72 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BCAH187_A2210 on replicon NC_011658
Organism: Bacillus cereus AH187



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011658  BCAH187_A2210  putative DNA-binding protein  100 
 
 
61 aa  123  1e-27  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2728  Xre  88.57 
 
 
40 aa  65.5  0.0000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000157861  hitchhiker  0.000186927 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0702  XRE family transcriptional regulator  49.06 
 
 
137 aa  57.4  0.00000007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000217339  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1714  XRE family transcriptional regulator  49.09 
 
 
67 aa  52.8  0.000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000253714  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0703  XRE family transcriptional regulator  45.61 
 
 
84 aa  51.6  0.000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000971993  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0012  transcriptional regulator  39.29 
 
 
131 aa  50.4  0.000009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.388282  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0117  transcriptional regulator, XRE family  43.1 
 
 
118 aa  48.9  0.00002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7925  putative transcriptional regulator, XRE family  41.82 
 
 
199 aa  48.1  0.00004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.421089 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3407  transcriptional regulator, XRE family  41.82 
 
 
192 aa  47.4  0.00007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0888  XRE family transcriptional regulator  35.71 
 
 
67 aa  47.4  0.00007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2435  transcriptional regulator, XRE family  37.5 
 
 
105 aa  47  0.00008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1998  hypothetical protein  38.6 
 
 
142 aa  47  0.00009  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.846621  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2780  transcriptional regulator, XRE family  41.51 
 
 
152 aa  47  0.00009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0182016  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR2077  hypothetical protein  38.6 
 
 
126 aa  46.6  0.0001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0843  XRE family transcriptional regulator  40 
 
 
130 aa  46.2  0.0001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1603  DNA-binding protein  36.21 
 
 
62 aa  45.4  0.0002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00182563  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0364  XRE family transcriptional regulator  43.4 
 
 
231 aa  45.8  0.0002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2460  XRE family transcriptional regulator  39.62 
 
 
142 aa  46.2  0.0002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0113682  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0239  XRE family transcriptional regulator  35.09 
 
 
115 aa  45.4  0.0002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000283783  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0776  helix-turn-helix domain-containing protein  38.98 
 
 
123 aa  45.8  0.0002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000212762  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5294  transcriptional regulator, XRE family  38.18 
 
 
194 aa  45.1  0.0003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8701  transcriptional regulator, XRE family  36.36 
 
 
200 aa  45.4  0.0003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.257362 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2430  transcriptional regulator, XRE family  38.18 
 
 
64 aa  45.4  0.0003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00155043 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1374  transcriptional regulator, XRE family  36.84 
 
 
71 aa  44.7  0.0004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.111041  normal  0.717323 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0543  transcriptional regulator, XRE family  37.93 
 
 
71 aa  44.7  0.0004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1827  XRE family transcriptional regulator  40.43 
 
 
252 aa  44.3  0.0006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0400601  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3618  XRE family transcriptional regulator  37.04 
 
 
123 aa  43.9  0.0007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3195  transcriptional regulator, XRE family  32.14 
 
 
80 aa  43.9  0.0008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0958967  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4152  helix-turn-helix domain-containing protein  36.36 
 
 
191 aa  43.5  0.001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07480  helix-turn-helix domain protein  37.74 
 
 
301 aa  43.1  0.001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.961759  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3466  transcriptional regulator, XRE family  35.85 
 
 
121 aa  43.5  0.001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2429  XRE family transcriptional regulator  36.36 
 
 
191 aa  43.5  0.001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0848952 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0336  XRE family transcriptional regulator  34.55 
 
 
140 aa  43.5  0.001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  unclonable  0.000000000838003  normal  0.0169736 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4136  XRE family transcriptional regulator  33.9 
 
 
78 aa  43.5  0.001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.527123  normal  0.419565 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3945  transcriptional regulator, XRE family  33.33 
 
 
125 aa  43.1  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4271  transcriptional regulator, XRE family  33.33 
 
 
125 aa  42.7  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.313399 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0631  hypothetical protein  29.31 
 
 
73 aa  42.7  0.002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3019  transcriptional regulator, XRE family  38.18 
 
 
198 aa  42.4  0.002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0917  XRE family transcriptional regulator  41.82 
 
 
78 aa  42.4  0.002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1613  Cro/CI family transcriptional regulator  35.71 
 
 
470 aa  42.4  0.002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.1413  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1557  Cro/CI family transcriptional regulator  35.71 
 
 
470 aa  42.4  0.002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3219  XRE family transcriptional regulator  31.58 
 
 
125 aa  42.4  0.002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2613  XRE family transcriptional regulator  34.55 
 
 
219 aa  42.4  0.002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.629122 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3929  hypothetical protein  35.71 
 
 
483 aa  42.4  0.002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4666  transcriptional regulator, XRE family  34.55 
 
 
197 aa  42  0.003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.223091  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0472  transcriptional regulator, XRE family  36.36 
 
 
79 aa  42  0.003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  unclonable  0.0000000091739  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02050  predicted transcriptional regulator  34.55 
 
 
201 aa  42  0.003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0893  XRE family transcriptional regulator  41.18 
 
 
110 aa  42  0.003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  decreased coverage  0.00171565  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1621  transcriptional regulator  38.6 
 
 
146 aa  42  0.003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2248  transcriptional regulator, XRE family  36.36 
 
 
505 aa  42  0.003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.99928  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4623  putative transcriptional regulator, XRE family  34.55 
 
 
197 aa  41.6  0.004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.155979 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2033  hypothetical protein  31.67 
 
 
64 aa  41.6  0.004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01392  predicted DNA-binding transcriptional regulator  35.19 
 
 
178 aa  41.2  0.005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2431  transcriptional regulator, XRE family  35.85 
 
 
125 aa  41.2  0.005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000620136 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1881  DNA-binding protein  35.09 
 
 
142 aa  41.2  0.005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2212  transcriptional regulator, XRE family  35.19 
 
 
178 aa  41.2  0.005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2225  XRE family transcriptional regulator  35.19 
 
 
178 aa  41.2  0.005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.639128 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0466  transcriptional regulator, XRE family  40.74 
 
 
69 aa  41.2  0.005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000580829  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01402  hypothetical protein  35.19 
 
 
178 aa  41.2  0.005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1517  DNA-binding protein  35.19 
 
 
178 aa  41.2  0.005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1613  DNA-binding protein  35.19 
 
 
178 aa  41.2  0.005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2039  DNA-binding protein  35.19 
 
 
178 aa  41.2  0.005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000824446  hitchhiker  5.01479e-19 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1740  DNA-binding protein  35.19 
 
 
178 aa  41.2  0.005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000189008  hitchhiker  2.35786e-17 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3459  transcriptional regulator  33.96 
 
 
145 aa  40.8  0.006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00424563  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1497  XRE family transcriptional regulator  34.55 
 
 
71 aa  40.8  0.007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.764708  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7158  transcriptional regulator, XRE family  40 
 
 
78 aa  40.8  0.007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.776523  normal  0.018417 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3465  XRE family transcriptional regulator  33.96 
 
 
142 aa  40.8  0.007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0023  transcriptional regulator  32.14 
 
 
108 aa  40.4  0.008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  0.181624 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3146  transcriptional regulator, XRE family  34.55 
 
 
80 aa  40.4  0.008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000500747  normal  0.0337918 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3389  XRE family transcriptional regulator  38 
 
 
83 aa  40.4  0.008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.14531  normal  0.0634839 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1628  XRE family transcriptional regulator  34.55 
 
 
133 aa  40.4  0.009  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3050  transcriptional regulator, XRE family  36.36 
 
 
195 aa  40.4  0.009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0215158  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>