More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BCAH820_2545 on replicon NC_011773
Organism: Bacillus cereus AH820



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Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006274  BCZK2270  TetR family transcriptional regulator  99.5 
 
 
211 aa  407  1e-113  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0152904  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2312  TetR family transcriptional regulator  99.5 
 
 
201 aa  407  1e-113  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  3.94535e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2545  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 
201 aa  409  1e-113  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.91976e-46 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2354  TetR family transcriptional regulator  99.5 
 
 
201 aa  405  1e-112  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0622512  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2530  TetR family transcriptional regulator  99.5 
 
 
201 aa  405  1e-112  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.828016  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1689  transcriptional regulator, TetR family  95.02 
 
 
201 aa  394  1e-109  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0605741  hitchhiker  3.10562e-15 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4901  TetR family transcriptional regulator  34.56 
 
 
209 aa  78.2  7e-14  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4440  transcriptional regulator, TetR family  31.25 
 
 
220 aa  72.4  4e-12  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1191  TetR family transcriptional regulator  28.78 
 
 
219 aa  70.9  1e-11  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00105223  normal  0.516093 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4427  TetR family transcriptional regulator  27.67 
 
 
216 aa  70.9  1e-11  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0851  TetR family transcriptional regulator  33.11 
 
 
241 aa  70.1  2e-11  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2249  transcriptional regulator, TetR family  31.25 
 
 
228 aa  70.1  2e-11  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.115177  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4597  TetR family transcriptional regulator  28.1 
 
 
217 aa  68.6  6e-11  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00568004 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4071  TetR family transcriptional regulator  31.03 
 
 
235 aa  67.4  1e-10  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.365856  normal  0.0686473 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4133  TetR family transcriptional regulator  26.32 
 
 
217 aa  67.4  1e-10  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.110099 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0158  transcriptional regulator, TetR family  26.85 
 
 
207 aa  66.6  2e-10  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0147  transcriptional regulator, TetR family  26.85 
 
 
207 aa  66.6  2e-10  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.710629  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2630  TetR family transcriptional regulator  31.97 
 
 
205 aa  66.6  2e-10  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0697093  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0140  TetR family transcriptional regulator  26.85 
 
 
208 aa  66.6  3e-10  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1298  transcriptional regulator TetR family  26.9 
 
 
235 aa  66.2  3e-10  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2510  TetR family transcriptional regulator  32.67 
 
 
245 aa  65.5  5e-10  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3617  TetR family transcriptional regulator  26.75 
 
 
219 aa  64.7  8e-10  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4750  TetR family transcriptional regulator  26.75 
 
 
219 aa  64.7  8e-10  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.0204514 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1888  TetR family transcriptional regulator  31.29 
 
 
212 aa  64.7  8e-10  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3949  TetR family transcriptional regulator  31.29 
 
 
212 aa  65.1  8e-10  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.549729 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5533  TetR family transcriptional regulator  26.75 
 
 
219 aa  64.7  8e-10  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.445482  normal  0.987341 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3584  TetR family transcriptional regulator  31.29 
 
 
212 aa  64.7  1e-09  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1731  TetR family transcriptional regulator  25.53 
 
 
199 aa  64.3  1e-09  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.206322 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3926  TetR family transcriptional regulator  26.87 
 
 
258 aa  64.3  1e-09  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0176  transcriptional regulator, TetR family  30.28 
 
 
263 aa  64.7  1e-09  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.99928  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5093  transcriptional regulator, TetR family  24.49 
 
 
233 aa  64.3  1e-09  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0355233 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5697  TetR family transcriptional regulator  28.3 
 
 
220 aa  63.9  2e-09  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.197583  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4259  regulatory protein TetR  27.69 
 
 
208 aa  63.2  2e-09  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.344931  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1169  transcriptional regulator, TetR family  27.39 
 
 
214 aa  63.5  2e-09  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2134  TetR family transcriptional regulator  30.67 
 
 
212 aa  63.2  3e-09  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.175968 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0653  TetR family transcriptional regulator  31.08 
 
 
239 aa  62.4  4e-09  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.895019 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4300  transcriptional regulator  30.15 
 
 
225 aa  62.8  4e-09  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5516  TetR family transcriptional regulator  31.21 
 
 
270 aa  62.4  4e-09  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.165925  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4904  TetR family transcriptional regulator  30.19 
 
 
225 aa  62.4  4e-09  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1000  TetR family transcriptional regulator  25.17 
 
 
204 aa  62.8  4e-09  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5749  TetR family transcriptional regulator  30.99 
 
 
225 aa  62.4  4e-09  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.147109  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0328  putative transcriptional regulator  29.94 
 
 
222 aa  62  5e-09  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.536324  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4322  transcriptional regulator, TetR family  31.08 
 
 
242 aa  62  6e-09  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5451  transcriptional regulator TetR family  30.63 
 
 
241 aa  61.6  7e-09  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4014  transcriptional regulator, TetR family  32.41 
 
 
225 aa  61.6  8e-09  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4343  transcriptional regulator, TetR family  32.41 
 
 
225 aa  61.6  8e-09  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0349599  decreased coverage  7.50918e-07 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1864  transcriptional regulator, TetR family  28.08 
 
 
218 aa  61.2  9e-09  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.796207  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2561  transcriptional regulator, TetR family  29.01 
 
 
203 aa  61.2  1e-08  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3330  TetR family transcriptional regulator  32.41 
 
 
225 aa  61.2  1e-08  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.648103  normal  0.907597 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3059  TetR family transcriptional regulator  28.57 
 
 
205 aa  60.5  2e-08  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5785  TetR family transcriptional regulator  25.14 
 
 
219 aa  60.5  2e-08  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.558716 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4020  TetR family transcriptional regulator  37.07 
 
 
258 aa  60.1  2e-08  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.12217  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1987  TetR family transcriptional regulator  27.86 
 
 
210 aa  60.5  2e-08  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3413  transcriptional regulator, TetR family  28.37 
 
 
246 aa  59.7  3e-08  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5245  transcriptional regulator, TetR family  27.97 
 
 
251 aa  59.3  4e-08  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS02063  putative transcription regulator transcription regulator protein  27.27 
 
 
224 aa  59.3  4e-08  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0495626  normal  0.936254 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0175  TetR family transcriptional regulator  23.94 
 
 
203 aa  59.3  4e-08  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3905  TetR family transcriptional regulator  35.56 
 
 
211 aa  58.9  4e-08  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2165  transcriptional regulator, TetR family  39.34 
 
 
263 aa  58.9  5e-08  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2332  TetR family transcriptional regulator  30.91 
 
 
202 aa  58.9  5e-08  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3265  TetR family transcriptional regulator  30.33 
 
 
206 aa  58.5  6e-08  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.111309  normal  0.286417 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1164  TetR family transcriptional regulator  32.64 
 
 
184 aa  58.5  6e-08  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  8.72016e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5928  transcriptional regulator, TetR family  29.17 
 
 
215 aa  58.2  8e-08  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.511087  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0377  transcriptional regulator, TetR family  37.21 
 
 
224 aa  58.2  8e-08  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.294343  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7226  putative transcriptional regulator, TetR family  42.62 
 
 
209 aa  58.2  9e-08  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.373834 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1543  TetR family transcriptional regulator  49.09 
 
 
238 aa  57.8  1e-07  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.176522 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4577  TetR family transcriptional regulator  24.29 
 
 
247 aa  57.4  1e-07  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1790  TetR family transcriptional regulator  35.23 
 
 
220 aa  57.8  1e-07  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.536923  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38090  TetR-family transcriptional regulatory protein  26.9 
 
 
221 aa  57.8  1e-07  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0395776  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2131  regulatory protein, TetR  30.56 
 
 
218 aa  57.8  1e-07  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00771887  normal  0.859247 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2022  transcriptional regulator, TetR family  27.01 
 
 
225 aa  57.8  1e-07  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.613149  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0891  TetR family transcriptional regulator  27.27 
 
 
211 aa  57.4  2e-07  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0994  transcriptional regulator, TetR family  30.37 
 
 
214 aa  57  2e-07  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.146386  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0199  TetR family regulatory protein  31.03 
 
 
214 aa  57  2e-07  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0560  transcriptional regulator, TetR family  31.39 
 
 
208 aa  57  2e-07  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14700  transcriptional regulator, TetR family  40.58 
 
 
207 aa  56.6  2e-07  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  3.73009e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2347  transcriptional regulator, TetR family  30.56 
 
 
223 aa  57.4  2e-07  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.123383  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6229  transcriptional regulator TetR family  28.08 
 
 
240 aa  56.6  2e-07  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.93873  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1794  TetR family transcriptional regulator  48.21 
 
 
229 aa  56.2  3e-07  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.152901  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4787  transcriptional regulator, TetR family  44.12 
 
 
212 aa  56.2  3e-07  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0422575  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2811  putative DNA-binding transcriptional regulator  33.33 
 
 
236 aa  56.6  3e-07  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3370  transcriptional regulator, TetR family  37.84 
 
 
228 aa  56.6  3e-07  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  decreased coverage  0.0063882  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2899  putative DNA-binding transcriptional regulator  33.33 
 
 
236 aa  56.6  3e-07  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4789  transcriptional regulator  44.12 
 
 
212 aa  56.2  3e-07  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1650  TetR family transcriptional regulator  28.91 
 
 
196 aa  56.2  3e-07  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00305011  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3012  transcriptional regulator, TetR family  23.94 
 
 
200 aa  55.8  4e-07  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4482  TetR family transcriptional regulator  53.06 
 
 
212 aa  55.8  4e-07  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4181  transcriptional regulator, TetR family  30.5 
 
 
227 aa  55.8  4e-07  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000221958 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0474  transcriptional regulator, TetR family  29.53 
 
 
212 aa  55.5  5e-07  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.542957  hitchhiker  4.20035e-18 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0125  TetR family transcriptional regulator  32.12 
 
 
238 aa  55.5  5e-07  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.493759  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2914  transcriptional regulator, TetR family  28.75 
 
 
202 aa  55.5  5e-07  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4551  transcriptional regulator, N-terminus  51.02 
 
 
112 aa  55.5  6e-07  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4770  transcriptional regulator, TetR family  51.02 
 
 
212 aa  55.1  7e-07  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4571  transcriptional regulator, TetR family  24.74 
 
 
231 aa  55.1  7e-07  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4396  TetR family transcriptional regulator  51.02 
 
 
212 aa  55.1  7e-07  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4386  TetR family transcriptional regulator  51.02 
 
 
212 aa  55.1  7e-07  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0805  TetR family transcriptional regulator  29.2 
 
 
204 aa  55.1  7e-07  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0886  TetR family transcriptional regulator  24.87 
 
 
231 aa  55.1  8e-07  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
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NC_011725  BCB4264_A4761  transcriptional regulator, TetR family  51.02 
 
 
212 aa  55.1  8e-07  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.107387  n/a   
 
 
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NC_010086  Bmul_3448  TetR family transcriptional regulator  27.95 
 
 
240 aa  54.7  8e-07  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
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