More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_7802 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008688  Pden_4825  ATP-dependent metalloprotease FtsH  66.89 
 
 
610 aa  826    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.185194  normal  0.513387 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1428  ATP-dependent metalloprotease FtsH  61.5 
 
 
633 aa  724    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4397  ATP-dependent metalloprotease FtsH  62.4 
 
 
618 aa  769    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1231  ATP-dependent metalloprotease FtsH  60.94 
 
 
617 aa  708    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.901618  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6007  ATP-dependent metalloprotease FtsH  63.37 
 
 
645 aa  751    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.851813  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5357  cell division protein ftsH (ATP-dependent zinc-metallo protease)  65.15 
 
 
615 aa  787    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0232294 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3391  ATP-dependent metalloprotease FtsH  66.78 
 
 
624 aa  827    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.565531  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2062  vesicle-fusing ATPase  61.34 
 
 
617 aa  704    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.139839  normal  0.716859 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1702  ATP-dependent metalloprotease FtsH  54.65 
 
 
714 aa  644    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.575929  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08270  ATP-dependent metallopeptidase M41, FtsH  67.17 
 
 
616 aa  791    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0624  ATP-dependent metalloprotease FtsH  66.83 
 
 
605 aa  821    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.365345 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4374  ATP-dependent metalloprotease FtsH  62.56 
 
 
618 aa  771    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1495  FtsH-2 peptidase  55.27 
 
 
635 aa  643    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.421707  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3415  FtsH-2 peptidase  64.73 
 
 
627 aa  813    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4465  ATP-dependent metalloprotease FtsH  66.23 
 
 
610 aa  823    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5314  ATP-dependent metalloprotease FtsH  54.65 
 
 
696 aa  643    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.130847  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1798  ATP-dependent metalloprotease FtsH  64.36 
 
 
635 aa  786    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4241  FtsH-2 peptidase  63.39 
 
 
621 aa  765    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2418  ATP-dependent metalloprotease FtsH  64.4 
 
 
616 aa  794    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4390  ATP-dependent metalloprotease FtsH  64.51 
 
 
623 aa  787    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.489169  normal  0.114321 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1168  FtsH-2 peptidase  67 
 
 
605 aa  825    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.747317  normal  0.986179 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0723  FtsH-2 peptidase  64.9 
 
 
609 aa  782    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0513277  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2293  ATP-dependent metalloprotease FtsH  65.9 
 
 
615 aa  798    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7802  cell division protein  100 
 
 
630 aa  1271    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.120789  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1839  cell division protein ftsH (ATP-dependent zinc-metallo protease)  61.19 
 
 
618 aa  723    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.651552 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0392  ATP-dependent metalloprotease FtsH  64.98 
 
 
618 aa  792    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.297627 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2457  ATP-dependent metalloprotease FtsH  54.65 
 
 
615 aa  643    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.133798  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0193  ATP-dependent metalloprotease FtsH  61 
 
 
607 aa  738    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3197  ATP-dependent metalloprotease FtsH  54.1 
 
 
647 aa  648    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3438  ATP-dependent metalloprotease FtsH  57.24 
 
 
607 aa  678    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.588898  hitchhiker  0.000161563 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4517  ATP-dependent metalloprotease FtsH  54.34 
 
 
663 aa  632  1e-180  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.723361  normal  0.670531 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4385  ATP-dependent metalloprotease FtsH  54.34 
 
 
663 aa  632  1e-180  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6194  FtsH-2 peptidase  53.45 
 
 
646 aa  630  1e-179  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1921  ATP-dependent metalloprotease FtsH  53.37 
 
 
646 aa  611  1e-173  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1947  ATP-dependent metalloprotease FtsH  53.37 
 
 
646 aa  611  1e-173  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5195  FtsH-2 peptidase  51.27 
 
 
627 aa  597  1e-169  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4814  ATP-dependent metalloprotease FtsH  52.98 
 
 
625 aa  590  1e-167  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.726318 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4334  ATP-dependent metalloprotease FtsH  50.57 
 
 
655 aa  587  1e-166  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0530372  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4937  ATP-dependent metalloprotease FtsH  53.22 
 
 
623 aa  582  1.0000000000000001e-165  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.206394  normal  0.640617 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2234  FtsH-2 peptidase  54.87 
 
 
645 aa  582  1.0000000000000001e-165  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0163354  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2804  ATP-dependent metalloprotease FtsH  53.92 
 
 
645 aa  582  1.0000000000000001e-165  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1901  FtsH-2 peptidase  51.65 
 
 
659 aa  585  1.0000000000000001e-165  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.660532 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3874  ATP-dependent metalloprotease FtsH  50.41 
 
 
655 aa  583  1.0000000000000001e-165  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.173142 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4181  ATP-dependent metalloprotease FtsH  50 
 
 
676 aa  578  1e-164  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5877  ATP-dependent metalloprotease FtsH  49.59 
 
 
635 aa  579  1e-164  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.943633  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0830  cell division protein FtsH3  52.09 
 
 
624 aa  576  1.0000000000000001e-163  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1520  FtsH-2 peptidase  49.52 
 
 
692 aa  578  1.0000000000000001e-163  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.428329  normal  0.402433 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2043  ATP-dependent metalloprotease FtsH  51.8 
 
 
687 aa  574  1.0000000000000001e-162  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000823852 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_13071  cell division protein FtsH3  51.23 
 
 
619 aa  574  1.0000000000000001e-162  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.208154 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5863  ATP-dependent metalloprotease FtsH  49.52 
 
 
658 aa  575  1.0000000000000001e-162  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0798132  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1483  peptidase M41, FtsH  52.07 
 
 
629 aa  573  1.0000000000000001e-162  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.45624  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1314  FtsH-2 peptidase  52.54 
 
 
623 aa  572  1.0000000000000001e-162  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.997053  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0081  ATP-dependent metalloprotease FtsH  48.55 
 
 
697 aa  574  1.0000000000000001e-162  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.849156  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_19161  cell division protein FtsH3  52.16 
 
 
625 aa  574  1.0000000000000001e-162  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.134422 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6211  ATP-dependent metalloprotease FtsH  47.86 
 
 
635 aa  569  1e-161  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.156837  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0100  ATP-dependent metalloprotease FtsH  48.28 
 
 
686 aa  570  1e-161  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_14491  cell division protein FtsH3  50.57 
 
 
620 aa  566  1e-160  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1774  FtsH-2 peptidase  50.49 
 
 
702 aa  566  1e-160  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.517267  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2066  ATP-dependent metalloprotease FtsH  50.65 
 
 
705 aa  565  1e-160  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2158  ATP-dependent metalloprotease FtsH  50.57 
 
 
706 aa  566  1e-160  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_16831  cell division protein FtsH3  52.09 
 
 
635 aa  565  1.0000000000000001e-159  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0338  ATP-dependent metalloprotease FtsH  48.01 
 
 
610 aa  558  1e-158  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0087  ATP-dependent metalloprotease FtsH  49.6 
 
 
694 aa  560  1e-158  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.4836  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0356  ATP-dependent metalloprotease FtsH  48.01 
 
 
610 aa  559  1e-158  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0848  ATP-dependent metalloprotease FtsH  52.86 
 
 
630 aa  561  1e-158  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.810549  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0078  peptidase M41, FtsH  47.19 
 
 
706 aa  558  1e-158  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0143352  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0925  FtsH-2 peptidase  51.16 
 
 
624 aa  559  1e-158  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.610523 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1890  FtsH peptidase  47.98 
 
 
608 aa  560  1e-158  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  unclonable  0.00000000000186964  hitchhiker  0.0000000000919555 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3570  ATP-dependent metalloprotease FtsH  54.41 
 
 
673 aa  559  1e-158  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3924  ATP-dependent metalloprotease FtsH  48.65 
 
 
658 aa  560  1e-158  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.888764  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3484  FtsH-2 peptidase  51.16 
 
 
621 aa  561  1e-158  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4443  ATP-dependent metalloprotease FtsH  48.65 
 
 
658 aa  560  1e-158  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.165692  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2543  ATP-dependent metalloprotease FtsH  54.41 
 
 
673 aa  559  1e-158  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.122057 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1040  ATP-dependent metalloprotease FtsH  54.21 
 
 
666 aa  556  1e-157  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.643588  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0836  ATP-dependent metalloprotease FtsH  47.69 
 
 
697 aa  557  1e-157  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.473024  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4275  ATP-dependent metalloprotease FtsH  49.44 
 
 
667 aa  555  1e-157  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0074  FtsH-2 protease  54.21 
 
 
917 aa  555  1e-157  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  decreased coverage  0.00600041  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0023  ATP-dependent metalloprotease FtsH  54.21 
 
 
852 aa  555  1e-157  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.16452  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1670  peptidase M41, FtsH  49.56 
 
 
663 aa  558  1e-157  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.398356  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1487  ATP-dependent metalloprotease FtsH  54.21 
 
 
666 aa  556  1e-157  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.643997  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1194  ATP-dependent metalloprotease FtsH  54.21 
 
 
666 aa  556  1e-157  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.256631  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_14251  cell division protein FtsH3  50.74 
 
 
620 aa  558  1e-157  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.520813  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0389  ATP-dependent metalloprotease FtsH  54.21 
 
 
666 aa  556  1e-157  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.185048  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0851  cell division protein FtsH  51.98 
 
 
637 aa  552  1e-156  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  decreased coverage  0.00696414  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1298  ATP-dependent metalloprotease FtsH  50.17 
 
 
662 aa  552  1e-156  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.231073  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_14631  cell division protein FtsH3  50.74 
 
 
620 aa  554  1e-156  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.336719  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0868  ATP-dependent metalloprotease FtsH  52.36 
 
 
607 aa  553  1e-156  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1574  ATP-dependent metalloprotease FtsH  54.02 
 
 
666 aa  554  1e-156  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.580758  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1809  cell division protein FtsH  48.93 
 
 
614 aa  551  1e-155  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0346889  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0123  ATP-dependent metalloprotease FtsH  47.27 
 
 
699 aa  549  1e-155  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1903  peptidase M41, FtsH  47.91 
 
 
629 aa  551  1e-155  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.89968  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1347  putative cell division protein FtsH-like protein  49.75 
 
 
643 aa  548  1e-155  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2678  FtsH-2 peptidase  47.92 
 
 
694 aa  551  1e-155  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1196  cell division protein FtsH  49.56 
 
 
648 aa  549  1e-155  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.266432  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0579  ATP-dependent metalloprotease FtsH  47.75 
 
 
717 aa  549  1e-155  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0326  ATP-dependent metalloprotease FtsH  47.04 
 
 
681 aa  550  1e-155  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.000000432409  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1112  ATP-dependent metalloprotease FtsH  49.16 
 
 
653 aa  547  1e-154  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.322168  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0565  ATP-dependent metalloprotease FtsH  47.75 
 
 
713 aa  548  1e-154  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.148069  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0438  membrane protease FtsH catalytic subunit  49.58 
 
 
673 aa  547  1e-154  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000747191  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4509  membrane protease FtsH catalytic subunit  48.93 
 
 
652 aa  543  1e-153  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.112611 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>