197 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_7608 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009485  BBta_7608  hypothetical protein  100 
 
 
255 aa  506  1e-142  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  decreased coverage  0.000430811  normal  0.301111 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0467  hypothetical protein  80.08 
 
 
246 aa  396  1e-109  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0374  hypothetical protein  78.57 
 
 
246 aa  389  1e-107  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.73431 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0509  methyltransferase type 11  74.51 
 
 
257 aa  384  1e-106  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.16372  normal  0.0246077 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0613  Methyltransferase type 11  74.5 
 
 
259 aa  384  1e-105  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.168434  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0094  methyltransferase type 11  76.99 
 
 
254 aa  375  1e-103  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.116481 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0070  methyltransferase type 11  76.15 
 
 
254 aa  372  1e-102  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.90869 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2018  methyltransferase type 11  59.22 
 
 
255 aa  300  2e-80  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0447  Methyltransferase type 11  53.75 
 
 
246 aa  263  3e-69  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2064  methyltransferase type 11  56.48 
 
 
248 aa  261  1e-68  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0394236  normal  0.0109079 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2509  methyltransferase type 11  54.46 
 
 
244 aa  253  2e-66  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.120147  normal  0.163861 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2732  Methyltransferase type 11  54.46 
 
 
250 aa  253  2e-66  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.413837  normal  0.291795 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2437  Methyltransferase type 11  54.02 
 
 
250 aa  252  4e-66  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1899  methyltransferase type 11  49.79 
 
 
248 aa  249  4e-65  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.749926 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0431  methyltransferase type 11  49.2 
 
 
257 aa  248  6e-65  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.336271 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1579  methyltransferase type 11  50.79 
 
 
252 aa  241  8e-63  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.168817 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0916  methyltransferase type 11  49.58 
 
 
244 aa  239  3e-62  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0845824 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4035  hypothetical protein  49.58 
 
 
253 aa  231  1e-59  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2551  methyltransferase type 11  49.37 
 
 
250 aa  224  8e-58  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0994  methyltransferase type 11  46.59 
 
 
259 aa  224  1e-57  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.415921  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3874  Methyltransferase type 11  48.54 
 
 
246 aa  223  2e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.269939  normal  0.0852061 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3081  methyltransferase type 11  47.39 
 
 
258 aa  223  2e-57  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.609499  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3581  Methyltransferase type 11  48.54 
 
 
258 aa  223  3e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.155439 
 
 
-
 
NC_004310  BR1986  hypothetical protein  47.03 
 
 
259 aa  219  5e-56  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3269  hypothetical protein  45.85 
 
 
264 aa  214  7e-55  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0379  methyltransferase type 11  48.32 
 
 
277 aa  214  9e-55  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1911  hypothetical protein  49.04 
 
 
234 aa  201  7e-51  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0058  putative SAM-dependent methyltransferase protein  40.08 
 
 
244 aa  192  4e-48  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1777  methyltransferase type 11  44.69 
 
 
235 aa  186  2e-46  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0314137  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2380  methyltransferase type 11  42.46 
 
 
255 aa  183  2e-45  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.311987 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2938  conserved hypohtetical protein  42.92 
 
 
256 aa  181  8e-45  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0406539  normal  0.0314304 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2295  hypothetical protein  39.77 
 
 
262 aa  173  3e-42  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.360023  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0970  hypothetical protein  39.77 
 
 
262 aa  173  3e-42  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2090  hypothetical protein  41.47 
 
 
248 aa  171  9e-42  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.859026  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2205  hypothetical protein  42.86 
 
 
262 aa  169  5e-41  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3814  methyltransferase type 11  40.08 
 
 
260 aa  169  6e-41  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1043  hypothetical protein  40.77 
 
 
253 aa  159  4e-38  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3063  hypothetical protein  36.9 
 
 
261 aa  149  5e-35  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  hitchhiker  5.85579e-06  normal  0.0470868 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1658  methyltransferase type 11  33.06 
 
 
256 aa  138  9e-32  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.356939 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1610  Methyltransferase type 11  30 
 
 
225 aa  72  9e-12  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0535703  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1703  SAM-dependent methyltransferase  27.03 
 
 
246 aa  61.6  1e-08  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.112357  normal  0.713631 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1586  methyltransferase type 11  29.94 
 
 
243 aa  60.1  3e-08  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.217774  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2816  generic methyl-transferase  30.9 
 
 
256 aa  60.1  4e-08  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2280  hypothetical protein  33.58 
 
 
278 aa  59.7  4e-08  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0954  Methyltransferase type 11  30.49 
 
 
260 aa  60.1  4e-08  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0595  hypothetical protein  29.73 
 
 
270 aa  57.8  2e-07  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0557  hypothetical protein  29.73 
 
 
270 aa  57.8  2e-07  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2789  hypothetical protein  29.73 
 
 
270 aa  57.8  2e-07  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00141234  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0764  hypothetical protein  29.73 
 
 
270 aa  57.8  2e-07  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1497  hypothetical protein  29.73 
 
 
270 aa  57.8  2e-07  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1601  hypothetical protein  29.73 
 
 
270 aa  57.8  2e-07  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1467  hypothetical protein  29.73 
 
 
270 aa  57.8  2e-07  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.406889  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1274  hypothetical protein  29.73 
 
 
270 aa  57.8  2e-07  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.199636  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1257  methyltransferase type 11  29.78 
 
 
270 aa  56.6  3e-07  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00176824  normal  0.197818 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2139  Methyltransferase type 11  25 
 
 
240 aa  57  3e-07  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.0101077 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1286  methyltransferase type 11  29.78 
 
 
270 aa  56.2  5e-07  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00312409  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0059  Methyltransferase type 11  33.33 
 
 
219 aa  56.2  5e-07  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.624064  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0805  methyltransferase type 11  29.78 
 
 
270 aa  56.2  5e-07  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.835113  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3468  hypothetical protein  28.66 
 
 
257 aa  55.5  8e-07  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2652  methyltransferase type 11  47.46 
 
 
251 aa  55.5  9e-07  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.0714866 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2034  methyltransferase type 11  30.05 
 
 
270 aa  54.3  2e-06  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0620207  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4428  hypothetical protein  29.26 
 
 
270 aa  53.9  2e-06  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  8.16138e-07  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1679  methyltransferase type 11  40.62 
 
 
273 aa  53.5  3e-06  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.822935 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1175  methyltransferase type 11  29.23 
 
 
270 aa  53.1  4e-06  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.000783857  normal  0.143083 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1163  methyltransferase type 11  29.23 
 
 
270 aa  53.1  4e-06  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0143221  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0592  methyltransferase type 11  37.5 
 
 
274 aa  52.8  5e-06  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2493  methyltransferase type 11  31.25 
 
 
238 aa  52.8  5e-06  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0424755  normal  0.184077 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2185  hypothetical protein  26.54 
 
 
252 aa  52.8  6e-06  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3659  Methyltransferase type 11  32.74 
 
 
255 aa  52  9e-06  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0109241  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1252  hypothetical protein  39.33 
 
 
289 aa  52  9e-06  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1764  methyltransferase  28.67 
 
 
243 aa  52  9e-06  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1514  hypothetical protein  26.9 
 
 
257 aa  51.6  1e-05  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2040  Methyltransferase type 11  29.32 
 
 
262 aa  51.6  1e-05  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0630  hypothetical protein  24.49 
 
 
240 aa  51.6  1e-05  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0423  putative methyltransferase  28.67 
 
 
243 aa  52  1e-05  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.209763  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2872  Methyltransferase type 11  36.36 
 
 
287 aa  52  1e-05  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00483361  normal  0.354275 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8231  methyltransferase type 11  28.07 
 
 
237 aa  50.8  2e-05  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1526  methyltransferase type 11  28.28 
 
 
207 aa  50.8  2e-05  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.164104  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1458  methyltransferase type 11  25.36 
 
 
265 aa  50.4  2e-05  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1594  generic methyl-transferase  25.87 
 
 
238 aa  50.4  2e-05  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28280  methyltransferase family protein  37.8 
 
 
258 aa  50.8  2e-05  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.639383  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2065  hypothetical protein  27.38 
 
 
252 aa  50.8  2e-05  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.13247  normal  0.0779555 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1732  Methyltransferase type 11  28.27 
 
 
262 aa  50.8  2e-05  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0169099  normal  0.614838 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1971  hypothetical protein  34.72 
 
 
273 aa  50.8  2e-05  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.536207 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2874  type 11 methyltransferase  27.19 
 
 
237 aa  51.2  2e-05  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0869  methyltransferase type 11  28.47 
 
 
271 aa  50.4  3e-05  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.292642  normal  0.353512 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2358  Methyltransferase type 11  33.33 
 
 
634 aa  50.4  3e-05  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.295252  hitchhiker  0.00225016 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1620  generic methyl-transferase  29.33 
 
 
259 aa  50.1  4e-05  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.152762  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1762  hypothetical protein  26.54 
 
 
253 aa  50.1  4e-05  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.479103  normal  0.934306 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1827  hypothetical protein  26.21 
 
 
245 aa  50.1  4e-05  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2339  Methyltransferase type 11  40.91 
 
 
251 aa  49.7  4e-05  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.560895  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2207  methyltransferase type 11  28.27 
 
 
264 aa  49.7  5e-05  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000439917  normal  0.236721 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0497  methyltransferase type 11  48.08 
 
 
246 aa  49.7  5e-05  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.00659645  normal  0.142728 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4143  hypothetical protein  27.44 
 
 
266 aa  49.3  6e-05  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2138  Methyltransferase type 11  25.27 
 
 
237 aa  49.3  6e-05  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0910  methyltransferase type 11  32.97 
 
 
239 aa  49.3  6e-05  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3715  hypothetical protein  27.44 
 
 
257 aa  48.9  7e-05  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.944001  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1722  hypothetical protein  27.44 
 
 
257 aa  48.9  7e-05  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6705  Methyltransferase type 11  36.11 
 
 
810 aa  48.9  7e-05  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3459  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  26.8 
 
 
503 aa  48.9  7e-05  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>