More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_7481 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009485  BBta_7481  ABC transporter ATP-binding protein  100 
 
 
267 aa  529  1e-149  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0421656  normal  0.0607667 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0571  ABC transporter related  76.71 
 
 
267 aa  374  1e-103  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.260264  normal  0.332215 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0259  ABC transporter related  73.18 
 
 
270 aa  374  1e-102  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.511865 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0470  ABC transporter related  70.9 
 
 
276 aa  368  1e-101  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0571  ABC transporter related  71.43 
 
 
271 aa  350  8.999999999999999e-96  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.750725  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0426  ABC transporter related  67.42 
 
 
268 aa  348  7e-95  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0332  ABC transporter, ATPase subunit  66.67 
 
 
267 aa  334  9e-91  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3870  ABC transporter related  62.45 
 
 
267 aa  302  5.000000000000001e-81  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1677  ABC transporter related  57.03 
 
 
274 aa  289  3e-77  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.012686  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1308  ABC transporter related  54 
 
 
252 aa  288  9e-77  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4664  ABC transporter related  55.51 
 
 
274 aa  287  1e-76  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.456657 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3146  ABC transporter related  57.63 
 
 
266 aa  287  1e-76  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.25473 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0800  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter ATPase  60.57 
 
 
276 aa  286  2e-76  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.872437  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5133  ABC transporter related  57.2 
 
 
266 aa  282  3.0000000000000004e-75  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0892  ABC transporter related  60.49 
 
 
252 aa  278  5e-74  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.0967243 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1090  ABC transporter related  55.86 
 
 
261 aa  275  5e-73  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1383  ABC transporter related  56.56 
 
 
269 aa  275  6e-73  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.181644  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3551  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  53.85 
 
 
324 aa  274  9e-73  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.375079  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2014  ABC nitrate/sulfonate/bicarbonate transporter, ATPase subunit  54.72 
 
 
277 aa  270  2e-71  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4759  ABC transporter related  56.02 
 
 
276 aa  266  2e-70  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.328175  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3211  ABC transporter, ATP-binding protein  54.66 
 
 
282 aa  264  1e-69  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1163  ABC transporter related  56.59 
 
 
257 aa  263  2e-69  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.119429 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2589  ABC transporter related  53.85 
 
 
284 aa  258  8e-68  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.40805 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1264  ABC transporter ATP-binding protein  53.94 
 
 
284 aa  256  3e-67  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.150023 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1094  ABC transporter related  51.81 
 
 
299 aa  253  3e-66  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0108861  normal  0.165383 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1472  ABC transporter related  53.66 
 
 
246 aa  250  1e-65  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2039  ABC transporter related  51.41 
 
 
306 aa  250  2e-65  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.768155 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1720  ABC transporter related  50.6 
 
 
304 aa  247  1e-64  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3413  ATP-binding protein of ABC transporter  57.66 
 
 
259 aa  243  1.9999999999999999e-63  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.24016 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0833  ABC transporter related  53.5 
 
 
246 aa  239  4e-62  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.557912  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3141  ABC transporter-related protein  51.93 
 
 
233 aa  228  1e-58  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0745233  normal  0.0402056 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2866  ABC transporter related protein  47.77 
 
 
299 aa  222  4e-57  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1885  ABC transporter-like protein  45.52 
 
 
274 aa  219  3.9999999999999997e-56  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.152883 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1475  ABC transporter related  44.76 
 
 
254 aa  218  6e-56  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3808  ABC transporter-related protein  48.93 
 
 
271 aa  218  7.999999999999999e-56  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0346  ABC transporter related  44.09 
 
 
278 aa  216  2e-55  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0445  ABC transporter related  44.35 
 
 
254 aa  216  2.9999999999999998e-55  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3892  ABC transporter related  48.07 
 
 
271 aa  215  5.9999999999999996e-55  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2104  ABC transporter related protein  44.96 
 
 
268 aa  215  7e-55  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3136  ABC transporter related protein  50.44 
 
 
261 aa  212  3.9999999999999995e-54  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.257722  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3034  ABC transporter related  43.53 
 
 
265 aa  212  3.9999999999999995e-54  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.971108  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0392  ABC transporter related  46.35 
 
 
254 aa  212  3.9999999999999995e-54  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.238571  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0991  ABC transporter related  42.74 
 
 
258 aa  211  7.999999999999999e-54  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.671415  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3751  ABC transporter, ATPase subunit  47.6 
 
 
271 aa  211  1e-53  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2032  ABC transporter related protein  48.59 
 
 
278 aa  210  1e-53  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0545807  normal  0.262342 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6033  putative ABC transporter, ATP-binding protein  44.14 
 
 
261 aa  210  2e-53  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4886  ABC transporter related  47.77 
 
 
297 aa  209  4e-53  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4503  ABC transporter related protein  47.08 
 
 
267 aa  209  4e-53  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2052  ABC transporter related  52.61 
 
 
284 aa  209  5e-53  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.405737 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0408  ABC transporter related  49.57 
 
 
259 aa  209  5e-53  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0896853  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7628  ABC transporter ATP-binding protein  47.13 
 
 
281 aa  209  5e-53  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.494067  normal  0.333376 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1081  ABC transporter related  52.61 
 
 
289 aa  208  6e-53  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.0182261 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6282  ABC transporter related  49.56 
 
 
266 aa  207  1e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.166424  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2760  ABC transporter related protein  55.02 
 
 
278 aa  208  1e-52  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.398097  normal  0.0252415 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2044  ABC transporter related  48.66 
 
 
262 aa  207  1e-52  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.471854  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1128  ABC transporter related  42.64 
 
 
267 aa  207  1e-52  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1030  ABC transporter, ATP-binding protein  45.18 
 
 
254 aa  206  4e-52  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1733  ABC transporter related  52.13 
 
 
284 aa  206  4e-52  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0513  ABC transporter related  40.89 
 
 
254 aa  206  4e-52  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1090  taurine ABC transporter, ATP-binding protein  47.19 
 
 
260 aa  206  5e-52  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1857  ABC transporter related  45.02 
 
 
304 aa  206  5e-52  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3507  ABC transporter related  46.41 
 
 
261 aa  205  5e-52  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0770339  normal  0.17835 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1428  ABC transporter related  41.11 
 
 
267 aa  205  6e-52  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.250833  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3100  ABC transporter related  47.58 
 
 
276 aa  205  8e-52  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.872567 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1860  ABC transporter related  43.39 
 
 
259 aa  204  1e-51  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.188134  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2628  ABC transporter related  45.39 
 
 
275 aa  204  1e-51  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3870  ABC transporter related  45.49 
 
 
272 aa  204  1e-51  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0307  ABC transporter related  45.34 
 
 
259 aa  203  2e-51  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7645  putative sulfonate ABC transporter, ATP binding protein  46.5 
 
 
261 aa  204  2e-51  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0412308  normal  0.633643 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5154  ABC transporter related  49.38 
 
 
268 aa  203  3e-51  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.597589  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1358  ABC transporter related  41.39 
 
 
262 aa  203  3e-51  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1168  putative ABC transporter, ATP-binding protein  46.34 
 
 
275 aa  203  3e-51  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0378  hypothetical protein  45.61 
 
 
260 aa  203  3e-51  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0849  ABC transporter-related protein  46.53 
 
 
253 aa  202  3e-51  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0140067  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2802  ABC transporter related protein  44.66 
 
 
260 aa  202  4e-51  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2275  ABC transporter related  43.25 
 
 
264 aa  202  5e-51  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0996963 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0404  ABC transporter related protein  44.3 
 
 
261 aa  202  6e-51  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1489  ABC transporter related  46.32 
 
 
283 aa  202  6e-51  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6457  ABC transporter ATP-binding protein  43.86 
 
 
261 aa  201  7e-51  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0467  ABC transporter related  44.75 
 
 
274 aa  201  8e-51  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3754  ABC transporter related  47.62 
 
 
264 aa  201  8e-51  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.444646  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2954  ABC transporter related  45.18 
 
 
272 aa  201  8e-51  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2643  ABC transporter related  40.82 
 
 
261 aa  201  9.999999999999999e-51  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.430112  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0087  ABC transporter related  49.31 
 
 
263 aa  201  9.999999999999999e-51  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3130  ABC transporter related  43.85 
 
 
278 aa  201  9.999999999999999e-51  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0618  ABC transporter related  42.98 
 
 
259 aa  201  9.999999999999999e-51  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1505  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport system ATPase component  45.15 
 
 
262 aa  200  1.9999999999999998e-50  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0234474  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0327  ABC transporter related  41.11 
 
 
264 aa  200  1.9999999999999998e-50  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.341199  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17270  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport system, ATPase component  44.81 
 
 
274 aa  200  1.9999999999999998e-50  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.115827  normal  0.528564 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3789  ABC transporter related  46.51 
 
 
254 aa  200  1.9999999999999998e-50  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0962243  normal 
 
 
-
 
NC_009959  Dshi_4164  ABC transporter related  46.28 
 
 
268 aa  201  1.9999999999999998e-50  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.143983  normal  0.780966 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1481  ABC transporter related  46.49 
 
 
283 aa  199  3e-50  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2836  ABC transporter related  44.58 
 
 
272 aa  200  3e-50  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.840356  normal  0.83525 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4057  ABC transporter related  46.22 
 
 
288 aa  199  3e-50  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.170324 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0463  ABC transporter related  48.68 
 
 
257 aa  200  3e-50  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.335416  normal  0.0141237 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5800  ABC transporter related  43.82 
 
 
284 aa  199  3.9999999999999996e-50  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1435  ABC transporter related protein  47.01 
 
 
291 aa  199  5e-50  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.597503  normal  0.846861 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4331  alkanesulfonate ABC transporter ATP-binding protein  45.26 
 
 
256 aa  198  6e-50  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1187  taurine ABC transporter, ATP-binding protein  47.19 
 
 
260 aa  198  7.999999999999999e-50  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0360138  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4843  putative ABC transporter ATP-binding protein  44.76 
 
 
284 aa  198  7.999999999999999e-50  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.365039 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>