More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BCAH187_A3180 on replicon NC_011658
Organism: Bacillus cereus AH187



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010681  Bphyt_3527  amino acid permease-associated region  61.12 
 
 
555 aa  660    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0238018  normal  0.261752 
 
 
-
 
NC_003296  RS03682  amino-acid permease transmembrane protein  59.43 
 
 
543 aa  653    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.00632894  normal  0.215553 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3773  amino acid permease-associated region  58.68 
 
 
544 aa  651    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3180  amino acid permease  100 
 
 
528 aa  1049    Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.35942  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2863  amino acid permease  98.67 
 
 
528 aa  1037    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.817081  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2503  amino acid permease-associated region  59.5 
 
 
530 aa  654    Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.701941  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5772  amino acid permease-associated region  58.59 
 
 
543 aa  635    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0431  amino acid transporter  61.18 
 
 
517 aa  650    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0271358  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4850  amino acid permease-associated region  58.68 
 
 
576 aa  651    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.102365  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2726  amino acid permease-associated region  58.93 
 
 
530 aa  633  1e-180  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2935  amino acid permease  58.75 
 
 
533 aa  631  1e-180  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3608  amino acid permease  58.94 
 
 
533 aa  631  1e-179  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3619  amino acid permease  58.94 
 
 
533 aa  631  1e-179  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3595  amino acid permease  58.94 
 
 
533 aa  631  1e-179  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.243323  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0499  amino acid permease  58.94 
 
 
533 aa  627  1e-178  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1948  amino acid permease  58.94 
 
 
533 aa  627  1e-178  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0977  amino acid permease  58.94 
 
 
533 aa  627  1e-178  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.956795  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0681  amino acid permease  58.94 
 
 
533 aa  627  1e-178  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0435  amino acid permease-associated region  58.24 
 
 
532 aa  619  1e-176  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0857728  normal  0.529934 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2893  amino acid permease-associated region  58.32 
 
 
532 aa  613  9.999999999999999e-175  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0706357  normal  0.902102 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0409  amino acid permease-associated region  58.43 
 
 
532 aa  602  1.0000000000000001e-171  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.352811  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3592  amino acid transporter  58.7 
 
 
532 aa  600  1e-170  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.337468 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0477  amino acid permease-associated region  58.13 
 
 
532 aa  591  1e-168  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.694981 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2601  amino acid permease-associated region  58.13 
 
 
532 aa  591  1e-167  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0504  amino acid permease-associated region  58.13 
 
 
532 aa  591  1e-167  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.907763  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03036  amino acid transporter  54.86 
 
 
516 aa  585  1e-166  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0806  amino acid permease-associated region  48 
 
 
530 aa  519  1e-146  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.0501787 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2526  amino acid permease-associated region  47.81 
 
 
545 aa  498  1e-140  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.0000127161  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2477  amino acid permease-associated region  47.81 
 
 
545 aa  498  1e-140  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.000000817564  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0356  amino acid permease-associated region  47.83 
 
 
536 aa  501  1e-140  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000370463  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2034  amino acid permease family protein  48.55 
 
 
559 aa  489  1e-137  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  unclonable  0.000000000879129  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0262  amino acid transporter  47.64 
 
 
491 aa  463  1e-129  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1000  amino acid permease-associated region  37.38 
 
 
529 aa  364  2e-99  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1213  amino acid permease-associated region  36.05 
 
 
541 aa  350  3e-95  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0948  amino acid permease-associated region  35.85 
 
 
546 aa  339  8e-92  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0158045  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1691  amino acid permease-associated region  36.42 
 
 
522 aa  335  1e-90  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.677415  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2309  amino acid permease-associated region  35.48 
 
 
543 aa  330  3e-89  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.22998  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1725  amino acid permease  36.26 
 
 
525 aa  326  5e-88  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0462  amino acid permease family protein  36.26 
 
 
518 aa  325  1e-87  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01444  amino acid permease  35.43 
 
 
528 aa  323  4e-87  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2069  amino acid permease  34.34 
 
 
541 aa  322  9.000000000000001e-87  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1259  amino acid ABC transporter permease  35.12 
 
 
537 aa  322  9.999999999999999e-87  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.507972 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1286  amino acid permease-associated region  35.98 
 
 
537 aa  320  3e-86  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.473778 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4132  amino acid permease-associated region  34.83 
 
 
537 aa  320  3.9999999999999996e-86  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.402344  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0469  amino acid permease  33.78 
 
 
541 aa  317  3e-85  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.343944  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1885  amino acid permease  33.78 
 
 
664 aa  317  3e-85  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0567  amino acid permease  33.78 
 
 
666 aa  317  4e-85  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.23606  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4030  amino acid permease-associated region  35.28 
 
 
541 aa  315  9.999999999999999e-85  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.562876  normal  0.281547 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3549  amino acid permease-associated region  35.09 
 
 
541 aa  312  7.999999999999999e-84  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.769299  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4449  amino acid permease-associated region  35.05 
 
 
541 aa  312  1e-83  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.724513 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1896  amino acid transporter  34.91 
 
 
541 aa  311  2.9999999999999997e-83  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.957704  normal  0.512532 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4228  amino acid permease-associated region  34.53 
 
 
541 aa  310  5e-83  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0704647  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4138  amino acid permease-associated region  34.53 
 
 
541 aa  310  5e-83  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.122354  normal  0.214246 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3381  amino acid permease-associated region  34.53 
 
 
541 aa  308  1.0000000000000001e-82  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.281924  normal  0.281793 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1836  amino acid permease-associated region  35.56 
 
 
521 aa  308  2.0000000000000002e-82  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.874306  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2109  amino acid permease-associated region  35.83 
 
 
537 aa  304  2.0000000000000002e-81  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0533  amino acid permease family protein  34.99 
 
 
531 aa  294  3e-78  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0878  amino acid permease  32.57 
 
 
642 aa  291  2e-77  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.487607  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1421  amino acid permease  32.57 
 
 
519 aa  291  2e-77  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0140485  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2193  amino acid permease  32.57 
 
 
642 aa  291  2e-77  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.182525  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0684  amino acid permease family protein  32.51 
 
 
560 aa  288  2e-76  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1493  amino acid permease  32.33 
 
 
560 aa  287  4e-76  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.613139  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2704  amino acid permease-associated region  36.69 
 
 
616 aa  278  2e-73  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1455  amino acid permease-associated region  37.58 
 
 
635 aa  277  3e-73  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2800  amino acid permease-associated region  32.97 
 
 
630 aa  274  3e-72  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5265  amino acid permease-associated region  33.98 
 
 
546 aa  273  5.000000000000001e-72  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1459  amino acid permease-associated region  33.46 
 
 
539 aa  271  2.9999999999999997e-71  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1782  amino acid permease family protein  33.46 
 
 
539 aa  271  2.9999999999999997e-71  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0537506  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6568  putative amino acid transporter  35.12 
 
 
533 aa  268  2e-70  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.979574 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0287  hypothetical protein  34.27 
 
 
521 aa  267  2.9999999999999995e-70  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2312  hypothetical protein  33.52 
 
 
535 aa  267  4e-70  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2044  amino acid permease-associated region  32.48 
 
 
647 aa  266  7e-70  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2082  amino acid permease-associated region  32.82 
 
 
539 aa  265  1e-69  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2457  amino acid permease family protein  32.82 
 
 
539 aa  265  1e-69  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4472  amino acid permease-associated region  32.73 
 
 
533 aa  263  6e-69  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.299339  normal  0.878033 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0022  amino acid permease  32.14 
 
 
542 aa  262  1e-68  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2453  hypothetical protein  32.21 
 
 
535 aa  261  2e-68  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0439  amino acid permease family protein  31.88 
 
 
528 aa  259  1e-67  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0601  amino acid permease-associated region  31.88 
 
 
528 aa  259  1e-67  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1993  amino acid permease family protein  31.94 
 
 
542 aa  258  2e-67  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1258  amino acid permease-associated region  31.48 
 
 
576 aa  258  2e-67  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.0000476519  hitchhiker  0.00000000276245 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0129  amino acid permease-associated region  33.19 
 
 
614 aa  233  9e-60  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2241  amino acid permease family protein  30.39 
 
 
518 aa  229  8e-59  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_10831  hypothetical protein  28.97 
 
 
514 aa  215  9.999999999999999e-55  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0461  amino acid permease-associated region  27.15 
 
 
511 aa  170  5e-41  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0889  amino acid permease-associated region  27.42 
 
 
467 aa  158  2e-37  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1769  amino acid permease-associated region  29.88 
 
 
439 aa  144  5e-33  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1408  cationic amino acid transporter  26.05 
 
 
483 aa  141  1.9999999999999998e-32  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0734654  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0926  amino acid permease-associated region  25.41 
 
 
522 aa  142  1.9999999999999998e-32  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0361  amino acid permease-associated region  26.09 
 
 
539 aa  142  1.9999999999999998e-32  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.741399  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1341  amino acid permease-associated region  26.89 
 
 
496 aa  140  6e-32  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1640  amino acid permease-associated region  24.21 
 
 
503 aa  137  7.000000000000001e-31  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.469925  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06077  cationic amino acid transporter  26.42 
 
 
486 aa  130  7.000000000000001e-29  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00275694  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00850  cationic amino acid transporter  26.42 
 
 
486 aa  130  7.000000000000001e-29  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  decreased coverage  0.0000549978  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0943  amino acid permease-associated region  26.27 
 
 
464 aa  128  3e-28  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.975115 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0305  amino acid permease-associated region  27.46 
 
 
468 aa  127  4.0000000000000003e-28  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2221  amino acid permease-associated region  26.32 
 
 
495 aa  125  1e-27  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000300523  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1416  amino acid permease-associated region  25.89 
 
 
486 aa  126  1e-27  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0079  putative amino acid permease  26.17 
 
 
440 aa  125  2e-27  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1000  amino acid permease-associated region  27.27 
 
 
566 aa  124  4e-27  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>