More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BCAH820_3828 on replicon NC_011773
Organism: Bacillus cereus AH820



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_003909  BCE_3854  transcription elongation factor NusA  100 
 
 
368 aa  739    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00000110606  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3914  transcription elongation factor NusA  98.91 
 
 
368 aa  733    Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000262405  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3667  transcription elongation factor NusA  100 
 
 
368 aa  739    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.0000000535514  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3557  transcription elongation factor NusA  100 
 
 
368 aa  739    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000000374855  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3575  transcription elongation factor NusA  100 
 
 
368 aa  739    Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000000544237  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2468  transcription elongation factor NusA  97.01 
 
 
366 aa  717    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000156927  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1330  transcription elongation factor NusA  98.91 
 
 
368 aa  735    Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000381059  hitchhiker  0.000133045 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3638  transcription elongation factor NusA  98.37 
 
 
368 aa  731    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.000480862  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3953  transcription elongation factor NusA  100 
 
 
368 aa  739    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.000000000569611  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3863  transcription elongation factor NusA  100 
 
 
368 aa  739    Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000188549  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3828  transcription elongation factor NusA  100 
 
 
368 aa  739    Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  1.7515e-61 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1152  transcription elongation factor NusA  80.17 
 
 
382 aa  584  1e-166  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.0000000162475  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2044  transcription elongation factor NusA  78.16 
 
 
383 aa  575  1.0000000000000001e-163  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1326  transcription elongation factor NusA  63.61 
 
 
391 aa  467  9.999999999999999e-131  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1352  transcription elongation factor NusA  63.61 
 
 
391 aa  467  9.999999999999999e-131  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0833  transcription elongation factor NusA  61.79 
 
 
407 aa  462  1e-129  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.792423  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1047  NusA antitermination factor  64.14 
 
 
362 aa  452  1.0000000000000001e-126  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.00000000000154988  unclonable  0.0000000137146 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0994  NusA antitermination factor  62.46 
 
 
404 aa  449  1e-125  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000000558995  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3679  NusA antitermination factor  62.54 
 
 
493 aa  451  1e-125  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000224558  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3191  transcription elongation factor NusA  63.87 
 
 
381 aa  447  1.0000000000000001e-124  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000141994  normal  0.115207 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1432  NusA antitermination factor  63.34 
 
 
373 aa  446  1.0000000000000001e-124  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000109855  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1960  transcription elongation factor NusA  59.51 
 
 
384 aa  441  9.999999999999999e-123  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0055359  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1665  NusA antitermination factor  58.67 
 
 
365 aa  431  1e-120  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000721447  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1648  transcription elongation factor NusA  59.13 
 
 
346 aa  428  1e-119  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000247005  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1441  NusA antitermination factor  61.08 
 
 
380 aa  418  1e-116  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0429547  normal  0.129125 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0923  transcription elongation factor NusA  59.54 
 
 
359 aa  417  9.999999999999999e-116  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00000194155  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0454  NusA antitermination factor  61.45 
 
 
382 aa  414  1e-114  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07820  NusA antitermination factor  62.17 
 
 
377 aa  414  1e-114  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0811  transcription elongation factor NusA  58.02 
 
 
423 aa  411  1e-113  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.0000010954  hitchhiker  0.00234388 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0897  transcription elongation factor NusA  56.6 
 
 
378 aa  403  1e-111  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0054777  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1943  transcription elongation factor NusA  55.22 
 
 
366 aa  397  1e-109  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1661  transcription elongation factor NusA  55.22 
 
 
366 aa  395  1e-109  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1358  transcription elongation factor  55.91 
 
 
365 aa  381  1e-105  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.946051  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2777  NusA antitermination factor  54.39 
 
 
354 aa  377  1e-103  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.000000726051  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0696  NusA antitermination factor  52.99 
 
 
395 aa  367  1e-100  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.00000000696258  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_857  transcription elongation factor  50.73 
 
 
487 aa  362  5.0000000000000005e-99  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.000000272174  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3683  NusA antitermination factor  53.18 
 
 
442 aa  361  1e-98  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00388019  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0876  transcription elongation factor NusA  49.85 
 
 
491 aa  360  2e-98  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0313079  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0814  transcription elongation factor NusA  51.03 
 
 
382 aa  358  8e-98  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.0015948  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0985  transcription elongation factor NusA  50.15 
 
 
491 aa  357  9.999999999999999e-98  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.00150789  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1584  transcription elongation factor NusA  52.87 
 
 
381 aa  357  1.9999999999999998e-97  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0634631  normal  0.227689 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0473  NusA antitermination factor  51.59 
 
 
444 aa  352  4e-96  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000679634  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1134  NusA antitermination factor  50 
 
 
442 aa  352  5e-96  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.0000746814  normal  0.939177 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3749  NusA antitermination factor  50.29 
 
 
442 aa  352  5e-96  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00409142  unclonable  0.0000152852 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1899  transcription elongation factor NusA  51.68 
 
 
383 aa  352  7e-96  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000368219  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2983  transcription elongation factor NusA  52.91 
 
 
382 aa  350  2e-95  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.0049800000000001e-28 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1300  transcription elongation factor NusA  52.91 
 
 
383 aa  350  2e-95  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000861889  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1586  transcription elongation factor NusA  50.15 
 
 
385 aa  346  4e-94  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  decreased coverage  0.00876176  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0912  NusA antitermination factor  50.29 
 
 
372 aa  345  6e-94  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1553  transcription elongation factor NusA  51.36 
 
 
406 aa  343  2.9999999999999997e-93  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  8.02973e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0996  NusA antitermination factor  52.34 
 
 
369 aa  340  2e-92  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.00000000936712  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0607  NusA antitermination factor  46.97 
 
 
433 aa  339  4e-92  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000000457156  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0961  transcription elongation factor NusA  49.85 
 
 
401 aa  335  5e-91  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.462921  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3729  NusA antitermination factor  48.86 
 
 
506 aa  335  5.999999999999999e-91  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.00128644  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0430  transcription elongation factor  48.34 
 
 
473 aa  335  9e-91  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.2178  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0378  transcription elongation factor NusA  46.26 
 
 
383 aa  335  1e-90  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.138784  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1667  transcription elongation factor NusA  51.68 
 
 
385 aa  334  1e-90  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1227  transcription elongation factor NusA  47.8 
 
 
449 aa  332  6e-90  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.000158035  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0380  transcription elongation factor NusA  47.16 
 
 
391 aa  332  7.000000000000001e-90  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.078834  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0497  transcription elongation factor NusA  48.68 
 
 
440 aa  331  1e-89  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3036  transcription elongation factor NusA  46.48 
 
 
475 aa  327  3e-88  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00201036  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2515  transcription elongation factor NusA  45.21 
 
 
443 aa  323  4e-87  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3219  NusA antitermination factor  48.77 
 
 
503 aa  323  4e-87  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.517549  normal  0.104407 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1049  NusA antitermination factor  46.96 
 
 
357 aa  323  4e-87  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000259791  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3626  NusA antitermination factor  46.61 
 
 
536 aa  322  5e-87  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.475474 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3928  transcription elongation factor NusA  47.08 
 
 
534 aa  322  5e-87  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1049  NusA antitermination factor  46.31 
 
 
538 aa  319  5e-86  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1517  transcription elongation factor NusA  48.39 
 
 
348 aa  319  5e-86  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.261597  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1047  transcription elongation factor NusA  47.79 
 
 
344 aa  318  7e-86  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.0000699393  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1065  transcription elongation factor NusA  47.49 
 
 
344 aa  318  7.999999999999999e-86  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000123432  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1206  NusA antitermination factor  47.62 
 
 
360 aa  317  2e-85  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00000000876177  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2163  transcription elongation factor NusA  47.2 
 
 
537 aa  317  3e-85  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2075  transcription elongation factor NusA  47.2 
 
 
537 aa  317  3e-85  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.183083  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2297  NusA antitermination factor  46.02 
 
 
532 aa  317  3e-85  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0358902 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3161  transcription elongation factor NusA  44.03 
 
 
429 aa  316  4e-85  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00111335  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0749  transcription elongation factor NusA  46.9 
 
 
535 aa  316  5e-85  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3332  NusA antitermination factor  47.55 
 
 
351 aa  316  5e-85  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.166447  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3729  NusA antitermination factor  46.31 
 
 
545 aa  315  8e-85  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0217708 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4616  NusA antitermination factor  46.61 
 
 
536 aa  315  9e-85  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0831604  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3439  transcription elongation factor NusA  46.61 
 
 
552 aa  315  9.999999999999999e-85  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.787039  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0295  transcription elongation factor NusA  47.2 
 
 
531 aa  314  9.999999999999999e-85  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0917388  normal  0.0106159 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4069  transcription elongation factor NusA  46.31 
 
 
535 aa  313  1.9999999999999998e-84  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0598  transcription elongation factor NusA  47.21 
 
 
539 aa  314  1.9999999999999998e-84  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0442  transcription elongation factor NusA  46.92 
 
 
537 aa  313  1.9999999999999998e-84  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2821  NusA antitermination factor  46.02 
 
 
560 aa  314  1.9999999999999998e-84  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.143768  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0029  transcription elongation factor NusA  47.21 
 
 
536 aa  313  2.9999999999999996e-84  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0055  transcription elongation factor NusA  46.63 
 
 
537 aa  313  2.9999999999999996e-84  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.255127  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2925  NusA antitermination factor  45.72 
 
 
545 aa  311  1e-83  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.624825  normal  0.0501763 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2699  transcription termination factor NusA  45.72 
 
 
545 aa  311  1e-83  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.311383  normal  0.577361 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4389  transcription elongation factor NusA  46.02 
 
 
533 aa  311  1e-83  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0022  transcription elongation factor NusA  46.92 
 
 
538 aa  310  2e-83  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.0361846 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2613  NusA antitermination factor  46.31 
 
 
544 aa  311  2e-83  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.109477  normal  0.215578 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0233  transcription elongation factor NusA  46.33 
 
 
540 aa  309  4e-83  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.157572  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1059  NusA antitermination factor  46.45 
 
 
333 aa  308  8e-83  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  hitchhiker  0.00843571  normal  0.0553593 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3564  NusA antitermination factor  46.31 
 
 
365 aa  308  1.0000000000000001e-82  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0133345  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0166  transcription elongation factor NusA  45.72 
 
 
538 aa  308  1.0000000000000001e-82  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.590136  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3041  transcription elongation factor NusA  44.25 
 
 
572 aa  308  1.0000000000000001e-82  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2412  transcription elongation factor NusA  44.81 
 
 
441 aa  308  1.0000000000000001e-82  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.659924  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2431  transcription elongation factor NusA  44.21 
 
 
428 aa  308  1.0000000000000001e-82  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.786529  normal  0.585225 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0061  transcription elongation factor NusA  45.77 
 
 
449 aa  306  3e-82  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.941395  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>