More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_7658 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009485  BBta_7658  putative ABC transporter, ATP-binding protein  100 
 
 
241 aa  488  1e-137  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.133914  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0576  ABC transporter related  80.33 
 
 
264 aa  395  1e-109  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.490377  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0129  ABC transporter related  81.28 
 
 
264 aa  390  1e-107  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0358  ABC transporter related  80 
 
 
270 aa  387  1e-107  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.996244 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0061  ABC transporter related  78.99 
 
 
269 aa  380  1e-104  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0435  ABC transporter related  59.92 
 
 
245 aa  288  6e-77  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0126  ABC transporter component  60.43 
 
 
271 aa  274  1e-72  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.959991  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2238  ABC transporter related  55.79 
 
 
246 aa  273  3e-72  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0769136  normal  0.0562594 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3286  ABC transporter-related protein  47.62 
 
 
250 aa  211  7e-54  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.874938  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3360  ABC transporter related  46.75 
 
 
250 aa  209  2e-53  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3169  ABC transporter, ATPase subunit  46.32 
 
 
250 aa  209  4e-53  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.386052  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1617  ABC transporter related  50.65 
 
 
259 aa  192  5e-48  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.428283 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2783  ABC transporter-related protein  40.95 
 
 
244 aa  177  1e-43  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.474433  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0363  ABC transporter related  39.57 
 
 
243 aa  175  6e-43  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0340  ABC transporter related  38.72 
 
 
243 aa  169  4e-41  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3538  ABC transporter related  38.5 
 
 
323 aa  162  3e-39  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2942  ABC transporter related protein  37.39 
 
 
251 aa  162  4e-39  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1484  nodulation ABC transporter NodI  42.66 
 
 
309 aa  162  6e-39  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.374303  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0113  ABC transporter related  39.06 
 
 
241 aa  160  1e-38  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2121  ABC transporter related protein  38.63 
 
 
315 aa  160  2e-38  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0809  ABC transporter-related protein  39.91 
 
 
257 aa  159  4e-38  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1504  ABC transporter related  39.91 
 
 
914 aa  157  1e-37  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.13475  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1304  ABC transporter related  36.78 
 
 
590 aa  155  5e-37  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1117  ABC transporter related  39.91 
 
 
326 aa  155  7e-37  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.222979  n/a   
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9217  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  38.79 
 
 
913 aa  155  8e-37  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.808205  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0555  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  38.6 
 
 
907 aa  154  1e-36  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0167  response regulator receiver domain-containing protein  37.99 
 
 
921 aa  153  2e-36  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000281851 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2493  ABC transporter related protein  44.71 
 
 
318 aa  153  2e-36  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000144687  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1683  ABC transporter related  38.84 
 
 
314 aa  154  2e-36  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4964  ABC transporter related  36.24 
 
 
327 aa  152  4e-36  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.763895  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1005  ABC transporter related  41.26 
 
 
257 aa  152  4e-36  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00810555  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7849  ABC transporter permease ATP-binding protein  37.72 
 
 
915 aa  152  5e-36  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0180786  normal  0.28937 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0081  ABC transporter related  39.04 
 
 
911 aa  152  5e-36  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.111976  normal  0.167025 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1546  ABC transporter related protein  43.54 
 
 
341 aa  152  6e-36  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0316  ABC transporter related  36.4 
 
 
901 aa  151  7e-36  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0170  ABC-2 type transport system  37.12 
 
 
925 aa  151  8e-36  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.476544  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1802  ABC transporter related  40.87 
 
 
340 aa  151  1e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.398486 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3660  ABC transporter permease ATP-binding protein  38.6 
 
 
924 aa  151  1e-35  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.388882  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0018  ABC transporter related  36.29 
 
 
909 aa  151  1e-35  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5268  ABC transporter related  38.86 
 
 
906 aa  149  3e-35  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.155488  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1108  ABC transporter related  38.46 
 
 
255 aa  149  3e-35  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.298542 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1019  ABC transporter related  35.54 
 
 
590 aa  149  3e-35  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1594  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  42.03 
 
 
323 aa  149  4e-35  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.658594  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4919  nodulation factor exporter subunit NodI  41.26 
 
 
342 aa  149  4e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2950  ABC transporter related  35.37 
 
 
943 aa  149  4e-35  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2776  response regulator receiver domain-containing protein  36.63 
 
 
1089 aa  149  5e-35  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.591057  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4231  ABC transporter related  40.29 
 
 
304 aa  148  6e-35  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3159  ABC transporter, 2 fused ATPase and 1 inner membrane subunits  38.6 
 
 
901 aa  149  6e-35  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.827226  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3558  ABC transporter related  37.83 
 
 
307 aa  148  6e-35  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0440586  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1039  RND efflux system, cytoplasmic membrane extrusion protein  37.28 
 
 
1082 aa  148  7e-35  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2633  ABC transporter, ATP-binding protein/permease  37.28 
 
 
1066 aa  148  7e-35  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0021  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  40.61 
 
 
321 aa  148  7e-35  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1033  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  39.11 
 
 
317 aa  148  7e-35  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.100021 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1309  RND efflux system, cytoplasmic membrane extrusion protein  37.28 
 
 
1071 aa  148  7e-35  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2172  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  38.29 
 
 
317 aa  148  7e-35  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0139  RND efflux system, cytoplasmic membrane extrusion protein  37.28 
 
 
1071 aa  148  7e-35  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5115  ABC transporter related  38.86 
 
 
906 aa  148  8e-35  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0165  RND efflux system, cytoplasmic membrane extrusion protein  37.28 
 
 
1079 aa  148  8e-35  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.243814  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5207  ABC transporter permease/ATP-binding protein  38.86 
 
 
906 aa  148  8e-35  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.468455  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3446  ABC transporter related  36.4 
 
 
922 aa  148  9e-35  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3024  ABC transporter related  42.65 
 
 
338 aa  147  1e-34  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0851155  normal  0.0538989 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4915  ABC transporter related  38.43 
 
 
933 aa  148  1e-34  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04710  ATP-binding ABC transporter family nodulation protein NodI  38.33 
 
 
328 aa  147  1e-34  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.427122  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0586  ABC transporter-related protein  38.6 
 
 
327 aa  147  1e-34  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.737047  hitchhiker  0.000179773 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0987  ABC-2:ABC transporter related  36.24 
 
 
920 aa  147  1e-34  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.149444  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3577  ABC transporter related  37.12 
 
 
930 aa  147  1e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1766  ABC transporter-like protein  38.33 
 
 
311 aa  147  1e-34  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_2014  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  38.67 
 
 
317 aa  147  2e-34  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  hitchhiker  2.25656e-05  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3573  ABC transporter related  36.48 
 
 
313 aa  147  2e-34  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1431  ABC transporter related  41.06 
 
 
316 aa  147  2e-34  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3896  ABC transporter related  38.16 
 
 
901 aa  147  2e-34  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.184002 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1937  ABC transporter related  39.53 
 
 
322 aa  147  2e-34  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1355  ABC transporter related  37.78 
 
 
315 aa  147  2e-34  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  4.05969e-06  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6187  nodulation factor exporter subunit NodI  40 
 
 
355 aa  147  2e-34  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7720  nodulation ABC transporter NodI  37.61 
 
 
304 aa  147  2e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.948879  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3370  ABC transporter, ATP-binding protein  38.27 
 
 
356 aa  147  2e-34  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0614768  decreased coverage  0.00407786 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1036  ABC transporter related  40.98 
 
 
328 aa  146  2e-34  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1432  ABC transporter related  35.78 
 
 
908 aa  146  2e-34  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2686  ABC transporter, ATP-binding protein  36.4 
 
 
930 aa  147  2e-34  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1768  nodulation ABC transporter NodI  35.93 
 
 
304 aa  146  3e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.733108  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0210  ABC transporter related  36.4 
 
 
916 aa  146  3e-34  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.10228  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4160  ABC transporter related  35.47 
 
 
314 aa  146  3e-34  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3588  putative ABC-type multidrug transport system, ATPase component  39.63 
 
 
322 aa  146  3e-34  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1634  nodulation ABC transporter NodI  38.6 
 
 
304 aa  146  3e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.770331  normal  0.764361 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1497  ABC transporter related  37.28 
 
 
936 aa  146  3e-34  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2361  ABC transporter related  37.28 
 
 
936 aa  146  3e-34  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0787622  normal  0.702477 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0438  RND efflux system, cytoplasmic membrane extrusion protein  37.28 
 
 
1017 aa  145  4e-34  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1596  nodulation ABC transporter NodI  37.67 
 
 
304 aa  145  4e-34  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.993965  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0568  ABC transporter related  37.44 
 
 
241 aa  145  4e-34  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1116  nodulation ABC transporter NodI  37.67 
 
 
304 aa  145  4e-34  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3773  bacitracin transport ATP-binding protein BcrA  40.49 
 
 
303 aa  145  5e-34  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.379604  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0256  bacitracin ABC transporter, ATP-binding protein  35.83 
 
 
309 aa  145  5e-34  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0981  ABC transporter related  40.09 
 
 
325 aa  145  5e-34  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0240  ABC transporter related  39.57 
 
 
311 aa  145  5e-34  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0491819  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2081  ABC transporter related protein  40.09 
 
 
310 aa  145  6e-34  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2709  ABC transporter related  41.26 
 
 
298 aa  145  6e-34  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.0350953 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0231  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  37.84 
 
 
316 aa  145  6e-34  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.158088 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0328  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  40 
 
 
339 aa  145  6e-34  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.328549  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0633  ABC transporter related  35.86 
 
 
314 aa  145  7e-34  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02799  sodium ABC transporter ATP-binding protein  37.07 
 
 
248 aa  145  7e-34  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>