More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BCAH187_A4790 on replicon NC_011658
Organism: Bacillus cereus AH187



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011658  BCAH187_A4790  30S ribosomal protein S4  100 
 
 		 200 aa  413  9.999999999999999e-116  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.0000000781758  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4793  30S ribosomal protein S4  99.5 
 
 		 200 aa  412  1e-114  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00592592  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4554  30S ribosomal protein S4  99.5 
 
 		 200 aa  412  1e-114  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000221474  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4389  30S ribosomal protein S4  99.5 
 
 		 200 aa  412  1e-114  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.000645812  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4399  30S ribosomal protein S4  99.5 
 
 		 200 aa  412  1e-114  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000278276  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4908  30S ribosomal protein S4  99.5 
 
 		 200 aa  412  1e-114  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0786166  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4773  30S ribosomal protein S4  99.5 
 
 		 200 aa  412  1e-114  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0471  30S ribosomal protein S4  98.5 
 
 		 200 aa  408  1e-113  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000100944  hitchhiker  4.8786299999999993e-20 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4764  30S ribosomal protein S4  98.5 
 
 		 200 aa  409  1e-113  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.0013865  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3327  30S ribosomal protein S4  97.5 
 
 		 200 aa  406  1.0000000000000001e-112  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000248743  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4485  30S ribosomal protein S4  97 
 
 		 200 aa  402  1e-111  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.644744  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2724  30S ribosomal protein S4  83.5 
 
 		 200 aa  356  9.999999999999999e-98  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000000198678  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0715  30S ribosomal protein S4  82 
 
 		 200 aa  352  2e-96  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1284  30S ribosomal protein S4  77.5 
 
 		 200 aa  326  1.0000000000000001e-88  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  decreased coverage  0.00000240031  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1810  30S ribosomal protein S4  78 
 
 		 200 aa  326  1.0000000000000001e-88  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000029578  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1775  30S ribosomal protein S4  78 
 
 		 200 aa  326  1.0000000000000001e-88  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  decreased coverage  0.000000344809  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0500  30S ribosomal protein S4  66.17 
 
 		 201 aa  273  1.0000000000000001e-72  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000000917743  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1842  SSU ribosomal protein S4P  63.5 
 
 		 203 aa  269  2e-71  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1973  30S ribosomal protein S4  65.67 
 
 		 203 aa  268  4e-71  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.000000312348  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2137  30S ribosomal protein S4  65.67 
 
 		 203 aa  268  5e-71  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.0000101892  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0300  30S ribosomal protein S4  63.68 
 
 		 203 aa  263  2e-69  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00214384  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1226  30S ribosomal protein S4  63.68 
 
 		 224 aa  262  2e-69  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1394  SSU ribosomal protein S4P  63.37 
 
 		 262 aa  256  1e-67  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00631065  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0326  30S ribosomal protein S4  53.33 
 
 		 208 aa  212  2.9999999999999995e-54  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl586  30S ribosomal protein S4  52.68 
 
 		 208 aa  211  7.999999999999999e-54  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000352215  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0202  ribosomal protein S4  51.98 
 
 		 203 aa  206  2e-52  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1009  30S ribosomal protein S4  52.63 
 
 		 208 aa  204  6e-52  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.262144  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1752  30S ribosomal protein S4  52.15 
 
 		 208 aa  204  8e-52  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  decreased coverage  0.000068654  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1943  ribosomal protein S4  51.2 
 
 		 208 aa  202  2e-51  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0237  30S ribosomal protein S4  49.51 
 
 		 208 aa  202  3e-51  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.0862147  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0868  ribosomal protein S4  50 
 
 		 200 aa  201  5e-51  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.392716  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0206  30S ribosomal protein S4  52.63 
 
 		 208 aa  201  6e-51  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0094  30S ribosomal protein S4  53.33 
 
 		 208 aa  201  6e-51  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.0810213  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3137  30S ribosomal protein S4  48.26 
 
 		 201 aa  201  6e-51  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0424686  normal  0.56438 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04260  30S ribosomal protein S4  53.2 
 
 		 202 aa  201  8e-51  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.342435  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1112  30S ribosomal protein S4  51.98 
 
 		 201 aa  198  5e-50  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1141  30S ribosomal protein S4  51.98 
 
 		 201 aa  198  5e-50  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.273227 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1129  30S ribosomal protein S4  51.98 
 
 		 201 aa  198  5e-50  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.433147  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5761  ribosomal protein S4  49.75 
 
 		 201 aa  197  1.0000000000000001e-49  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0058  30S ribosomal protein S4  52.38 
 
 		 208 aa  197  1.0000000000000001e-49  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1912  30S ribosomal protein S4  49.75 
 
 		 201 aa  196  2.0000000000000003e-49  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4369  ribosomal protein S4  49.25 
 
 		 201 aa  196  2.0000000000000003e-49  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.663068  normal  0.672175 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1766  30S ribosomal protein S4  50.24 
 
 		 208 aa  194  7e-49  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.534162  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1172  30S ribosomal protein S4  47.26 
 
 		 201 aa  194  7e-49  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05845  30S ribosomal protein S4  48.26 
 
 		 201 aa  194  8.000000000000001e-49  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.16626  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1581  30S ribosomal protein S4  49.76 
 
 		 208 aa  193  1e-48  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4000  ribosomal protein S4  49.51 
 
 		 206 aa  193  1e-48  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00226649  hitchhiker  0.000661916 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2300  30S ribosomal protein S4  50.24 
 
 		 206 aa  193  1e-48  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.50143  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1947  30S ribosomal protein S4  49.76 
 
 		 208 aa  193  1e-48  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.134861  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0894  30S ribosomal protein S4  48.31 
 
 		 206 aa  192  2e-48  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000013906  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4252  ribosomal protein S4  51.21 
 
 		 206 aa  192  2e-48  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00000019621  unclonable  0.00000000000276102 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1159  ribosomal protein S4  49.51 
 
 		 206 aa  192  3e-48  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000286157  normal  0.0899698 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2684  30S ribosomal protein S4  49.76 
 
 		 208 aa  192  4e-48  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.000106865  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2880  ribosomal protein S4  47.32 
 
 		 205 aa  192  4e-48  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1435  30S ribosomal protein S4  49.5 
 
 		 201 aa  191  8e-48  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4971  30S ribosomal protein S4  49.5 
 
 		 201 aa  191  8e-48  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.557252 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0372  30S ribosomal protein S4  46.77 
 
 		 201 aa  191  9e-48  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2998  ribosomal protein S4  50.49 
 
 		 206 aa  190  1e-47  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00785982 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3782  30S ribosomal protein S4  50 
 
 		 206 aa  187  1e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.034256  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3611  30S ribosomal protein S4  50 
 
 		 206 aa  187  1e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00202112  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2129  SSU ribosomal protein S4P  48.76 
 
 		 200 aa  187  1e-46  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0414725  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2592  30S ribosomal protein S4  45.85 
 
 		 205 aa  187  1e-46  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0221081  normal  0.907343 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3612  30S ribosomal protein S4  50 
 
 		 206 aa  187  1e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0916894  normal  0.743877 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3684  30S ribosomal protein S4  50 
 
 		 206 aa  187  1e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  decreased coverage  0.00775419  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3719  30S ribosomal protein S4  50 
 
 		 206 aa  187  1e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0332489  normal  0.162839 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03147  30S ribosomal protein S4  49.52 
 
 		 206 aa  186  2e-46  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.224373  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0417  ribosomal protein S4  49.52 
 
 		 206 aa  186  2e-46  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000174636  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3779  30S ribosomal protein S4  49.52 
 
 		 206 aa  186  2e-46  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0105305  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03098  hypothetical protein  49.52 
 
 		 206 aa  186  2e-46  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.14617  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3490  30S ribosomal protein S4  49.52 
 
 		 206 aa  186  2e-46  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000164824  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4618  30S ribosomal protein S4  49.52 
 
 		 206 aa  186  2e-46  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000445858  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0417  30S ribosomal protein S4  49.52 
 
 		 206 aa  186  2e-46  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.045567  hitchhiker  0.000000319693 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3682  30S ribosomal protein S4  49.52 
 
 		 206 aa  186  2e-46  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00624205  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3591  30S ribosomal protein S4  49.52 
 
 		 206 aa  186  2e-46  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0175638  normal  0.0749349 
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0566  30S ribosomal protein S4  50 
 
 		 202 aa  186  3e-46  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2270  30S ribosomal protein S4  45.81 
 
 		 203 aa  186  3e-46  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0573155  hitchhiker  0.0031746 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2613  30S ribosomal protein S4  47.12 
 
 		 206 aa  185  4e-46  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.872553  normal  0.744433 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1841  30S ribosomal protein S4  48.06 
 
 		 206 aa  185  4e-46  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.470668  normal  0.674871 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13495  30S ribosomal protein S4  49.5 
 
 		 201 aa  185  4e-46  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000412742  normal  0.375665 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0346  ribosomal protein S4  47.34 
 
 		 207 aa  185  4e-46  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  0.00000340936  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3500  30S ribosomal protein S4  47.12 
 
 		 206 aa  185  5e-46  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0101758  hitchhiker  0.0000000843675 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1319  30S ribosomal protein S4  46.48 
 
 		 209 aa  185  5e-46  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000360982  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1367  30S ribosomal protein S4  46.48 
 
 		 209 aa  185  5e-46  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000845169  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5046  30S ribosomal protein S4  47.34 
 
 		 207 aa  185  5e-46  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0980  30S ribosomal protein S4  45.54 
 
 		 209 aa  184  6e-46  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.40186  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1046  30S ribosomal protein S4  48.31 
 
 		 207 aa  184  6e-46  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1007  ribosomal protein S4  48.8 
 
 		 206 aa  184  8e-46  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000000469854  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0743  ribosomal protein S4  49.52 
 
 		 206 aa  184  9e-46  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.068041  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0182  30S ribosomal protein S4  49.04 
 
 		 206 aa  184  9e-46  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000162542  hitchhiker  0.00157389 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001718  SSU ribosomal protein S4p (S9e)  48.08 
 
 		 206 aa  183  1.0000000000000001e-45  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000000581298  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00753  30S ribosomal protein S4  48.08 
 
 		 206 aa  183  1.0000000000000001e-45  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0625  30S ribosomal protein S4  47.83 
 
 		 207 aa  183  1.0000000000000001e-45  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0208  30S ribosomal protein S4  48.56 
 
 		 206 aa  183  1.0000000000000001e-45  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000000624869  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0255  30S ribosomal protein S4  48.1 
 
 		 206 aa  182  2.0000000000000003e-45  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3727  30S ribosomal protein S4  48.57 
 
 		 206 aa  182  2.0000000000000003e-45  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00253397  hitchhiker  0.00505868 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00962  30S ribosomal protein S4  48.56 
 
 		 206 aa  183  2.0000000000000003e-45  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00755213  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0983  SSU ribosomal protein S4P  48.56 
 
 		 206 aa  183  2.0000000000000003e-45  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000000000923822  hitchhiker  0.00443869 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0223  30S ribosomal protein S4  48.1 
 
 		 206 aa  182  2.0000000000000003e-45  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000007109  unclonable  0.0000000000236085 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0218  30S ribosomal protein S4  48.1 
 
 		 206 aa  182  2.0000000000000003e-45  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000114073  hitchhiker  0.00573009 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0223  30S ribosomal protein S4  48.57 
 
 		 206 aa  183  2.0000000000000003e-45  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00230473  unclonable  0.0000000000516884 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>