174 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BCAH187_A4032 on replicon NC_011658
Organism: Bacillus cereus AH187



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011658  BCAH187_A4032  prophage LambdaBa02, repressor protein  100 
 
 
114 aa  236  8e-62  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00194689  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3833  prophage LambdaBa02, repressor protein  71.93 
 
 
114 aa  174  4e-43  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4130  prophage lambdaba02, repressor protein  71.93 
 
 
114 aa  174  4e-43  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.05101  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0416  prophage LambdaBa04, DNA-binding protein  43.86 
 
 
114 aa  101  3e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0428  prophage lambdaba04, DNA-binding protein  43.86 
 
 
114 aa  101  3e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.663163  n/a   
 
 
-
 
NC_007105  pE33L54_0054  prophage repressor protein  30.7 
 
 
114 aa  69.3  0.00000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.515617  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1027  transcriptional regulator, XRE family  37.5 
 
 
321 aa  62  0.000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0465  transcriptional regulator, XRE family  26.79 
 
 
163 aa  58.2  0.00000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00289124  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0418  prophage LambdaBa04, DNA-binding protein  31.53 
 
 
113 aa  56.2  0.0000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00527482  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0432  prophage LambdaBa04, DNA-binding protein  31.53 
 
 
113 aa  56.2  0.0000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000371645  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0278  XRE family transcriptional regulator  35.96 
 
 
128 aa  54.3  0.0000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000672654  normal  0.646275 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1715  XRE family transcriptional regulator  32.53 
 
 
152 aa  54.3  0.0000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000119777  normal  0.864438 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3618  XRE family transcriptional regulator  39.34 
 
 
123 aa  54.3  0.0000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0239  XRE family transcriptional regulator  39.44 
 
 
115 aa  53.9  0.0000007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000283783  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3450  transcriptional regulator protein-like protein  35.63 
 
 
489 aa  53.9  0.0000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.168406  normal  0.18413 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0776  helix-turn-helix domain-containing protein  40.62 
 
 
123 aa  53.9  0.0000007  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000212762  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1430  transcriptional regulator, XRE family  35 
 
 
490 aa  53.9  0.0000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.236575  normal 
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0234  transcriptional regulator  26.36 
 
 
108 aa  53.1  0.000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00111986  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3288  transcriptional regulator, XRE family  31.91 
 
 
135 aa  53.1  0.000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0188  DNA-binding protein  26.36 
 
 
108 aa  53.1  0.000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000978101  hitchhiker  1.67724e-41 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1378  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  35 
 
 
481 aa  52.4  0.000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.84072  n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6747  XRE family transcriptional regulator  30.61 
 
 
115 aa  52.4  0.000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2431  transcriptional regulator, XRE family  38.57 
 
 
125 aa  51.6  0.000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000620136 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2433  transcriptional regulator, XRE family  37.31 
 
 
132 aa  51.2  0.000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000213647 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0275  cupin 2 domain-containing protein  47.17 
 
 
188 aa  51.2  0.000004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000353927  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0273  XRE family transcriptional regulator  47.17 
 
 
176 aa  51.6  0.000004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.0000144131  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1604  DNA-binding protein  38.1 
 
 
114 aa  51.2  0.000005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00115974  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2111  XRE family transcriptional regulator  29.41 
 
 
380 aa  50.4  0.000007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2436  transcriptional regulator, XRE family  28.57 
 
 
104 aa  50.4  0.000008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0117  transcriptional regulator, XRE family  32.22 
 
 
118 aa  50.4  0.000008  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3459  transcriptional regulator  30.93 
 
 
145 aa  50.4  0.000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00424563  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1576  transcriptional regulator, XRE family  38.71 
 
 
75 aa  49.7  0.00001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1666  transcriptional regulator, XRE family  33.33 
 
 
205 aa  50.1  0.00001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.130033  hitchhiker  0.00224482 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2256  transcriptional regulator, XRE family  40.62 
 
 
117 aa  49.7  0.00001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2431  XRE family transcriptional regulator  36.92 
 
 
143 aa  49.7  0.00001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1565  transcriptional regulator, XRE family  38.71 
 
 
75 aa  49.7  0.00001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1587  transcriptional regulator, XRE family  38.71 
 
 
75 aa  49.7  0.00001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3286  DNA-binding protein  31.82 
 
 
179 aa  48.9  0.00002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.414425  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0364  XRE family transcriptional regulator  30.77 
 
 
231 aa  49.3  0.00002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26020  predicted transcriptional regulator  33.33 
 
 
200 aa  49.3  0.00002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.676624  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0697  transcriptional regulator, XRE family  34.62 
 
 
151 aa  48.5  0.00003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0540  helix-turn-helix domain-containing protein  32.05 
 
 
90 aa  48.5  0.00003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.229999 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0632  DNA-binding protein  31.88 
 
 
181 aa  48.5  0.00003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.404047  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3317  transcriptional regulator, XRE family  33.87 
 
 
281 aa  48.1  0.00004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000786405  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2209  putative DNA-binding protein  25.69 
 
 
117 aa  48.1  0.00004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.706329  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1136  helix-turn-helix domain-containing protein  33.33 
 
 
77 aa  48.1  0.00004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07480  helix-turn-helix domain protein  28.77 
 
 
301 aa  48.1  0.00004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.961759  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1864  XRE family transcriptional regulator  34.18 
 
 
490 aa  48.1  0.00004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5920  transcriptional regulator, XRE family  30.77 
 
 
72 aa  48.1  0.00004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3465  XRE family transcriptional regulator  31.58 
 
 
142 aa  47.8  0.00005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2371  transcriptional regulator, XRE family  37.29 
 
 
165 aa  47.8  0.00006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.111191  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4210  XRE family transcriptional regulator  35.44 
 
 
106 aa  47.4  0.00006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.0378977 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4320  XRE family transcriptional regulator  30.43 
 
 
181 aa  47.8  0.00006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.810122  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2460  XRE family transcriptional regulator  31.75 
 
 
142 aa  47.4  0.00007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0113682  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3095  XRE family transcriptional regulator  32.81 
 
 
152 aa  47.4  0.00007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00900  predicted transcriptional regulator  26.26 
 
 
369 aa  47.4  0.00007  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.506264 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0956  DNA-binding protein  33.33 
 
 
92 aa  46.6  0.0001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00187553  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1276  transcriptional regulator, XRE family  32.81 
 
 
69 aa  46.6  0.0001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1627  XRE family transcriptional regulator  38.6 
 
 
300 aa  46.6  0.0001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000332957  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1147  XRE family transcriptional regulator  32.81 
 
 
69 aa  46.6  0.0001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011656  BCAH187_E0031  transcriptional regulator, MerR family  37.5 
 
 
211 aa  46.2  0.0001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  1.60803e-35  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3135  transcriptional regulator, XRE family  32.35 
 
 
137 aa  46.2  0.0001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.317529  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0495  XRE family transcriptional regulator  33.96 
 
 
100 aa  46.6  0.0001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00400235  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2730  putative DNA-binding protein  26.61 
 
 
117 aa  46.6  0.0001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.0000010572  hitchhiker  0.0000267972 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1193  helix-turn-helix domain-containing protein  32.31 
 
 
68 aa  46.2  0.0001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.67349  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4414  immunity repressor protein  32.53 
 
 
139 aa  46.6  0.0001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2104  helix-turn-helix domain-containing protein  36.76 
 
 
95 aa  46.2  0.0001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0694198  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1207  transcriptional regulator, XRE family  32.81 
 
 
69 aa  46.6  0.0001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.12255  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1239  transcriptional regulator, XRE family  27.27 
 
 
235 aa  45.8  0.0002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0944  DNA-binding protein transcriptional regulator  32.79 
 
 
149 aa  45.8  0.0002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000000485883  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1103  hypothetical protein  33.33 
 
 
149 aa  45.8  0.0002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.23911e-56 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4781  transcriptional regulator, XRE family  30.49 
 
 
113 aa  46.2  0.0002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00061071  normal  0.699893 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1022  DNA-binding protein  32.79 
 
 
149 aa  45.4  0.0002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000116919  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2401  XRE family transcriptional regulator  31.51 
 
 
97 aa  46.2  0.0002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000000242769  hitchhiker  0.0000223583 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6563  transcriptional regulator, XRE family  32.73 
 
 
72 aa  45.4  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1725  transcriptional regulator, XRE family  26.83 
 
 
145 aa  45.4  0.0003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0702  XRE family transcriptional regulator  25.93 
 
 
137 aa  45.1  0.0003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000217339  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4028  prophage LambdaBa02, repressor protein  30.77 
 
 
122 aa  44.7  0.0004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.210086  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3831  prophage LambdaBa02, repressor protein  30.77 
 
 
122 aa  45.1  0.0004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0071415  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4126  prophage LambdaBa02, repressor protein  30.77 
 
 
122 aa  45.1  0.0004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.158818  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06770  transcriptional regulator  29 
 
 
489 aa  45.1  0.0004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.949032  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0552  XRE family transcriptional regulator  31.18 
 
 
117 aa  44.7  0.0004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.747826 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0511  DNA-binding protein  31.58 
 
 
210 aa  45.1  0.0004  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00239636 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0941  transcriptional regulator, XRE family  32.1 
 
 
141 aa  44.7  0.0005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.551097  normal  0.0671843 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3463  XRE family transcriptional regulator  33.8 
 
 
97 aa  44.3  0.0005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4456  transcriptional regulator, XRE family  34.38 
 
 
147 aa  44.3  0.0006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4788  transcriptional regulator, XRE family  29.27 
 
 
114 aa  44.3  0.0006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.0000000200631  normal  0.763075 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0945  XRE family transcriptional regulator  31.67 
 
 
149 aa  44.3  0.0006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000414379  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1349  immunity repressor protein  30.26 
 
 
144 aa  44.3  0.0006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20950  putative prophage repressor  35.82 
 
 
200 aa  43.9  0.0007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000578065  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1881  transcriptional regulator  32.5 
 
 
259 aa  43.9  0.0007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0431466  hitchhiker  0.00212922 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0207  transcriptional regulator, XRE family  30.3 
 
 
106 aa  43.9  0.0008  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.0000425004  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0092  XRE family transcriptional regulator  25.93 
 
 
210 aa  43.9  0.0008  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1881  DNA-binding protein  30 
 
 
142 aa  43.5  0.0009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40150  putative transcriptional regulator  26.92 
 
 
183 aa  43.5  0.0009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1292  transcriptional regulator, XRE family  33.33 
 
 
110 aa  43.5  0.0009  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.020008  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3983  putative phage repressor  35.38 
 
 
240 aa  43.5  0.0009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00000900431  normal  0.128218 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1878  transcriptional regulator, XRE family  35.59 
 
 
70 aa  43.5  0.0009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0885  XRE family transcriptional regulator  26.51 
 
 
218 aa  43.5  0.001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0903  helix-turn-helix domain-containing protein  30.34 
 
 
255 aa  43.5  0.001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.0000000193278  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>