More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BCAH820_4459 on replicon NC_011773
Organism: Bacillus cereus AH820



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011773  BCAH820_4459  transcription elongation factor GreA  100 
 
 
175 aa  352  2e-96  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0719149 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0737  transcription elongation factor GreA  96 
 
 
175 aa  340  5.999999999999999e-93  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.718576  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4226  transcription elongation factor GreA  96.57 
 
 
175 aa  340  8e-93  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4499  transcription elongation factor GreA  95.43 
 
 
175 aa  338  2e-92  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.251038  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4275  transcription elongation factor GreA  100 
 
 
158 aa  315  1e-85  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.282937  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4112  transcription elongation factor GreA  100 
 
 
158 aa  315  1e-85  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4123  transcription elongation factor GreA  100 
 
 
158 aa  315  1e-85  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4607  transcription elongation factor GreA  100 
 
 
158 aa  315  1e-85  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4461  transcription elongation factor GreA  99.37 
 
 
158 aa  313  7e-85  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.310238  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4512  transcription elongation factor GreA  99.37 
 
 
158 aa  313  7e-85  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000192957  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3092  transcription elongation factor GreA  95.57 
 
 
158 aa  301  3.0000000000000004e-81  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0972  transcription elongation factor GreA  77.85 
 
 
158 aa  249  2e-65  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2481  transcription elongation factor GreA  77.85 
 
 
159 aa  248  2e-65  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0472  transcription elongation factor GreA  62.66 
 
 
160 aa  194  4.0000000000000005e-49  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.384084  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1389  transcription elongation factor  61.94 
 
 
160 aa  192  3e-48  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  unclonable  3.76815e-17  hitchhiker  8.922560000000001e-24 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0660  transcription elongation factor GreA  61.04 
 
 
156 aa  188  4e-47  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.143981  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1246  transcription elongation factor GreA  60.13 
 
 
162 aa  188  4e-47  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0270341  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1174  transcription elongation factor GreA  65.41 
 
 
158 aa  187  5e-47  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1667  transcription elongation factor GreA  62.89 
 
 
158 aa  181  7e-45  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1701  transcription elongation factor GreA  62.89 
 
 
158 aa  181  7e-45  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0289  transcription elongation factor GreA  58.71 
 
 
160 aa  177  4.999999999999999e-44  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1214  transcription elongation factor GreA  55.41 
 
 
158 aa  174  7e-43  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000000531032  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2782  transcription elongation factor GreA  52.56 
 
 
158 aa  169  2e-41  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2468  transcription elongation factor GreA  52.56 
 
 
158 aa  169  2e-41  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1612  transcription elongation factor GreA  61.69 
 
 
160 aa  166  2e-40  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.986319  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0162  transcription elongation factor GreA  57.05 
 
 
156 aa  162  2.0000000000000002e-39  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  7.34558e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0151  GreA/GreB family elongation factor  54.84 
 
 
160 aa  162  2.0000000000000002e-39  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.000000000000044733  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2897  transcription elongation factor GreA  52.53 
 
 
159 aa  162  2.0000000000000002e-39  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00740  transcription elongation factor GreA  53.69 
 
 
161 aa  162  3e-39  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000778945  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0174  transcription elongation factor GreA  52.6 
 
 
158 aa  157  5e-38  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000153177  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0809  transcription elongation factor GreA  53.33 
 
 
157 aa  157  7e-38  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000158219  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0115  GreA/GreB family elongation factor  47.77 
 
 
159 aa  151  5e-36  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000000137367  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0250  transcription elongation factor GreA  51.3 
 
 
158 aa  149  2e-35  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000127535  normal  0.353375 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0208  transcription elongation factor GreA  53.21 
 
 
158 aa  149  2e-35  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.000000182043  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2353  transcription elongation factor GreA  47.44 
 
 
157 aa  148  4e-35  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.000000957781  decreased coverage  0.00150302 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0658  transcription elongation factor GreA  49.67 
 
 
162 aa  147  6e-35  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000000211465  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0130  transcription elongation factor GreA  48.37 
 
 
163 aa  142  2e-33  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  unclonable  0.000000000129551  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0395  transcription elongation factor GreA  49.67 
 
 
158 aa  143  2e-33  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2181  transcription elongation factor GreA  49.33 
 
 
154 aa  142  2e-33  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.015275  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0627  transcription elongation factor GreA  47.5 
 
 
157 aa  139  3e-32  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1676  transcription elongation factor GreA  44.23 
 
 
155 aa  138  3.9999999999999997e-32  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000127836  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1002  transcription elongation factor GreA  49.02 
 
 
156 aa  136  2e-31  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000716767  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1680  transcription elongation factor GreA  46.85 
 
 
161 aa  135  4e-31  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.212705 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1128  transcription elongation factor GreA  47.71 
 
 
156 aa  134  5e-31  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.0000607304  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1648  transcription elongation factor GreA  50.38 
 
 
159 aa  134  6.0000000000000005e-31  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0116  transcription elongation factor GreA  53.02 
 
 
164 aa  134  8e-31  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.000000184686  hitchhiker  0.00194606 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1129  GreA/GreB family elongation factor  46.05 
 
 
158 aa  133  9.999999999999999e-31  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2073  transcription elongation factor GreA  46.67 
 
 
168 aa  133  9.999999999999999e-31  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.383099 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1577  transcription elongation factor GreA  46 
 
 
161 aa  132  1.9999999999999998e-30  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1372  transcription elongation factor GreA  46.67 
 
 
161 aa  132  3e-30  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1728  transcription elongation factor GreA  45.33 
 
 
166 aa  131  5e-30  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2209  transcription elongation factor GreA  45.33 
 
 
166 aa  131  5e-30  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2119  transcription elongation factor GreA  45.33 
 
 
166 aa  131  5e-30  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.736032  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0077  transcription elongation factor GreA  42.95 
 
 
157 aa  130  9e-30  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.00207801  normal  0.174892 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0008  transcription elongation factor GreA  42.31 
 
 
157 aa  130  9e-30  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.000636821  hitchhiker  0.00000229317 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0394  transcription elongation factor GreA  43.71 
 
 
158 aa  129  2.0000000000000002e-29  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.715679  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1851  transcription elongation factor GreA  46.71 
 
 
158 aa  129  3e-29  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.888423  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0798  transcription elongation factor GreA  44.52 
 
 
159 aa  128  3e-29  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.000258876  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19500  transcription elongation factor GreA  50.7 
 
 
155 aa  128  4.0000000000000003e-29  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.000496817  unclonable  0.000000000539704 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0563  transcription elongation factor GreA  45.57 
 
 
158 aa  128  4.0000000000000003e-29  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00266162  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0453  transcription elongation factor GreA  43.71 
 
 
158 aa  128  4.0000000000000003e-29  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4930  transcription elongation factor GreA  44.81 
 
 
158 aa  128  4.0000000000000003e-29  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.41417 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0327  transcription elongation factor GreA  44.74 
 
 
161 aa  128  4.0000000000000003e-29  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0850  transcription elongation factor GreA  46.75 
 
 
158 aa  127  6e-29  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal  0.209846 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3355  transcription elongation factor GreA  45.45 
 
 
158 aa  127  6e-29  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.00153993  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2677  transcription elongation factor GreA  45.22 
 
 
160 aa  127  7.000000000000001e-29  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2549  transcription elongation factor GreA  45.22 
 
 
160 aa  127  7.000000000000001e-29  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1653  transcription elongation factor GreA  44.67 
 
 
162 aa  127  7.000000000000001e-29  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0186205  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0875  transcription elongation factor GreA  44.81 
 
 
158 aa  127  9.000000000000001e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.73287  normal  0.0631013 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2027  transcription elongation factor GreA  47.06 
 
 
158 aa  127  1.0000000000000001e-28  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1263  transcription elongation factor GreA  45.22 
 
 
168 aa  126  1.0000000000000001e-28  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0260201 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1264  transcription elongation factor GreA  46.41 
 
 
158 aa  125  2.0000000000000002e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.165873 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1258  transcription elongation factor GreA  41.62 
 
 
176 aa  125  2.0000000000000002e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0812  transcription elongation factor GreA  46.41 
 
 
158 aa  125  2.0000000000000002e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2213  transcription elongation factor GreA  46.15 
 
 
158 aa  125  2.0000000000000002e-28  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1293  transcription elongation factor GreA  46.41 
 
 
158 aa  125  2.0000000000000002e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4821  transcription elongation factor GreA  44.08 
 
 
154 aa  125  3e-28  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3030  transcription elongation factor GreA  45.64 
 
 
152 aa  125  3e-28  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.953757  decreased coverage  0.00490744 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1182  transcription elongation factor GreA  47.4 
 
 
158 aa  125  3e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.22898 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2780  transcription elongation factor GreA  45.75 
 
 
158 aa  125  3e-28  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.115654  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2866  transcription elongation factor GreA  45.1 
 
 
158 aa  125  3e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0891965  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1170  transcription elongation factor GreA  47.4 
 
 
158 aa  125  3e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1813  transcription elongation factor GreA  43.71 
 
 
158 aa  125  3e-28  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  decreased coverage  0.00359574  normal  0.0174151 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_13240  transcription elongation factor GreA  45.21 
 
 
156 aa  125  4.0000000000000003e-28  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  decreased coverage  0.00714364  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2677  GreA/GreB family elongation factor  45.1 
 
 
158 aa  125  4.0000000000000003e-28  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1980  transcription elongation factor GreA  44.08 
 
 
158 aa  124  5e-28  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00819368 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4435  transcription elongation factor GreA  47.4 
 
 
158 aa  124  6e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3076  transcription elongation factor GreA  44 
 
 
171 aa  124  7e-28  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0910  transcription elongation factor GreA  43.51 
 
 
157 aa  124  7e-28  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3017  transcription elongation factor GreA  42 
 
 
157 aa  124  8.000000000000001e-28  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1310  transcription elongation factor GreA  43.33 
 
 
162 aa  124  9e-28  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.324095  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4293  transcription elongation factor GreA  44.67 
 
 
157 aa  123  1e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.795745 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1776  transcription elongation factor GreA  44.37 
 
 
156 aa  123  1e-27  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.325664  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1564  transcription elongation factor GreA  43.71 
 
 
160 aa  123  1e-27  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  unclonable  0.0000000000290434  hitchhiker  0.000735134 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1733  transcription elongation factor GreA  45.39 
 
 
158 aa  123  1e-27  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.669906  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0423  transcription elongation factor GreA  44.37 
 
 
156 aa  123  1e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2192  transcription elongation factor GreA  43.95 
 
 
173 aa  123  1e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0127913  normal  0.0702404 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0201  transcription elongation factor GreA  41.33 
 
 
167 aa  123  1e-27  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000273731  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0788  transcription elongation factor GreA  46.41 
 
 
158 aa  122  2e-27  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3373  transcription elongation factor GreA  44.3 
 
 
158 aa  122  2e-27  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  2.81015e-17  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>