More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BCAH187_C0074 on replicon NC_011655
Organism: Bacillus cereus AH187



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_005707  BCE_A0091  DNA polymerase III, beta subunit  99.19 
 
 		 370 aa  754    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.731549  n/a   
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0074  DNA polymerase III, beta subunit  100 
 
 		 370 aa  759    Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.0000073045  normal  1 
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0051  DNA polymerase III, beta subunit  99.73 
 
 		 370 aa  756    Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00213452 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0002  DNA polymerase III subunit beta  28.12 
 
 		 378 aa  148  1.0000000000000001e-34  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0002  DNA polymerase III subunit beta  26.39 
 
 		 379 aa  147  2.0000000000000003e-34  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0173994  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0002  DNA polymerase III subunit beta  26.39 
 
 		 379 aa  147  2.0000000000000003e-34  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.00000820509  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0002  DNA polymerase III subunit beta  26.12 
 
 		 379 aa  145  1e-33  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0872061  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0002  DNA polymerase III subunit beta  26.25 
 
 		 381 aa  145  1e-33  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000341772  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5318  DNA polymerase III subunit beta  26.25 
 
 		 381 aa  145  1e-33  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.00172021  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0002  DNA polymerase III subunit beta  25.86 
 
 		 379 aa  144  2e-33  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.341639  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0002  DNA polymerase III subunit beta  26.25 
 
 		 381 aa  145  2e-33  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0002  DNA polymerase III subunit beta  25.86 
 
 		 379 aa  144  2e-33  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0132884  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0002  DNA polymerase III subunit beta  25.86 
 
 		 379 aa  144  3e-33  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00656712  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0002  DNA polymerase III subunit beta  25.86 
 
 		 379 aa  144  3e-33  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.478099 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0002  DNA polymerase III subunit beta  25.46 
 
 		 381 aa  143  4e-33  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.000678483  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2552  DNA polymerase III subunit beta  26.25 
 
 		 377 aa  142  9.999999999999999e-33  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0587336  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0002  DNA polymerase III subunit beta  26.12 
 
 		 377 aa  140  3e-32  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0177596  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0002  DNA polymerase III subunit beta  26.12 
 
 		 377 aa  140  3e-32  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  decreased coverage  0.00213885  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0002  DNA polymerase III subunit beta  26.25 
 
 		 378 aa  135  9.999999999999999e-31  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00000000167002  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0002  DNA polymerase III subunit beta  25.33 
 
 		 378 aa  132  6.999999999999999e-30  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0002  DNA polymerase III subunit beta  27.27 
 
 		 378 aa  128  2.0000000000000002e-28  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0002  DNA polymerase III, beta subunit  25.77 
 
 		 378 aa  127  3e-28  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.000189832  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0002  DNA polymerase III, beta subunit  25.53 
 
 		 380 aa  121  1.9999999999999998e-26  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2604  DNA polymerase III subunit beta  23.7 
 
 		 376 aa  120  4.9999999999999996e-26  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.756021  hitchhiker  0.0000491978 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0002  DNA polymerase III subunit beta  25.96 
 
 		 380 aa  119  7.999999999999999e-26  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.376275  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0002  DNA polymerase sliding clamp subunit  25.91 
 
 		 376 aa  118  1.9999999999999998e-25  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000188302  unclonable  1.4129e-28 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0002  DNA polymerase III, beta subunit  24.34 
 
 		 374 aa  116  7.999999999999999e-25  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  unclonable  0.00000374529  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2706  DNA polymerase III subunit beta  23.44 
 
 		 376 aa  113  5e-24  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2750  DNA polymerase III subunit beta  23.06 
 
 		 376 aa  111  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000190996  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0002  DNA polymerase III, beta subunit  22.11 
 
 		 375 aa  111  2.0000000000000002e-23  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  unclonable  0.000000418991  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2456  DNA polymerase III subunit beta  22.6 
 
 		 376 aa  110  4.0000000000000004e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0115889  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2720  DNA polymerase III subunit beta  23.51 
 
 		 376 aa  110  5e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.001463  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2430  DNA polymerase III subunit beta  22.83 
 
 		 376 aa  110  5e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000000841235  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0002  DNA polymerase III, beta subunit  24.55 
 
 		 367 aa  109  9.000000000000001e-23  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.00000485336  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2499  DNA polymerase III subunit beta  22.66 
 
 		 376 aa  107  2e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000103767  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2460  DNA polymerase III subunit beta  22.11 
 
 		 376 aa  107  2e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000810658  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2684  DNA polymerase III subunit beta  22.66 
 
 		 376 aa  107  2e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0002  DNA polymerase III, beta subunit  24.54 
 
 		 375 aa  108  2e-22  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.140323  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl002  DNA polymerase III, beta chain  24.48 
 
 		 373 aa  107  4e-22  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2699  DNA polymerase III subunit beta  22.19 
 
 		 376 aa  106  7e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000020623 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0002  DNA polymerase III subunit beta  27.25 
 
 		 366 aa  105  9e-22  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.279408  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0002  DNA polymerase III subunit beta  27.25 
 
 		 366 aa  105  9e-22  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.316057  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0002  DNA polymerase III, beta subunit  22.83 
 
 		 372 aa  102  1e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0002  DNA polymerase III, beta subunit  23.36 
 
 		 374 aa  101  2e-20  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.017071  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_00001  DNA polymerase III subunit beta  25.14 
 
 		 385 aa  101  2e-20  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.280893  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0002  DNA polymerase III, beta subunit  23.06 
 
 		 372 aa  100  3e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0618208  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00003  DNA polymerase III, beta subunit  23.47 
 
 		 366 aa  100  5e-20  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.0000112219  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0001  DNA polymerase III, beta subunit  24.55 
 
 		 372 aa  99.4  9e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0872728  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0002  DNA polymerase III, beta subunit  22.93 
 
 		 365 aa  99  1e-19  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.610199  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_00001  DNA polymerase III subunit beta  25.82 
 
 		 385 aa  98.6  2e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.354313  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0002  DNA polymerase III, beta subunit  24.42 
 
 		 367 aa  97.4  4e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  unclonable  0.00000348538  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00001  DNA polymerase III subunit beta  26.38 
 
 		 385 aa  97.4  4e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3047  DNA polymerase III subunit beta  23.5 
 
 		 371 aa  97.1  4e-19  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.579013  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4329  DNA polymerase III subunit beta  23.9 
 
 		 372 aa  96.7  5e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4592  DNA polymerase III subunit beta  22.98 
 
 		 372 aa  96.7  6e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0352599 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0002  DNA polymerase III subunit beta  23.96 
 
 		 373 aa  96.7  6e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0861969  hitchhiker  0.000000929484 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3543  DNA polymerase III subunit beta  22.6 
 
 		 372 aa  96.3  7e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0001  DNA polymerase III subunit beta  25.26 
 
 		 385 aa  96.3  7e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0001  DNA polymerase III subunit beta  24.15 
 
 		 390 aa  96.3  8e-19  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.174171  normal  0.105878 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0002  DNA polymerase III, beta subunit  23.45 
 
 		 373 aa  95.9  9e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00126039  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0002  DNA polymerase III, beta subunit  23.38 
 
 		 366 aa  95.9  1e-18  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.00000000848773  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0351  DNA polymerase III subunit beta  22.51 
 
 		 412 aa  95.9  1e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.203557  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0002  DNA polymerase III, beta subunit  23.38 
 
 		 366 aa  95.9  1e-18  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000634429  hitchhiker  0.000143129 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0002  DNA polymerase III, beta subunit  23.38 
 
 		 366 aa  95.9  1e-18  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000000637071  unclonable  0.00000000000326658 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0002  DNA polymerase III subunit beta  23.56 
 
 		 372 aa  95.5  1e-18  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0002  DNA polymerase III, beta subunit  23.38 
 
 		 366 aa  95.9  1e-18  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000000103765  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0002  DNA polymerase III, beta subunit  22.34 
 
 		 375 aa  95.9  1e-18  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.301651  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0002  DNA polymerase III, beta subunit  23.04 
 
 		 367 aa  95.1  2e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0007  DNA-directed DNA polymerase  22.98 
 
 		 366 aa  95.1  2e-18  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.000000118658  unclonable  0.000000000121971 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0002  DNA polymerase III, beta subunit  22.34 
 
 		 375 aa  95.1  2e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0002  DNA polymerase III, beta subunit  21.78 
 
 		 376 aa  95.1  2e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0001  DNA polymerase III subunit beta  24.4 
 
 		 385 aa  95.1  2e-18  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.392011  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0002  DNA polymerase III, beta subunit  22.34 
 
 		 375 aa  95.1  2e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1551  DNA polymerase III, beta subunit  22.63 
 
 		 367 aa  94.7  2e-18  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.422589  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0002  DNA polymerase III, beta subunit  23 
 
 		 366 aa  95.1  2e-18  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000000490932  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0004  DNA polymerase III subunit beta  22.31 
 
 		 385 aa  94.4  3e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.638398  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0002  DNA polymerase III subunit beta  21.3 
 
 		 366 aa  94.4  3e-18  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.366013 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0002  DNA polymerase III, beta subunit  24.22 
 
 		 366 aa  94.4  3e-18  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00000472427  hitchhiker  0.00139326 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0009  DNA polymerase III, beta subunit  23.86 
 
 		 366 aa  94  4e-18  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0002  DNA polymerase III, beta subunit  23.64 
 
 		 366 aa  94  4e-18  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.000000136085  unclonable  0.00000000917615 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0010  DNA polymerase III, beta subunit  23.93 
 
 		 366 aa  94  4e-18  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.0000000642144  hitchhiker  0.00000000134313 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0002  DNA polymerase III, beta subunit  23.93 
 
 		 366 aa  94  4e-18  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000000577304  unclonable  0.000000000023362 
 
 
-
 
NC_002620  TC0347  DNA polymerase III subunit beta  23.08 
 
 		 366 aa  93.6  5e-18  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.229839  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0002  DNA polymerase III, beta subunit  21.73 
 
 		 372 aa  93.6  6e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0002  DNA polymerase III, beta subunit  20.57 
 
 		 376 aa  93.2  6e-18  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0014  DNA-directed DNA polymerase  22.81 
 
 		 366 aa  93.2  6e-18  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000000733559  hitchhiker  0.000643873 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1278  DNA polymerase III subunit beta  23.44 
 
 		 373 aa  93.2  7e-18  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  unclonable  2.76035e-25  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0002  DNA polymerase III subunit beta  23.06 
 
 		 373 aa  93.2  7e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.969312  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2688  DNA polymerase III, beta subunit  22.92 
 
 		 369 aa  93.2  7e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0188688  hitchhiker  0.00114167 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0002  DNA polymerase III, beta subunit  23.9 
 
 		 366 aa  92.8  8e-18  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.000000158001  unclonable  0.00000341195 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0002  DNA polymerase III, beta subunit  22.22 
 
 		 372 aa  92.8  9e-18  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000259068  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0002  DNA polymerase III subunit beta  25.52 
 
 		 378 aa  92  1e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.065739  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0002  DNA polymerase III, beta subunit  24.22 
 
 		 373 aa  92  1e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.394263  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0963  DNA polymerase III, beta subunit  22.35 
 
 		 362 aa  92  2e-17  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.245361  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0002  DNA polymerase III, beta subunit  22.51 
 
 		 366 aa  91.3  2e-17  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.00000000267756  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0002  DNA polymerase III subunit beta  22.55 
 
 		 365 aa  91.7  2e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  unclonable  0.0000000590568  unclonable  0.00000000000512174 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0003  DNA polymerase III subunit beta  22.8 
 
 		 373 aa  90.9  3e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.991791  normal  0.512948 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0231  DNA polymerase III, beta subunit  23.14 
 
 		 367 aa  90.5  4e-17  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.0000000874025  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0004  DNA polymerase III subunit beta  22.19 
 
 		 372 aa  90.5  4e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000114385  unclonable  5.12755e-25 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0002  DNA polymerase III, beta subunit  22.16 
 
 		 366 aa  90.5  4e-17  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.00000000544098  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>