More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_7838 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_7838  CheW protein  100 
 
 		 155 aa  310  5.999999999999999e-84  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.933873  normal  0.68736 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6736  CheW protein  73.72 
 
 		 156 aa  234  4e-61  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.17041  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0144  CheW protein  68.83 
 
 		 156 aa  228  3e-59  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.675367  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4675  CheW protein  70.21 
 
 		 157 aa  211  2.9999999999999995e-54  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4816  CheW protein  56.12 
 
 		 189 aa  164  4e-40  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00422429 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5776  CheW protein  55.4 
 
 		 185 aa  161  3e-39  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.727432  normal  0.120994 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4315  chemotaxis protein  46.31 
 
 		 175 aa  142  2e-33  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0365627  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1400  CheW protein  46.21 
 
 		 170 aa  141  4e-33  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.527066  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3263  CheW protein  45.45 
 
 		 170 aa  135  1e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.983749 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3562  CheW protein  44.44 
 
 		 169 aa  135  2e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.105088 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0613  CheW protein  45.32 
 
 		 175 aa  130  9e-30  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1609  CheW protein  38.57 
 
 		 157 aa  112  1.0000000000000001e-24  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2648  CheW protein  37.86 
 
 		 163 aa  113  1.0000000000000001e-24  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.34231  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0265  putative CheW protein  37.32 
 
 		 163 aa  108  3e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.453603 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1918  CheW protein  35.25 
 
 		 161 aa  107  8.000000000000001e-23  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.33362  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0684  purine-binding chemotaxis protein CheW  36.73 
 
 		 164 aa  106  1e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.260325  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4311  chemotaxis protein  35.06 
 
 		 164 aa  106  1e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7835  chemotaxis protein cheW  36.62 
 
 		 162 aa  106  1e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.788351  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1734  CheW protein  35.97 
 
 		 163 aa  105  2e-22  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1301  purine-binding chemotaxis protein CheW  35.81 
 
 		 164 aa  104  5e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.278999  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1299  purine-binding chemotaxis protein CheW  35.37 
 
 		 164 aa  104  6e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.125322  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3155  CheW protein  34.78 
 
 		 164 aa  103  7e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1600  CheW protein  35.17 
 
 		 171 aa  103  8e-22  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.443722  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2421  CheW protein  36.03 
 
 		 178 aa  102  1e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.726921  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0143  CheW protein  36.62 
 
 		 162 aa  103  1e-21  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.699834  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2991  putative CheW protein  35.97 
 
 		 169 aa  102  2e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.5403  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2986  putative CheW protein  34.97 
 
 		 162 aa  102  2e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.344963  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1420  CheW protein  34.29 
 
 		 161 aa  102  2e-21  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.701601  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1142  purine-binding chemotaxis protein CheW  37.5 
 
 		 164 aa  101  5e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0223438  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3653  CheW protein  36.69 
 
 		 167 aa  101  5e-21  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1106  CheW protein  33.33 
 
 		 164 aa  100  6e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2360  putative CheW protein  35.97 
 
 		 173 aa  100  1e-20  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.210142  normal  0.140243 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3558  CheW protein  34.06 
 
 		 160 aa  99  2e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.911694  normal  0.981486 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0575  CheW protein  34.23 
 
 		 164 aa  98.6  3e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.447704  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4670  CheW protein  34.51 
 
 		 159 aa  98.6  3e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.913092  normal  0.785076 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2476  CheW protein  36.73 
 
 		 185 aa  96.7  1e-19  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.100144  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3259  CheW protein  33.09 
 
 		 158 aa  96.7  1e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.105416  normal  0.09229 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2572  CheW protein  35.66 
 
 		 185 aa  96.3  1e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6732  CheW protein  35.21 
 
 		 165 aa  95.9  2e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0258565  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1793  putative CheW protein  37.41 
 
 		 167 aa  96.3  2e-19  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1381  CheW protein  34.27 
 
 		 181 aa  94  7e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.916051  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1402  CheW protein  34.53 
 
 		 179 aa  92.8  1e-18  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.713319  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0616  CheW protein  34.04 
 
 		 163 aa  93.2  1e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.662625  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1208  CheW protein  33.81 
 
 		 179 aa  90.9  6e-18  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0917816 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0874  CheW protein  35.34 
 
 		 167 aa  90.5  8e-18  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02863  chemotaxis protein CheW  34.23 
 
 		 163 aa  90.1  9e-18  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0658  CheW protein  34.59 
 
 		 169 aa  89  2e-17  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4818  CheW protein  34.07 
 
 		 157 aa  89  2e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.596943  hitchhiker  0.00835574 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5778  CheW protein  34.07 
 
 		 162 aa  89  2e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0235487  normal  0.138046 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1585  chemotaxis protein, CheW2  34.03 
 
 		 163 aa  88.2  4e-17  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0237  putative CheW protein  34.03 
 
 		 163 aa  88.2  4e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1993  CheW protein  33.78 
 
 		 165 aa  86.7  1e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000146725 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2234  CheW protein  33.78 
 
 		 165 aa  86.7  1e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1566  putative CheW protein  36.15 
 
 		 169 aa  85.9  2e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.173837  normal  0.497426 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3023  CheW protein  34.01 
 
 		 164 aa  85.9  2e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4154  CheW protein  34.06 
 
 		 147 aa  84.7  4e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0243  CheW protein  35.97 
 
 		 163 aa  84.7  4e-16  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0792  CheW protein  36.69 
 
 		 164 aa  83.6  9e-16  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.238147 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2175  CheW protein  36.5 
 
 		 166 aa  83.2  0.000000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.765903  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1208  putative CheW protein  33.81 
 
 		 167 aa  82.8  0.000000000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.10603 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1207  CheW protein  29.75 
 
 		 164 aa  82.4  0.000000000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.848506  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0284  CheW protein  38.4 
 
 		 158 aa  82  0.000000000000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.628672 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3800  CheW protein  34.44 
 
 		 176 aa  82  0.000000000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1572  CheW protein  30.32 
 
 		 161 aa  81.6  0.000000000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.650684  normal  0.674901 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1391  CheW protein  30.41 
 
 		 164 aa  81.6  0.000000000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.896559  normal  0.172651 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2482  CheW protein  35.56 
 
 		 194 aa  82  0.000000000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.259604  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2578  CheW protein  35.56 
 
 		 194 aa  81.6  0.000000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.322319  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2363  putative CheW protein  29.87 
 
 		 165 aa  81.3  0.000000000000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.699196  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3202  purine-binding chemotaxis protein CheW  31.76 
 
 		 164 aa  81.3  0.000000000000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1307  CheW protein  31.76 
 
 		 164 aa  81.3  0.000000000000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.897711 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1374  CheW protein  31.76 
 
 		 164 aa  81.3  0.000000000000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.158762 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1367  CheW protein  31.76 
 
 		 164 aa  81.3  0.000000000000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00367325 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2246  putative CheW protein  29.22 
 
 		 164 aa  80.9  0.000000000000006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.537789  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0646  putative CheW protein  30.94 
 
 		 185 aa  80.9  0.000000000000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0808526  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1643  CheW protein  29.68 
 
 		 161 aa  80.9  0.000000000000006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3298  CheW-like protein  32 
 
 		 187 aa  80.9  0.000000000000006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2113  putative CheW protein  29.22 
 
 		 164 aa  80.9  0.000000000000006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1386  CheW protein  30.41 
 
 		 163 aa  80.5  0.000000000000007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2099  CheW protein  29.22 
 
 		 170 aa  80.5  0.000000000000007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0593429  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002839  positive regulator of CheA protein activity (CheW)  31.03 
 
 		 164 aa  80.5  0.000000000000007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.856149  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3300  putative CheW protein  32.33 
 
 		 160 aa  80.5  0.000000000000009  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1988  chemotaxis protein CheW  30.52 
 
 		 159 aa  79.7  0.00000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.381098  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2901  putative CheW protein  31.76 
 
 		 164 aa  80.1  0.00000000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.3057  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3428  CheW-like protein  30.32 
 
 		 159 aa  79.7  0.00000000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.661205 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3043  putative CheW protein  31.76 
 
 		 164 aa  80.1  0.00000000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.605856 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2911  putative CheW protein  31.76 
 
 		 164 aa  80.1  0.00000000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.810949  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1450  putative CheW protein  33.33 
 
 		 148 aa  79.7  0.00000000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2283  chemotaxis protein CheW  32.14 
 
 		 164 aa  80.1  0.00000000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2076  CheW protein  29.8 
 
 		 170 aa  79.7  0.00000000000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1462  CheW protein  31.76 
 
 		 164 aa  80.1  0.00000000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1375  CheW protein  33.33 
 
 		 194 aa  80.1  0.00000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1966  putative CheW protein  29.87 
 
 		 162 aa  79.7  0.00000000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1259  putative CheW protein  37.6 
 
 		 158 aa  79.7  0.00000000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.543562  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0636  CheW protein  28.57 
 
 		 192 aa  79.3  0.00000000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4332  purine-binding chemotaxis protein CheW  29.8 
 
 		 159 aa  79  0.00000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.300318  normal  0.430196 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1144  CheW-like protein  33.81 
 
 		 184 aa  79  0.00000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.990234  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0627  CheW protein  28.57 
 
 		 194 aa  79.3  0.00000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3658  CheW protein  29.8 
 
 		 159 aa  79  0.00000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0602  CheW protein  28.57 
 
 		 194 aa  79  0.00000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.727696  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1535  putative CheW protein  29.8 
 
 		 159 aa  79  0.00000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.107211  normal  0.640168 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>