More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_7860 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009485  BBta_7860  hypothetical protein  100 
 
 
324 aa  657  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.266797 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5060  hypothetical protein  51.84 
 
 
331 aa  352  4e-96  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6352  hypothetical protein  50.94 
 
 
321 aa  325  4e-88  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.997284  normal  0.0840681 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0869  hypothetical protein  51.34 
 
 
339 aa  308  1e-82  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3546  hypothetical protein  50.17 
 
 
330 aa  307  2e-82  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0909589  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2869  hypothetical protein  50.34 
 
 
330 aa  306  3e-82  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5382  extra-cytoplasmic solute receptor  45.54 
 
 
331 aa  306  3e-82  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.203559  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0596  hypothetical protein  46.5 
 
 
336 aa  296  3e-79  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.642014  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3937  hypothetical protein  50 
 
 
328 aa  295  1e-78  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.178831  normal  0.0313351 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4821  hypothetical protein  46 
 
 
330 aa  294  1e-78  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3974  hypothetical protein  45.37 
 
 
328 aa  293  3e-78  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.406148 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3324  hypothetical protein  45.37 
 
 
328 aa  292  6e-78  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  decreased coverage  0.0025587  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3983  extra-cytoplasmic solute receptor  44.95 
 
 
328 aa  292  6e-78  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0104878 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4624  hypothetical protein  45.74 
 
 
327 aa  291  9e-78  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0462  hypothetical protein  47.12 
 
 
345 aa  290  2e-77  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.170176 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0453  hypothetical protein  47.12 
 
 
345 aa  290  2e-77  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.533416  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4609  extra-cytoplasmic solute receptor  45.91 
 
 
328 aa  290  3e-77  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.636278 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2117  hypothetical protein  45 
 
 
327 aa  288  6e-77  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.299705  normal  0.290671 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3145  hypothetical protein  47.11 
 
 
333 aa  287  2e-76  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.261814  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4389  hypothetical protein  45.3 
 
 
321 aa  286  3e-76  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.907682 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0779  hypothetical protein  46.28 
 
 
360 aa  285  6e-76  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0200  hypothetical protein  45.92 
 
 
349 aa  285  6e-76  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0489  hypothetical protein  44.91 
 
 
344 aa  285  7e-76  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0161  hypothetical protein  44.67 
 
 
330 aa  285  9e-76  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0143  hypothetical protein  44.67 
 
 
330 aa  285  9e-76  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.627963 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3614  hypothetical protein  46 
 
 
355 aa  285  1e-75  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.380289  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3884  hypothetical protein  44.89 
 
 
328 aa  284  2e-75  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4004  hypothetical protein  45.45 
 
 
339 aa  283  4e-75  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.506172  normal  0.0371737 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2991  hypothetical protein  46.91 
 
 
333 aa  283  4e-75  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.36978  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5112  hypothetical protein  47.18 
 
 
325 aa  281  2e-74  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.386337  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1253  hypothetical protein  45.86 
 
 
324 aa  280  3e-74  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4286  extra-cytoplasmatic solute receptor  43.96 
 
 
353 aa  279  4e-74  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.85012 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4853  extra-cytoplasmic solute receptor  43.19 
 
 
314 aa  278  6e-74  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0565268  normal  0.206495 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3664  hypothetical protein  43.85 
 
 
324 aa  277  2e-73  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3832  extra-cytoplasmic solute receptor  42.46 
 
 
322 aa  276  3e-73  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0191  hypothetical protein  45.36 
 
 
335 aa  276  3e-73  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5035  hypothetical protein  46.1 
 
 
339 aa  276  3e-73  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.401942  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5565  hypothetical protein  47.47 
 
 
335 aa  276  5e-73  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.517724  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1121  hypothetical protein  44.44 
 
 
325 aa  275  7e-73  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.237862  normal  0.618143 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1041  hypothetical protein  44.44 
 
 
327 aa  275  9e-73  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4876  extra-cytoplasmic solute receptor  44.97 
 
 
328 aa  273  3e-72  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.748926  normal  0.754985 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5438  hypothetical protein  45.17 
 
 
326 aa  272  5e-72  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5574  extra-cytoplasmic solute receptor  44.98 
 
 
330 aa  272  7e-72  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1815  hypothetical protein  43.96 
 
 
325 aa  272  7e-72  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00540737  normal  0.0160042 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5894  extra-cytoplasmic solute receptor  44.65 
 
 
358 aa  271  1e-71  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4229  twin-arginine translocation pathway signal  44.92 
 
 
335 aa  270  3e-71  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.467764  normal  0.364318 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5589  hypothetical protein  43.56 
 
 
335 aa  270  3e-71  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2113  hypothetical protein  41.9 
 
 
318 aa  269  4e-71  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.723108  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4214  hypothetical protein  44.3 
 
 
324 aa  269  5e-71  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4073  extra-cytoplasmic solute receptor  42.81 
 
 
332 aa  269  6e-71  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000509768  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6217  hypothetical protein  45.36 
 
 
322 aa  268  1e-70  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0641942  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0801  hypothetical protein  43.96 
 
 
323 aa  268  1e-70  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.618864  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4213  extra-cytoplasmic solute receptor  45.74 
 
 
326 aa  268  1e-70  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3830  hypothetical protein  41.28 
 
 
330 aa  267  2e-70  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.956859  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0797  hypothetical protein  45.15 
 
 
386 aa  267  2e-70  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1691  hypothetical protein  43.62 
 
 
331 aa  266  3e-70  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5146  hypothetical protein  40.12 
 
 
327 aa  266  4e-70  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0987531  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4334  twin-arginine translocation pathway signal  43.52 
 
 
335 aa  265  6e-70  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.0464074 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3558  hypothetical protein  44.15 
 
 
327 aa  265  1e-69  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1708  hypothetical protein  41.05 
 
 
322 aa  264  2e-69  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  4.67968e-05  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4323  hypothetical protein  40.8 
 
 
344 aa  263  2e-69  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.957408  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4279  hypothetical protein  40.13 
 
 
356 aa  263  2e-69  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.877893  normal  0.56539 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5896  hypothetical protein  41.74 
 
 
332 aa  264  2e-69  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.971815  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6278  hypothetical protein  43.77 
 
 
322 aa  263  3e-69  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  hitchhiker  0.000130922  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1912  hypothetical protein  40.91 
 
 
335 aa  263  4e-69  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1128  hypothetical protein  41.85 
 
 
324 aa  263  4e-69  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.794936  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3163  hypothetical protein  42.3 
 
 
334 aa  262  5e-69  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  hitchhiker  2.18374e-05 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5278  extra-cytoplasmic solute receptor  42.38 
 
 
331 aa  262  5e-69  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.777708  normal  0.21823 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5370  extra-cytoplasmic solute receptor  44.44 
 
 
322 aa  261  1e-68  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.114035  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4511  hypothetical protein  43.48 
 
 
337 aa  261  1e-68  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1908  hypothetical protein  43.56 
 
 
336 aa  261  1e-68  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.781517  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5061  extra-cytoplasmic solute receptor  40.53 
 
 
335 aa  260  2e-68  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000369607  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3671  extra-cytoplasmic solute receptor  43.38 
 
 
334 aa  260  2e-68  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3178  hypothetical protein  39.51 
 
 
328 aa  259  3e-68  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000137109 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5547  hypothetical protein  40.8 
 
 
325 aa  259  3e-68  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4820  hypothetical protein  43.48 
 
 
322 aa  259  3e-68  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1327  hypothetical protein  40.38 
 
 
328 aa  259  6e-68  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3966  hypothetical protein  40.51 
 
 
356 aa  259  6e-68  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0682449  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2095  hypothetical protein  44.48 
 
 
324 aa  258  7e-68  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5119  hypothetical protein  40 
 
 
328 aa  257  2e-67  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.111845 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0179  hypothetical protein  42.09 
 
 
328 aa  257  2e-67  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.303741 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0112  hypothetical protein  42.62 
 
 
338 aa  257  2e-67  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.25815  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5105  hypothetical protein  42.43 
 
 
329 aa  257  2e-67  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3801  extra-cytoplasmic solute receptor  39.56 
 
 
330 aa  256  4e-67  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.828068  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1197  hypothetical protein  44.55 
 
 
324 aa  255  6e-67  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0619  hypothetical protein  40.25 
 
 
325 aa  254  1e-66  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4779  hypothetical protein  40.92 
 
 
324 aa  254  1e-66  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2444  hypothetical protein  43.67 
 
 
334 aa  253  2e-66  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5741  hypothetical protein  40.24 
 
 
339 aa  252  5e-66  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.286317  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3949  hypothetical protein  41.28 
 
 
339 aa  252  6e-66  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.187886  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4972  hypothetical protein  43.14 
 
 
328 aa  252  7e-66  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.345918  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4047  extra-cytoplasmic solute receptor  39.2 
 
 
329 aa  252  7e-66  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0364236  normal  0.64466 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5108  extra-cytoplasmic solute receptor  41.51 
 
 
326 aa  252  7e-66  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  3.51886e-10  normal  0.964391 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1635  hypothetical protein  40.92 
 
 
333 aa  251  8e-66  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.345549  normal  0.902401 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4645  extra-cytoplasmic solute receptor  39.06 
 
 
348 aa  251  8e-66  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.176289  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4610  hypothetical protein  39.75 
 
 
322 aa  252  8e-66  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0432088  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1026  hypothetical protein  42.01 
 
 
333 aa  252  8e-66  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.346833  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4401  hypothetical protein  43.96 
 
 
321 aa  251  9e-66  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0268815  normal  0.198915 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0267  hypothetical protein  41.84 
 
 
337 aa  251  1e-65  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.717963  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1019  hypothetical protein  44.44 
 
 
334 aa  251  2e-65  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.100584  normal  0.433272 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>