161 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_7521 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009485  BBta_7521  hypothetical protein  100 
 
 
236 aa  484  1e-136  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.20194  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3299  hypothetical protein  63.8 
 
 
233 aa  291  5e-78  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0140803 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2891  hypothetical protein  64.25 
 
 
244 aa  290  1e-77  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4803  hypothetical protein  63.68 
 
 
244 aa  287  9e-77  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.382329  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3365  hypothetical protein  63.68 
 
 
244 aa  287  9e-77  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00947046  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4151  hypothetical protein  62.72 
 
 
234 aa  286  2e-76  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.807728  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5225  hypothetical protein  65.61 
 
 
242 aa  282  4.0000000000000003e-75  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.408717  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0926  flavin reductase domain protein FMN-binding  59.63 
 
 
228 aa  280  1e-74  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.332625  normal  0.0485806 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0091  hypothetical protein  62.38 
 
 
233 aa  270  1e-71  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.121116 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4048  hypothetical protein  54.46 
 
 
226 aa  210  2e-53  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.293698  normal  0.899235 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7867  flavin reductase domain protein FMN-binding  47.51 
 
 
233 aa  200  9.999999999999999e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.358358 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4625  hypothetical protein  47.34 
 
 
215 aa  168  8e-41  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0411446 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1051  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  48.29 
 
 
216 aa  158  7e-38  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.136443 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5960  flavin reductase domain protein FMN-binding  43.06 
 
 
237 aa  157  1e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1414  hypothetical protein  41.24 
 
 
225 aa  150  2e-35  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.563385  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1997  flavin reductase domain protein FMN-binding  39.25 
 
 
185 aa  136  3.0000000000000003e-31  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.418492  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0925  hypothetical protein  31.05 
 
 
198 aa  117  9.999999999999999e-26  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.339303  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2753  flavin reductase domain protein FMN-binding  34.34 
 
 
209 aa  115  6.9999999999999995e-25  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1355  flavin reductase domain protein FMN-binding  33.84 
 
 
196 aa  114  8.999999999999998e-25  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2986  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  33.33 
 
 
196 aa  112  3e-24  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2620  flavin reductase domain protein FMN-binding  32.32 
 
 
196 aa  106  4e-22  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.592321  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1083  hypothetical protein  29.94 
 
 
204 aa  68.9  0.00000000006  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.2808  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0832  hypothetical protein  32.52 
 
 
206 aa  65.9  0.0000000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.158602  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1150  flavoprotein oxygenase  31.68 
 
 
207 aa  65.9  0.0000000005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.462825 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1820  hypothetical protein  34.57 
 
 
207 aa  65.5  0.0000000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40150  Flavin reductase-like protein  36.62 
 
 
177 aa  65.5  0.0000000008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.710187  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4899  hypothetical protein  32.12 
 
 
205 aa  65.1  0.0000000008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3881  flavin reductase domain-containing protein  25.63 
 
 
209 aa  64.7  0.000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2510  flavin reductase domain protein FMN-binding  31.74 
 
 
186 aa  63.9  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.365491  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2631  hypothetical protein  31.03 
 
 
221 aa  64.3  0.000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.300035  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0081  hypothetical protein  34.94 
 
 
209 aa  63.5  0.000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2682  hypothetical protein  33.74 
 
 
205 aa  63.2  0.000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2036  flavin reductase domain protein FMN-binding  30.54 
 
 
190 aa  62.8  0.000000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000423527  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1899  hypothetical protein  35.19 
 
 
202 aa  62  0.000000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.843142  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2181  flavin reductase domain protein FMN-binding  30.05 
 
 
190 aa  61.6  0.00000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1359  hypothetical protein  30.82 
 
 
208 aa  61.2  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.262276  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1122  hypothetical protein  32.14 
 
 
221 aa  61.2  0.00000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2040  flavin reductase domain protein FMN-binding  27.49 
 
 
186 aa  60.8  0.00000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.228084  hitchhiker  0.0000000489831 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1133  hypothetical protein  31.55 
 
 
208 aa  60.5  0.00000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.311037 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5713  flavin reductase domain protein FMN-binding  30.72 
 
 
189 aa  60.5  0.00000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.483715  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4071  hypothetical protein  31.25 
 
 
205 aa  60.1  0.00000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.261199  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1011  hypothetical protein  31.93 
 
 
202 aa  59.7  0.00000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00000116177  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0761  hypothetical protein  30.95 
 
 
208 aa  59.3  0.00000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1215  hypothetical protein  30.36 
 
 
208 aa  59.3  0.00000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1242  hypothetical protein  30.95 
 
 
208 aa  59.3  0.00000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0053  hypothetical protein  30.64 
 
 
210 aa  59.3  0.00000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.234931  normal  0.568294 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0519  flavin reductase domain-containing protein  33.58 
 
 
176 aa  58.9  0.00000007  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.348159  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2815  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  32.42 
 
 
219 aa  58.5  0.00000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.112665  normal 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6309  hypothetical protein  33.82 
 
 
207 aa  58.2  0.0000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4219  hypothetical protein  30.91 
 
 
205 aa  57.8  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.269485 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0889  hypothetical protein  30.29 
 
 
200 aa  57.8  0.0000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.581973  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4298  hypothetical protein  30.06 
 
 
207 aa  56.6  0.0000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2631  hypothetical protein  29.76 
 
 
202 aa  56.2  0.0000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1661  flavoredoxin  24.48 
 
 
192 aa  56.2  0.0000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.600705  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1399  flavin reductase, putative  24.48 
 
 
192 aa  56.2  0.0000004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0187374  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2210  flavin reductase domain-containing protein  31.03 
 
 
189 aa  56.2  0.0000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1289  flavin reductase domain protein FMN-binding  35.24 
 
 
123 aa  55.5  0.0000008  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2498  flavin reductase domain-containing protein  29.77 
 
 
180 aa  55.1  0.0000009  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.198101  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG0359  flavin reductase domain-containing protein  25 
 
 
195 aa  54.3  0.000001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.184245 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0590  hypothetical protein  31.37 
 
 
185 aa  54.7  0.000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.237388 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1365  hypothetical protein  28.27 
 
 
196 aa  54.7  0.000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.300021  normal  0.0686539 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4215  hypothetical protein  33.81 
 
 
184 aa  54.3  0.000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.380151  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0124  flavin reductase domain protein FMN-binding  28.14 
 
 
186 aa  54.7  0.000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2225  flavin reductase domain protein FMN-binding  25.76 
 
 
195 aa  53.9  0.000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1916  putative flavin reductase-like protein  33.33 
 
 
177 aa  54.3  0.000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0609748  normal  0.257395 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0347  flavin reductase domain-containing protein  27.09 
 
 
191 aa  53.5  0.000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.643208  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2217  hypothetical protein  28.3 
 
 
207 aa  53.9  0.000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0565603 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02220  hypothetical protein  31.9 
 
 
208 aa  53.1  0.000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.686893  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2487  hypothetical protein  30 
 
 
203 aa  53.1  0.000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.239635  normal  0.0244852 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4002  hypothetical protein  29.45 
 
 
207 aa  53.1  0.000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.548606  normal  0.130195 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4462  hypothetical protein  28.92 
 
 
209 aa  53.1  0.000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.70984  normal  0.854602 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0805  flavin reductase-like, FMN-binding  30.58 
 
 
188 aa  52.8  0.000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3753  flavin reductase-like, FMN-binding  31.25 
 
 
186 aa  53.1  0.000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.722732  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2664  flavin reductase domain protein FMN-binding  30.58 
 
 
180 aa  52.8  0.000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4414  hypothetical protein  27.53 
 
 
218 aa  53.1  0.000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.629184  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3466  hypothetical protein  32.1 
 
 
209 aa  52.4  0.000006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.421094 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3276  flavin reductase domain protein FMN-binding  25.93 
 
 
295 aa  52.4  0.000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0642  flavin reductase domain protein FMN-binding  31.19 
 
 
190 aa  52  0.000007  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0563737  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1039  hypothetical protein  30.49 
 
 
201 aa  52.4  0.000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.708626  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2366  flavoprotein oxygenase DIM6/NTAB family-like protein  28.95 
 
 
203 aa  52  0.000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.460598  normal  0.14144 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5906  hypothetical protein  28.65 
 
 
195 aa  52  0.000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1944  flavin reductase domain protein FMN-binding  29.01 
 
 
180 aa  52  0.000009  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.334773  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0862  flavin reductase-like, FMN-binding  30.99 
 
 
178 aa  51.6  0.00001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.374228  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5253  flavin reductase domain protein FMN-binding  27.75 
 
 
196 aa  51.6  0.00001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.504075 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2679  hypothetical protein  28.24 
 
 
230 aa  51.6  0.00001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2736  hypothetical protein  28.24 
 
 
230 aa  51.6  0.00001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6898  hypothetical protein  29.88 
 
 
203 aa  50.4  0.00002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.800563  normal  0.546229 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0520  flavin reductase domain protein FMN-binding  29.86 
 
 
189 aa  51.2  0.00002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6314  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  28.74 
 
 
294 aa  50.4  0.00002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0249  flavoredoxin, putative  29.69 
 
 
187 aa  50.4  0.00003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.0000303002  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2269  hypothetical protein  27.38 
 
 
229 aa  50.1  0.00003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0922  flavin reductase domain protein FMN-binding  28.78 
 
 
195 aa  50.1  0.00003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1050  hypothetical protein  30.2 
 
 
191 aa  50.1  0.00003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7416  hypothetical protein  28.74 
 
 
188 aa  50.1  0.00003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.933873  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1739  flavin reductase domain protein FMN-binding  27.27 
 
 
180 aa  50.1  0.00003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2920  hypothetical protein  25.27 
 
 
202 aa  49.3  0.00005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01680  hypothetical protein  27.48 
 
 
292 aa  49.3  0.00006  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1786  flavoprotein oxygenase DIM6/NTAB family-like protein  28 
 
 
228 aa  48.9  0.00006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.60124  normal  0.96149 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4267  hypothetical protein  28.57 
 
 
221 aa  48.9  0.00007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.308533  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3148  flavin reductase-like, FMN-binding  28.95 
 
 
219 aa  48.5  0.00008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>