168 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_p0023 on replicon NC_009475
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009475  BBta_p0023  transcriptional regulator  100 
 
 		 108 aa  219  9.999999999999999e-57  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  0.181624 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1157  XRE family transcriptional regulator  61.9 
 
 		 106 aa  140  9e-33  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.00152463  hitchhiker  0.0000187625 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3236  transcriptional regulator, XRE family  37.86 
 
 		 113 aa  65.5  0.0000000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.355166  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0551  XRE family transcriptional regulator  34.34 
 
 		 106 aa  57  0.00000008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2295  transcriptional regulator  33.01 
 
 		 106 aa  55.8  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.302272  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2373  XRE family transcriptional regulator  30.69 
 
 		 107 aa  55.8  0.0000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.859226  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1577  peptidase S24-like domain-containing protein  30.59 
 
 		 216 aa  55.1  0.0000003  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000000555461  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0580  repressor protein C2  29.41 
 
 		 238 aa  51.6  0.000003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1064  transcriptional regulator, XRE family  35.62 
 
 		 206 aa  50.8  0.000007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0300833  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4003  transcriptional regulator, XRE family  42.86 
 
 		 61 aa  50.4  0.000008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2927  transcriptional regulator, XRE family  38.1 
 
 		 130 aa  49.7  0.00001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.298234 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_217  hypothetical protein  32.32 
 
 		 132 aa  50.1  0.00001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007616  NmulC_2782  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  31.68 
 
 		 106 aa  48.5  0.00003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.821719  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5157  XRE family transcriptional regulator  28.97 
 
 		 107 aa  48.1  0.00003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.086798  normal  0.235984 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3652  XRE family transcriptional regulator  30 
 
 		 196 aa  48.5  0.00003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00533728 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0336  XRE family transcriptional regulator  38.1 
 
 		 140 aa  48.1  0.00004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  unclonable  0.000000000838003  normal  0.0169736 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2484  transcriptional regulator, XRE family  36.36 
 
 		 67 aa  48.1  0.00004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3407  transcriptional regulator, XRE family  35.14 
 
 		 192 aa  47.4  0.00006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1538  XRE family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 374 aa  47.8  0.00006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1889  transcriptional regulator, XRE family  40.62 
 
 		 188 aa  47.4  0.00007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7925  putative transcriptional regulator, XRE family  36.49 
 
 		 199 aa  47.4  0.00007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.421089 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2717  hypothetical protein  34.62 
 
 		 119 aa  47.4  0.00007  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.570521 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2320  transcriptional regulator, XRE family  40.62 
 
 		 188 aa  47  0.00008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3050  transcriptional regulator, XRE family  32 
 
 		 195 aa  47  0.00009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0215158  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3404  cupin 2 domain-containing protein  33.33 
 
 		 215 aa  47  0.00009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2305  XRE family transcriptional regulator  36.51 
 
 		 130 aa  47  0.00009  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.0843666 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1787  Cro/CI family transcriptional regulator  41.94 
 
 		 200 aa  46.6  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0263563  normal  0.220225 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1849  Cro/CI family transcriptional regulator  41.94 
 
 		 200 aa  46.6  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.646761  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1668  Cro/CI family transcriptional regulator  41.94 
 
 		 200 aa  47  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.118403 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1789  transcriptional regulator, Cro/CI family  41.94 
 
 		 200 aa  47  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.225 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3247  XRE family transcriptional regulator  42.19 
 
 		 187 aa  46.2  0.0001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000592797 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3349  XRE family transcriptional regulator  34.83 
 
 		 115 aa  46.2  0.0001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.185008 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0424  XRE family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 188 aa  46.2  0.0001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0328  transcriptional regulator, XRE family  35.71 
 
 		 191 aa  46.2  0.0001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.000000000353964  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0327  XRE family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 191 aa  46.2  0.0001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000523898  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1487  transcriptional regulator, Cro/CI family  41.94 
 
 		 200 aa  46.2  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.335106  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3298  Cro/CI family transcriptional regulator  42.19 
 
 		 187 aa  46.2  0.0002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1435  transcriptional regulator SinR  33.33 
 
 		 107 aa  45.8  0.0002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000395729  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1393  transcriptional regulator SinR  33.33 
 
 		 107 aa  45.8  0.0002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.111718  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0239  XRE family transcriptional regulator  34.94 
 
 		 115 aa  45.4  0.0002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000283783  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3700  XRE family transcriptional regulator  38.57 
 
 		 191 aa  45.8  0.0002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00000696836  normal  0.275941 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5294  transcriptional regulator, XRE family  34.67 
 
 		 194 aa  45.8  0.0002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0319  XRE family transcriptional regulator  38.57 
 
 		 191 aa  45.8  0.0002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00000000379854  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1566  transcriptional regulator, XRE family  33.33 
 
 		 202 aa  45.8  0.0002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0862847 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0364  XRE family transcriptional regulator  39.06 
 
 		 231 aa  45.8  0.0002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1197  XRE family transcriptional regulator  33.82 
 
 		 107 aa  45.8  0.0002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0325651  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1371  transcriptional regulator SinR  33.82 
 
 		 107 aa  45.4  0.0003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000100854 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1195  transcriptional regulator SinR  33.82 
 
 		 107 aa  45.4  0.0003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00148794  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1174  transcriptional regulator  33.82 
 
 		 107 aa  45.4  0.0003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1176  transcriptional regulator  33.82 
 
 		 107 aa  45.4  0.0003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000910939  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1292  transcriptional regulator SinR  33.82 
 
 		 107 aa  45.4  0.0003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.00598951  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1333  transcriptional regulator SinR  33.82 
 
 		 107 aa  45.1  0.0003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.248023  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0323  XRE family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 191 aa  45.4  0.0003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.00000000737434  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0095  XRE family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 107 aa  45.4  0.0003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0505  cryptic phage CTXphi transcriptional repressor RstR  27.45 
 
 		 111 aa  45.1  0.0003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.451167  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1067  cryptic phage CTXphi transcriptional repressor RstR  27.45 
 
 		 111 aa  45.1  0.0003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.745753  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1070  cryptic phage CTXphi transcriptional repressor RstR  27.45 
 
 		 111 aa  45.1  0.0003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0650  XRE family transcriptional regulator  42.19 
 
 		 187 aa  45.4  0.0003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0324  XRE family transcriptional regulator  38.57 
 
 		 191 aa  44.7  0.0004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000421536  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0165  transcriptional regulator, XRE family  38.1 
 
 		 201 aa  44.7  0.0004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0321  XRE family transcriptional regulator  34.52 
 
 		 191 aa  44.7  0.0004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000000250107  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1378  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  27.05 
 
 		 481 aa  44.7  0.0005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.84072  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0524  XRE family transcriptional regulator  39.39 
 
 		 187 aa  44.7  0.0005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.0000000000827128  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1003  XRE family transcriptional regulator  30.43 
 
 		 107 aa  44.7  0.0005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.77905  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1390  transcriptional regulator  34.94 
 
 		 252 aa  44.3  0.0006  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.163834  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7277  transcriptional regulator, XRE family  33.85 
 
 		 189 aa  44.3  0.0006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1115  transcriptional regulator, Cro/CI family  38.46 
 
 		 77 aa  44.3  0.0006  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.253142  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3263  transcriptional regulator, XRE family  40.32 
 
 		 188 aa  43.9  0.0007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0162  transcriptional regulator  36.84 
 
 		 145 aa  43.9  0.0008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000550867  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8701  transcriptional regulator, XRE family  27.1 
 
 		 200 aa  43.9  0.0008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.257362 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3529  XRE family transcriptional regulator  39.68 
 
 		 200 aa  43.9  0.0008  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.295271 
 
 
-
 
NC_002978  WD0508  transcriptional regulator, putative  23.86 
 
 		 312 aa  43.5  0.001  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS04780  putative transcription regulator protein  37.1 
 
 		 205 aa  43.5  0.001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05657  putative DNA-binding transcriptional regulatory transcription regulator protein  37.1 
 
 		 205 aa  43.5  0.001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2346  transcriptional regulator  39.34 
 
 		 215 aa  42.7  0.001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.958774 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1430  transcriptional regulator, XRE family  28.57 
 
 		 490 aa  43.5  0.001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.236575  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2460  XRE family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 142 aa  43.1  0.001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0113682  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7699  putative transcriptional regulator  36.26 
 
 		 112 aa  43.5  0.001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.829097  normal  0.153836 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1423  transcriptional regulator, XRE family  32 
 
 		 195 aa  43.5  0.001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1193  helix-turn-helix domain-containing protein  39.68 
 
 		 68 aa  43.5  0.001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.67349  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3019  transcriptional regulator, XRE family  35.71 
 
 		 198 aa  43.1  0.001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3360  DNA-binding protein  38.1 
 
 		 67 aa  42.7  0.002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.534769  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4441  transcriptional regulator, XRE family  33.33 
 
 		 123 aa  42.7  0.002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3368  DNA-binding protein  36.51 
 
 		 67 aa  42  0.002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00271776  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1886  DNA-binding protein  38.1 
 
 		 67 aa  42.7  0.002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1453  transcriptional regulator, XRE family  30.3 
 
 		 171 aa  42.4  0.002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5358  putative transcriptional regulator, XRE family  30.67 
 
 		 201 aa  42.4  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.406538  normal  0.655587 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1211  XRE family transcriptional regulator  39.34 
 
 		 67 aa  42.4  0.002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0267  XRE family transcriptional regulator  27.78 
 
 		 118 aa  42.7  0.002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.257195  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1548  hypothetical protein  35.21 
 
 		 154 aa  42.4  0.002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.115778  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00900  predicted transcriptional regulator  32.84 
 
 		 369 aa  42.4  0.002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.506264 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2282  hypothetical protein  29.41 
 
 		 158 aa  42.7  0.002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.442198 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0635  transcriptional regulator, XRE family  34.67 
 
 		 198 aa  42.7  0.002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4011  transcriptional regulator SinR  34.43 
 
 		 107 aa  42.7  0.002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0025622  hitchhiker  0.000000000000530943 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2481  DNA-binding protein  40.3 
 
 		 185 aa  42  0.003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00193646  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3130  transcriptional regulator  36.51 
 
 		 67 aa  42  0.003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0662  XRE family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 259 aa  41.6  0.003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2204  XRE family transcriptional regulator  24.75 
 
 		 107 aa  42  0.003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  hitchhiker  0.000000112019  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3489  XRE family transcriptional regulator  39.68 
 
 		 187 aa  41.6  0.003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3344  DNA-binding protein  36.51 
 
 		 66 aa  41.6  0.003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>