More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BCAH820_5263 on replicon NC_011773
Organism: Bacillus cereus AH820



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011773  BCAH820_5263  transcriptional regulator, LysR family  100 
 
 
297 aa  610  1e-173  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5025  LysR family transcriptional regulator  98.32 
 
 
297 aa  601  1.0000000000000001e-171  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5664  transcriptional regulator, LysR family  98.32 
 
 
297 aa  601  1.0000000000000001e-171  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5406  LysR family transcriptional regulator  98.32 
 
 
297 aa  601  1.0000000000000001e-171  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5293  transcriptional regulator, LysR family  98.65 
 
 
297 aa  602  1.0000000000000001e-171  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4855  LysR family transcriptional regulator  97.98 
 
 
297 aa  599  1e-170  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4870  LysR family transcriptional regulator  97.98 
 
 
297 aa  598  1e-170  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5338  transcriptional regulator, LysR family  97.98 
 
 
297 aa  598  1e-170  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5280  LysR family transcriptional regulator  96.96 
 
 
297 aa  589  1e-167  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4969  LysR family transcriptional regulator  94.26 
 
 
297 aa  573  1.0000000000000001e-163  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3716  LysR family transcriptional regulator  87.12 
 
 
297 aa  536  1e-151  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1148  transcriptional regulator, LysR family  46.49 
 
 
303 aa  275  7e-73  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000219344  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2199  transcriptional regulator, LysR family  41.96 
 
 
298 aa  225  8e-58  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1679  transcriptional regulator, LysR family  38.33 
 
 
304 aa  216  4e-55  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1713  transcriptional regulator, LysR family  38.33 
 
 
304 aa  215  5.9999999999999996e-55  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2915  transcriptional regulator, LysR family  38.54 
 
 
305 aa  208  7e-53  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3776  transcriptional regulator, LysR family  38.16 
 
 
314 aa  208  8e-53  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.988638  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0411  LysR family transcriptional regulator  37.02 
 
 
308 aa  198  7e-50  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1877  LysR family transcriptional regulator  36.8 
 
 
297 aa  190  2.9999999999999997e-47  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000269934  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0449  LysR family transcriptional regulator  34.8 
 
 
307 aa  186  4e-46  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00010985  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0820  transcriptional regulator, LysR family  34.47 
 
 
307 aa  182  6e-45  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0509  transcriptional regulator, LysR family  35.42 
 
 
293 aa  181  1e-44  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.187244  hitchhiker  0.00160332 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1443  LysR family transcriptional regulator  34.69 
 
 
303 aa  178  1e-43  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1555  LysR family transcriptional regulator  34.01 
 
 
318 aa  175  7e-43  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000214293  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05450  transcriptional regulator, LysR family  33.56 
 
 
296 aa  175  8e-43  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0434511  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0666  LysR family transcriptional regulator  30.72 
 
 
295 aa  175  9.999999999999999e-43  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1791  LysR family transcriptional regulator  33.46 
 
 
290 aa  172  7.999999999999999e-42  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.027343 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1717  transcriptional regulator  34.8 
 
 
314 aa  171  1e-41  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2531  transcriptional regulator, LysR family  33.33 
 
 
308 aa  167  2e-40  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.351481  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2159  transcriptional regulator, LysR family  33.33 
 
 
308 aa  167  2e-40  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.597139  hitchhiker  0.0000167573 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0284  LysR family transcriptional regulator  30.38 
 
 
294 aa  167  2.9999999999999998e-40  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3033  transcriptional regulator, LysR family  34.96 
 
 
325 aa  167  2.9999999999999998e-40  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  hitchhiker  0.0089298  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0065  LysR family transcriptional regulator  37.2 
 
 
296 aa  166  2.9999999999999998e-40  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1993  transcriptional regulator, LysR family  30.95 
 
 
319 aa  166  5.9999999999999996e-40  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1184  LysR family transcriptional regulator  31.83 
 
 
308 aa  165  6.9999999999999995e-40  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.204393 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1255  LysR family transcriptional regulator  36.3 
 
 
304 aa  165  8e-40  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.515451  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2243  LysR family transcriptional regulator  34.83 
 
 
302 aa  164  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.839693  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2243  LysR family transcriptional regulator  34.95 
 
 
289 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2291  LysR family transcriptional regulator  35.59 
 
 
300 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2158  LysR family transcriptional regulator  35.59 
 
 
300 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0300496  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2099  LysR family transcriptional regulator  35.59 
 
 
300 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2069  LysR family transcriptional regulator  34.83 
 
 
295 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.450351  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1763  LysR family transcriptional regulator  34.72 
 
 
296 aa  164  2.0000000000000002e-39  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1978  LysR family transcriptional regulator  34.93 
 
 
296 aa  163  3e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.224272  normal  0.0418865 
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6941  transcriptional regulator, LysR family  33.46 
 
 
298 aa  163  4.0000000000000004e-39  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4080  LysR family transcriptional regulator  31.83 
 
 
308 aa  162  8.000000000000001e-39  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3660  LysR family transcriptional regulator  34.01 
 
 
295 aa  162  9e-39  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.141797 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4465  transcriptional regulator, LysR family  31.79 
 
 
319 aa  161  1e-38  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00192923  normal  0.232029 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1825  LysR family transcriptional regulator  34.02 
 
 
302 aa  161  1e-38  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.705034  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4402  transcriptional regulator, LysR family  31.79 
 
 
319 aa  161  1e-38  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0958  LysR family transcriptional regulator  35.25 
 
 
297 aa  161  2e-38  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0456  LysR family transcriptional regulator  34.15 
 
 
294 aa  160  2e-38  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2293  LysR family transcriptional regulator  35.14 
 
 
301 aa  160  2e-38  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1637  LysR family transcriptional regulator  31.49 
 
 
308 aa  160  3e-38  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.841057  normal  0.105618 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2680  transcriptional regulator, LysR family  35.64 
 
 
308 aa  160  4e-38  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.578382  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2280  transcriptional regulator, LysR family  33.55 
 
 
305 aa  159  4e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0269  LysR substrate-binding  35.27 
 
 
298 aa  159  5e-38  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.670723  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2775  transcriptional regulator, LysR family  33.89 
 
 
297 aa  159  5e-38  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.332368  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5262  LysR family transcriptional regulator  32.43 
 
 
296 aa  158  9e-38  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0804009  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0687  LysR family transcriptional regulator  32.86 
 
 
311 aa  158  9e-38  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.591422  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20130  LysR family transcriptional regulator  32.29 
 
 
308 aa  158  9e-38  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1386  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  31.14 
 
 
308 aa  157  1e-37  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4025  transcriptional regulator, LysR family  31.14 
 
 
308 aa  157  2e-37  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.854112  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1239  LysR family transcriptional regulator  31.14 
 
 
308 aa  157  2e-37  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.603267  hitchhiker  0.00000000418584 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4062  hypothetical protein  31.74 
 
 
302 aa  156  4e-37  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.228225  normal  0.120917 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1732  putative transcriptional regulator  31.94 
 
 
308 aa  156  4e-37  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.470848  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0263  transcriptional regulator, LysR family  34.57 
 
 
322 aa  155  5.0000000000000005e-37  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1656  LysR family transcriptional regulator  35.15 
 
 
297 aa  156  5.0000000000000005e-37  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2659  LysR family transcriptional regulator  33.45 
 
 
313 aa  155  6e-37  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.112809  normal  0.412166 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0266  LysR family transcriptional regulator  33.45 
 
 
313 aa  155  6e-37  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.275341  normal  0.0743516 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0396  LysR family transcriptional regulator  29.62 
 
 
300 aa  155  6e-37  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.21777  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4022  LysR family transcriptional regulator  30.8 
 
 
308 aa  155  8e-37  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000162423 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1692  rubisco operon transcriptional regulator  31.85 
 
 
332 aa  154  1e-36  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.250885  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1657  putative DNA-binding transcriptional regulator  32.39 
 
 
290 aa  155  1e-36  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0307226  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3732  transcriptional regulator, LysR family  33.33 
 
 
300 aa  154  1e-36  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000560912  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5945  transcriptional regulator, LysR family  32.4 
 
 
307 aa  154  2e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.626175  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2640  RuBisCO operon transcriptional regulator  32.27 
 
 
305 aa  154  2e-36  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0637  transcriptional regulator, LysR family  31.72 
 
 
312 aa  154  2e-36  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.0000713061  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0171  transcriptional regulator, LysR family  32.95 
 
 
305 aa  154  2e-36  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1390  transcriptional regulator, LysR family  31.85 
 
 
308 aa  154  2e-36  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1656  LysR family transcriptional regulator  34.81 
 
 
297 aa  154  2e-36  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.191617  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1928  putative DNA-binding transcriptional regulator  32.39 
 
 
290 aa  153  2.9999999999999998e-36  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0121617  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5031  LysR family transcriptional regulator  34.13 
 
 
297 aa  153  2.9999999999999998e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.361143 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4870  transcriptional regulator, LysR family  31.19 
 
 
298 aa  153  2.9999999999999998e-36  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0726  LysR family transcriptional regulator  29.55 
 
 
308 aa  153  2.9999999999999998e-36  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.414898  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6344  LysR family transcriptional regulator  34.81 
 
 
297 aa  154  2.9999999999999998e-36  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.552099  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1735  LysR family transcriptional regulator  34.81 
 
 
297 aa  154  2.9999999999999998e-36  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3313  LysR family transcriptional regulator  30.54 
 
 
302 aa  154  2.9999999999999998e-36  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.600178  normal  0.236469 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2494  transcriptional regulator, LysR family  30 
 
 
322 aa  152  4e-36  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02086  predicted DNA-binding transcriptional regulator  32.98 
 
 
293 aa  152  5e-36  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0640427  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02045  hypothetical protein  32.98 
 
 
293 aa  152  5e-36  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.074382  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2293  putative DNA-binding transcriptional regulator  32.98 
 
 
293 aa  152  5e-36  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2304  putative DNA-binding transcriptional regulator  32.98 
 
 
293 aa  152  5e-36  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00791446 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3293  putative DNA-binding transcriptional regulator  32.98 
 
 
293 aa  152  5e-36  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.020887  normal  0.438576 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1477  LysR family transcriptional regulator  32.21 
 
 
314 aa  152  5e-36  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.490418  normal  0.438801 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2454  putative DNA-binding transcriptional regulator  32.98 
 
 
293 aa  152  5e-36  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0809  putative DNA-binding transcriptional regulator  32.63 
 
 
293 aa  152  7e-36  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4630  LysR family transcriptional regulator  31.53 
 
 
302 aa  152  7e-36  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5024  LysR family transcriptional regulator  30.86 
 
 
311 aa  151  1e-35  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0432035  normal  0.889367 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1748  LysR family transcriptional regulator  34.47 
 
 
297 aa  151  1e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.8769 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>