275 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_p0120 on replicon NC_009475
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009475  BBta_p0120  hypothetical protein  100 
 
 
91 aa  177  4.999999999999999e-44  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3817  hypothetical protein  82.42 
 
 
91 aa  152  1e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.510545  normal 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4381  hypothetical protein  81.32 
 
 
91 aa  152  2e-36  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0207  hypothetical protein  80.22 
 
 
91 aa  149  1e-35  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3435  hypothetical protein  79.12 
 
 
91 aa  149  1e-35  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0910  hypothetical protein  76.92 
 
 
91 aa  147  7e-35  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1481  hypothetical protein  76.92 
 
 
91 aa  145  2.0000000000000003e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.494418  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3870  hypothetical protein  75.82 
 
 
91 aa  142  2e-33  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.863177 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1857  protein of unknown function DUF156  76.92 
 
 
91 aa  141  3e-33  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.151072  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3092  hypothetical protein  71.43 
 
 
91 aa  132  1.9999999999999998e-30  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.642683  normal  0.388953 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2632  hypothetical protein  53.85 
 
 
95 aa  104  4e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.00527658  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2284  hypothetical protein  57.5 
 
 
98 aa  98.2  4e-20  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3243  hypothetical protein  57.5 
 
 
129 aa  94.7  4e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0175  hypothetical protein  50 
 
 
145 aa  86.3  1e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.860909  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1900  protein of unknown function DUF156  50.62 
 
 
109 aa  84.7  3e-16  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1470  hypothetical protein  45.68 
 
 
100 aa  83.6  9e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0383615  hitchhiker  0.0000277305 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3498  hypothetical protein  45.68 
 
 
100 aa  83.2  0.000000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.434736  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3761  hypothetical protein  45.68 
 
 
100 aa  82  0.000000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.894336  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3781  hypothetical protein  45.68 
 
 
100 aa  82.8  0.000000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00152892  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3577  hypothetical protein  45.68 
 
 
100 aa  82  0.000000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000813292  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3831  hypothetical protein  45.68 
 
 
100 aa  82  0.000000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.715708  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3477  hypothetical protein  45.68 
 
 
100 aa  82  0.000000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00168287  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3489  hypothetical protein  45.68 
 
 
100 aa  82  0.000000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0105501  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3861  hypothetical protein  45.68 
 
 
100 aa  82  0.000000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00835588  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3743  hypothetical protein  45.68 
 
 
100 aa  82  0.000000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000430591 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1688  protein of unknown function DUF156  56.41 
 
 
103 aa  82  0.000000000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1700  protein of unknown function DUF156  56.41 
 
 
103 aa  82  0.000000000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0139409  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5191  protein of unknown function DUF156  60.56 
 
 
93 aa  82  0.000000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0909997  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1802  protein of unknown function DUF156  55.26 
 
 
103 aa  81.3  0.000000000000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5706  hypothetical protein  55.7 
 
 
97 aa  81.3  0.000000000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.840437 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5303  hypothetical protein  55.7 
 
 
97 aa  81.3  0.000000000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.198456  normal  0.383245 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0148  hypothetical protein  50.63 
 
 
103 aa  80.9  0.000000000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.626316  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1741  protein of unknown function DUF156  49.4 
 
 
92 aa  80.9  0.000000000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0157  hypothetical protein  50.63 
 
 
103 aa  80.9  0.000000000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.603264  normal  0.882667 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2404  hypothetical protein  48.15 
 
 
101 aa  80.5  0.000000000000007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000296567  n/a   
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0183  hypothetical protein  52.63 
 
 
103 aa  80.5  0.000000000000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.49313  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10191  hypothetical protein  50.63 
 
 
96 aa  80.5  0.000000000000008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0279  YvgZ  52.63 
 
 
103 aa  80.5  0.000000000000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3668  hypothetical protein  55.7 
 
 
97 aa  80.1  0.000000000000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.531949  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3133  protein of unknown function DUF156  55.7 
 
 
99 aa  79.7  0.00000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.032258  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0132  hypothetical protein  51.14 
 
 
108 aa  79.7  0.00000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4021  protein of unknown function DUF156  53.62 
 
 
93 aa  80.1  0.00000000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.359633 
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4587  hypothetical protein  59.15 
 
 
93 aa  79.7  0.00000000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0138  hypothetical protein  50.63 
 
 
103 aa  80.1  0.00000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0713014 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4267  hypothetical protein  48.72 
 
 
110 aa  79.3  0.00000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3495  hypothetical protein  56.67 
 
 
121 aa  78.2  0.00000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2597  protein of unknown function DUF156  52.56 
 
 
109 aa  78.2  0.00000000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3257  protein of unknown function DUF156  48.72 
 
 
101 aa  78.2  0.00000000000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.664348  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0784  protein of unknown function DUF156  57.75 
 
 
98 aa  78.6  0.00000000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.63261  normal  0.0129071 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2499  protein of unknown function DUF156  52.94 
 
 
141 aa  78.6  0.00000000000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.716085 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2278  hypothetical protein  49.38 
 
 
92 aa  78.2  0.00000000000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0466  protein of unknown function DUF156  55.13 
 
 
97 aa  77.8  0.00000000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.686705  normal  0.135664 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0484  hypothetical protein  64.15 
 
 
104 aa  78.2  0.00000000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.082192 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5881  hypothetical protein  50.63 
 
 
98 aa  78.2  0.00000000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.811301 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4242  protein of unknown function DUF156  52.56 
 
 
115 aa  77.8  0.00000000000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3702  hypothetical protein  49.37 
 
 
93 aa  77.8  0.00000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.81583  normal  0.0547705 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3652  protein of unknown function DUF156  56.67 
 
 
121 aa  77.8  0.00000000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0017  hypothetical protein  57.63 
 
 
93 aa  77.4  0.00000000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0533  hypothetical protein  53.25 
 
 
100 aa  77  0.00000000000008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0395944  normal  0.0381301 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3648  protein of unknown function DUF156  56.67 
 
 
121 aa  77  0.00000000000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3583  protein of unknown function DUF156  56.67 
 
 
121 aa  76.6  0.0000000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0673  hypothetical protein  49.35 
 
 
152 aa  76.3  0.0000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.121389  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3404  hypothetical protein  52.94 
 
 
93 aa  75.9  0.0000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1112  protein of unknown function DUF156  50 
 
 
98 aa  75.5  0.0000000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.192751  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5648  protein of unknown function DUF156  51.9 
 
 
93 aa  75.1  0.0000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9134  hypothetical protein  49.35 
 
 
93 aa  75.1  0.0000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.733777 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19810  hypothetical protein  48.05 
 
 
119 aa  75.1  0.0000000000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.418046  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0445  hypothetical protein  51.95 
 
 
103 aa  75.5  0.0000000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.467567  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36130  hypothetical protein  53.85 
 
 
93 aa  74.3  0.0000000000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.225482  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36760  hypothetical protein  53.73 
 
 
93 aa  74.3  0.0000000000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.176148 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4549  protein of unknown function DUF156  47.44 
 
 
98 aa  73.9  0.0000000000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3671  protein of unknown function DUF156  57.63 
 
 
93 aa  73.9  0.0000000000007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4045  hypothetical protein  50 
 
 
93 aa  73.9  0.0000000000007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3871  protein of unknown function DUF156  43.9 
 
 
125 aa  73.9  0.0000000000007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00362908 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3257  protein of unknown function DUF156  49.25 
 
 
96 aa  73.6  0.0000000000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0988  protein of unknown function DUF156  40.66 
 
 
91 aa  72.8  0.000000000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.11096  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0952  hypothetical protein  53.23 
 
 
95 aa  73.6  0.000000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4097  hypothetical protein  50.82 
 
 
115 aa  73.2  0.000000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4465  hypothetical protein  52.24 
 
 
109 aa  73.2  0.000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4548  hypothetical protein  52.24 
 
 
109 aa  73.2  0.000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1454  hypothetical protein  52.24 
 
 
109 aa  72.4  0.000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1739  protein of unknown function DUF156  50.75 
 
 
103 aa  72.4  0.000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0478748  hitchhiker  0.00498764 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1650  hypothetical protein  52.86 
 
 
93 aa  72.4  0.000000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1472  hypothetical protein  52.24 
 
 
109 aa  72.4  0.000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3443  protein of unknown function DUF156  46.15 
 
 
119 aa  71.6  0.000000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0992847  hitchhiker  0.00675708 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2658  protein of unknown function DUF156  48.68 
 
 
99 aa  72  0.000000000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00269509  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4499  hypothetical protein  52.86 
 
 
108 aa  71.6  0.000000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.519747 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1674  hypothetical protein  46.75 
 
 
97 aa  70.5  0.000000000007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.184479  hitchhiker  0.000845863 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0391  hypothetical protein  41.56 
 
 
95 aa  70.5  0.000000000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1271  protein of unknown function DUF156  46.67 
 
 
88 aa  70.5  0.000000000007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.858801  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3602  protein of unknown function DUF156  47.76 
 
 
100 aa  70.5  0.000000000008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.251846  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3411  protein of unknown function DUF156  41.98 
 
 
91 aa  70.5  0.000000000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0125991 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2077  protein of unknown function DUF156  54.39 
 
 
87 aa  70.5  0.000000000009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.938076  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3147  hypothetical protein  48.57 
 
 
103 aa  70.1  0.00000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.010028 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13320  hypothetical protein  46.15 
 
 
91 aa  69.7  0.00000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00119769  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0819  hypothetical protein  50.82 
 
 
89 aa  69.3  0.00000000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  decreased coverage  0.0000000405513  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21350  hypothetical protein  62.75 
 
 
126 aa  68.9  0.00000000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.481053  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1007  protein of unknown function DUF156  46.67 
 
 
100 aa  68.9  0.00000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.20895  normal  0.265795 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3676  protein of unknown function DUF156  48.53 
 
 
103 aa  68.6  0.00000000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0410766  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_10580  hypothetical protein  49.18 
 
 
101 aa  68.6  0.00000000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.0042499  normal  0.482533 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>