More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_7629 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009485  BBta_7629  putative ABC transporter permease protein  100 
 
 
282 aa  550  1e-156  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.262472  normal  0.441686 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2985  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  55.69 
 
 
273 aa  279  4e-74  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0770  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  56.91 
 
 
273 aa  276  2e-73  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3099  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  45.38 
 
 
261 aa  214  9.999999999999999e-55  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.578785 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3181  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.02 
 
 
277 aa  208  8e-53  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0283642  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3131  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.42 
 
 
281 aa  200  3e-50  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1169  putative ABC transporter permease protein  38.33 
 
 
279 aa  176  5e-43  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6052  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.06 
 
 
274 aa  160  2e-38  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0454164  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1862  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.13 
 
 
257 aa  160  2e-38  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.116723  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0620  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.1 
 
 
254 aa  157  1e-37  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.63161  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3269  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.15 
 
 
253 aa  156  4e-37  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.283078  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3205  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.83 
 
 
265 aa  155  5.0000000000000005e-37  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000457845  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1221  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.14 
 
 
246 aa  154  1e-36  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1393  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.32 
 
 
254 aa  154  2e-36  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.302994  normal  0.157809 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0814  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.68 
 
 
270 aa  153  2e-36  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3118  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  37.55 
 
 
284 aa  153  4e-36  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4580  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.8 
 
 
257 aa  152  5e-36  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2296  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.82 
 
 
250 aa  152  5e-36  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0614  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.4 
 
 
250 aa  150  2e-35  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0881  putative ABC transporter, permease protein  35.6 
 
 
251 aa  149  6e-35  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00328051  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0797  ABC transporter, permease protein, putative  35.6 
 
 
250 aa  149  6e-35  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0643  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.6 
 
 
251 aa  149  7e-35  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0403  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.73 
 
 
271 aa  148  1.0000000000000001e-34  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4527  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.79 
 
 
253 aa  147  2.0000000000000003e-34  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4547  putative ABC transporter, permease protein  35.6 
 
 
251 aa  147  2.0000000000000003e-34  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.113137  normal  0.441246 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0784  putative ABC transporter, permease protein  36.13 
 
 
250 aa  147  2.0000000000000003e-34  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.605831  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0637  ABC transporter, permease  34.8 
 
 
250 aa  146  3e-34  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00537874  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0637  ABC transporter, permease  34.8 
 
 
250 aa  146  3e-34  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0693  ABC transporter permease  34.8 
 
 
250 aa  146  4.0000000000000006e-34  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0727  ABC transporter permease  34.8 
 
 
250 aa  146  4.0000000000000006e-34  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0363276  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0804  putative ABC transporter, permease protein  34.8 
 
 
250 aa  146  5e-34  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.22036e-46 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4254  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.27 
 
 
283 aa  145  6e-34  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0441349  normal  0.902161 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3606  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.8 
 
 
257 aa  145  7.0000000000000006e-34  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.071611 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7650  ABC nitrate/sulfonate/bicarbonate transporter, inner membrane subunit  37.5 
 
 
247 aa  144  1e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.621765  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3758  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.85 
 
 
256 aa  144  1e-33  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2116  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.58 
 
 
253 aa  144  2e-33  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2545  binding-protein-dependent transport system protein  33.08 
 
 
287 aa  142  8e-33  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.240068  normal  0.521676 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2376  ABC transporter substrate binding inner membrane protein  33.47 
 
 
265 aa  141  9.999999999999999e-33  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000865  hydroxymethylpyrimidine ABC transporter transmembrane component  33.47 
 
 
266 aa  139  3.9999999999999997e-32  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1488  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.09 
 
 
247 aa  139  4.999999999999999e-32  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2064  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.53 
 
 
254 aa  139  4.999999999999999e-32  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00112586  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0354  ABC transporter, permease  31.33 
 
 
265 aa  137  2e-31  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0493  putative ABC transporter, permease protein  31.33 
 
 
257 aa  137  2e-31  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3093  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  36.03 
 
 
259 aa  137  2e-31  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.942666 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1445  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30 
 
 
259 aa  137  2e-31  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.318112 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1151  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.8 
 
 
254 aa  137  2e-31  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2127  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.41 
 
 
255 aa  137  2e-31  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.427162 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0620  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38 
 
 
258 aa  137  3.0000000000000003e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06840  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport system permease component  32.61 
 
 
266 aa  136  3.0000000000000003e-31  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0394  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.19 
 
 
259 aa  137  3.0000000000000003e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00657833 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0033  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.04 
 
 
243 aa  136  3.0000000000000003e-31  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4878  putative ABC transporter, permease protein  32.49 
 
 
255 aa  136  3.0000000000000003e-31  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2962  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.49 
 
 
280 aa  136  4e-31  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0794658  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0367  ABC transporter permease  30.9 
 
 
265 aa  136  5e-31  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0357  ABC transporter, permease  30.9 
 
 
265 aa  136  5e-31  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0424  putative ABC transporter, permease protein  30.9 
 
 
257 aa  135  5e-31  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0381  ABC transporter permease  30.9 
 
 
257 aa  135  5e-31  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3658  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.22 
 
 
245 aa  135  5e-31  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0362  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.49 
 
 
255 aa  136  5e-31  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2777  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.54 
 
 
292 aa  135  6.0000000000000005e-31  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0491  ABC transporter, permease protein, putative  30.9 
 
 
257 aa  135  7.000000000000001e-31  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0877  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.98 
 
 
260 aa  135  7.000000000000001e-31  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000112184  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2621  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.93 
 
 
281 aa  134  1.9999999999999998e-30  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000218671  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3124  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.77 
 
 
255 aa  134  1.9999999999999998e-30  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0452  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.11 
 
 
252 aa  133  3e-30  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0467336 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6281  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.61 
 
 
256 aa  133  3e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.783663  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0446  putative ABC transporter, permease protein  32.07 
 
 
257 aa  133  3.9999999999999996e-30  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0891  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.47 
 
 
268 aa  132  6e-30  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.223421 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4514  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44.7 
 
 
263 aa  132  6.999999999999999e-30  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.99074 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0493  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter inner membrane protein  34.47 
 
 
287 aa  132  9e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.114665  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1140  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.06 
 
 
255 aa  131  1.0000000000000001e-29  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3961  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.73 
 
 
287 aa  131  1.0000000000000001e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2084  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.13 
 
 
260 aa  131  1.0000000000000001e-29  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.566245  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2678  ABC transporter, permease protein  34.41 
 
 
285 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0253  ABC transporter, permease protein  34.41 
 
 
282 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.735185  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0435  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.78 
 
 
250 aa  130  2.0000000000000002e-29  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0038  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.01 
 
 
285 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.090458  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0032  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.01 
 
 
285 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3419  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.29 
 
 
258 aa  130  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.121812  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3274  ABC transporter, permease protein  34.41 
 
 
282 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1853  ABC transporter, permease protein  34.41 
 
 
282 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.989072  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0040  ABC transporter, permease protein  34.41 
 
 
282 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0040  ABC transporter, permease protein  34.41 
 
 
282 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.522623  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2699  ABC transporter, permease protein  34.41 
 
 
282 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4033  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.33 
 
 
287 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.753159  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0051  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.01 
 
 
282 aa  130  3e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3278  ABC transporter related protein  33.73 
 
 
257 aa  130  3e-29  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.000407876  normal  0.0335836 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3506  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.06 
 
 
282 aa  130  3e-29  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0528385  normal  0.0939424 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0450  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.62 
 
 
222 aa  130  3e-29  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3295  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  33.6 
 
 
279 aa  129  4.0000000000000003e-29  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3810  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.74 
 
 
258 aa  129  4.0000000000000003e-29  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.42897 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0033  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.01 
 
 
282 aa  129  4.0000000000000003e-29  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.589022  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0030  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.47 
 
 
264 aa  129  5.0000000000000004e-29  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.050552  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0037  ABC transporter, permease protein  34.65 
 
 
259 aa  129  5.0000000000000004e-29  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0024  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.01 
 
 
285 aa  129  5.0000000000000004e-29  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0476  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.52 
 
 
249 aa  129  5.0000000000000004e-29  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0355  putative ABC aliphatic sulfonates transporter, permease subunit  31.76 
 
 
264 aa  129  5.0000000000000004e-29  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0423  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.76 
 
 
264 aa  129  5.0000000000000004e-29  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0024  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.47 
 
 
264 aa  129  7.000000000000001e-29  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2561  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.72 
 
 
279 aa  129  7.000000000000001e-29  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>