73 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_p0189 on replicon NC_009475
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009475  BBta_p0189  putative copper resistance protein CopB precursor  100 
 
 		 260 aa  527  1e-149  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2135  copper resistance B precursor  48.04 
 
 		 351 aa  192  3e-48  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2421  copper resistance B precursor  47.06 
 
 		 403 aa  189  4e-47  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.754821 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2351  copper resistance B precursor  46.19 
 
 		 398 aa  183  3e-45  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0202  copper resistance B precursor  45.41 
 
 		 260 aa  181  1e-44  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0381  copper resistance B precursor  39.15 
 
 		 353 aa  175  6e-43  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2220  copper resistance B precursor  42.93 
 
 		 341 aa  171  1e-41  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.205984  normal  0.780487 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2491  copper resistance B precursor  41.86 
 
 		 305 aa  168  1e-40  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.853934 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2930  copper resistance B precursor  41 
 
 		 347 aa  167  2e-40  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3622  copper resistance B precursor  41.4 
 
 		 305 aa  166  2.9999999999999998e-40  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3545  copper resistance B precursor  43.65 
 
 		 237 aa  161  9e-39  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0320075  n/a   
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6113  Cu(II)/Cu(I) resistance outer membrane protein CopB  38.03 
 
 		 495 aa  160  1e-38  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.109399  normal  0.679723 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0785  copper resistance B precursor  40.49 
 
 		 321 aa  160  3e-38  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.969863  normal  0.401852 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1970  copper resistance B precursor  40.48 
 
 		 237 aa  160  3e-38  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4288  copper resistance B precursor  40.58 
 
 		 237 aa  159  5e-38  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.28688  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0250  copper resistance B precursor  40.58 
 
 		 237 aa  159  5e-38  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2217  copper resistance B precursor  38.89 
 
 		 363 aa  159  5e-38  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0429936  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1376  copper resistance B precursor  38.3 
 
 		 247 aa  159  5e-38  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.379919  n/a   
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5101  copper resistance B precursor  40.28 
 
 		 421 aa  158  7e-38  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.082477 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2205  copper resistance B precursor  40.09 
 
 		 262 aa  158  8e-38  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5670  copper resistance protein B  39.62 
 
 		 360 aa  158  9e-38  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.366564  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1494  copper resistance B precursor  41.29 
 
 		 312 aa  157  1e-37  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.196943  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1325  copper resistance protein B  37.77 
 
 		 288 aa  157  1e-37  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.282385  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1720  copper resistance B precursor  39.25 
 
 		 324 aa  155  4e-37  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.099384  normal  1 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5337  copper resistance B precursor  39.25 
 
 		 324 aa  155  4e-37  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.931181  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4396  copper resistance B precursor  35.77 
 
 		 256 aa  155  5.0000000000000005e-37  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.523353  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3811  copper resistance B precursor  40 
 
 		 301 aa  155  5.0000000000000005e-37  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.992888  normal  0.848683 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0657  copper resistance protein B  39.81 
 
 		 346 aa  154  1e-36  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3232  copper resistance protein B  34.91 
 
 		 397 aa  154  1e-36  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.197761  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1839  copper resistance B precursor  38.39 
 
 		 429 aa  154  2e-36  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.425584  hitchhiker  0.0000315743 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1778  copper resistance B precursor  38.79 
 
 		 332 aa  154  2e-36  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.104151  normal  0.145157 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0013  copper resistance B precursor  41.62 
 
 		 371 aa  152  5e-36  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.188743  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0013  copper resistance B precursor  41.62 
 
 		 371 aa  152  5e-36  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.001908  normal  0.0882664 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0573  copper resistance B precursor  36.25 
 
 		 311 aa  152  5e-36  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.972949 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0015  copper resistance B precursor  41.62 
 
 		 371 aa  152  5e-36  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0966383  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2339  copper resistance B precursor  36.87 
 
 		 343 aa  151  8.999999999999999e-36  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.254235  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3415  copper resistance B precursor  39.05 
 
 		 298 aa  150  1e-35  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5182  copper resistance B precursor  40.54 
 
 		 371 aa  150  1e-35  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.336515  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5379  copper resistance B precursor  38.81 
 
 		 369 aa  150  2e-35  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.486591 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37810  copper resistance protein B precursor  40.86 
 
 		 351 aa  149  4e-35  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0815776  normal  0.208347 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5375  copper resistance B precursor  33.93 
 
 		 306 aa  149  6e-35  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.357667 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1712  copper resistance B precursor  33.73 
 
 		 288 aa  148  8e-35  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.322874  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1570  copper resistance B precursor  37.5 
 
 		 302 aa  147  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.729928  normal  0.0120943 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1267  copper resistance B precursor  34.98 
 
 		 303 aa  146  3e-34  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00955945  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3915  copper resistance protein B  37 
 
 		 258 aa  145  5e-34  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2488  copper resistance B precursor  38.86 
 
 		 337 aa  145  6e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.519855  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0273  copper resistance B precursor  39.38 
 
 		 274 aa  145  9e-34  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.500422  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3106  copper resistance B precursor  35.8 
 
 		 341 aa  144  2e-33  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.37471  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0347  copper resistance B precursor  39.46 
 
 		 236 aa  142  4e-33  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.515255 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2630  copper resistance B precursor  34.65 
 
 		 313 aa  141  9.999999999999999e-33  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.879879  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1482  copper resistance B precursor  32.35 
 
 		 272 aa  140  1.9999999999999998e-32  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000648661 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3256  copper resistance B precursor  36.16 
 
 		 318 aa  139  4.999999999999999e-32  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.27948  normal  0.22863 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4266  copper resistance B precursor  40.64 
 
 		 249 aa  138  8.999999999999999e-32  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.852956  decreased coverage  0.00992965 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1946  putative copper resistance protein B  41.08 
 
 		 287 aa  136  3.0000000000000003e-31  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.300672  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00270  Copper resistance B precursor  38.31 
 
 		 323 aa  136  3.0000000000000003e-31  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1708  copper resistance B precursor  37.38 
 
 		 237 aa  133  1.9999999999999998e-30  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00160337  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2204  copper resistance protein B, putative  35.02 
 
 		 294 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1234  copper resistance B precursor  38.22 
 
 		 326 aa  133  3e-30  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1827  copper resistance B precursor  35.48 
 
 		 291 aa  133  3e-30  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.193991  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2115  copper resistance B precursor  38.04 
 
 		 235 aa  132  3.9999999999999996e-30  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1574  copper resistance B precursor  35.92 
 
 		 235 aa  131  9e-30  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03131  copper resistance protein B  39.25 
 
 		 368 aa  129  3e-29  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0127  copper resistance B precursor  37.38 
 
 		 246 aa  129  3e-29  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0449  copper resistance B precursor  37.17 
 
 		 326 aa  129  3e-29  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.835872  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2457  copper resistance B precursor  32.11 
 
 		 323 aa  129  6e-29  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.379097  normal  0.733317 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00404  hypothetical protein  32.39 
 
 		 235 aa  107  2e-22  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0093  copper resistance B precursor  33.89 
 
 		 314 aa  99  7e-20  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0109  copper resistance protein B precursor  32.04 
 
 		 289 aa  97.8  2e-19  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1590  copper-resistance protein CopB  26.02 
 
 		 339 aa  77.8  0.0000000000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000266353  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0711  copper resistance B precursor  24.8 
 
 		 354 aa  77.4  0.0000000000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.136599 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0696  putative copper-resistance protein CopB  25.1 
 
 		 384 aa  71.2  0.00000000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.000706782  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2931  hypothetical protein  25.46 
 
 		 232 aa  70.1  0.00000000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.771222  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0800  copper resistance protein B  27.03 
 
 		 803 aa  55.5  0.0000008  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>