213 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BCAH820_2649 on replicon NC_011773
Organism: Bacillus cereus AH820



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_005945  BAS2451  hypothetical protein  100 
 
 		 165 aa  337  5e-92  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.073124  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2413  hypothetical protein  100 
 
 		 165 aa  337  5e-92  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000015361  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2631  hypothetical protein  100 
 
 		 165 aa  337  5e-92  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2649  hypothetical protein  100 
 
 		 165 aa  337  5e-92  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000115894 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2376  hypothetical protein  99.39 
 
 		 165 aa  335  1.9999999999999998e-91  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.247862  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2658  hypothetical protein  95.76 
 
 		 165 aa  326  8e-89  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.287076  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2509  PadR-like family transcriptional regulator  90.91 
 
 		 165 aa  312  9.999999999999999e-85  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0736667  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2669  hypothetical protein  89.7 
 
 		 165 aa  311  1.9999999999999998e-84  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.010535 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2655  hypothetical protein  89.7 
 
 		 165 aa  310  4.999999999999999e-84  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2700  hypothetical protein  97.62 
 
 		 112 aa  169  1e-41  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.724274  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7317  PadR-like family transcriptional regulator  26.04 
 
 		 229 aa  66.2  0.0000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.939389  normal  0.16375 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4677  PadR family transcriptional regulator  27.81 
 
 		 203 aa  64.7  0.0000000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3567  PadR-like family transcriptional regulator  25.6 
 
 		 213 aa  60.8  0.000000008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.979058  normal  0.850546 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2527  transcriptional regulator, PadR-like family  25.73 
 
 		 202 aa  60.8  0.000000009  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2019  transcriptional regulator, PadR-like family  38.1 
 
 		 160 aa  60.1  0.00000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.41981 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3512  transcriptional repressor PadR  36.46 
 
 		 179 aa  59.3  0.00000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5080  PadR-like family transcriptional regulator  26.37 
 
 		 212 aa  59.3  0.00000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.6626  hitchhiker  0.0000475922 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3098  PadR family transcriptional regulator  26.67 
 
 		 187 aa  58.5  0.00000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2204  PadR family transcriptional regulator  31 
 
 		 179 aa  58.5  0.00000004  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0586729  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1535  transcriptional regulator, PadR-like family  22.93 
 
 		 183 aa  57.8  0.00000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.918183  normal  0.0405313 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1669  PadR family transcriptional regulator  38.1 
 
 		 179 aa  57.8  0.00000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.107785  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1645  transcriptional regulator  38.1 
 
 		 179 aa  57.8  0.00000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1946  transcriptional regulator, PadR family  38.1 
 
 		 179 aa  57.8  0.00000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.145779  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1910  PadR family transcriptional regulator  38.1 
 
 		 174 aa  57.8  0.00000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4528  PadR family transcriptional regulator  30.09 
 
 		 272 aa  57.4  0.00000008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_2045  PadR family transcriptional regulator  31.4 
 
 		 116 aa  57.4  0.00000008  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4200  transcriptional regulator, PadR-like family  25.58 
 
 		 209 aa  57.4  0.00000009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4562  transcriptional regulator PadR family protein  25.97 
 
 		 211 aa  57  0.0000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.605184  normal  0.596762 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1035  PadR family transcriptional regulator  33.72 
 
 		 108 aa  55.8  0.0000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00460025  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37830  transcriptional regulator, PadR family  25.73 
 
 		 227 aa  55.8  0.0000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3551  transcriptional regulator, PadR-like family  27.78 
 
 		 210 aa  55.5  0.0000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0813  PadR family transcriptional regulator  28 
 
 		 195 aa  55.8  0.0000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.403384 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3510  transcriptional regulator, PadR-like family  29.38 
 
 		 198 aa  55.5  0.0000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2234  PadR-like family transcriptional regulator  33.71 
 
 		 174 aa  55.8  0.0000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.156481  decreased coverage  0.00573263 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4588  transcriptional regulator, PadR-like family  36.25 
 
 		 125 aa  55.1  0.0000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00658109  normal  0.0547899 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1345  transcriptional regulator, PadR-like family  29.47 
 
 		 190 aa  55.5  0.0000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10046  hypothetical protein  29.06 
 
 		 180 aa  55.1  0.0000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7032  transcriptional regulator, PadR-like family  28.07 
 
 		 181 aa  54.7  0.0000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3358  transcriptional regulator, PadR-like family  24.21 
 
 		 213 aa  54.7  0.0000006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1313  transcriptional regulator, PadR-like family  35.8 
 
 		 113 aa  54.3  0.0000007  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.107904  normal  0.0202461 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6039  PadR-like family transcriptional regulator  27.12 
 
 		 181 aa  54.3  0.0000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.258534  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0868  PadR-like family transcriptional regulator  27.97 
 
 		 181 aa  54.3  0.0000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.525718  normal  0.842124 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1117  transcriptional regulator, PadR-like family  34.57 
 
 		 122 aa  54.3  0.0000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.742645 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4304  hypothetical protein  30.95 
 
 		 119 aa  53.9  0.0000009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3146  PadR-like family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 185 aa  53.9  0.000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.280559 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3110  transcriptional regulator, PadR-like family  28.65 
 
 		 325 aa  53.1  0.000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000271029  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1163  transcriptional regulator, PadR-like family  23.93 
 
 		 191 aa  52.8  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.984047 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8234  transcriptional regulator, PadR-like family  32 
 
 		 123 aa  52.4  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8052  transcriptional regulator protein-like protein  26.11 
 
 		 175 aa  52.4  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.440354  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5073  transcriptional regulator, PadR-like family  21.55 
 
 		 205 aa  52.8  0.000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.189916  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_13740  predicted transcriptional regulator  22.5 
 
 		 196 aa  52.8  0.000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1371  transcriptional regulator, PadR-like family  26.72 
 
 		 182 aa  52.4  0.000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0218081  normal  0.0807721 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0172  PadR-like family transcriptional regulator  32.73 
 
 		 242 aa  52.4  0.000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.786766 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2179  PadR-like family transcriptional regulator  23.7 
 
 		 186 aa  52.4  0.000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00487663 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3181  transcriptional regulator, PadR-like family  21.71 
 
 		 177 aa  52  0.000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.000117068  hitchhiker  0.000000000506359 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2137  PadR family transcriptional regulator  25.81 
 
 		 199 aa  51.6  0.000005  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2396  transcriptional regulator, PadR-like family  27.96 
 
 		 111 aa  51.2  0.000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.109028  normal  0.171865 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4747  transcriptional regulator PadR family protein  29.06 
 
 		 252 aa  51.2  0.000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_R0045  transcriptional regulator, PadR-like family  33.75 
 
 		 110 aa  50.8  0.000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02430  transcriptional regulator, PadR family  30.97 
 
 		 174 aa  50.4  0.00001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.467679  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5383  transcriptional regulator, PadR-like family  28.93 
 
 		 249 aa  50.1  0.00001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0755  PadR family transcriptional regulator  31.33 
 
 		 125 aa  50.4  0.00001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.916558  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0346  transcriptional regulator, PadR-like family  22.94 
 
 		 201 aa  50.4  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.824785  normal  0.03301 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1119  transcriptional regulator, PadR-like family  29.7 
 
 		 123 aa  50.1  0.00001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000828793  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8023  transcriptional regulator protein-like protein  23.75 
 
 		 178 aa  50.1  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3127  transcriptional regulator, PadR-like family  34.21 
 
 		 128 aa  49.3  0.00002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.177743  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1891  PadR family transcriptional regulator  32.05 
 
 		 134 aa  49.3  0.00002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.240691  normal  0.0316492 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5217  PadR family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 118 aa  49.7  0.00002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5375  PadR family transcriptional regulator  29.25 
 
 		 181 aa  49.3  0.00002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.658005  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5305  PadR family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 118 aa  49.7  0.00002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5464  PadR family transcriptional regulator  29.25 
 
 		 181 aa  49.3  0.00002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0280313 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2017  Transcriptional regulator PadR-like protein  23.15 
 
 		 181 aa  50.1  0.00002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  decreased coverage  0.00625751  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5597  PadR family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 118 aa  49.7  0.00002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.459425  normal  0.499532 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5751  PadR family transcriptional regulator  29.25 
 
 		 181 aa  49.3  0.00002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.833226  normal  0.410016 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3281  PadR family transcriptional regulator  30.85 
 
 		 109 aa  49.7  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3031  transcriptional regulator, PadR-like family  38.81 
 
 		 150 aa  49.7  0.00002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2191  transcriptional regulator, PadR-like family  34.18 
 
 		 115 aa  49.7  0.00002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  3.02647e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1923  transcriptional regulator, PadR-like family  28.1 
 
 		 184 aa  49.3  0.00002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.870316 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0778  transcriptional regulator, PadR-like family  35.14 
 
 		 115 aa  48.9  0.00003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4957  transcriptional regulator, PadR-like family  23.73 
 
 		 212 aa  48.9  0.00003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2928  transcriptional regulator, PadR-like family  33.78 
 
 		 106 aa  48.9  0.00003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.425588  hitchhiker  0.00045831 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1267  transcriptional regulator, PadR-like family  34.18 
 
 		 185 aa  48.5  0.00004  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1493  PadR family transcriptional regulator  33.75 
 
 		 204 aa  48.5  0.00004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.170448  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2223  hypothetical protein  26.73 
 
 		 179 aa  48.5  0.00004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000756416  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0301  transcriptional regulator, PadR-like family  32 
 
 		 176 aa  48.1  0.00005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4407  transcriptional regulator protein-like protein  23.03 
 
 		 176 aa  48.1  0.00005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0291759 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1921  PadR family transcriptional regulator  31.76 
 
 		 114 aa  48.1  0.00005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9364  transcriptional regulator protein-like protein  23.16 
 
 		 224 aa  48.1  0.00005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.401607  normal  0.508496 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3822  transcriptional regulator, PadR-like family  29.47 
 
 		 114 aa  47.8  0.00006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2526  PadR-like family transcriptional regulator  28.28 
 
 		 183 aa  47.8  0.00006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0713427  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1641  PadR-like family transcriptional regulator  32.86 
 
 		 130 aa  47.8  0.00007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.103704 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0735  PadR-like family transcriptional regulator  32.47 
 
 		 111 aa  47.8  0.00007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6781  transcriptional regulator, PadR-like family  29.25 
 
 		 174 aa  47.8  0.00007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3845  transcriptional regulator, PadR-like family  28.18 
 
 		 174 aa  47.8  0.00007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3702  transcriptional regulator, PadR-like family  25.45 
 
 		 212 aa  47.4  0.00008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_06690  predicted transcriptional regulator  31.4 
 
 		 191 aa  47.4  0.00009  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.00000111873  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0870  transcriptional regulator, PadR-like family  32.91 
 
 		 109 aa  47.4  0.00009  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.126206  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4576  PadR family transcriptional regulator  26.51 
 
 		 181 aa  47  0.0001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2076  transcriptional regulator, PadR-like family  28.21 
 
 		 126 aa  47  0.0001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.668384  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4160  transcriptional regulator, PadR-like family  26.86 
 
 		 222 aa  46.6  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.354182  normal  0.0431624 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>