More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BCAH187_A5477 on replicon NC_011658
Organism: Bacillus cereus AH187



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006274  BCZK3506  sensory box/GGDEF family protein  44.27 
 
 
911 aa  751  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.143738  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3516  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  44.01 
 
 
906 aa  749  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.80269  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3781  sensory box/GGDEF family protein  44.12 
 
 
910 aa  749  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.424975  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5099  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  88.89 
 
 
909 aa  1669  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5477  sensory box/GGDEF family protein  100 
 
 
909 aa  1853  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3794  sensory box/GGDEF family protein  44.49 
 
 
908 aa  753  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.620688  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2272  sensory box/GGDEF family protein  41.76 
 
 
912 aa  725  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.82349  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2357  sensory box/GGDEF family protein  41.76 
 
 
912 aa  728  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3594  sensory box/GGDEF family protein  44.61 
 
 
911 aa  755  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5151  sensory box/GGDEF family protein  95.16 
 
 
909 aa  1759  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.954767  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5001  sensory box/GGDEF family protein  95.71 
 
 
909 aa  1764  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.129859  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1691  sensory box/GGDEF family protein  43.87 
 
 
838 aa  700  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  8.33802e-13 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2314  sensory box/GGDEF family protein  42.64 
 
 
912 aa  740  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.6229  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3494  sensory box/GGDEF family protein  44.61 
 
 
911 aa  756  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0435317  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1577  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  42.87 
 
 
911 aa  741  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.286617  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3630  sensory box/GGDEF family protein  44.04 
 
 
828 aa  701  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.931883  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2533  sensory box/GGDEF family protein  41.76 
 
 
912 aa  728  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5392  sensory box/GGDEF family protein  95.16 
 
 
909 aa  1757  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.98335e-28 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3879  sensory box/GGDEF family protein  44.61 
 
 
911 aa  755  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5543  sensory box/GGDEF family protein  95.16 
 
 
909 aa  1759  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.129042  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3761  sensory box/GGDEF family protein  44.49 
 
 
908 aa  754  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.8986e-09 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2548  sensory box/GGDEF family protein  44.12 
 
 
828 aa  706  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.19879e-34 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5528  sensory box/GGDEF family protein  91.31 
 
 
909 aa  1714  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.024998  hitchhiker  5.85102e-07 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5426  sensory box/GGDEF family protein  99.23 
 
 
909 aa  1845  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1451  sensory box/ggdef family  44.01 
 
 
914 aa  732  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  decreased coverage  2.57716e-07 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3847  sensory box/ggdef family  43.9 
 
 
906 aa  734  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5422  sensory box/GGDEF family protein  91.97 
 
 
909 aa  1724  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.500636  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3821  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC and GAF sensor(s)  72.49 
 
 
906 aa  1366  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4983  sensory box/GGDEF family protein  95.27 
 
 
909 aa  1759  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5479  sensory box/GGDEF family protein  37.87 
 
 
892 aa  510  1e-143  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5146  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  34.74 
 
 
892 aa  504  1e-141  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5048  sensory box/GGDEF family protein  35.27 
 
 
892 aa  503  1e-141  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5197  sensory box/GGDEF family protein  35.53 
 
 
892 aa  503  1e-141  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.619616  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5593  sensory box/GGDEF family protein  35.53 
 
 
892 aa  503  1e-141  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5032  hypothetical protein  35.53 
 
 
892 aa  503  1e-141  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5527  sensory box/GGDEF family protein  41.41 
 
 
604 aa  489  1e-137  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5441  sensory box/GGDEF family protein  38.3 
 
 
735 aa  492  1e-137  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5471  sensory box/GGDEF family protein  36.14 
 
 
814 aa  477  1e-133  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00599956  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5481  sensory box/GGDEF family protein  38.58 
 
 
735 aa  474  1e-132  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0242915  hitchhiker  1.94028e-17 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3319  sensory box protein  36.71 
 
 
733 aa  412  1e-113  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0669106 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3912  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC and Chase sensor(s)  36.75 
 
 
1209 aa  406  1e-112  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3140  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  38.82 
 
 
754 aa  408  1e-112  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0675  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  38.86 
 
 
925 aa  407  1e-112  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3344  signal transduction protein  39.29 
 
 
1055 aa  406  1e-112  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0085  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  34.96 
 
 
738 aa  404  1e-111  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.127866 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2209  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  37.94 
 
 
844 aa  405  1e-111  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3821  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC and Chase sensor(s)  36.75 
 
 
1209 aa  406  1e-111  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.0235394 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3424  GGDEF domain-containing protein  40.14 
 
 
1502 aa  404  1e-111  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2016  sensory box/GGDEF family protein  38.69 
 
 
799 aa  404  1e-111  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.334987  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3328  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  37.76 
 
 
965 aa  401  1e-110  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.928447  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1456  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  37.27 
 
 
1212 aa  399  1e-109  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.4231 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0689  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  35.38 
 
 
723 aa  397  1e-109  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.452404 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0409  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor  37.67 
 
 
925 aa  397  1e-109  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.231334  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3727  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  36.76 
 
 
748 aa  398  1e-109  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0957  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  41.21 
 
 
633 aa  394  1e-108  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3085  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  37.02 
 
 
905 aa  394  1e-108  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0415  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  40.08 
 
 
1486 aa  393  1e-108  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4029  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC and Chase sensor(s)  35.87 
 
 
1228 aa  394  1e-108  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0408  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  41.13 
 
 
862 aa  394  1e-108  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2593  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  35.83 
 
 
608 aa  390  1e-107  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0703266 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0630  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  35.99 
 
 
699 aa  392  1e-107  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2044  sensory box/GGDEF family protein  41.24 
 
 
762 aa  392  1e-107  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0341  sensory box protein  39.18 
 
 
1515 aa  391  1e-107  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3776  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC and GAF sensor(s)  35.92 
 
 
1098 aa  390  1e-107  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1346  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC and GAF sensor(s)  44.19 
 
 
947 aa  391  1e-107  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1930  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC and GAF sensor(s)  35.35 
 
 
735 aa  391  1e-107  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.737816 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0949  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC and GAF sensor(s)  39.33 
 
 
962 aa  390  1e-107  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1710  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  38.49 
 
 
720 aa  390  1e-107  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.425295  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3950  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  38.08 
 
 
1508 aa  387  1e-106  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0987  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  37.03 
 
 
739 aa  388  1e-106  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  7.57549e-05  decreased coverage  0.00276789 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3829  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  38.1 
 
 
1505 aa  389  1e-106  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1605  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  35.46 
 
 
688 aa  389  1e-106  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  decreased coverage  0.0013251  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4145  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC and GAF sensor(s)  38.08 
 
 
1508 aa  387  1e-106  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4026  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC and GAF sensor(s)  38.08 
 
 
1508 aa  387  1e-106  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4052  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC and GAF sensor(s)  38.08 
 
 
1508 aa  387  1e-106  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1593  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  37.75 
 
 
706 aa  389  1e-106  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3633  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  39.18 
 
 
1504 aa  388  1e-106  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0782  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  37.01 
 
 
736 aa  387  1e-106  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1983  sensory box protein  36.05 
 
 
1136 aa  389  1e-106  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0811196 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4631  sensory box/GGDEF domain/EAL domain protein  37.17 
 
 
1278 aa  388  1e-106  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0677  sensory box/GGDEF family protein  35.54 
 
 
947 aa  389  1e-106  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  8.25914e-12  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3743  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  37.52 
 
 
722 aa  387  1e-106  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.265049 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1514  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  35.53 
 
 
1098 aa  384  1e-105  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0672  sensory box protein  37.41 
 
 
1276 aa  385  1e-105  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.321974  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1183  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  35.95 
 
 
722 aa  386  1e-105  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0703  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC and GAF sensor(s)  37.41 
 
 
1276 aa  385  1e-105  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.26462  normal  0.0640291 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3532  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  41.24 
 
 
744 aa  383  1e-105  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.543005 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0704  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  37.41 
 
 
1276 aa  386  1e-105  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.116377  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4265  PAS:GGDEF  37.5 
 
 
1278 aa  386  1e-105  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60870  motility regulator  37.32 
 
 
1415 aa  383  1e-105  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.739569  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0311  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  38.82 
 
 
1504 aa  385  1e-105  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4144  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC and Chase sensor(s)  35.08 
 
 
1215 aa  380  1e-104  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0946  sensory box/GGDEF family protein  34.04 
 
 
842 aa  380  1e-104  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2725  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC and GAF sensor(s)  34.89 
 
 
717 aa  380  1e-104  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.172089 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1546  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  35.36 
 
 
1098 aa  381  1e-104  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.223692 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2737  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  37.01 
 
 
951 aa  380  1e-104  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000925868 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0703  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  42.27 
 
 
703 aa  381  1e-104  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5242  motility regulator  37.14 
 
 
1410 aa  382  1e-104  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.435118  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2565  two component signal transduction response regulator  36.83 
 
 
703 aa  382  1e-104  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0700  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  38.68 
 
 
820 aa  382  1e-104  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>