144 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BCAH187_A2889 on replicon NC_011658
Organism: Bacillus cereus AH187



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011658  BCAH187_A2889  putative sarcosine oxidase, alpha subunit  100 
 
 
110 aa  229  7.000000000000001e-60  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.36789  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2563  sarcosine oxidase, alpha subunit  95.45 
 
 
110 aa  219  9.999999999999999e-57  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2647  sarcosine oxidase subunit alpha, N-terminal  95.45 
 
 
110 aa  218  3e-56  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0375869  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2598  sarcosine oxidase, alpha subunit  95.45 
 
 
110 aa  218  3e-56  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2844  putative sarcosine oxidase, alpha subunit  95.45 
 
 
110 aa  218  3e-56  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000266999 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2850  sarcosine oxidase alpha subunit  91.82 
 
 
110 aa  213  7e-55  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00413596  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2641  sarcosine oxidase, alpha subunit  91.82 
 
 
110 aa  211  3.9999999999999995e-54  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00222021  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2443  sarcosine oxidase alpha subunit  90 
 
 
110 aa  208  2e-53  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0360142  normal  0.998563 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0972  sarcosine oxidase, alpha subunit  45.16 
 
 
103 aa  86.7  9e-17  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000186283  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0938  hypothetical protein  47.25 
 
 
469 aa  83.6  9e-16  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.903873  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5918  hypothetical protein  49.33 
 
 
95 aa  81.3  0.000000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.0000277826  normal  0.0333521 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0089  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase  42.39 
 
 
478 aa  80.9  0.000000000000006  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  decreased coverage  0.000828017  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0083  hypothetical protein  38.38 
 
 
112 aa  71.2  0.000000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0721  FAD dependent oxidoreductase  41.24 
 
 
983 aa  68.2  0.00000000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2710  hypothetical protein  44 
 
 
97 aa  66.2  0.0000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.678347  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000038  hypothetical protein  37.33 
 
 
99 aa  65.5  0.0000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0205  hypothetical protein  36.47 
 
 
108 aa  65.1  0.0000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.260069  normal  0.512826 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8314  uncharacterized NAD(FAD)-dependent dehydrogenase  37.97 
 
 
98 aa  63.2  0.000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4725  FAD dependent oxidoreductase  46.27 
 
 
85 aa  62.4  0.000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3638  hypothetical protein  36.99 
 
 
115 aa  62  0.000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0468705  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5605  FAD dependent oxidoreductase  38.95 
 
 
984 aa  61.2  0.000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1838  putative sarcosine oxidase alpha subunit  37.5 
 
 
99 aa  60.8  0.000000007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.227251  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0690  hypothetical protein  43.08 
 
 
107 aa  60.5  0.000000008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0780442  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6007  hypothetical protein  39.73 
 
 
113 aa  60.5  0.000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00459941  normal  0.16745 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5373  hypothetical protein  37.04 
 
 
114 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.220109 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4415  hypothetical protein  35 
 
 
118 aa  58.9  0.00000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.706002  normal  0.855895 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6381  hypothetical protein  36.59 
 
 
107 aa  58.2  0.00000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6614  hypothetical protein  36.59 
 
 
107 aa  58.2  0.00000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.0572685 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4935  hypothetical protein  35.21 
 
 
104 aa  57.8  0.00000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.254281  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0918  FAD dependent oxidoreductase  32.95 
 
 
960 aa  57.8  0.00000005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4108  ferredoxin  43.08 
 
 
85 aa  57.4  0.00000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0719298  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2741  putative sarcosine oxidase alpha subunit  38.36 
 
 
96 aa  57  0.00000009  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  hitchhiker  0.00423187  normal  0.294412 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0305  hypothetical protein  29.29 
 
 
101 aa  56.6  0.0000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4562  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  32.14 
 
 
591 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0998615  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0926  hypothetical protein  43.28 
 
 
71 aa  55.8  0.0000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.99107 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3538  hypothetical protein  35.71 
 
 
114 aa  55.1  0.0000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.227842  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6212  hypothetical protein  35.37 
 
 
95 aa  54.7  0.0000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.56865  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4399  putative sarcosine oxidase alpha subunit  42.86 
 
 
99 aa  54.7  0.0000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.265808 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4424  putative sarcosine oxidase alpha subunit  32.58 
 
 
103 aa  53.9  0.0000008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.178387  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1932  putative sarcosine oxidase alpha subunit  34.09 
 
 
99 aa  53.5  0.0000009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5061  hypothetical protein  33.73 
 
 
115 aa  53.5  0.0000009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.29675 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0050  hypothetical protein  34.09 
 
 
108 aa  52.8  0.000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3944  hypothetical protein  32.5 
 
 
112 aa  53.5  0.000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.260668  normal  0.814713 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1687  hypothetical protein  32.95 
 
 
102 aa  53.1  0.000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.410801  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1832  SoxA protein  36.99 
 
 
98 aa  53.1  0.000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.537733 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1696  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  31.33 
 
 
963 aa  53.5  0.000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2501  sarcosine oxidase alpha subunit  40.3 
 
 
80 aa  53.5  0.000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.295491  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0458  sarcosine oxidase, alpha subunit  39.34 
 
 
1006 aa  52  0.000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0886  hypothetical protein  30.61 
 
 
101 aa  51.6  0.000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4715  sarcosine oxidase, alpha subunit, heterotetrameric  39.34 
 
 
1006 aa  51.6  0.000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.764897  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4669  ferredoxin  39.47 
 
 
90 aa  51.2  0.000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.646461  normal  0.942381 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0876  putative ferredoxin-containing oxidase  30 
 
 
98 aa  51.2  0.000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.332826 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1476  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  31.82 
 
 
429 aa  51.2  0.000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4129  sarcosine oxidase alpha subunit family protein  41.67 
 
 
1005 aa  51.6  0.000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1380  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  31.82 
 
 
429 aa  51.2  0.000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1598  sarcosine oxidase, alpha subunit, heterotetrameric  32.17 
 
 
1000 aa  50.8  0.000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.898229  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5050  sarcosine oxidase, alpha subunit family  32.17 
 
 
1000 aa  50.8  0.000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.125712  normal  0.268825 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1842  ferredoxin  36 
 
 
84 aa  50.8  0.000007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0048  sarcosine oxidase subunit alpha  42.59 
 
 
1028 aa  50.4  0.000008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.416697 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2478  ferredoxin / FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  31.82 
 
 
429 aa  49.7  0.00001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0755  hypothetical protein  30.77 
 
 
107 aa  50.1  0.00001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6499  hypothetical protein  31.4 
 
 
97 aa  50.1  0.00001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.563111  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6627  hypothetical protein  33.77 
 
 
112 aa  49.3  0.00002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.511531  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5205  sarcosine oxidase, alpha subunit, heterotetrameric  28.04 
 
 
1005 aa  49.7  0.00002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0352677 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6534  hypothetical protein  33.33 
 
 
130 aa  48.9  0.00002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.855278 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71500  sarcosine oxidase alpha subunit  28.57 
 
 
1005 aa  49.3  0.00002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4428  hypothetical protein  35.62 
 
 
128 aa  49.3  0.00002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.121041  normal  0.609909 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3858  sarcosine oxidase alpha subunit  37.93 
 
 
937 aa  48.9  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0454194  normal  0.0206575 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18830  glycine cleavage system T protein (aminomethyltransferase)  44 
 
 
925 aa  48.5  0.00003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36330  hydrogen cyanide synthase HcnA  37.33 
 
 
104 aa  48.5  0.00003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.533947 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4436  hypothetical protein  32.47 
 
 
102 aa  48.9  0.00003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6549  hypothetical protein  31.4 
 
 
99 aa  48.5  0.00003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.851972  normal  0.34224 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0393  putative sarcosine oxidase alpha subunit  40.74 
 
 
1002 aa  48.1  0.00004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0998  sarcosine oxidase, alpha subunit  40.74 
 
 
1002 aa  48.1  0.00004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1952  sarcosine oxidase, alpha subunit, heterotetrameric  40.74 
 
 
1002 aa  48.1  0.00004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1860  sarcosine oxidase, alpha subunit  40.74 
 
 
1002 aa  48.1  0.00004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.769627  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31610  hypothetical protein  31.76 
 
 
87 aa  47.8  0.00005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7054  hypothetical protein  31.18 
 
 
113 aa  47.8  0.00005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.385812 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1389  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  32.61 
 
 
452 aa  47.8  0.00005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.232335  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4828  sarcosine oxidase, alpha subunit, heterotetrameric  42 
 
 
1003 aa  47.8  0.00006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.527733  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4731  hypothetical protein  32.88 
 
 
116 aa  47.8  0.00006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.428558  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3632  hypothetical protein  32.88 
 
 
115 aa  47.4  0.00006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.315693 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6206  sarcosine oxidase subunit alpha  27.68 
 
 
1005 aa  47.8  0.00006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2480  sarcosine oxidase, alpha subunit  41.67 
 
 
1007 aa  47  0.00008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4034  sarcosine oxidase, alpha subunit  41.67 
 
 
1007 aa  47  0.00008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5701  hypothetical protein  32.91 
 
 
99 aa  47  0.00008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6065  hypothetical protein  32.91 
 
 
99 aa  47  0.00008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1103  sarcosine oxidase subunit alpha  40.74 
 
 
1003 aa  46.6  0.0001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0428535 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0488  sarcosine oxidase, alpha subunit, heterotetrameric  40.74 
 
 
1003 aa  46.6  0.0001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4342  putative sarcosine oxidase alpha subunit  32.53 
 
 
98 aa  46.6  0.0001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.320277  normal  0.580736 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3331  sarcosine oxidase alpha subunit family protein  40.74 
 
 
999 aa  46.6  0.0001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.967331 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3218  sarcosine oxidase alpha subunit family protein  40.74 
 
 
1003 aa  46.6  0.0001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.6611  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5067  sarcosine oxidase alpha subunit family protein  40.74 
 
 
1003 aa  46.6  0.0001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.844501  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4544  sarcosine oxidase alpha subunit family protein  40.74 
 
 
1003 aa  46.6  0.0001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5149  sarcosine oxidase alpha subunit family protein  40.74 
 
 
1003 aa  46.6  0.0001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.685714  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3506  sarcosine oxidase alpha subunit family protein  40.74 
 
 
1003 aa  46.6  0.0001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3658  sarcosine oxidase, alpha subunit family  31.96 
 
 
997 aa  46.6  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.259851  normal  0.147827 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5130  sarcosine oxidase alpha subunit family protein  40.74 
 
 
1003 aa  46.6  0.0001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.564835  normal  0.907469 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0325  sarcosine oxidase, alpha subunit family  29.41 
 
 
1004 aa  45.8  0.0002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.684006  normal  0.0259905 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0348  sarcosine oxidase alpha subunit family protein  29.41 
 
 
1004 aa  45.8  0.0002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.223565  normal  0.24512 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>