More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_7855 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_7855  TPR domain-containing protein  100 
 
 		 648 aa  1291    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.126864 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4611  TPR domain-containing protein  43.21 
 
 		 615 aa  443  1e-123  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.100536 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0301  TPR repeat-containing protein  40.99 
 
 		 1827 aa  433  1e-120  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1065  TPR repeat-containing protein  40.71 
 
 		 740 aa  392  1e-107  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.761998  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1825  TPR repeat-containing protein  41.27 
 
 		 523 aa  374  1e-102  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.578572  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1066  TPR repeat-containing protein  39.74 
 
 		 747 aa  348  3e-94  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1426  TPR repeat-containing protein  40.36 
 
 		 574 aa  342  1e-92  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7517  hypothetical protein  40.72 
 
 		 703 aa  340  5.9999999999999996e-92  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.328747  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3120  TPR repeat-containing protein  39.23 
 
 		 767 aa  338  2.9999999999999997e-91  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2530  TPR repeat-containing protein  37.93 
 
 		 608 aa  330  3e-89  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.187337  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3028  TPR repeat-containing protein  36.93 
 
 		 620 aa  322  1.9999999999999998e-86  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.985806  normal  0.0142271 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3016  TPR/sulfotransferase domain-containing protein  39.53 
 
 		 577 aa  318  1e-85  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0959  hypothetical protein  36.63 
 
 		 620 aa  317  4e-85  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.868556 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1067  TPR repeat-containing protein  39.34 
 
 		 747 aa  317  5e-85  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.905012 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3808  TPR repeat-containing protein  39.13 
 
 		 578 aa  315  1.9999999999999998e-84  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.556982 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3201  TPR repeat-containing protein  35.97 
 
 		 955 aa  313  5.999999999999999e-84  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.0757905 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0481  TPR repeat-containing protein  31.89 
 
 		 3145 aa  306  1.0000000000000001e-81  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.948354 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4648  TPR repeat-containing protein  37.7 
 
 		 520 aa  302  1e-80  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.649741  normal  0.91098 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0722  TPR repeat-containing protein  35.99 
 
 		 615 aa  302  1e-80  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.434562 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0190  TPR repeat-containing protein  35.88 
 
 		 601 aa  292  1e-77  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3748  TPR repeat-containing protein  36.23 
 
 		 1450 aa  290  6e-77  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0755  TPR repeat-containing protein  34.8 
 
 		 662 aa  286  7e-76  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.466717  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0892  TPR repeat-containing protein  35.07 
 
 		 636 aa  286  1.0000000000000001e-75  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.647896  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3832  TPR repeat-containing protein  37.16 
 
 		 688 aa  286  1.0000000000000001e-75  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00173771 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3330  TPR repeat-containing protein  38.95 
 
 		 1038 aa  283  7.000000000000001e-75  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2491  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  33.83 
 
 		 689 aa  281  3e-74  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0904  TPR repeat-containing protein  34.76 
 
 		 612 aa  280  6e-74  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.587904  normal  0.769196 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4628  TPR repeat-containing protein  35.46 
 
 		 714 aa  279  1e-73  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.342126 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0217  TPR repeat-containing protein  37.87 
 
 		 646 aa  277  5e-73  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2412  TPR repeat-containing protein  40.83 
 
 		 529 aa  276  8e-73  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2369  TPR repeat-containing protein  34.07 
 
 		 639 aa  275  2.0000000000000002e-72  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.319986  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3746  TPR repeat-containing protein  34.35 
 
 		 602 aa  274  4.0000000000000004e-72  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.824926  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0232  TPR repeat-containing protein  37.11 
 
 		 649 aa  271  2e-71  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2875  TPR repeat-containing protein  37.11 
 
 		 649 aa  271  2e-71  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0308  TPR repeat-containing protein  41.36 
 
 		 636 aa  270  8e-71  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00465819 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2307  TPR repeat-containing protein  33.69 
 
 		 653 aa  268  2.9999999999999995e-70  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0495  TPR repeat-containing protein  35.2 
 
 		 592 aa  268  2.9999999999999995e-70  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.31548  hitchhiker  0.000811281 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4141  TPR repeat-containing protein  33.8 
 
 		 637 aa  268  2.9999999999999995e-70  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.780051  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3747  TPR repeat-containing protein  37.11 
 
 		 1005 aa  267  2.9999999999999995e-70  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2681  TPR domain protein  33.69 
 
 		 653 aa  268  2.9999999999999995e-70  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0911  TPR domain-containing protein  34.29 
 
 		 714 aa  267  5.999999999999999e-70  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.55611 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0639  TPR repeat-containing protein  38.67 
 
 		 542 aa  264  4e-69  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1093  TPR repeat-containing protein  26.93 
 
 		 681 aa  263  8.999999999999999e-69  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.353622  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1619  TPR domain-containing protein  34.48 
 
 		 626 aa  262  1e-68  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0978258  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3831  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  37.21 
 
 		 1034 aa  262  1e-68  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0133068 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0987  TPR repeat-containing protein  33.72 
 
 		 611 aa  258  2e-67  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.384547  normal  0.0740288 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0549  TPR repeat-containing protein  33.6 
 
 		 635 aa  258  3e-67  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1028  TPR repeat-containing protein  33.6 
 
 		 635 aa  258  3e-67  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.608823  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0955  TPR repeat-containing protein  29.06 
 
 		 637 aa  257  6e-67  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3833  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  39.16 
 
 		 760 aa  256  1.0000000000000001e-66  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00358812 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0177  TPR repeat-containing protein  34.16 
 
 		 614 aa  254  3e-66  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2599  TPR domain-containing protein  34.16 
 
 		 614 aa  254  3e-66  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0734298  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0970  TPR domain-containing protein  34.16 
 
 		 614 aa  254  3e-66  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0453  TPR domain-containing protein  33.7 
 
 		 626 aa  254  4.0000000000000004e-66  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.311085  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3015  TPR domain-containing protein  33.54 
 
 		 626 aa  253  7e-66  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2906  TPR repeat-containing protein  33.99 
 
 		 614 aa  253  8.000000000000001e-66  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0475913  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2201  TPR repeat-containing protein  36.75 
 
 		 556 aa  253  1e-65  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.805282  normal  0.800144 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2985  sulfotransferase  32.27 
 
 		 1077 aa  251  4e-65  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2322  TPR repeat-containing protein  34.07 
 
 		 935 aa  248  3e-64  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0205826 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3866  TPR repeat protein  33.44 
 
 		 1677 aa  248  3e-64  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0257  TPR repeat-containing protein  36.64 
 
 		 457 aa  243  7.999999999999999e-63  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2967  TPR repeat-containing protein  34.16 
 
 		 614 aa  242  1e-62  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2058  TPR repeat-containing protein  31.79 
 
 		 1454 aa  240  6.999999999999999e-62  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2194  TPR repeat-containing protein  31.79 
 
 		 1451 aa  239  8e-62  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.496906  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6068  TPR repeat-containing protein  35.62 
 
 		 527 aa  233  6e-60  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.115417 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1170  TPR repeat-containing protein  38.92 
 
 		 472 aa  232  2e-59  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.126874  normal  1 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6627  TPR repeat-containing protein  30.61 
 
 		 611 aa  228  4e-58  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0378674 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3075  TPR repeat-containing protein  32.49 
 
 		 780 aa  227  5.0000000000000005e-58  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18211  hypothetical protein  27.32 
 
 		 603 aa  227  5.0000000000000005e-58  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.905605 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2537  TPR repeat-containing protein  38.52 
 
 		 412 aa  226  7e-58  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.795786  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3164  hypothetical protein  38.04 
 
 		 387 aa  226  1e-57  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0955  TPR domain-containing protein  32.31 
 
 		 705 aa  226  1e-57  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.497218  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1547  TPR domain-containing protein  37.31 
 
 		 473 aa  225  2e-57  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.661842  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0141  TPR repeat-containing protein  35.6 
 
 		 438 aa  225  2e-57  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.00386004  normal  0.115434 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1512  TPR domain-containing protein  32.88 
 
 		 550 aa  224  4.9999999999999996e-57  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0206479  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1856  hypothetical protein  40.98 
 
 		 360 aa  222  1.9999999999999999e-56  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3353  Exostosin family protein  37.37 
 
 		 872 aa  221  1.9999999999999999e-56  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0479946  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6369  TPR repeat-containing protein  30.43 
 
 		 607 aa  221  3.9999999999999997e-56  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3354  TPR repeat-containing protein  39.59 
 
 		 1212 aa  221  5e-56  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0550  TPR repeat-containing protein  35.31 
 
 		 595 aa  216  1.9999999999999998e-54  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.492764  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1060  TPR repeat-containing protein  34.62 
 
 		 558 aa  214  4.9999999999999996e-54  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.325724  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4040  TPR domain-containing protein  34.88 
 
 		 540 aa  212  2e-53  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.186285 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0339  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  32.2 
 
 		 545 aa  211  4e-53  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2618  hypothetical protein  30.6 
 
 		 630 aa  209  1e-52  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4384  hypothetical protein  32.61 
 
 		 546 aa  208  3e-52  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1398  TPR repeat-containing protein  34.33 
 
 		 484 aa  207  4e-52  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1096  sulfotransferase  31.52 
 
 		 1764 aa  206  9e-52  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3361  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  34.15 
 
 		 454 aa  205  2e-51  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0780323  normal  0.195256 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5809  TPR repeat-containing protein  29.84 
 
 		 546 aa  205  2e-51  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.520553 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0462  TPR domain-containing protein  33.07 
 
 		 711 aa  204  3e-51  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.317996  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2044  TPR domain-containing protein  33.5 
 
 		 598 aa  204  6e-51  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1949  TPR repeat-containing protein  33.5 
 
 		 598 aa  202  9.999999999999999e-51  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.411479  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1712  TPR repeat-containing protein  32.29 
 
 		 595 aa  201  3e-50  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.884408 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1219  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  29.55 
 
 		 604 aa  200  9e-50  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3326  TPR repeat-containing protein  30.02 
 
 		 607 aa  198  2.0000000000000003e-49  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.644925 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1719  TPR repeat-containing protein  24.96 
 
 		 583 aa  198  3e-49  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3865  TPR repeat protein  31.42 
 
 		 503 aa  197  7e-49  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4266  hypothetical protein  40.27 
 
 		 389 aa  194  4e-48  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0564  TPR repeat-containing protein  31.9 
 
 		 505 aa  194  4e-48  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2088  tetratricopeptide TPR_2  33.47 
 
 		 600 aa  193  7e-48  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.311183  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>