14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_7707 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009475  BBta_p0267  hypothetical protein  100 
 
 
603 aa  1220    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1470  hypothetical protein  100 
 
 
603 aa  1220    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0264078  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3329  hypothetical protein  100 
 
 
603 aa  1220    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7314  hypothetical protein  100 
 
 
603 aa  1220    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.528529  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7405  hypothetical protein  100 
 
 
603 aa  1220    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0404816  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7707  hypothetical protein  100 
 
 
603 aa  1220    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.26795  normal  0.141664 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6208  hypothetical protein  28.06 
 
 
560 aa  193  8e-48  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3443  hypothetical protein  22.87 
 
 
545 aa  72  0.00000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3482  hypothetical protein  22.87 
 
 
545 aa  72  0.00000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010679  Bphyt_7359  phage integrase  23.55 
 
 
579 aa  56.6  0.000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.88342  normal  0.88087 
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6253  phage integrase  23.65 
 
 
552 aa  50.8  0.00008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3610  hypothetical protein  24.31 
 
 
559 aa  50.1  0.0001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3163  hypothetical protein  22.92 
 
 
602 aa  49.3  0.0002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.738774  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0098  hypothetical protein  19.52 
 
 
538 aa  44.3  0.007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>