8  0.0002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.379498  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2436  XRE family transcriptional regulator  36.51 
 
 		 68 aa  45.8  0.0002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.109963  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2793  transcriptional regulator, XRE family  32.31 
 
 		 108 aa  46.2  0.0002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000000236555  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0986  transcriptional regulator, XRE family  32.14 
 
 		 130 aa  45.8  0.0002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0584  transcriptional regulator  37.29 
 
 		 495 aa  45.4  0.0002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0697  transcriptional regulator, XRE family  35.94 
 
 		 475 aa  46.2  0.0002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.280462  normal  0.896724 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1427  transcriptional regulator, XRE family  36.51 
 
 		 68 aa  45.8  0.0002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3050  transcriptional regulator, XRE family  35.59 
 
 		 195 aa  45.4  0.0002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0215158  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3132  putative transcription regulator protein  37.7 
 
 		 209 aa  45.4  0.0003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.25062  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0702  XRE family transcriptional regulator  36.67 
 
 		 137 aa  45.4  0.0003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000217339  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5338  transcriptional regulator, XRE family  37.29 
 
 		 503 aa  45.1  0.0003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.81894 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3407  transcriptional regulator, XRE family  37.29 
 
 		 192 aa  45.1  0.0003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2158  XRE family transcriptional regulator  36.07 
 
 		 224 aa  45.4  0.0003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00315318  normal  0.41098 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3036  XRE family transcriptional regulator  33.93 
 
 		 67 aa  45.4  0.0003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3227  transcriptional regulator  37.29 
 
 		 201 aa  45.1  0.0003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.792428  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19180  predicted transcriptional regulator  38.98 
 
 		 141 aa  45.4  0.0003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.433834  normal  0.0717748 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2228  XRE family transcriptional regulator  35.09 
 
 		 197 aa  45.1  0.0003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.386344  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>