37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_7657 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_7657  putative ABC transporter, permease protein  100 
 
 		 270 aa  530  1e-149  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0868338  normal  0.877787 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0062  hypothetical protein  80.97 
 
 		 276 aa  433  1e-120  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0357  hypothetical protein  80.99 
 
 		 271 aa  431  1e-120  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0128  hypothetical protein  80.97 
 
 		 276 aa  434  1e-120  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.474534  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0577  ABC-2 type transporter  78.73 
 
 		 276 aa  429  1e-119  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.228177  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2239  hypothetical protein  53.38 
 
 		 268 aa  287  1e-76  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.627796  normal  0.0598095 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0127  ABC-2 transporter component  49.23 
 
 		 282 aa  263  3e-69  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0177807  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0434  ABC-2 type transporter  42.91 
 
 		 266 aa  210  2e-53  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2789  ABC-2 type transporter  33.85 
 
 		 267 aa  135  5e-31  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3359  ABC-2 type transporter  34.63 
 
 		 270 aa  135  6.0000000000000005e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1618  ABC-2 type transporter  38.81 
 
 		 269 aa  133  3.9999999999999996e-30  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.794446 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3168  ABC transporter, inner membrane subunit  35.04 
 
 		 270 aa  132  7.999999999999999e-30  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3285  ABC-2 type transporter  34.24 
 
 		 270 aa  130  2.0000000000000002e-29  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0378  ABC-2 type transporter  27.2 
 
 		 261 aa  78.6  0.0000000000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.572571  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0406  ABC-2 type transporter  28.27 
 
 		 279 aa  49.3  0.00006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0129272  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1697  ABC-2 type transporter  31.63 
 
 		 271 aa  48.9  0.00008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1142  ABC transporter permease protein  26.81 
 
 		 257 aa  48.5  0.0001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0101435  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1012  ABC transporter, permease protein  26.81 
 
 		 257 aa  48.5  0.0001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00000447992  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0698  hypothetical protein  31.54 
 
 		 374 aa  48.5  0.0001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0718  hypothetical protein  31.54 
 
 		 356 aa  48.5  0.0001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2367  hypothetical protein  32.68 
 
 		 370 aa  47  0.0003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.175245  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03555  ABC-type multidrug transport system, permease component  28.12 
 
 		 271 aa  46.6  0.0004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1805  ABC-2 type transporter  29.14 
 
 		 290 aa  46.6  0.0005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2356  ABC-2 type transporter  29.79 
 
 		 286 aa  46.6  0.0005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.328671  normal  0.119199 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2477  ABC-2 type transporter  29.79 
 
 		 286 aa  46.2  0.0006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.299444 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27780  putative ABC transporter, permease protein  28.57 
 
 		 259 aa  45.8  0.0007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.235012 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2346  ABC transporter  28.57 
 
 		 259 aa  45.8  0.0007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0982615  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1471  ABC-2 type transporter  29.29 
 
 		 259 aa  45.8  0.0007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1896  ABC transporter  29.79 
 
 		 259 aa  45.4  0.001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.312969  hitchhiker  0.0000781572 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0734  ABC-2 type transporter  26.71 
 
 		 241 aa  45.1  0.001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00105629  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3266  ABC-2 type transporter  47.73 
 
 		 281 aa  44.3  0.002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1438  ABC-2 type transporter  31.72 
 
 		 273 aa  44.7  0.002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_718  ABC transporter, permease protein  25.68 
 
 		 260 aa  43.9  0.003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000115983  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1707  ABC transporter, permease protein, putative  25.79 
 
 		 373 aa  43.5  0.004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0814  ABC transporter, permease protein  26.39 
 
 		 241 aa  43.5  0.004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0811  ABC-2 type transporter  25.95 
 
 		 377 aa  42.7  0.007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4230  ABC-2 type transporter  29.81 
 
 		 375 aa  42  0.01  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>