More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BCAH820_4690 on replicon NC_011773
Organism: Bacillus cereus AH820



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_005945  BAS4471  translation initiation factor IF-3  100 
 
 
195 aa  339  8e-93  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  2.20658e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4317  translation initiation factor IF-3  100 
 
 
195 aa  339  8e-93  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  1.17232e-12  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4306  translation initiation factor IF-3  100 
 
 
195 aa  339  8e-93  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  1.45665e-14  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4706  translation initiation factor IF-3  100 
 
 
195 aa  339  8e-93  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  4.32272e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4819  translation initiation factor IF-3  100 
 
 
186 aa  339  9e-93  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  6.90292e-13  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4690  translation initiation factor IF-3  100 
 
 
166 aa  338  2e-92  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  7.37112e-62 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4699  translation initiation factor IF-3  100 
 
 
166 aa  338  2e-92  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  2.60309e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0554  translation initiation factor IF-3  99.4 
 
 
166 aa  338  3e-92  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  1.2216e-07  unclonable  2.53125e-26 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4683  translation initiation factor IF-3  99.4 
 
 
166 aa  338  3e-92  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  1.01645e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4406  translation initiation factor IF-3  98.8 
 
 
166 aa  335  2e-91  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  1.11711e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3261  translation initiation factor IF-3  96.39 
 
 
195 aa  330  7e-90  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  1.25648e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0798  translation initiation factor IF-3  83.03 
 
 
202 aa  288  2e-77  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2660  translation initiation factor IF-3  81.93 
 
 
190 aa  285  2e-76  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  6.48528e-12  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1409  translation initiation factor IF-3  63.86 
 
 
172 aa  229  1e-59  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  unclonable  1.37178e-16  unclonable  1.34184e-28 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1241  translation initiation factor 3  62.65 
 
 
170 aa  226  1e-58  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  2.56408e-14  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1244  translation initiation factor IF-3  67.88 
 
 
175 aa  224  3e-58  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  decreased coverage  3.17297e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1772  translation initiation factor IF-3  65.45 
 
 
200 aa  220  7e-57  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  1.39127e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1738  translation initiation factor IF-3  65.45 
 
 
200 aa  220  7e-57  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  1.96833e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1225  translation initiation factor 3  60.12 
 
 
164 aa  210  7e-54  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  3.14962e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1090  hypothetical protein  57.41 
 
 
179 aa  202  2e-51  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  1.29093e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2400  translation initiation factor IF-3  54.27 
 
 
164 aa  201  4e-51  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00646191  normal  0.390668 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1311  translation initiation factor IF-3  56.44 
 
 
164 aa  201  5e-51  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  6.44552e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1384  translation initiation factor IF-3  63.25 
 
 
176 aa  197  5e-50  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.000113221  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2033  translation initiation factor IF-3  63.58 
 
 
216 aa  197  7e-50  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  1.52468e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4639  translation initiation factor IF-3  54.55 
 
 
219 aa  194  3e-49  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  4.86529e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0215  translation initiation factor IF-3  56.52 
 
 
198 aa  194  5e-49  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  2.62616e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2172  translation initiation factor IF-3  59.46 
 
 
154 aa  194  7e-49  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  8.64988e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1516  translation initiation factor IF-3  54.55 
 
 
172 aa  192  2e-48  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.027432  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1089  translation initiation factor IF-3  61.45 
 
 
176 aa  192  2e-48  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  1.88384e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1032  translation initiation factor IF-3  56.52 
 
 
238 aa  191  4e-48  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.82167  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1383  translation initiation factor IF-3  51.52 
 
 
187 aa  190  9e-48  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  1.11233e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1434  translation initiation factor IF-3  57.14 
 
 
225 aa  189  1e-47  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0842222  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1319  translation initiation factor IF-3  54.32 
 
 
190 aa  188  3e-47  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0918782  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1204  translation initiation factor IF-3  56.44 
 
 
171 aa  188  3e-47  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  2.44125e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0333  translation initiation factor IF-3  49.39 
 
 
194 aa  185  3e-46  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.392305  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3052  translation initiation factor IF-3  51.52 
 
 
182 aa  184  7e-46  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2666  translation initiation factor IF-3  52.17 
 
 
176 aa  182  1e-45  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1937  translation initiation factor IF-3  48.17 
 
 
194 aa  182  2e-45  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0510424  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0588  translation initiation factor IF-3  48.17 
 
 
194 aa  182  2e-45  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.954262  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1149  translation initiation factor IF-3  48.45 
 
 
202 aa  181  3e-45  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1758  translation initiation factor 3  52.6 
 
 
154 aa  180  6e-45  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  1.20038e-09  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1578  translation initiation factor IF-3  50.91 
 
 
178 aa  179  1e-44  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1976  translation initiation factor IF-3  50.91 
 
 
173 aa  179  2e-44  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0447  translation initiation factor IF-3  56.44 
 
 
164 aa  179  2e-44  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  4.72838e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3163  translation initiation factor IF-3  52.8 
 
 
252 aa  179  2e-44  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0170352  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05720  translation initiation factor 3  50.31 
 
 
207 aa  178  3e-44  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  1.88671e-05  normal  0.0169059 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0425  translation initiation factor IF-3  51.85 
 
 
171 aa  178  3e-44  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  9.64088e-06  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0534  translation initiation factor IF-3  50.98 
 
 
165 aa  178  3e-44  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  7.58155e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0428  translation initiation factor IF-3  51.28 
 
 
156 aa  178  3e-44  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0983  translation initiation factor IF-3  52.5 
 
 
176 aa  177  6e-44  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.104 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1875  translation initiation factor IF-3  50.93 
 
 
239 aa  177  8e-44  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.384688 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2156  translation initiation factor IF-3  50.9 
 
 
175 aa  176  9e-44  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  1.87486e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2466  translation initiation factor IF-3  49.7 
 
 
177 aa  176  1e-43  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  hitchhiker  0.00240261  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3024  translation initiation factor IF-3  50.62 
 
 
173 aa  176  1e-43  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3224  translation initiation factor IF-3  49.7 
 
 
183 aa  176  1e-43  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.51494 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1968  translation initiation factor IF-3  49.7 
 
 
183 aa  176  1e-43  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.00361564  hitchhiker  0.00796429 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2109  translation initiation factor IF-3  49.08 
 
 
219 aa  176  1e-43  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  2.73336e-05  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2642  translation initiation factor IF-3  50.91 
 
 
178 aa  176  1e-43  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0641  translation initiation factor IF-3  48.77 
 
 
175 aa  176  1e-43  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0129727 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2769  translation initiation factor IF-3  50.91 
 
 
178 aa  176  1e-43  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1882  translation initiation factor IF-3  50.93 
 
 
204 aa  176  1e-43  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0284235  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3480  translation initiation factor IF-3  49.7 
 
 
183 aa  176  1e-43  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0422454  normal  0.0155112 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0766  translation initiation factor IF-3  53.59 
 
 
181 aa  175  2e-43  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2146  translation initiation factor IF-3  55.56 
 
 
173 aa  175  2e-43  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  6.92224e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3158  translation initiation factor IF-3  48.15 
 
 
173 aa  175  2e-43  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1858  translation initiation factor IF-3  55.56 
 
 
173 aa  174  3e-43  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  6.44129e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14590  translation initiation factor 3  52.8 
 
 
401 aa  174  3e-43  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1937  translation initiation factor IF-3  45.68 
 
 
174 aa  174  3e-43  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.413665  normal  0.0464847 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2418  translation initiation factor IF-3  52.5 
 
 
196 aa  174  4e-43  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1678  translation initiation factor IF-3  50.31 
 
 
170 aa  174  6e-43  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0127847  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4144  translation initiation factor IF-3  50.31 
 
 
227 aa  173  8e-43  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0415962  hitchhiker  0.000102893 
 
 
-
 
NC_002620  TC0221  translation initiation factor IF-3  50.93 
 
 
186 aa  173  8e-43  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  hitchhiker  0.00015702  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0044  translation initiation factor IF-3  47.5 
 
 
173 aa  173  9e-43  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3182  translation initiation factor IF-3  49.69 
 
 
205 aa  173  1e-42  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0466683  normal  0.175076 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1477  translation initiation factor 3  52.17 
 
 
396 aa  172  1e-42  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0613769  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2538  translation initiation factor IF-3  46.58 
 
 
173 aa  173  1e-42  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.838605  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2619  translation initiation factor IF-3  57.14 
 
 
176 aa  172  2e-42  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1480  translation initiation factor IF-3  52.17 
 
 
356 aa  172  2e-42  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.87235e-11 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2996  translation initiation factor IF-3  49.06 
 
 
173 aa  172  2e-42  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3328  translation initiation factor IF-3  52.17 
 
 
243 aa  172  2e-42  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.825238  normal  0.390058 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2218  translation initiation factor IF-3  48.15 
 
 
182 aa  171  3e-42  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  decreased coverage  2.64089e-06  normal  0.129164 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3025  translation initiation factor 3  51.55 
 
 
238 aa  172  3e-42  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.335133 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2042  translation initiation factor IF-3  49.7 
 
 
199 aa  171  3e-42  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0708817  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6087  Translation initiation factor 3 (IF-3)-like protein  49.69 
 
 
222 aa  171  3e-42  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.897729  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2981  translation initiation factor 3  51.55 
 
 
238 aa  172  3e-42  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11658  translation initiation factor IF-3  49.69 
 
 
201 aa  171  3e-42  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2996  translation initiation factor 3  51.55 
 
 
238 aa  171  3e-42  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.171641  normal  0.0309942 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2229  translation initiation factor IF-3  50.62 
 
 
173 aa  171  4e-42  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00231449 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3488  translation initiation factor 3  52.8 
 
 
173 aa  171  4e-42  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1161  translation initiation factor 3  52.6 
 
 
154 aa  171  4e-42  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.41261  normal  0.930143 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2054  translation initiation factor IF-3  50.33 
 
 
152 aa  171  4e-42  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000423398  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0660  translation initiation factor IF-3  46.91 
 
 
176 aa  171  4e-42  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  3.67528e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5473  translation initiation factor IF-3  50.31 
 
 
204 aa  171  5e-42  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1269  translation initiation factor 3  49.7 
 
 
225 aa  171  5e-42  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.628011  normal  0.508823 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2459  translation initiation factor 3  49.09 
 
 
243 aa  171  5e-42  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1443  translation initiation factor 3  55.63 
 
 
143 aa  170  8e-42  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  1.86833e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2150  translation initiation factor IF-3  47.53 
 
 
173 aa  169  1e-41  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.235978  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1612  translation initiation factor IF-3  46.91 
 
 
173 aa  169  1e-41  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00252676 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1095  translation initiation factor IF-3  49.36 
 
 
156 aa  170  1e-41  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.171775  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1778  translation initiation factor IF-3  50 
 
 
156 aa  170  1e-41  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.843423 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>