More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_7810 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009485  BBta_7810  putative zinc protease  100 
 
 
467 aa  956    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.129356  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4035  peptidase M16-like  45.07 
 
 
461 aa  371  1e-101  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.291122 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1713  putative Zn-dependent protease  42.83 
 
 
461 aa  369  1e-101  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.137894 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4858  peptidase M16 domain protein  44.88 
 
 
463 aa  366  1e-100  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4179  peptidase M16-like  44.93 
 
 
476 aa  364  2e-99  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.567421  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3165  peptidase M16-like  43.93 
 
 
464 aa  362  6e-99  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2204  peptidase M16 domain-containing protein  45.61 
 
 
469 aa  360  2e-98  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0863446  normal  0.285951 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2545  peptidase M16  43.51 
 
 
464 aa  354  2e-96  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1392  peptidase M16-like  44.19 
 
 
489 aa  352  7e-96  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.260457  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2863  peptidase M16 domain protein  44.9 
 
 
457 aa  347  3e-94  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0631519 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2217  peptidase M16 domain-containing protein  42.96 
 
 
454 aa  346  5e-94  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.800004  hitchhiker  0.0078002 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0394  peptidase M16 domain protein  41.88 
 
 
459 aa  343  2.9999999999999997e-93  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0405646  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0094  peptidase M16-like  44.1 
 
 
477 aa  343  2.9999999999999997e-93  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2283  peptidase M16 domain protein  42.28 
 
 
460 aa  342  1e-92  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.366903  normal  0.739928 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1801  peptidase M16 domain-containing protein  42.86 
 
 
469 aa  341  2e-92  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.123425 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4178  peptidase M16 domain-containing protein  41.47 
 
 
459 aa  340  4e-92  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2328  peptidase M16 domain-containing protein  42.12 
 
 
460 aa  339  5e-92  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.977171  normal  0.638567 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2605  peptidase M16 domain protein  42.12 
 
 
460 aa  339  5e-92  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.204595 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2931  peptidase M16 domain-containing protein  41.63 
 
 
448 aa  339  8e-92  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  decreased coverage  0.00146664  normal  0.111067 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2972  peptidase M16-like  41.94 
 
 
459 aa  338  9.999999999999999e-92  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2760  peptidase M16 domain-containing protein  41.23 
 
 
448 aa  337  1.9999999999999998e-91  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1097  putative zinc protease  41.23 
 
 
448 aa  337  1.9999999999999998e-91  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.414004  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0187  protease  41.05 
 
 
514 aa  337  1.9999999999999998e-91  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1009  peptidase M16 domain-containing protein  43.13 
 
 
468 aa  337  2.9999999999999997e-91  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3038  peptidase M16 domain-containing protein  39.29 
 
 
513 aa  332  1e-89  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.101443  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0290  peptidase M16 domain-containing protein  41.19 
 
 
456 aa  327  2.0000000000000001e-88  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.779559 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0430  peptidase M16-like  38.44 
 
 
453 aa  305  8.000000000000001e-82  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2715  peptidase M16 domain-containing protein  41.11 
 
 
472 aa  298  1e-79  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.395042  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0361  peptidase M16 protein  38.52 
 
 
453 aa  296  4e-79  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4045  peptidase M16-like  40.14 
 
 
463 aa  295  1e-78  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3617  peptidase M16 domain protein  39.6 
 
 
470 aa  275  1.0000000000000001e-72  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.903787  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0377  insulinase family protein  37.72 
 
 
453 aa  274  2.0000000000000002e-72  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.454609  decreased coverage  0.00376869 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0734  peptidase M16-like protein  36.65 
 
 
470 aa  274  3e-72  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0282  peptidase M16-like protein  36.15 
 
 
504 aa  274  3e-72  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.35404  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0335  peptidase M16, C-terminal:peptidase M16, N-terminal  35.94 
 
 
506 aa  271  1e-71  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.844691  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2987  M16 family peptidase  38 
 
 
466 aa  269  8e-71  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.669528  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1941  peptidase M16-like  35.89 
 
 
453 aa  260  4e-68  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2737  peptidase M16-like  35.33 
 
 
465 aa  259  7e-68  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1632  peptidase M16 domain protein  35.21 
 
 
454 aa  256  6e-67  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.48477  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0387  putative zinc protease protein  36.56 
 
 
501 aa  255  1.0000000000000001e-66  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2725  hypothetical protein  35.24 
 
 
441 aa  255  1.0000000000000001e-66  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2598  hypothetical protein  35.24 
 
 
441 aa  255  1.0000000000000001e-66  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0242  peptidase M16 domain protein  35.27 
 
 
477 aa  253  3e-66  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0269  peptidase M16 domain protein  35.22 
 
 
494 aa  253  4.0000000000000004e-66  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.271306  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3228  peptidase M16 domain-containing protein  37.62 
 
 
493 aa  252  8.000000000000001e-66  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.966774 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1927  peptidase M16 domain-containing protein  34.59 
 
 
455 aa  249  5e-65  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.464341  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1800  peptidase M16 domain-containing protein  37.12 
 
 
492 aa  246  4e-64  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.296573  normal  0.835018 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2144  peptidase M16 domain-containing protein  34.75 
 
 
453 aa  247  4e-64  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00773461  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3719  peptidase M16, C-terminal:peptidase M16, N-terminal  35.75 
 
 
452 aa  243  3.9999999999999997e-63  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.0647985 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1057  M16 family peptidase  34.5 
 
 
439 aa  243  6e-63  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0171  peptidase M16 domain protein  36.65 
 
 
462 aa  242  1e-62  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0696206  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0892  peptidase M16 domain-containing protein  34.5 
 
 
499 aa  242  1e-62  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.12862  normal 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0849  insulinase-like:peptidase M16, C-terminal  33.33 
 
 
438 aa  240  4e-62  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.745956  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3519  peptidase M16 domain-containing protein  35.38 
 
 
484 aa  238  3e-61  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2842  peptidase M16 domain protein  35.61 
 
 
484 aa  237  4e-61  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.853184  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4762  peptidase M16 domain-containing protein  38.12 
 
 
479 aa  237  4e-61  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.250673  normal  0.651283 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1933  peptidase M16-like  33.97 
 
 
459 aa  236  9e-61  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0501339  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0063  M16 family peptidase  37.53 
 
 
459 aa  235  1.0000000000000001e-60  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0261125  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0467  putative zinc protease  34.05 
 
 
465 aa  233  6e-60  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.723216  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04890  putative zinc protease  34.05 
 
 
465 aa  233  6e-60  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1671  peptidase M16-like  37.23 
 
 
509 aa  231  2e-59  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3872  peptidase M16 domain-containing protein  35.1 
 
 
484 aa  231  2e-59  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.817075  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1482  peptidase M16-like  34.52 
 
 
493 aa  227  3e-58  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.830241  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03530  peptidase M16-like protein  33.81 
 
 
448 aa  227  4e-58  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.00356454  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0932  insulinase-like peptidase  35.02 
 
 
489 aa  226  9e-58  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2107  M16 family peptidase  32.71 
 
 
442 aa  224  3e-57  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0217  peptidase, M16 family  32.47 
 
 
459 aa  223  8e-57  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.233228  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2306  peptidase M16 domain-containing protein  35.41 
 
 
443 aa  221  3e-56  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0353  peptidase M16 domain-containing protein  34.61 
 
 
451 aa  220  3.9999999999999997e-56  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5115  peptidase M16 domain protein  33.41 
 
 
433 aa  218  1e-55  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0363191  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4176  peptidase M16 domain-containing protein  34.86 
 
 
455 aa  218  1e-55  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0478283  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4373  peptidase M16 domain protein  37.62 
 
 
473 aa  216  5.9999999999999996e-55  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4988  peptidase M16 domain-containing protein  32.93 
 
 
433 aa  216  8e-55  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1279  peptidase M16-like  35.93 
 
 
481 aa  215  9.999999999999999e-55  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5165  peptidase M16 domain-containing protein  32.68 
 
 
433 aa  215  9.999999999999999e-55  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.491422  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5162  peptidase M16 domain-containing protein  33.41 
 
 
451 aa  213  4.9999999999999996e-54  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0426  peptidase, M16 family  33.25 
 
 
450 aa  212  1e-53  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5112  peptidase M16 domain protein  33.17 
 
 
451 aa  211  2e-53  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.233553  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4752  insulinase-like:peptidase M16, C-terminal  33.25 
 
 
450 aa  211  2e-53  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.0494338 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5338  peptidase M16-like  33.89 
 
 
451 aa  210  4e-53  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.796458 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3581  peptidase M16 domain-containing protein  29.58 
 
 
461 aa  209  7e-53  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4985  peptidase M16 domain-containing protein  32.94 
 
 
451 aa  208  2e-52  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2078  peptidase M16 domain protein  35.44 
 
 
441 aa  207  3e-52  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3948  peptidase M16 domain-containing protein  31.38 
 
 
443 aa  206  5e-52  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.843768  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1867  peptidase M16-like  35.68 
 
 
457 aa  206  1e-51  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0102  peptidase M16-like  38.4 
 
 
458 aa  204  2e-51  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.49801  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0109  peptidase M16 domain protein  38.4 
 
 
458 aa  204  4e-51  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.470915  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1782  peptidase M16 domain-containing protein  31.44 
 
 
530 aa  203  6e-51  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.636723  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0120  peptidase M16 domain protein  37.07 
 
 
458 aa  202  9e-51  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2658  peptidase M16 domain-containing protein  34.63 
 
 
460 aa  202  9.999999999999999e-51  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.287658  hitchhiker  0.000609596 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1972  peptidase M16 domain-containing protein  34.71 
 
 
428 aa  202  9.999999999999999e-51  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3486  peptidase M16-like protein  30.17 
 
 
441 aa  201  1.9999999999999998e-50  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0315623  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1993  peptidase M16 domain protein  34.95 
 
 
457 aa  202  1.9999999999999998e-50  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5791  peptidase M16 domain protein  30.18 
 
 
447 aa  199  7e-50  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0298791 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3815  peptidase M16 domain-containing protein  29.07 
 
 
443 aa  199  1.0000000000000001e-49  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4537.2  Zn-dependent peptidase  29.07 
 
 
443 aa  197  2.0000000000000003e-49  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3742  peptidase M16 domain-containing protein  28.84 
 
 
443 aa  197  2.0000000000000003e-49  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3940  peptidase M16 domain-containing protein  28.84 
 
 
443 aa  197  4.0000000000000005e-49  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3491  peptidase M16 domain-containing protein  28.84 
 
 
443 aa  197  4.0000000000000005e-49  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0761  insulinase family protease  30.23 
 
 
446 aa  196  6e-49  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.126087  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>