More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BCAH187_A0173 on replicon NC_011658
Organism: Bacillus cereus AH187



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011658  BCAH187_A0173  tRNA pseudouridine synthase A  100 
 
 
252 aa  530  1e-150  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  1.75513e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0155  tRNA pseudouridine synthase A  97.62 
 
 
252 aa  524  1e-148  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.18067e-36 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0142  tRNA pseudouridine synthase A  99.19 
 
 
247 aa  518  1e-146  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  6.29315e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0142  tRNA pseudouridine synthase A  97.98 
 
 
247 aa  515  1e-145  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  4.19417e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0135  tRNA pseudouridine synthase A  97.98 
 
 
247 aa  515  1e-145  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000154872  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0142  tRNA pseudouridine synthase A  97.98 
 
 
247 aa  515  1e-145  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  7.71013e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0163  tRNA pseudouridine synthase A  96.03 
 
 
252 aa  515  1e-145  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  1.89836e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5163  tRNA pseudouridine synthase A  95.63 
 
 
252 aa  515  1e-145  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  1.76686e-08  hitchhiker  4.31811e-11 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0137  tRNA pseudouridine synthase A  97.98 
 
 
247 aa  515  1e-145  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  1.39661e-12  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0137  tRNA pseudouridine synthase A  96.03 
 
 
252 aa  516  1e-145  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  2.39358e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0136  tRNA pseudouridine synthase A  91.5 
 
 
247 aa  484  1e-136  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  2.96429e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0143  tRNA pseudouridine synthase A  62.04 
 
 
248 aa  320  1e-86  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  1.60558e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0139  tRNA pseudouridine synthase A  57.55 
 
 
258 aa  302  3e-81  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0321  tRNA pseudouridine synthase A  49.19 
 
 
264 aa  223  2e-57  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  5.66898e-11  hitchhiker  1.98611e-17 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1452  tRNA pseudouridine synthase A  44.98 
 
 
256 aa  219  3e-56  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  8.96278e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0100  tRNA pseudouridine synthase A  43.78 
 
 
258 aa  217  1e-55  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0165  tRNA pseudouridine synthase A  42.51 
 
 
248 aa  211  1e-53  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3634  tRNA pseudouridine synthase A  44.49 
 
 
245 aa  210  1e-53  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.13903  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2246  tRNA pseudouridine synthase A  43.15 
 
 
267 aa  208  6e-53  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  3.74145e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2287  tRNA pseudouridine synthase A  43.15 
 
 
267 aa  208  6e-53  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0252642  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1237  tRNA pseudouridine synthase ACD  43.32 
 
 
245 aa  205  5e-52  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0714167  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2939  tRNA pseudouridine synthase A  42.86 
 
 
244 aa  204  1e-51  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1218  tRNA pseudouridine synthase ACD  42.91 
 
 
245 aa  203  2e-51  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000567145  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0793  tRNA pseudouridine synthase A  45.93 
 
 
245 aa  202  3e-51  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  2.29391e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2426  tRNA pseudouridine synthase A  41.7 
 
 
246 aa  201  1e-50  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  2.20887e-05  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1685  tRNA pseudouridine synthase A  42.45 
 
 
244 aa  200  2e-50  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0491  tRNA pseudouridine synthase A  44.58 
 
 
253 aa  200  2e-50  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2681  tRNA pseudouridine synthase A  42.39 
 
 
262 aa  199  3e-50  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0556679  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0319  tRNA pseudouridine synthase A  45.38 
 
 
250 aa  197  2e-49  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  3.52927e-07  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0900  tRNA pseudouridine synthase A  41.22 
 
 
244 aa  195  6e-49  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  1.06944e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0228  tRNA pseudouridine synthase A  38.82 
 
 
255 aa  194  9e-49  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0937  tRNA pseudouridine synthase ACD  43.67 
 
 
244 aa  194  1e-48  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1060  tRNA pseudouridine synthase A  42.57 
 
 
248 aa  192  4e-48  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1248  tRNA pseudouridine synthase A  42.57 
 
 
248 aa  192  4e-48  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0255  tRNA pseudouridine synthase A  41.6 
 
 
247 aa  192  6e-48  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  2.51416e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0626  tRNA pseudouridine synthase A  41.77 
 
 
252 aa  190  2e-47  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.133889  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1494  tRNA pseudouridine synthase A  42.15 
 
 
259 aa  189  3e-47  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.643957  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0466  tRNA pseudouridine synthase A  41.74 
 
 
252 aa  189  3e-47  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000184743  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2299  pseudouridylate synthase  40.41 
 
 
249 aa  189  4e-47  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  3.90138e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1800  tRNA pseudouridine synthase A  43.15 
 
 
267 aa  188  9e-47  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0686  tRNA pseudouridine synthase ACD  42.86 
 
 
246 aa  188  9e-47  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  9.03127e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0421  tRNA pseudouridine synthase A  41.11 
 
 
260 aa  188  9e-47  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  4.17493e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2680  tRNA pseudouridine synthase A  41.22 
 
 
244 aa  186  3e-46  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  4.43367e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2365  tRNA pseudouridine synthase A  41.22 
 
 
244 aa  185  5e-46  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  1.87105e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0401  tRNA pseudouridine synthase A  38.21 
 
 
245 aa  177  1e-43  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0911  tRNA pseudouridine synthase A  39.02 
 
 
250 aa  177  1e-43  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  1.23783e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3350  tRNA pseudouridine synthase A  38.21 
 
 
247 aa  177  2e-43  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0985621 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2098  tRNA pseudouridine synthase A  39.18 
 
 
270 aa  177  2e-43  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.831526 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1859  tRNA pseudouridine synthase ACD  40.57 
 
 
245 aa  177  2e-43  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.411434  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0228  tRNA pseudouridine synthase A  41.27 
 
 
253 aa  176  3e-43  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  4.01865e-11  normal  0.634585 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2251  tRNA pseudouridine synthase A  41.53 
 
 
246 aa  175  5e-43  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.218051  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02450  pseudouridylate synthase I  41.7 
 
 
246 aa  175  5e-43  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  8.6341e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01500  pseudouridylate synthase I  41.7 
 
 
246 aa  175  5e-43  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  8.6087e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0605  tRNA pseudouridine synthase A  38.37 
 
 
256 aa  175  7e-43  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  7.09788e-15  hitchhiker  0.00819756 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4830  tRNA pseudouridine synthase A  37.8 
 
 
245 aa  174  9e-43  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0152439  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0543  tRNA pseudouridine synthase A  37.8 
 
 
245 aa  174  9e-43  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000330857  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0473  tRNA pseudouridine synthase A  37.8 
 
 
245 aa  174  1e-42  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2726  tRNA pseudouridine synthase A  40.62 
 
 
259 aa  174  2e-42  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0543  tRNA pseudouridine synthase A  37.8 
 
 
245 aa  174  2e-42  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.432297  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0492  tRNA pseudouridine synthase A  37.8 
 
 
245 aa  174  2e-42  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.138657  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4372  tRNA pseudouridine synthase A  36.73 
 
 
267 aa  173  3e-42  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0841  tRNA pseudouridine synthase A  37.64 
 
 
305 aa  173  3e-42  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.258098  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0407  tRNA pseudouridine synthase A  37.4 
 
 
245 aa  172  4e-42  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0487  tRNA pseudouridine synthase A  37.4 
 
 
245 aa  172  4e-42  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0462  tRNA pseudouridine synthase A  37.4 
 
 
245 aa  172  4e-42  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0020  tRNA pseudouridine synthase A  40.82 
 
 
243 aa  172  5e-42  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6844  tRNA pseudouridine synthase A  37.1 
 
 
270 aa  171  7e-42  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000523123  normal  0.307747 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0405  tRNA pseudouridine synthase A  37.4 
 
 
245 aa  171  8e-42  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00300726  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1048  tRNA pseudouridine synthase A  36.73 
 
 
244 aa  171  9e-42  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  7.74285e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2273  tRNA pseudouridine synthase A  39.04 
 
 
263 aa  171  1e-41  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  hitchhiker  2.17948e-06 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3803  tRNA pseudouridine synthase A  37.04 
 
 
259 aa  171  1e-41  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2883  tRNA pseudouridine synthase A  36.29 
 
 
270 aa  171  1e-41  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0101662  normal  0.88579 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1051  tRNA pseudouridine synthase A  37.7 
 
 
276 aa  170  2e-41  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal  0.238902 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3382  tRNA pseudouridine synthase A  35.92 
 
 
244 aa  170  2e-41  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  7.53277e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0255  tRNA pseudouridine synthase A  36.8 
 
 
250 aa  169  3e-41  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00104612  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2707  tRNA pseudouridine synthase A  36.4 
 
 
278 aa  169  5e-41  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.580118  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0468  tRNA pseudouridine synthase A  38.37 
 
 
271 aa  169  5e-41  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  4.42967e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0746  tRNA pseudouridine synthase A  41.32 
 
 
247 aa  169  5e-41  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  unclonable  3.57289e-23  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0770  tRNA pseudouridine synthase A  37.05 
 
 
275 aa  168  7e-41  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1666  tRNA pseudouridine synthase A  36.29 
 
 
261 aa  168  8e-41  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.0056205  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2995  tRNA pseudouridine synthase ACD  38.55 
 
 
278 aa  168  1e-40  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00964869 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2497  tRNA pseudouridine synthase A  36.48 
 
 
271 aa  167  1e-40  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1700  tRNA pseudouridine synthase A  34.29 
 
 
261 aa  166  2e-40  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.125972 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1914  tRNA pseudouridine synthase A  36.89 
 
 
351 aa  166  3e-40  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21360  pseudouridylate synthase I  37.69 
 
 
271 aa  166  4e-40  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0418388  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1051  tRNA pseudouridine synthase A  36.36 
 
 
255 aa  165  5e-40  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  8.73816e-06  hitchhiker  0.00519599 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2984  tRNA pseudouridine synthase A  36.63 
 
 
261 aa  165  6e-40  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000426991  normal  0.427567 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0677  tRNA pseudouridine synthase A  34.15 
 
 
270 aa  165  6e-40  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.873291  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0527  tRNA pseudouridine synthase A  33.87 
 
 
271 aa  165  6e-40  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1856  tRNA pseudouridine synthase A  33.87 
 
 
271 aa  165  6e-40  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0227794  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4238  tRNA pseudouridine synthase A  34.55 
 
 
250 aa  164  1e-39  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00146243 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1723  tRNA pseudouridine synthase A  33.74 
 
 
270 aa  164  1e-39  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0771  tRNA pseudouridine synthase A  33.74 
 
 
270 aa  164  1e-39  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2447  tRNA pseudouridine synthase A  33.74 
 
 
270 aa  164  1e-39  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.808323  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2877  tRNA pseudouridine synthase A  35.51 
 
 
244 aa  164  1e-39  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.00616108  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2309  tRNA pseudouridine synthase A  33.74 
 
 
270 aa  164  1e-39  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0622933  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1647  tRNA pseudouridine synthase A  33.74 
 
 
270 aa  164  1e-39  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1652  tRNA pseudouridine synthase A  36.21 
 
 
261 aa  164  1e-39  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0120499  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1901  tRNA pseudouridine synthase A  34.69 
 
 
252 aa  163  2e-39  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  3.48254e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0571  tRNA pseudouridine synthase A  36.8 
 
 
255 aa  163  2e-39  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.217469  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>