More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_7848 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009485  BBta_7848  putative ABC transporter (permease protein)  100 
 
 
376 aa  745  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  decreased coverage  0.00792305  normal  0.174905 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0811  ABC-2 type transporter  65.22 
 
 
375 aa  498  1e-140  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0080  ABC-2 type transporter  64.34 
 
 
379 aa  476  1e-133  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0879828  normal  0.577589 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2949  ABC-2 type transporter  64.64 
 
 
382 aa  471  1e-131  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2362  ABC-2 type transporter  54.2 
 
 
382 aa  407  1e-112  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0759041  normal  0.863187 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1496  ABC-2 type transporter  53.93 
 
 
382 aa  406  1e-112  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.679397  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0209  ABC-2 type transporter  53.12 
 
 
393 aa  401  1e-110  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.223728  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0758  ABC-2 type transporter  56.76 
 
 
376 aa  397  1e-109  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69060  putative permease of ABC transporter  56.87 
 
 
374 aa  396  1e-109  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1951  ABC-2 type transporter  54.77 
 
 
373 aa  397  1e-109  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.171698  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1505  ABC-2 type transporter  54.89 
 
 
373 aa  395  1e-109  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.366767  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5973  ABC transporter permease  56.6 
 
 
374 aa  394  1e-108  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16770  ABC-2 type transporter, permease component  51.48 
 
 
372 aa  392  1e-108  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  decreased coverage  0.00841824  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1562  ABC-2 type transporter  51.47 
 
 
374 aa  392  1e-108  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.986622  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2685  hypothetical protein  53.68 
 
 
373 aa  392  1e-108  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3418  ABC-2 type transporter  56.56 
 
 
373 aa  394  1e-108  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03287  hypothetical protein  54.72 
 
 
374 aa  388  1e-107  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0229  ABC-2 type transporter  54.72 
 
 
374 aa  388  1e-107  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3837  ABC transporter, ATP-binding protein  54.72 
 
 
374 aa  388  1e-107  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03335  predicted transporter subunit: membrane component of ABC superfamily  54.72 
 
 
374 aa  388  1e-107  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0988  hypothetical protein  54.5 
 
 
374 aa  390  1e-107  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.564547  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3447  ABC-2 type transporter  52.43 
 
 
376 aa  386  1e-106  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0565648  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3777  ABC transporter ATP-binding protein  53.91 
 
 
374 aa  385  1e-106  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.439357  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3957  ABC transporter ATP-binding protein  53.91 
 
 
374 aa  385  1e-106  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3897  ABC transporter ATP-binding protein  54.18 
 
 
374 aa  387  1e-106  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3684  ABC transporter, ATP-binding protein  54.45 
 
 
374 aa  387  1e-106  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0501  ABC-2 type transporter  53.53 
 
 
399 aa  386  1e-106  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3967  ABC transporter, ATP-binding protein  54.45 
 
 
374 aa  388  1e-106  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3774  ABC transporter, ATP-binding protein  54.45 
 
 
374 aa  388  1e-106  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0230  ABC-2 type transporter  54.45 
 
 
374 aa  387  1e-106  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0566  ABC-2 type transporter  53.53 
 
 
399 aa  386  1e-106  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.222842  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3789  ABC-2 type transporter  52.83 
 
 
390 aa  385  1e-106  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4830  ABC transporter, ATP-binding protein  54.72 
 
 
374 aa  387  1e-106  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1742  ABC-2 type transporter  52.83 
 
 
401 aa  387  1e-106  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00338931 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4914  ABC-2 type transporter  52.75 
 
 
370 aa  382  1e-105  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3854  ABC transporter ATP-binding protein  53.64 
 
 
374 aa  384  1e-105  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3787  ABC transporter, ATP-binding protein  53.91 
 
 
374 aa  384  1e-105  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0626  ABC-2 type transporter  56.1 
 
 
373 aa  380  1e-104  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0537  ABC-2 type transporter  52.99 
 
 
398 aa  380  1e-104  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0166  hypothetical protein  51.21 
 
 
374 aa  375  1e-103  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000154077 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1683  multidrug ABC transporter permease component  52.83 
 
 
397 aa  378  1e-103  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0017586  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2341  ABC multidrug efflux pump, inner membrane subunit  52.83 
 
 
374 aa  375  1e-103  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.612393  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0169  hypothetical protein  51.49 
 
 
371 aa  372  1e-102  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.466784  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2181  ABC-2 type transporter  53.21 
 
 
374 aa  374  1e-102  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.64312  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4844  ABC-2 type transporter  52.89 
 
 
375 aa  374  1e-102  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.0699099 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3879  ABC transporter  54.31 
 
 
350 aa  372  1e-102  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1349  ABC transporter, permease protein, putative  53.42 
 
 
370 aa  371  1e-101  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1307  putative ABC transporter, permease protein  53.15 
 
 
370 aa  368  1e-101  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0171  hypothetical protein  52.69 
 
 
375 aa  370  1e-101  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.330821  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0557  hypothetical protein  52.99 
 
 
379 aa  369  1e-101  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1613  ABC-2 type transporter  47.72 
 
 
374 aa  370  1e-101  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0750  ABC-2 type transporter  50.95 
 
 
375 aa  370  1e-101  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.212958  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1825  ABC-2 type transporter  53.7 
 
 
370 aa  368  1e-100  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0526143  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1040  ABC transporter, permease  50.94 
 
 
374 aa  366  1e-100  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1308  ABC transporter, permease protein  50.94 
 
 
374 aa  365  1e-100  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1150  ABC-2 type transporter  51.36 
 
 
412 aa  367  1e-100  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.13202  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0437  ABC transporter, permease  50.67 
 
 
374 aa  365  1e-100  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0164  ABC transporter, permease protein  50.94 
 
 
374 aa  365  1e-100  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0920361  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0138  ABC transporter, permease  50.94 
 
 
374 aa  365  1e-100  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2777  ABC-type multidrug transport system, permease component  50.67 
 
 
374 aa  364  1e-99  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2634  ABC transporter, permease protein  50.67 
 
 
374 aa  364  1e-99  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0315  ABC-2 type transporter  55.26 
 
 
374 aa  364  1e-99  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5749  ABC-2 type transporter  48.53 
 
 
375 aa  359  4e-98  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.166668  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4687  ABC-2 type transporter  50.54 
 
 
370 aa  359  5e-98  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.696171  normal  0.325536 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5269  ABC-2 type transporter  50.41 
 
 
370 aa  358  6e-98  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.139137  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4663  hypothetical protein  52.75 
 
 
370 aa  358  9e-98  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.736815  normal  0.215518 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5443  hypothetical protein  50.27 
 
 
372 aa  357  2e-97  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00889571 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3576  hypothetical protein  50.14 
 
 
370 aa  355  9e-97  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1431  hypothetical protein  50.14 
 
 
371 aa  355  1e-96  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6205  ABC-2 type transporter  51.36 
 
 
374 aa  353  4e-96  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.261883 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5116  ABC-2 type transporter  49.59 
 
 
370 aa  351  1e-95  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.75858  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5208  ABC transporter  49.32 
 
 
370 aa  351  2e-95  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.325379  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3659  putative ABC transporter (permease protein)  51.24 
 
 
370 aa  348  8e-95  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  decreased coverage  0.00759514  normal 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9218  ABC transporter  46.76 
 
 
374 aa  345  1e-93  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.797463  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0019  ABC-2 type transporter  50 
 
 
373 aa  343  4e-93  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00132  putative ABC transport protein  46.49 
 
 
373 aa  333  3e-90  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5884  ABC-2 type transporter  50.96 
 
 
374 aa  327  2e-88  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3215  hypothetical protein  42.47 
 
 
374 aa  288  8e-77  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3895  ABC-2 type transporter  43.28 
 
 
374 aa  276  3e-73  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.505485  normal  0.0804287 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3157  ABC transporter, inner membrane subunit  43.28 
 
 
374 aa  276  4e-73  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  decreased coverage  0.00527406  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1136  hypothetical protein  31.71 
 
 
381 aa  194  1e-48  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4676  ABC-2 type transporter  30.93 
 
 
379 aa  159  1e-37  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0811  ABC-2 type transporter  29.37 
 
 
377 aa  158  1e-37  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1797  ABC-2 type transporter  30.95 
 
 
368 aa  142  7e-33  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1151  ABC-2 type transporter  28.73 
 
 
376 aa  142  9e-33  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.382414  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1379  ABC-2 type transporter  30.67 
 
 
370 aa  141  2e-32  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.463817  hitchhiker  7.27606e-07 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0655  hypothetical protein  30.79 
 
 
376 aa  137  3e-31  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00126989 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1738  ABC-2 type transporter  28.3 
 
 
372 aa  136  5e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0814  ABC-2 type transporter, permease protein  28.18 
 
 
368 aa  135  8e-31  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.547864  normal  0.91145 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00776  hypothetical protein  28.18 
 
 
368 aa  135  8e-31  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0939  ABC-2 type transporter, permease protein  28.18 
 
 
368 aa  135  8e-31  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2850  ABC-2 type transporter  28.18 
 
 
368 aa  135  8e-31  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.146675  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00759  predicted transporter subunit: membrane component of ABC superfamily  28.18 
 
 
368 aa  135  8e-31  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0846  ABC-2 type transporter, permease protein  28.18 
 
 
368 aa  135  8e-31  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2851  ABC-2 type transporter  28.18 
 
 
368 aa  135  8e-31  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00579888 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2561  ABC-2 type transporter, permease protein  28.18 
 
 
368 aa  135  8e-31  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0698  putative transmembrane protein  28.88 
 
 
376 aa  135  9e-31  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0856  ABC-2 type transporter, permease protein  28.18 
 
 
368 aa  135  9e-31  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3272  ABC-2 type transporter  28.87 
 
 
376 aa  134  2e-30  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0504  ABC-2 type transporter  29.95 
 
 
368 aa  134  3e-30  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0820778  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>