63 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BCAH187_A1193 on replicon NC_011658
Organism: Bacillus cereus AH187



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006274  BCZK0936  glycerol uptake operon antiterminator regulatory protein  100 
 
 
186 aa  381  1e-105  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  1.65931e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1193  glycerol uptake operon antiterminator regulatory protein  100 
 
 
186 aa  381  1e-105  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  1.79213e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0945  glycerol uptake operon antiterminator regulatory protein  100 
 
 
186 aa  381  1e-105  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  1.10817e-14  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0958  glycerol uptake operon antiterminator regulatory protein  100 
 
 
186 aa  381  1e-105  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  3.21337e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1104  glycerol uptake operon antiterminator regulatory protein  100 
 
 
186 aa  381  1e-105  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.44575e-56 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1024  glycerol uptake operon antiterminator regulatory protein  100 
 
 
186 aa  381  1e-105  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  3.06499e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1123  glycerol uptake operon antiterminator regulatory protein  99.46 
 
 
186 aa  379  1e-104  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  7.33013e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4235  glycerol uptake operon antiterminator regulatory protein  97.85 
 
 
186 aa  377  1e-104  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  7.1595e-08  decreased coverage  2.85878e-09 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1064  glycerol uptake operon antiterminator regulatory protein  98.92 
 
 
186 aa  377  1e-104  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  1.21142e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0946  glycerol-3-phosphate responsive antiterminator, GlpP  94.62 
 
 
186 aa  363  1e-100  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  4.0322e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0805  glycerol-3-phosphate responsive antiterminator  90.32 
 
 
186 aa  349  2e-95  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  2.13912e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2092  glycerol-3-phosphate responsive antiterminator, GlpP  62.37 
 
 
192 aa  248  4e-65  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0526  glycerol-3-phosphate responsive antiterminator, GlpP  59.44 
 
 
184 aa  220  1e-56  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0050  glycerol-3-phosphate responsive antiterminator, GlpP  50.28 
 
 
183 aa  186  2e-46  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1383  glycerol uptake operon antiterminator regulatory protein  44.32 
 
 
180 aa  175  3e-43  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000112502  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1357  glycerol uptake operon antiterminator regulatory protein  44.32 
 
 
180 aa  175  3e-43  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0507386  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0865  glycerol uptake operon antiterminator regulatory protein  42.05 
 
 
177 aa  168  5e-41  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0752666  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1018  glycerol-3-phosphate responsive antiterminator  36.99 
 
 
189 aa  135  2e-31  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1388  glycerol-3-phosphate responsive antiterminator, GlpP  30.9 
 
 
203 aa  128  6e-29  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0616  glycerol-3-phosphate responsive antiterminator  35 
 
 
186 aa  126  2e-28  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1323  glycerol-3-phosphate responsive antiterminator, GlpP  39.66 
 
 
181 aa  125  5e-28  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00224266  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08130  glycerol-3-phosphate responsive antiterminator  35.71 
 
 
189 aa  122  3e-27  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0128  glycerol-3-phosphate responsive antiterminator, GlpP  35.43 
 
 
195 aa  120  9e-27  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0280  glycerol-3-phosphate responsive antiterminator, GlpP  36.72 
 
 
185 aa  118  6e-26  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0933  glycerol-3-phosphate responsive antiterminator, GlpP  36.93 
 
 
187 aa  117  1e-25  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  4.87081e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2847  glycerol-3-phosphate responsive antiterminator  31.91 
 
 
188 aa  112  3e-24  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  2.5966e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4737  putative glycerol uptake operon antiterminator regulatory protein  40.74 
 
 
188 aa  110  9e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2560  glycerol uptake operon antiterminator  34.62 
 
 
186 aa  108  4e-23  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0479  glycerol-3-phosphate responsive antiterminator, GlpP  40 
 
 
188 aa  108  4e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0478  glycerol-3-phosphate responsive antiterminator (G3P_antiterm)  39.26 
 
 
188 aa  108  4e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0621  putative glycerol uptake operon antiterminator regulatory protein  39.26 
 
 
188 aa  108  4e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0628  glycerol uptake operon antiterminator regulatory protein, putative  40 
 
 
188 aa  108  4e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0476  glycerol-3-phosphate responsive antiterminator (G3P_antiterm)  39.26 
 
 
188 aa  108  4e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0696  putative glycerol uptake operon antiterminator regulatory protein  40 
 
 
188 aa  108  5e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2877  glycerol uptake operon antiterminator  34.62 
 
 
186 aa  108  7e-23  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0602  putative glycerol uptake operon antiterminator regulatory protein  40 
 
 
188 aa  107  7e-23  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1492  glycerol-3-phosphate responsive antiterminator, GlpP  32.58 
 
 
189 aa  107  1e-22  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0883  glycerol-3-phosphate responsive antiterminator, GlpP  38.76 
 
 
203 aa  107  1e-22  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2465  glycerol-3-phosphate responsive antiterminator, GlpP  32.02 
 
 
189 aa  106  2e-22  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0534  glycerol uptake operon antiterminator regulatory protein  38.52 
 
 
188 aa  105  5e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1363  glycerol-3-phosphate responsive antiterminator  37.01 
 
 
184 aa  105  5e-22  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0565  glycerol uptake operon antiterminator regulatory protein  38.52 
 
 
188 aa  105  5e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0319  glycerol-3-phosphate responsive antiterminator, GlpP  33.33 
 
 
192 aa  104  8e-22  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0130  glycerol-3-phosphate responsive antiterminator  31.38 
 
 
207 aa  101  5e-21  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.198198  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2908  glycerol-3-phosphate responsive antiterminator  27.87 
 
 
191 aa  101  7e-21  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1558  glycerol-3-phosphate responsive antiterminator, GlpP  39.23 
 
 
190 aa  101  8e-21  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0920  glycerol-3-phosphate responsive antiterminator, GlpP  27.87 
 
 
191 aa  100  1e-20  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.572389  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0944  glycerol-3-phosphate responsive antiterminator, GlpP  27.87 
 
 
191 aa  100  1e-20  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.346113 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02576  hypothetical protein  27.87 
 
 
191 aa  100  1e-20  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2897  glycerol-3-phosphate responsive antiterminator  27.87 
 
 
191 aa  100  1e-20  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02613  predicted anti-terminator regulatory protein  27.87 
 
 
191 aa  100  1e-20  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3070  glycerol-3-phosphate responsive antiterminator (mRNA-binding), glpp  27.87 
 
 
191 aa  100  1e-20  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3105  glycerol-3-phosphate responsive antiterminator  27.87 
 
 
191 aa  99.8  2e-20  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0791634  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4023  glycerol-3-phosphate responsive antiterminator  27.87 
 
 
191 aa  100  2e-20  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.936677 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1118  GlpP family transcriptional regulator  29.45 
 
 
188 aa  96.7  2e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1062  glycerol uptake operon antiterminator  31.87 
 
 
203 aa  95.9  3e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.168143  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4359  glycerol uptake operon antiterminator  26.67 
 
 
203 aa  94.4  8e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.79067  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2463  glycerol-3-phosphate responsive antiterminator  28.57 
 
 
191 aa  92  5e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.143565  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2079  glycerol-3-phosphate responsive antiterminator (mRNA-binding)-like  25.75 
 
 
191 aa  90.9  1e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.105584  normal  0.435013 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4575  glycerol-3-phosphate responsive antiterminator, GlpP  25.77 
 
 
190 aa  90.1  2e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.486402  normal  0.92347 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5442  glycerol-3-phosphate responsive antiterminator (mRNA-binding)-like protein  26.38 
 
 
196 aa  85.5  4e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1328  glycerol-3-phosphate responsive antiterminator, GlpP  28.48 
 
 
176 aa  71.6  7e-12  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  9.36682e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1358  glycerol-3-phosphate responsive antiterminator  28.48 
 
 
176 aa  70.9  1e-11  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000981936  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>