89 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_7800 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_7800  hypothetical protein  100 
 
 		 276 aa  561  1.0000000000000001e-159  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.842137  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3319  hypothetical protein  68.16 
 
 		 278 aa  374  1e-103  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2297  protein of unknown function DUF114  66.29 
 
 		 286 aa  368  1e-101  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3097  hypothetical protein  64.13 
 
 		 282 aa  362  4e-99  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.645048 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3527  protein of unknown function DUF114  62.5 
 
 		 275 aa  361  8e-99  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2943  hypothetical protein  64.93 
 
 		 279 aa  358  4e-98  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0056563 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1552  hypothetical protein  63.7 
 
 		 279 aa  342  4e-93  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00238673 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0404  protein of unknown function DUF114  62.17 
 
 		 280 aa  336  2.9999999999999997e-91  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1334  protein of unknown function DUF114  58.89 
 
 		 280 aa  335  3.9999999999999995e-91  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.611057  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2712  protein of unknown function DUF114  58.52 
 
 		 269 aa  331  9e-90  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0011  hypothetical protein  54.89 
 
 		 284 aa  319  3.9999999999999996e-86  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1874  hypothetical protein  56 
 
 		 297 aa  318  6e-86  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.923248  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0011  hypothetical protein  54.51 
 
 		 284 aa  315  6e-85  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0215  protein of unknown function DUF114  55.51 
 
 		 278 aa  311  4.999999999999999e-84  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0321874  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1401  protein of unknown function DUF114  55.6 
 
 		 277 aa  303  2.0000000000000002e-81  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.129163  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1020  hypothetical protein  52.38 
 
 		 274 aa  302  3.0000000000000004e-81  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1661  hypothetical protein  52.38 
 
 		 274 aa  302  5.000000000000001e-81  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1299  protein of unknown function DUF114  54.44 
 
 		 277 aa  298  5e-80  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.856082  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0926  hypothetical protein  52.26 
 
 		 274 aa  296  2e-79  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1781  hypothetical protein  57.09 
 
 		 276 aa  296  3e-79  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03440  periplasmic serine protease (ClpP class)  54.15 
 
 		 268 aa  287  1e-76  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0558  protein of unknown function DUF114  54.51 
 
 		 283 aa  286  2e-76  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0678  hypothetical protein  54.79 
 
 		 279 aa  286  2.9999999999999996e-76  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1139  hypothetical protein  54.32 
 
 		 272 aa  286  2.9999999999999996e-76  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1198  hypothetical protein  52.36 
 
 		 283 aa  284  1.0000000000000001e-75  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4766  protein of unknown function DUF114  57.37 
 
 		 296 aa  283  3.0000000000000004e-75  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0583634  hitchhiker  0.000468876 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0381  hypothetical protein  52.71 
 
 		 276 aa  280  2e-74  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.824542  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0202  protein of unknown function DUF114  51.92 
 
 		 283 aa  280  2e-74  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0335  hypothetical protein  50.37 
 
 		 281 aa  277  2e-73  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0491521  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1233  hypothetical protein  53.1 
 
 		 292 aa  263  2e-69  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.17311  normal  0.434623 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11070  periplasmic serine protease (ClpP class)  52.14 
 
 		 265 aa  258  1e-67  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.000898783  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1537  hypothetical protein  48.25 
 
 		 301 aa  245  4.9999999999999997e-64  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.675779  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3600  hypothetical protein  42.05 
 
 		 272 aa  202  4e-51  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.354038  normal  0.0141904 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2112  hypothetical protein  34.46 
 
 		 350 aa  89.4  6e-17  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.492379  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3471  protein of unknown function DUF114  32.5 
 
 		 296 aa  81.6  0.00000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4476  hypothetical protein  64.91 
 
 		 70 aa  76.6  0.0000000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3424  protein of unknown function DUF114  36.96 
 
 		 339 aa  72  0.000000000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4091  hypothetical protein  31.72 
 
 		 293 aa  69.7  0.00000000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3172  protein of unknown function DUF114  29.19 
 
 		 328 aa  69.7  0.00000000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.601853  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3346  protein of unknown function DUF114  27.92 
 
 		 258 aa  67  0.0000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000106769  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0940  hypothetical protein  35.66 
 
 		 330 aa  63.9  0.000000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2773  hypothetical protein  29.95 
 
 		 323 aa  63.2  0.000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4353  peptidase S14 ClpP  37.35 
 
 		 620 aa  57.8  0.0000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.26326  hitchhiker  0.00986992 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2861  protein of unknown function DUF114  28.82 
 
 		 336 aa  55.5  0.0000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0878  hypothetical protein  25 
 
 		 338 aa  54.7  0.000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000902689  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1836  hypothetical protein  25.89 
 
 		 354 aa  53.1  0.000005  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1190  protein of unknown function DUF107  42.25 
 
 		 447 aa  52.8  0.000006  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00806251  n/a   
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4681  hypothetical protein  36.25 
 
 		 338 aa  52  0.00001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.214959  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1629  R2.LlaJI  25.38 
 
 		 349 aa  52  0.00001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0248162  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2190  peptidase S14, ClpP  36.89 
 
 		 688 aa  50.4  0.00003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000592191 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0514  peptidase S49  41.89 
 
 		 290 aa  49.7  0.00005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2389  peptidase S14, ClpP  38.75 
 
 		 351 aa  49.7  0.00005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.142476  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2623  Clp protease  35.14 
 
 		 197 aa  48.5  0.0001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3727  hypothetical protein  34.38 
 
 		 354 aa  48.5  0.0001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.175021  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2253  peptidase S14, ClpP  29.12 
 
 		 674 aa  47.8  0.0002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0288659 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0527  peptidase S49  31.25 
 
 		 286 aa  47  0.0003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.585752  normal  0.703911 
 
 
-
 
NC_004310  BR0396  protease IV, putative  43.75 
 
 		 368 aa  46.2  0.0005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.690183  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0405  putative protease IV  43.75 
 
 		 368 aa  46.2  0.0005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.787524  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1720  peptidase S14, ClpP  35.59 
 
 		 247 aa  46.2  0.0005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0626  peptidase S14 ClpP  38.6 
 
 		 244 aa  46.6  0.0005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0130  peptidase S49  38.27 
 
 		 306 aa  46.2  0.0006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.14674  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3971  peptidase S14, ClpP  46.3 
 
 		 216 aa  45.8  0.0007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.269828 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2501  peptidase S14 ClpP  40.28 
 
 		 280 aa  45.4  0.001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0232282  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1759  peptidase S49  45.31 
 
 		 356 aa  44.3  0.002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.257491  normal  0.0518499 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0586  Clp protease  30.51 
 
 		 247 aa  44.3  0.002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0841  putative periplasmic protease  39.47 
 
 		 347 aa  44.7  0.002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0227554  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3866  peptidase S14 ClpP  40.35 
 
 		 280 aa  44.3  0.002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00220297 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0643  peptidase S14, ClpP  39.19 
 
 		 282 aa  44.7  0.002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0947  proteinase sohB  39.74 
 
 		 288 aa  44.3  0.002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.328239  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0571  peptidase S49  33.01 
 
 		 286 aa  43.9  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0708  peptidase S49  42.19 
 
 		 286 aa  43.9  0.003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.884772  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1874  peptidase S14, ClpP  42.11 
 
 		 361 aa  43.9  0.003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1618  serine peptidase  42.86 
 
 		 316 aa  43.9  0.003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.439496  normal  0.582479 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1193  protein of unknown function DUF107  29.2 
 
 		 458 aa  43.9  0.003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0874985  normal  0.16265 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2853  peptidase S14 ClpP  26.96 
 
 		 564 aa  43.5  0.004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.12086  normal  0.0147966 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1046  ClpP protease  38.71 
 
 		 280 aa  43.5  0.004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.304732  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0361  peptidase S14, ClpP  36.84 
 
 		 280 aa  43.1  0.005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0014  hypothetical protein  37.65 
 
 		 427 aa  43.1  0.005  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0990  peptidase S14, ClpP  36.84 
 
 		 280 aa  43.1  0.005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2167  nodulation efficiency protein NfeD  33.71 
 
 		 428 aa  42.7  0.006  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0461  peptidase S49  30.91 
 
 		 288 aa  42.7  0.006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.361729 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1926  putative periplasmic protease  28.71 
 
 		 348 aa  42.7  0.007  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3105  peptidase S49  45.31 
 
 		 286 aa  42.7  0.007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.246798 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1925  putative periplasmic protease  38.16 
 
 		 348 aa  42.4  0.009  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0571162  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2306  putative periplasmic protease  38.16 
 
 		 348 aa  42.4  0.009  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2036  putative periplasmic protease  38.16 
 
 		 348 aa  42.4  0.009  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.210716  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0961  peptidase S14, ClpP  32.84 
 
 		 641 aa  42.4  0.009  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.019957  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0020  hypothetical protein  37 
 
 		 488 aa  42.4  0.009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0144278  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1326  hypothetical protein  40.58 
 
 		 388 aa  42  0.01  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>