73 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BCAH187_A1180 on replicon NC_011658
Organism: Bacillus cereus AH187



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_003909  BCE_1111  3'-5' exoribonuclease YhaM  99.68 
 
 
314 aa  641    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.189435  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0947  3'-5' exoribonuclease YhaM  99.36 
 
 
314 aa  640    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0716307  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0933  3'-5' exoribonuclease YhaM  99.68 
 
 
314 aa  641    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0143521  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0920  3'-5' exoribonuclease YhaM  99.68 
 
 
314 aa  641    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0118856  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1012  3'-5' exoribonuclease YhaM  99.36 
 
 
314 aa  640    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1180  3'-5' exoribonuclease YhaM  100 
 
 
314 aa  643    Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000316143  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1087  3'-5' exoribonuclease YhaM  99.36 
 
 
314 aa  640    Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.6154099999999997e-58 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1052  3'-5' exoribonuclease YhaM  99.68 
 
 
314 aa  641    Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0299092  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4249  3'-5' exoribonuclease YhaM  98.09 
 
 
314 aa  634    Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000074521 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0927  3'-5' exoribonuclease YhaM  96.5 
 
 
314 aa  626  1e-178  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.475944  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0796  3'-5' exoribonuclease YhaM  94.9 
 
 
318 aa  612  9.999999999999999e-175  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0636  3'-5' exoribonuclease YhaM  74.04 
 
 
324 aa  500  1e-140  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.000000000053339  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1452  3'-5' exoribonuclease YhaM  74.68 
 
 
376 aa  496  1e-139  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1378  3'-5' exoribonuclease YhaM  52.82 
 
 
313 aa  362  5.0000000000000005e-99  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.280441  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1895  3'-5' exoribonuclease YhaM  51.67 
 
 
313 aa  344  8.999999999999999e-94  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.469436  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1929  3'-5' exoribonuclease YhaM  51.67 
 
 
313 aa  344  8.999999999999999e-94  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1448  HD-superfamily hydrolase  45.51 
 
 
325 aa  295  7e-79  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000046208  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0730  HD-superfamily hydrolase  44.37 
 
 
316 aa  282  6.000000000000001e-75  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1773  HD domain-containing protein  45.81 
 
 
313 aa  279  4e-74  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0235466  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1766  HD-superfamily hydrolase  45.31 
 
 
313 aa  272  5.000000000000001e-72  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00925857  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0904  HD-superfamily hydrolase  41.88 
 
 
322 aa  261  1e-68  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2193  HD-superfamily hydrolase  41.23 
 
 
314 aa  250  2e-65  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0027  3'-5' exoribonuclease YhaM  40.32 
 
 
323 aa  248  1e-64  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.838244  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0027  HD domain-containing protein  40.32 
 
 
323 aa  246  4e-64  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl244  cmp-binding factor-1  33.76 
 
 
326 aa  184  1.0000000000000001e-45  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2548  metal dependent phosphohydrolase  36.49 
 
 
386 aa  177  2e-43  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.98451e-17 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0473  hypothetical protein  33.23 
 
 
326 aa  176  3e-43  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1665  metal dependent phosphohydrolase  36.14 
 
 
388 aa  176  4e-43  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0049  metal dependent phosphohydrolase  37.8 
 
 
371 aa  175  9.999999999999999e-43  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4294  metal dependent phosphohydrolase  35.45 
 
 
375 aa  174  1.9999999999999998e-42  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.298288  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2929  metal dependent phosphohydrolase  35.99 
 
 
366 aa  173  3.9999999999999995e-42  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.220477  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1091  metal dependent phosphohydrolase  33.23 
 
 
347 aa  169  6e-41  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.628877  normal  0.443941 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2466  metal-dependent phosphohydrolase HD sub domain protein  32.81 
 
 
328 aa  164  2.0000000000000002e-39  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0701415  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0157  metal dependent phosphohydrolase  31.41 
 
 
348 aa  163  4.0000000000000004e-39  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.961708 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1988  metal dependent phosphohydrolase  33.22 
 
 
295 aa  160  2e-38  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.489678  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1122  HD domain-containing protein  32.68 
 
 
375 aa  159  4e-38  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3087  metal dependent phosphohydrolase  32.67 
 
 
330 aa  158  1e-37  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.120543 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2675  metal dependent phosphohydrolase  32.9 
 
 
384 aa  155  7e-37  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.606537 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0086  metal dependent phosphohydrolase  31.27 
 
 
361 aa  155  8e-37  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1404  metal dependent phosphohydrolase  30.13 
 
 
343 aa  154  2e-36  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.248325  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1796  metal dependent phosphohydrolase  32.01 
 
 
315 aa  154  2e-36  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.00000175278  normal  0.229909 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0022  metal dependent phosphohydrolase  32.39 
 
 
361 aa  152  5.9999999999999996e-36  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0126816 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2013  HD-superfamily hydrolase  33.44 
 
 
387 aa  151  1e-35  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000276986  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0158  metal dependent phosphohydrolase  31.82 
 
 
315 aa  151  1e-35  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0129  metal dependent phosphohydrolase  32.71 
 
 
343 aa  150  2e-35  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2339  metal dependent phosphohydrolase  33.11 
 
 
347 aa  145  7.0000000000000006e-34  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0691  metal dependent phosphohydrolase  32.36 
 
 
344 aa  145  8.000000000000001e-34  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.00000585513  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0667  metal dependent phosphohydrolase  33.33 
 
 
336 aa  144  1e-33  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.000000000407652  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2404  HD-superfamily hydrolase  31.52 
 
 
321 aa  145  1e-33  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0036501  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0440  metal dependent phosphohydrolase  33.22 
 
 
377 aa  141  9.999999999999999e-33  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000386707  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1026  metal dependent phosphohydrolase  29.77 
 
 
327 aa  140  3.9999999999999997e-32  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1025  metal dependent phosphohydrolase  29.97 
 
 
336 aa  139  4.999999999999999e-32  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2639  metal dependent phosphohydrolase  30.03 
 
 
528 aa  136  5e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.130174  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2543  metal dependent phosphohydrolase  30.03 
 
 
531 aa  135  8e-31  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.738894  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1317  metal dependent phosphohydrolase  29.93 
 
 
534 aa  133  3e-30  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0700325  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2446  metal dependent phosphohydrolase  29.82 
 
 
534 aa  132  9e-30  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1164  metal dependent phosphohydrolase  31.51 
 
 
320 aa  131  2.0000000000000002e-29  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0147  metal dependent phosphohydrolase  28.96 
 
 
344 aa  125  8.000000000000001e-28  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0847  metal dependent phosphohydrolase  29.11 
 
 
354 aa  117  3e-25  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.241634  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0317  metal dependent phosphohydrolase  25.17 
 
 
333 aa  114  1.0000000000000001e-24  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5827  metal dependent phosphohydrolase  25.99 
 
 
295 aa  101  2e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.163543  normal  0.236354 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5784  metal dependent phosphohydrolase  25.25 
 
 
327 aa  96.3  5e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.106755  normal  0.825544 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1871  metal dependent phosphohydrolase  26.42 
 
 
317 aa  92.4  1e-17  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1645  metal dependent phosphohydrolase  28.89 
 
 
352 aa  83.2  0.000000000000005  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0913  hypothetical protein  27.42 
 
 
313 aa  77.4  0.0000000000003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0450  metal dependent phosphohydrolase  25.16 
 
 
309 aa  66.6  0.0000000005  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1243  metal dependent phosphohydrolase  32.14 
 
 
228 aa  65.5  0.000000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2850  metal dependent phosphohydrolase  20.58 
 
 
309 aa  63.9  0.000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0933  metal dependent phosphohydrolase  33.55 
 
 
249 aa  60.5  0.00000004  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1232  metal dependent phosphohydrolase  28.57 
 
 
228 aa  57  0.0000004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1443  metal dependent phosphohydrolase  27.98 
 
 
228 aa  56.6  0.0000005  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.281894  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0723  metal dependent phosphohydrolase  28.57 
 
 
228 aa  56.6  0.0000006  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0254  metal dependent phosphohydrolase  23.38 
 
 
320 aa  46.6  0.0005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.00126604  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>