More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BCAH820_2008 on replicon NC_011773
Organism: Bacillus cereus AH820



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003909  BCE_2056  LytR family transcription antiterminator  97.9 
 
 		 333 aa  644    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00905786  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1830  LytR family transcription antiterminator  100 
 
 		 333 aa  680    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.241912  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1804  LytR family transcriptional regulator  100 
 
 		 333 aa  680    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00220424  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1787  LytR family transcriptional regulator  100 
 
 		 335 aa  679    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1973  LytR family transcription antiterminator  100 
 
 		 333 aa  680    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2008  transcription antiterminator, LytR family  100 
 
 		 333 aa  680    Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.0610299999999994e-43 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1838  cell envelope-related transcriptional attenuator  96.4 
 
 		 333 aa  637    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00343174  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3352  transcription antiterminator, LytR family  96.1 
 
 		 335 aa  639    Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000199263  hitchhiker  0.0000000000000086496 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2078  transcription antiterminator, LytR family  97.9 
 
 		 333 aa  644    Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000542577  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1975  transcription antiterminator, LytR family  97 
 
 		 333 aa  641    Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.258453  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1499  cell envelope-related transcriptional attenuator  83.18 
 
 		 329 aa  530  1e-149  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.000000186761  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0519  cell envelope-related transcriptional attenuator  68.98 
 
 		 338 aa  475  1e-133  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0523  cell envelope-related transcriptional attenuator  67.17 
 
 		 337 aa  467  9.999999999999999e-131  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4695  transcription antiterminator, LytR family  70.48 
 
 		 338 aa  462  1e-129  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.541641  hitchhiker  0.0000000308245 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0516  LytR family transcriptional regulator  69.58 
 
 		 337 aa  459  9.999999999999999e-129  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0643  transcription antiterminator, LytR family  70.18 
 
 		 338 aa  460  9.999999999999999e-129  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.849345  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0673  LytR family transcription antiterminator  69.28 
 
 		 337 aa  457  1e-127  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0572  LytR family transcription antiterminator  69.28 
 
 		 337 aa  457  1e-127  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0516  LytR family transcriptional regulator  68.98 
 
 		 337 aa  456  1e-127  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0661  transcription antiterminator, LytR family  69.28 
 
 		 338 aa  457  1e-127  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.34714e-25 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0732  transcription antiterminator, LytR family  68.37 
 
 		 338 aa  454  1e-127  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0605  LytR family transcription antiterminator  69.51 
 
 		 333 aa  452  1.0000000000000001e-126  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0803  cell envelope-related transcriptional attenuator  54.78 
 
 		 317 aa  355  5e-97  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0838  transcription antiterminator, LytR family  55.07 
 
 		 399 aa  350  2e-95  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00382216  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0946  transcription antiterminator, LytR family  55.07 
 
 		 400 aa  350  2e-95  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000012569  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4498  transcription antiterminator, LytR family  54.49 
 
 		 399 aa  348  5e-95  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000182536 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0648  cell envelope-related transcriptional attenuator  55.36 
 
 		 388 aa  348  6e-95  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.500203  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0875  LytR family transcription antiterminator  55.07 
 
 		 400 aa  343  2e-93  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0676567  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0680  LytR family transcriptional regulator  55.07 
 
 		 398 aa  343  2e-93  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0694  cell envelope-related transcriptional attenuator  54.2 
 
 		 401 aa  343  2e-93  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.12922  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0746  LytR family transcription antiterminator  54.2 
 
 		 398 aa  340  2e-92  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0694  LytR family transcriptional regulator  54.2 
 
 		 398 aa  340  2e-92  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0354301  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0783  LytR family transcription antiterminator  54.2 
 
 		 398 aa  340  2e-92  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0878  transcription antiterminator, LytR family  54.2 
 
 		 398 aa  339  2.9999999999999998e-92  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.78734e-21 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3347  transcriptional regulator LytR, attenuator for lytABC and lytR expression  50 
 
 		 345 aa  325  5e-88  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000255205  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3605  LytR family transcription antiterminator  50 
 
 		 345 aa  323  4e-87  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0149783  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3613  transcription antiterminator, LytR family  50 
 
 		 345 aa  322  4e-87  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000276906  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3598  transcription antiterminator, LytR family  50.58 
 
 		 345 aa  320  3e-86  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000156827 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3381  LytR family transcription antiterminator  51.41 
 
 		 345 aa  318  7e-86  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.288134  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3647  LytR family transcription antiterminator  51.41 
 
 		 345 aa  318  7e-86  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0513784  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3698  transcription antiterminator, LytR family  52.16 
 
 		 345 aa  318  1e-85  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00180581  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1619  transcription antiterminator, LytR family  51.85 
 
 		 345 aa  317  2e-85  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00116574  hitchhiker  0.0000348163 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3295  transcriptional regulator LytR, attenuator for lytABC and lytR expression  50.29 
 
 		 345 aa  316  3e-85  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.189328  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3273  cell envelope-related transcriptional attenuator  49.27 
 
 		 345 aa  314  9.999999999999999e-85  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000492202  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3046  cell envelope-related transcriptional attenuator  44.41 
 
 		 322 aa  276  4e-73  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.634845  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0640  transcriptional regulator, putative  40.62 
 
 		 412 aa  236  5.0000000000000005e-61  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.00230389  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1115  hypothetical protein  42.39 
 
 		 405 aa  222  8e-57  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.108667  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1138  transcription attenuator LytR  42.39 
 
 		 405 aa  222  8e-57  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.195072  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3272  membrane-bound transcriptional regulator LytR  42.53 
 
 		 310 aa  218  2e-55  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000512755  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3385  membrane-bound transcriptional regulator LytR  37.3 
 
 		 313 aa  208  1e-52  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3243  cell envelope-related transcriptional attenuator  39.8 
 
 		 335 aa  204  1e-51  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5319  transcription antiterminator, LytR family  41.26 
 
 		 374 aa  203  3e-51  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5306  LytR family transcription antiterminator  40.89 
 
 		 377 aa  203  4e-51  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5640  transcription antiterminator, LytR family  40.89 
 
 		 372 aa  202  5e-51  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000247251 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3735  cell envelope-related transcriptional attenuator  39.2 
 
 		 383 aa  202  6e-51  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5566  membrane-bound transcriptional regulator LytR  40.13 
 
 		 304 aa  200  1.9999999999999998e-50  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5383  membrane-bound transcriptional regulator LytR  38.87 
 
 		 302 aa  199  5e-50  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5364  transcription antiterminator, LytR family  40.15 
 
 		 377 aa  199  5e-50  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4992  cell envelope-related transcriptional attenuator  40.89 
 
 		 374 aa  199  6e-50  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5288  transcription antiterminator, LytR family  39.78 
 
 		 375 aa  197  1.0000000000000001e-49  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000327862 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5047  LytR family transcription antiterminator  39.78 
 
 		 375 aa  197  2.0000000000000003e-49  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4877  LytR family transcriptional regulator  39.78 
 
 		 375 aa  197  2.0000000000000003e-49  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4892  LytR family transcriptional regulator  39.78 
 
 		 375 aa  197  2.0000000000000003e-49  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5432  LytR family transcription antiterminator  39.78 
 
 		 375 aa  197  2.0000000000000003e-49  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4947  membrane-bound transcriptional regulator LytR  43.27 
 
 		 304 aa  193  4e-48  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0889022  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5115  membrane-bound transcriptional regulator LytR  38.24 
 
 		 303 aa  189  7e-47  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5506  membrane-bound transcriptional regulator LytR  38.24 
 
 		 303 aa  189  7e-47  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00691653  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4961  membrane-bound transcriptional regulator LytR  38.24 
 
 		 303 aa  188  9e-47  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0205697  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5058  membrane-bound transcriptional regulator LytR  40.77 
 
 		 304 aa  187  2e-46  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5355  membrane-bound transcriptional regulator LytR  38.24 
 
 		 303 aa  187  3e-46  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5387  membrane-bound transcriptional regulator LytR  37.71 
 
 		 299 aa  185  1.0000000000000001e-45  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5436  membrane-bound transcriptional regulator LytR  40 
 
 		 302 aa  185  1.0000000000000001e-45  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3796  membrane-bound transcriptional regulator LytR  36.52 
 
 		 302 aa  180  2.9999999999999997e-44  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000323774  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1715  transcriptional regulator  35.58 
 
 		 374 aa  168  1e-40  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00565214 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1893  transcriptional regulator, putative  35.54 
 
 		 316 aa  154  1e-36  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2377  transcription attenuator LytR  36.29 
 
 		 318 aa  155  1e-36  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2334  cell envelope-related transcriptional attenuator  36.29 
 
 		 318 aa  155  1e-36  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.591324  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2366  cell envelope-related transcriptional attenuator  33.44 
 
 		 319 aa  152  1e-35  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000181907  unclonable  0.00000001 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3000  cell envelope-related transcriptional attenuator  33.02 
 
 		 495 aa  150  2e-35  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0435  transcriptional regulator  33.14 
 
 		 427 aa  148  1.0000000000000001e-34  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4120  cell envelope-related transcriptional attenuator  35.66 
 
 		 445 aa  147  2.0000000000000003e-34  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000955467  unclonable  0.000000000378568 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1057  cell envelope-related transcriptional attenuator  30.58 
 
 		 333 aa  140  3e-32  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0371332  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0400  cell envelope-related transcriptional attenuator  32.34 
 
 		 308 aa  140  3.9999999999999997e-32  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000000257107  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3112  cell envelope-related transcriptional attenuator  32.36 
 
 		 419 aa  139  8.999999999999999e-32  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0132049  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1352  cell envelope-related transcriptional attenuator  30.89 
 
 		 488 aa  138  1e-31  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00278352  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1157  transcriptional regulator  29.43 
 
 		 334 aa  138  1e-31  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  unclonable  0.000000000000266671  hitchhiker  6.72858e-19 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2377  cell envelope-related transcriptional attenuator  33.98 
 
 		 344 aa  138  2e-31  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00145979  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0174  transcriptional regulator  31.69 
 
 		 374 aa  137  3.0000000000000003e-31  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0565386  hitchhiker  0.0000000000000158467 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4100  cell envelope-related transcriptional attenuator  30.53 
 
 		 426 aa  135  9.999999999999999e-31  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.000000000000199964  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2095  cell envelope-related transcriptional attenuator  30.62 
 
 		 411 aa  135  9.999999999999999e-31  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0187  cell envelope-related transcriptional attenuator  29.62 
 
 		 563 aa  133  5e-30  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.234515 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0211  cell envelope-related transcriptional attenuator  36.44 
 
 		 262 aa  132  6.999999999999999e-30  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1921  cell envelope-related transcriptional attenuator  38.54 
 
 		 406 aa  132  7.999999999999999e-30  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.116318  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13390  cell envelope-related transcriptional attenuator  34.3 
 
 		 405 aa  132  1.0000000000000001e-29  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.557039  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01960  cell envelope-related function transcriptional attenuator common domain protein  34.98 
 
 		 490 aa  128  1.0000000000000001e-28  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00481524  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0893  cell envelope-related transcriptional attenuator  31.46 
 
 		 453 aa  125  1e-27  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.301121  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1399  cell envelope-related transcriptional attenuator  34.09 
 
 		 414 aa  124  2e-27  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3430  cell envelope-related transcriptional attenuator  35.8 
 
 		 439 aa  123  4e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0225853  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0125  putative transcriptional regulator  33.09 
 
 		 380 aa  123  5e-27  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00440963  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2953  cell envelope-related transcriptional attenuator  36.89 
 
 		 502 aa  121  9.999999999999999e-27  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.873931 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>